Hier beschreven is een effectieve methode voor het produceren van hoge virale titer voorraden van hepatitis E-virus (HEV) om efficiënt te infecteren hepatoma cellen. Met de gepresenteerde methode kunnen zowel niet-omhulde, als omhulde virale deeltjes worden geoogst en gebruikt voor het inenten van verschillende cellijnen.
Hepatitis E-virus is de belangrijkste oorzaak van levercirrose en leverfalen met toenemende prevalentie wereldwijd. Het enkelstrende RNA-virus wordt voornamelijk overgedragen door bloedtransfusies, ontoereikende hygiënische omstandigheden en besmette voedingsproducten. Tot op heden is het off-label medicijn ribavirin (RBV) de behandeling naar keuze voor veel patiënten. Niettemin moet een specifieke HEV-behandeling nog worden vastgesteld. Tot nu toe is de kennis over de HEV levenscyclus en pathogenese ernstig belemmerd door het ontbreken van een efficiënt HEV-celkweeksysteem. Een robuust celkweeksysteem is essentieel voor de studie van de virale levenscyclus, die ook de virale pathogenese omvat. Met de hier beschreven methode kan men virale titers produceren tot 3 x 106 focusvormende eenheid/mL (FFU/mL) van niet-omhulde HEV en tot 5 x 104 FFU/mL van omhulde HEV. Met behulp van deze deeltjes is het mogelijk om een verscheidenheid aan cellen van verschillende oorsprong te infecteren, waaronder primaire cellen en menselijke, evenals dierlijke cellijnen. De productie van besmettelijke HEV-deeltjes uit plasmiden vormt een oneindige bron, wat dit protocol buitengewoon efficiënt maakt.
Hepatitis E is een vrij onderschatte ziekte met toenemende prevalentie wereldwijd. Ongeveer 20 miljoen infecties resulteren in meer dan 70.000 sterfgevallen per jaar1. Het onderliggende middel, het Hepatitis E-virus (HEV), werd onlangs overgeplaatst en is nu ingedeeld binnen de familie Hepeviridae, waaronder het geslacht Orthohepevirus en het Piscihepevirus. HEV van verschillende oorsprong zijn ingedeeld binnen de soort Orthohepevirus A-D met inbegrip van isolaten van mensen, varkens, konijnen, ratten, vogels en andere zoogdieren2. Op dit moment zijn acht verschillende genotypes (GT) van het positief georiënteerde, enkelstrengs RNA-virus geïdentificeerd2. Hoewel ze verschillen in hun sequentie-identiteit, routes van transmissie en geografische spreiding, is hun genomische structuur zeer behouden. Meer specifiek, de 7.2 kbp HEV genoom is verdeeld in 3 grote open leesframes (ORF1-3). Terwijl ORF1 alle enzymen codeert die nodig zijn voor een succesvolle replicatie binnen de hostcel, codeert ORF2 het capsid-eiwit en werkt het ORF3-eiwit als een functioneel ionenkanaal dat nodig is voor de assemblage en afgifte van infectieuze deeltjes3. Eenmaal vrijgegeven in de basale of apical lumen HEV bestaat in zowel, quasi-veloped en niet-gehulde / naakte soorten, afhankelijk van de vraag of het virus afkomstig is van bloed of uitwerpselen, respectievelijk4,5.
Terwijl GT1 en GT2 zijn vooral te vinden in ontwikkelingslanden uitsluitend infecteren mensen6 via de fecale orale route, GT3, GT4 en GT7 komen voornamelijk voor in ontwikkelde landen1,7 met een verscheidenheid aan soorten die als reservoirs, b.v. varkens8, rat9, kip10,11, herten12, mongoose13, vleermuis14, konijn15,16, wilde zwijnen17 en nog veel meer7,18,19, die aantonen dat zoönose7,20,21,22. Naast ontoereikende hygiënische omstandigheden23 en besmette voedingsproducten12,24,25,26, is overdracht via bloedtransfusie en orgaantransplantaties ook mogelijk27,28. HEV is een veel voorkomende oorzaak van levercirrose en leverfalen29 vooral bij patiënten met reeds bestaande leverziekte, immuungecompromitteerde individuen (genotype 3, 4 en 7) en zwangere vrouwen (genotype 1). Van belang zijn er ook extrahepatische manifestaties zoals hematopoietische ziekte30,31,32, neurologische aandoeningen33 en nierletsel34.
Tot op heden is het off-label medicijn ribavirin (RBV) de keuzebehandeling voor veel geïnfecteerde patiëntenvan 35,36. Er zijn echter gevallen van falen van de behandeling en slechte klinische resultaten op lange termijn gemeld. Het falen van de behandeling is gekoppeld aan virale mutagenese en verhoogde virale heterogeniteit bij chronisch geïnfecteerde patiënten37,38,39. Integendeel, een recente Europese retrospectieve multicenter studie was niet in staat om polymerase mutaties te correleren met RBV behandeling falen40. In klinische waarnemingen en in vitro experimenten hebben interferon41,42,43, sofosbuvir44,45, zinkzouten46 en silvestrol47,48 ook antivirale effecten vertoond. Niettemin moet er nog een specifieke HEV-behandeling worden gevonden, die wordt belemmerd door het gebrek aan kennis over de HEV-levenscyclus en de pathogenese ervan. Daarom is een robuust celkweeksysteem voor virologische studies en de ontwikkeling van nieuwe antivirale geneesmiddelen dringend nodig49.
Helaas, net als andere hepatitis virussen, HEV is moeilijk te verspreiden in conventionele cellijnen en meestal vordert zeer langzaam leidt tot lage virale belastingen. Niettemin, sommige groepen waren in staat om virale belastingen te stimuleren door de generatie van de cellijn subklonen50 of de aanpassing van de media supplementen51. Onlangs is de generatie van cDNA klonen52 en de aanpassing van de primaire patiënt isolaten door passaging53,54 verder verbeterde HEV voortplanting in celcultuur55. In dit protocol gebruikten we het genoom van een celcultuur aangepaste Kernow-C1 stam (aangeduid als p6_WT)54 en een mutant stam herbergen een replicatie-verbeterende mutatie (aangeduid als p6_G1634R)37. Kernow-C1 is de meest gebruikte stam in HEV celcultuur en is in staat om hoge virale belastingen te produceren. Door het beoordelen van virale RNA kopie nummers, HEV replicatie kan worden gecontroleerd in vitro. Deze technieken maken het echter niet mogelijk om het aantal besmettelijke deeltjes te beoordelen. Daarom hebben we een immunofluorescentie kleuring vastgesteld om Focus Forming Units (FFU/mL) te bepalen.
De hier beschreven methode56 kan worden gebruikt om infectieuze virale deeltjes over de hele lengte te produceren die in staat zijn om een verscheidenheid aan celtypen van verschillende oorsprong te infecteren, waaronder primaire cellen en zoogdiercellijnen. Dit is een fundamentele voorwaarde om belangrijke aspecten van HEV-infectie en tropisme te ontcijferen. Er is geen noodzaak voor inenting met meestal beperkte patiënt isolaten. De productie van besmettelijke HEV-deeltjes uit plasmiden vormt een oneindige bron, wat dit protocol vergelijkbaar efficiënt maakt. Bovendien kan dit systeem worden gebruikt voor omgekeerde genetica waardoor in vivo geïdentificeerde genoomwijziging en hun impact op HEV-replicatie en fitness mogelijk zijn. Deze techniek overwint vele beperkingen en kan de weg vinden voor medicijnontwikkeling, mutagenesestudies en de evaluatie van virushostinteracties zoals beperking of toegangsfactoren.
Beginnend met het plasmidepreparaat, zouden de opbrengsten van DNA meer dan 150 ng/μL moeten overschrijden om veelvoudige linearisatie van de zelfde plasmidvoorraad te kunnen uitvoeren, die het risico van bacteriën-geïnduceerde mutagenese van essentiële genoomopeenvolgingen minimaliseert. Verder is het belangrijk om de beperking te controleren voor de volledige plasmide linearisatie door gel elektroforese (Figuur 8b). Een gebrek aan gelinealiseerd plasmide DNA zou leiden tot rollende cir…
The authors have nothing to disclose.
We zijn Suzanne Emerson dankbaar voor de hepatitis E virus p6 kloon. HEV-specifieke konijn hyperimmune serum werd vriendelijk geleverd door Rainer Ulrich, Friedrich Loeffler Instituut, Duitsland. Bovendien danken wij alle leden van de afdeling Moleculaire en Medische Virologie van de Ruhr-universiteit Bochum voor hun steun en discussie. Cijfers 1-7 werden gegenereerd met BioRender.com.
0.45 µm mesh | Sarstedt | 83.1826 | Harvest extracellular Virus |
4 % Histofix | CarlRoth | P087.4 | Immunofluorescence |
Acetic acid | CarlRoth | 6755.1 | Collagen working solution |
Amicon Ultra-15 | Merck Millipore | UFC910024 | Virus harvesting |
Ampicillin | Sigma-Aldrich | A1593 | Selection of transformed bacteria |
ATP | Roche | 11140965001 | in vitro transcription and electroporation |
BioRender | BioRender | Figure Generation | |
CaCl2 | Roth | 5239.2 | Cytomix |
Collagen R solution 0.4 % sterile | Serva | 47256.01 | Collagen working solution |
CTP | Roche | 11140922001 | in vitro transcription |
Cuvette | Biorad | 165-2088 | Electroporation |
DAPI | Invitrogen | D21490 | Immunofluorescence |
DMEM | gibco | 41965-039 | Cell culture |
DNAse | Promega | M6101 | in vitro transcription |
DTT | Promega | included in P2077 | in vitro transcription |
EGTA | Roth | 3054.3 | Cytomix |
Escherichia coli JM109 | Promega | L2005 | Transformation |
Fetal bovine serum | gibco | 10270106 | Cell culture |
Fluoromount | SouthernBiotech | 0100-01 | Immunofluorescence |
GenePulser Xcell Electroporation System | BioRad | 1652660 | Electroporation |
Gentamycin | gibco | 15710049 | Cell culture |
GTP | Roche | 11140957001 | in vitro transcription |
H2O | Braun | 184238001 | Immunofluorescence |
Hepes | Invitrogen | 15630-03 | Cytomix |
Horse serum | gibco | 16050122 | Immunofluorescence |
K2HPO4 | Roth | P749.1 | Cytomix |
KCL | Roth | 6781.3 | Cytomix |
KH2PO4 | Roth | 3904.2 | Cytomix |
L-Glutamin | gibco | 25030081 | Cell culture |
L-Glutathione reduced | Sigma-Aldrich | G4251-5G | Cytomix |
MEM | gibco | 31095-029 | Cell culture |
MEM NEAA (100×) | gibco | 11140-035 | Cell culture |
MgCl2 | Roth | 2189.2 | Cytomix |
Microvolume UV-Vis spectrophotometer NanoDrop One | Thermo Fisher | ND-ONE-W | DNA/RNA concentration |
MluI enzyme | NEB | R0198L | Linearization |
NEB buffer | NEB | included in R0198L | Linearization |
NucleoSpin Plasmid kit | Macherey & Nagel | 740588.250 | Plasmid preparation |
NucleoSpin RNA Clean-up Kit | Macherey & Nagel | 740948.250 | RNA purification |
PBS | gibco | 70011051 | Cell culture |
Pen/Strep | Thermo Fisher | 15140122 | Cell culture |
Plasmid encoding full-length HEV genome (p6_G1634R) | Todt et.al | Virus production | |
Plasmid encoding full-length HEV genome (p6_WT) | Shukla et al. | GenBank accession no. JQ679013 | Virus production |
Primary antibody 1E6 | LS-Bio | C67675 | Immunofluorescence |
Primary antibody 8282 | Rainer Ulrich, Friedrich Loeffler Institute, Germany | ||
QIAprep Spin Miniprep Kit | Qiagen | 27106 | DNA extraction |
Ribo m7G Cap Analog | Promega | P1711 | in vitro transcription |
RNase away | CarlRoth | A998.3 | RNA purification |
RNasin (RNase inhibitor) | Promega | N2515 | in vitro transcription |
Secondary antibody donkey anti-mouse 488 | Thermo Fisher | A-21202 | Immunofluorescence |
Secondary antibody goat anti-rabbit 488 | Thermo Fisher | A-11008 | Immunofluorescence |
Sodium Pyruvat | gibco | 11360070 | Cell culture |
T7 RNA polymerase | Promega | P2077 | in vitro transcription |
Transcription Buffer | Promega | included in P2077 | in vitro transcription |
Triton X-100 | CarlRoth | 3051.3 | Immunofluorescence |
Trypsin-EDTA (0.5 %) | gibco | 15400054 | Cell culture |
ultra-low IgG | gibco | 1921005PJ | Cell culture |
UTP | Roche | 11140949001 | in vitro transcription |