Bu protokol, odaklanmış ultrason kan beyin bariyeri (BBB) açılması, ortaya çıkan gen ekspresyonunun değerlendirilmesi ve histolojik testlerle kemogenetik reseptörlerin nöromodülasyon aktivitesinin ölçülmesi yoluyla gen iletimi için gerekli adımları tanımlar.
Akustik Hedefli Kemogenetik (ATAC), spesifik nöral devrelerin noninvaziv kontrolüne izin verir. ATAC, odaklanmış ultrason (FUS) ile indüklenen kan-beyin bariyeri açılışı (FUS-BBBO), adeno-ilişkili viral (AAV) vektörlerle gen iletimi ve tasarlanmış, kemogenetik, protein reseptörleri ve bunların akraba ligandları ile hücresel sinyallemenin aktivasyonunun bir kombinasyonu yoluyla bu kontrolü sağlar. ATAC ile tek bir noninvaziv ultrason uygulaması kullanarak hem büyük hem de küçük beyin bölgelerini milimetre hassasiyetinde transdüksiyon yapmak mümkündür. Bu transdüksiyon daha sonra bir ilaç kullanarak serbestçe hareket eden hayvanlarda uzun süreli, invaziv olmayan, cihazsız bir nöromodülasyona izin verebilir. FUS-BBBO, AAV’ler ve kemogenetik birden fazla hayvanda kullanıldığından, ATAC diğer hayvan türlerinde kullanım için de ölçeklenebilir olmalıdır. Bu makale, daha önce yayınlanmış bir protokolü genişletmekte ve karmaşık bir MRG uyumlu FUS cihazına ihtiyaç duymadan, MRG kılavuzluğunda küçük beyin bölgelerine FUS-BBBO ile gen iletiminin nasıl optimize edileceğini özetlemektedir. Protokol ayrıca, herhangi bir laboratuvar tarafından 3D olarak basılabilen ve farklı türler veya özel ekipman için kolayca değiştirilebilen fare hedefleme ve kısıtlama bileşenlerinin tasarımını da açıklar. Tekrarlanabilirliğe yardımcı olmak için protokol, ATAC geliştirmede mikro kabarcıkların, AAV’lerin ve damar delinmesinin nasıl kullanıldığını ayrıntılı olarak açıklar. Son olarak, ATAC kullanan çalışmaların ön araştırmalarına rehberlik etmesi için örnek bir veri gösterilmiştir.
Optogenetik 1,2 ve kemogenetik 3,4,5 gibi devreye özgü nöromodülasyon teknolojilerinin kullanımı, nöronal devre bozuklukları olarak psikiyatrik durumları anlamamızı sağlamıştır. Nöronal devrelerin incelenmesi zordur ve beyin bozukluklarının tedavisinde kontrol edilmesi daha da zordur, çünkü tipik olarak belirli hücre tipleri, beyin bölgeleri, moleküler sinyal yolları ve aktivasyon zamanlaması ile tanımlanırlar. Hem araştırma hem de klinik uygulamalar için ideal olarak, bu tür bir kontrol noninvaziv olarak uygulanacaktır, ancak hem kesin hem de noninvaziv nöromodülasyon elde etmek zordur. Örneğin, nöroaktif ilaçlar beyne noninvaziv olarak ulaşabilirken, beyin boyunca hareket ederek uzamsal özgüllükten yoksundurlar. Öte yandan, elektriksel derin beyin stimülasyonu belirli beyin bölgelerini kontrol edebilir, ancak belirli hücre tiplerini kontrol etmekte zorlanır ve ameliyat ve cihaz yerleştirme gerektirir6.
Akustik Hedefli Kemogenetik7 (ATAC), uzamsal, hücre tipi ve zamansal özgüllük ile nöromodülasyon sağlar. Üç tekniği birleştirir: uzamsal hedefleme için odaklanmış ultrason kaynaklı kan-beyin bariyeri açma (FUS-BBBO), hücre tipine özgü promotörlerin kontrolü altında genleri noninvaziv olarak iletmek için adeno ilişkili viral vektörlerin (AAV’ler) kullanımı ve transfekte edilmiş nöral devreleri ilaç uygulaması yoluyla seçici olarak modüle etmek için tasarlanmış kemogenetik reseptörler. FUS, ultrasonun insan beyni de dahil olmak üzere dokuların derinliklerine milimetre uzamsal hassasiyetle odaklanma yeteneğinden yararlanan FDA onaylı bir teknolojidir. Yüksek güçte FUS, esansiyel tremor8 için FDA onaylı bir tedavi de dahil olmak üzere noninvaziv hedefli ablasyon için kullanılır. FUS-BBBO, düşük yoğunluklu ultrasonu, ultrason odağında kan damarlarında salınan sistemik olarak uygulanan mikro kabarcıklarla birleştirir ve BBB9’un lokalize, geçici (6-24 saat) ve geri dönüşümlü açılmasına neden olur. Bu açıklık, kemirgenlerde10 ve insan olmayan primatlarda 15 önemli doku hasarı olmadan proteinlerin 9,10, küçük moleküllerin 11 ve viral vektörlerin7,12,13,14 beyne iletilmesine izin verir. FUS-BBBO16,17 için klinik çalışmalar devam etmekte olup, bu tekniğin olası terapötik uygulamalarını göstermektedir.
AAV kullanılarak viral gen iletimi, CNS bozuklukları için klinik kullanıma doğru hızla ilerlemektedir ve son FDA ve AB düzenleyici onayları önemli kilometre taşları olarak kabul edilmektedir. Son olarak, yalnızca Tasarımcı İlaçlar Tarafından Aktive Edilen Tasarımcı Reseptörleri (DREADD’ler) gibi kemogenetik reseptörler18, sinirbilimciler tarafından transgenik veya transfekte edilmiş hayvanlarda nöronal uyarılma üzerinde farmakolojik kontrol sağlamak için yaygın olarak kullanılmaktadır19,20. DREADD’ler, endojen ligandlardan ziyade sentetik kemogenetik moleküllere yanıt vermek üzere genetik olarak tasarlanmış G proteinine bağlı reseptörlerdir (GPCR’ler), öyle ki bu ligandların sistemik uygulaması, DREADD eksprese eden nöronların uyarılabilirliğini arttırır veya azaltır. Bu üç teknoloji ATAC’ta birleştirildiğinde, seçilen nöral devrelerin uzamsal, hücre tipi ve zamansal hassasiyetle noninvaziv modülasyonu için kullanılabilirler.
Burada, basit 3D baskılı hedefleme ekipmanı kullanarak farelerde FUS-BBBO ile beyin bölgelerinin doğru hedeflenmesi için metodolojiyi dahil ederek FUS-BBBO11 için daha önce yayınlanmış bir protokolü genişletiyor ve güncelliyoruz. Ayrıca, FUS-BBBO’nun ATAC’a bir uygulamasını da gösteriyoruz. Kemogenetik reseptörleri taşıyan AAV’lerin verilmesi ve gen ekspresyonunun ve nöromodülasyonun histoloji ile değerlendirilmesi için gerekli adımları gösteriyoruz. Bu teknik, özellikle gen ekspresyonu veya nöromodülasyon için büyük veya çoklu beyin bölgelerini hedeflemek için geçerlidir. Örneğin, bir korteksin geniş bir alanı FUS-BBBO ile kolayca transdüksiyon yapılabilir ve kemogenetik kullanılarak modüle edilebilir. Bununla birlikte, alternatif bir teknik olan intrakraniyal enjeksiyonlarla gen iletimi, çok sayıda invaziv enjeksiyon ve kraniotomi gerektirecektir. FUS-BBBO ve uygulaması ATAC, beyin bölgelerinin daha büyük ve invaziv olarak hedeflenmesinin daha zor olduğu farklı boyutlardaki hayvanlara ölçeklendirilebilir.
ATAC, doğru MRI kılavuzluğunda hedefleme, FUS-BBBO ve gen ekspresyonunun histolojik değerlendirmesi dahil olmak üzere belirli nöral devrelerin başarılı nöromodülasyonu için çeşitli tekniklerin başarılı bir şekilde uygulanmasını gerektirir. Görüntüleme kılavuzluğunda FUS-BBBO ile küçük beyin yapılarının hedeflenmesini basitleştirmek için 3D yazdırılabilir bileşenler geliştirildi.
MRG kılavuzluğunda odaklanmış ultrason (MRIgFUS) uygulaması bir takım zorluklar ortaya çıkarmaktadır. İlk olarak, tipik MRI bobini, ultrason donanımını değil, yalnızca bir numuneyi barındıracak şekilde tasarlanmış sınırlı alana sahiptir. MRI’ların daha büyük delikleri, sinyal bir bobinin32 doldurma faktörü ile ilgili olduğundan, ekipman maliyetini artırır ve görüntü kalitesini düşürür. Sonuç olarak, MRG’de bir hayvan görüntüsünün üstüne yerleştirilen herhangi bir FUS donanımı, görüntüleme kalitesinden ödün verecektir. İkincisi, MRI uyumlu cihazlar tasarlamak zor ve pahalıdır. MR uyumlu malzemelerin diyamanyetik olması, radyofrekans ışınlaması sırasında girdap akımı oluşturma eğiliminin düşük olması ve yüksek manyetik alanlarda düşük manyetik duyarlılığa sahip olması gerekir. Herhangi bir iletken malzemede, girdap akımlarının oluşması veya manyetik duyarlılığı da görüntüleme kalitesini olumsuz yönde etkileyecektir. Son olarak, mevcut MRI uyumlu malzemeler, stereotaksik çerçeveler gibi hassas hedefleme makinelerinin üretiminde tipik olarak kullanılan metallerden daha düşük Young modülüne ve dayanıklılığına sahiptir. Konumsal ayarlamalar için kullanılan motorların MRG uyumlu olması ve boyutlarından dolayı MRG deliğinin dışına yerleştirilmesi gerekir. Bu motorlar, MRI uyumlu malzemeler kullanılarak bir MRI deliği içindeki dönüştürücüye belirli bir mesafede bağlanmalıdır. Plastik çarpıtma sorunları, sağlam boyutlu bileşenleri uygulamak için deliğin içinde yeterli alan olmaması ve tüm beyin boyunca hedefleme pozisyonlarını değiştirmek için yetersiz alan, önceki çalışmalarda hedefleme doğruluğunu etkilemiştir.
Bu sorunları çözmek için MRG ve FUS-BBBO uygulamasında görüntülemenin tarayıcı dışında yapılmasına karar verildi. MRI rehberliğine izin vermek için fareler, fare beyin yapılarını hem MRG’de hem de stereotax koordinat alanında lokalize etmek için kullanılabilecek MRI ile görünür bir hedefleme kılavuzuna sahip 3D baskılı bir kısıtlamanın içine yerleştirildi. Hem fare kafatası hem de hedefleme kılavuzu kulak çubuğu tutucularına sıkıca tutturulduğundan (Şekil 1a,b), MRI görüntüsündeki uzamsal koordinatları ilişkilendirmek ve stereotaksik aletleri sıfırlamak için bir hedefleme kılavuzu kullanılabilir. Kısıtlamanın hareketli parçaları yoktur ve bir dönüştürücü içermez, bu da onu hem sağlam hem de bir MRI’nın içine sığacak kadar küçük hale getirmemize izin verdi ve dönüştürücünün elektroniğinden sinyal parazitini ortadan kaldırdı. Bazı materyaller için 3D baskılı destek MRG’de görülebildiği için hedefleme kılavuzunun içindeki boşluk oyulmuştur (Şekil 1c). Stereotax kalibrasyonunu sağlamak için düzenekte delikler açıldı (Şekil 3). Ultrason dönüştürücüsü, bir stereotaksın bir elektrot tutucusuna bağlandı ve hedefleme, bölüm 4’te açıklandığı gibi gerçekleştirildi (Şekil 1d). Dönüştürücü, düz düzlemden herhangi bir sapmayı önleyecek şekilde, kulak çubuklarının muhafazası ile uzunluğu boyunca desteklenmelidir. Dorso-ventral yönde hedefleme, dairesel bir dizide faz kaymaları kullanılarak elde edilebilir.
Pratik hedefleme hassasiyeti, ultrason odaklama ve kafatası zayıflaması ile belirlenir. FUS-BBBO prosedürü sıçanlarda 11 ayrıntılı olarak tanımlanmıştır ve bir dizi başka model organizmada23,33,34 ve insanlarda 16,17 uygulanmıştır. Ultrason odak boyutu arasındaki ilişki, frekansla ters orantılıdır, burada daha yüksek frekanslar daha hassas teslimatla sonuçlanabilir. Bununla birlikte, kafatasının zayıflaması, kafatasının ısınmasına ve kortikal alanlarda hasara yol açabilecek35 frekanslarıyla artar. Kesin hedefleme stratejisi beyin bölgesine bağlı olacaktır. Beyin dokusu içinde tam genişlikte yarım maksimum basıncın sığdığı bölgeler, striatum, orta beyin ve hipokampus gibi birçok beyin yapısında öngörülebilir ve güvenli BBB açılmasına izin verir. Beynin tabanına yakın bölgeler farelerde özel bir zorluk teşkil eder. Fare beyni, dorso-ventral yönde yaklaşık 8-10 mm’dir, bu da piyasada bulunan birçok dönüştürücünün tam genişlikte yarı maksimum boyutuyla karşılaştırılabilir. Sonuç olarak, kafatasının dibini hedeflemek, kulak kanallarında, ağızda veya nefes borusunda bulunan kemiklerden ve havadan ultrason yansımasına yol açabilir ve bu da öngörülemeyen yüksek ve düşük basınç modellerine yol açabilir36. Bu basınçların bazıları, kanamaya ve doku hasarına neden olduğu gösterilen bir atalet kavitasyon eşiğini geçebilir37. Kafatasının tabanına yakın bölgeleri hedeflemek için, kesişimsel genetik38’in gen ekspresyonunu FUS ışını ile hedeflenenden daha küçük bir alanla sınırlamak için kullanıldığı kesişimsel ATAC7’nin kullanılması tercih edilebilir. Yayınlanmış kesişimsel ATAC örneğinde, dopaminerjik hücrelerde bir gen düzenleme enzimini (Cre38) eksprese eden transgenik bir hayvan, dopaminerjik hücrelerin bulunduğu bölgenin alt bölümünde ultrason ile hedeflenmiştir. Son olarak, kortikal bölgeler FUS ile hedeflenebilir, ancak ultrasonun kırınımı ve yansıması meydana gelebilir ve bu da eşit olmayan basınç profillerine yol açabilir. Bu protokol, kullanılan türlere büyük ölçüde bağımlı olacağından kortikal bölgelerin hedeflenmesini kapsamaz; bununla birlikte, hipokampus 7’nin üzerindeki korteksin bir miktar hedeflendiği gözlemlenmiştir (örneğin, Şekil 7), en azından farelerde bunun mümkün olduğunu göstermektedir.
Kemogenetik aktivatör seçimi ve dozlama, spesifik deneysel ihtiyaçlara bağlı olacaktır. Yazarların çalışmalarından biri de dahil olmak üzere bir dizi çalışma7, önemli bir spesifik olmayan yanıtgöstermedi 39,40, daha yüksek dozlar (ör., 10 mg / kg) en azından bazı durumlarda41 yan etkilere neden olabilir. Bununla birlikte, tüm davranışsal deneylerde olduğu gibi, CNO ve metabolitlerinin42 potansiyel hedef dışı aktivitesi nedeniyle uygun kontroller31 gereklidir. Bu tür kontroller, DREADD’leri eksprese eden hayvanlara CNO ve salin kontrollerinin uygulanmasını ve CNO’nun vahşi tip hayvanlara uygulanmasını veya bazı özel durumlarda, sırasıyla kemogenetik reseptörleri eksprese eden ve eksprese etmeyen beynin ipsi ve kontralateral bölgelerinin karşılaştırılmasını içerebilir. Ek olarak, son araştırmalar, geliştirilmiş özgüllüğe sahip bir dizi yeni DREADD agonistiortaya çıkardı 28,29,43. Diğer kemogenetik reseptörler 5,25,44 de ATAC prosedürü ile birlikte kullanılabilir.
Gen ekspresyonunun histolojik değerlendirmesi, her hayvan için ölüm sonrası gereklidir. Hayvanların küçük bir kısmı, FUS-BBBO7’yi takiben zayıf gen ekspresyonu gösterir. Ek olarak, yanlış hedefleme mümkün olduğundan, gen ekspresyonunun uzamsal doğruluğunu ve özgüllüğünü göstermek gerekir. Bazı AAV’ler retrograd veya anterograd izleme yeteneği45 gösterebilir ve doğru ultrason hedeflemesine rağmen ultrason ile hedeflenen bölgeden uzakta transfeksiyona neden olabilir. Eksprese edilen kemogenetik reseptör bir floroforla kaynaşmışsa veya birlikte eksprese ediyorsa, doku kesitlerinde floroforun görüntülenmesi, ekspresyonun lokalizasyonunu ve yoğunluğunu değerlendirmek için yeterli olabilir. Bununla birlikte, birçok floresan proteini doku fiksasyon işlemi tarafından hasar görür ve DREADD’lerle sıklıkla kullanılan mCherry proteini için immün boyama, önceki çalışmalarda daha iyi sinyal vermiştir7. Son olarak, beynin belirli bölgelerindeki nöronların yoğunluğu nedeniyle (örneğin, hipokampustaki granüler hücre tabakası), hücre sayımlarını gerçekleştirmek için füzyonların aksine, IRES altında eksprese edilen nükleer lokalize floroforların kullanılması faydalı olabilir, çünkü çekirdekler DAPI veya TO-PRO-3 gibi nükleer lekelerle kolayca bölümlere ayrılabilir ve karşı boyanabilir. Nöromodülasyonu c-Fos boyama ile değerlendirmek için, herhangi bir floresan sinyali yerine nükleer karşı boyama yapmak ve c-Fos pozitif çekirdeklerini saymak zorunludur. Bazı durumlarda, hücresel kalıntılar floresan gösterebilir ve pozitif hücrelerin ölçümlerini karıştırabilir.
FUS-BBBO ile ilaç ve gen iletiminin sınırlamaları, invaziv intrakraniyal enjeksiyonlarla verilenden daha düşük çözünürlüğü ve daha büyük miktarlarda enjekte edilen ilaçlara veya viral vektörlere olan ihtiyacı içerir. Ek olarak, beyne doğrudan enjeksiyon, enjekte edilen bir bölgeye özel bir iletimle sonuçlanırken, FUS-BBBO, periferik dokulara olası bir iletimle sonuçlanan intravenöz bir yol kullanır. Nöromodülasyon için kemogenetik kullanımının sınırlamaları, nöromodülasyonun yoğunluğunda hızlı değişiklikler gerektiren bazı davranışsal protokoller için yetersiz olabilecek yavaş bir zaman ölçeğini içerir.
The authors have nothing to disclose.
Bu araştırma Beyin ve Davranış Vakfı, NARSAD Genç Araştırmacı Ödülü ile desteklenmiştir. Birkaç 3D baskılı bileşen orijinal olarak Fabien Rabusseau (Image Guided Therapy, Fransa) tarafından tasarlanmıştır. Yazar, makalenin hazırlanmasında teknik yardım için John Heath (Caltech) ve Margaret Swift’e (Caltech) teşekkür eder.
21-gauge needles (BD) | Fisher Scientific | 14826C | |
25-gauge butterfly catheter | Harvard Bioscience | 725966 | |
30-gauge needles (BD) | Fisher Scientific | 14826F | |
Absorbent blue pad | Office Depot | 902406 | |
Anti-c-Fos antibody | Santa Cruz Biotechnology | SC-253-G | |
Anti-mCherry antibody | Thermofisher | PA534974 | |
Bruker Biospec 70/30 | Bruker | custom | includes the RF coils |
Clozapine-n-oxide | Tocris | 4936 | |
Custom designed 3D printed mouse harnesses and MRIgFUS targeting components | ImageGuidedTherapy, Szablowski lab | custom | download from szablowskilab.org/downloads |
Custom MRIgFUS machine | ImageGuidedTherapy | N/A | |
Definity microbubbles | Lantheus | DE4 | |
Degassed aquasonic/ultrasound gel | Fisher Scientific | 5067714 | |
Depilation crème | Nair | n/a | |
Eight-element annular array transducer | Imasonic Inc. | custom | |
Ethanol Pads/Alcohol Swabs (70%) (BD) | Office Depot | 599893 | |
Heparin | Sigma-Aldrich | H3149-25KU | |
Isoflurane | Patterson Veterinary | 07-893-1389 | |
Ketamine | Patterson Veterinary | 07-890-8598 | |
Neutral buffered formalin (10%) | Sigma-Aldrich | HT501128-4L | |
Optical fiber hydrophone | Precision Acoustics | ||
PE10 tubing | Fisher Scientific | NC1513314 | |
Peristaltic pump | |||
Phosphate-buffered saline (PBS) | Sigma-Aldrich | 524650-1EA | |
Prohance contrast agent | Bracco | 0270-1111-04 | |
Saline | Fisher Scientific | NC9054335 | |
Secondary antibody, Donkey-anti goat | ThermoFisher | A-11055 | |
Secondary antibody, Donkey-anti rabbit | ThermoFisher | 84546 | |
Surgical scissors (straight) | Fisher Scientific | 17467480 | |
ThermoGuide Software | ImageGuidedTherapy | ||
Tissue glue (Gluture) | Fisher Scientific | NC9855218 | |
Tuberculin Syringe (1 mL) (BD) | Fisher Scientific | 14823434 | |
VeroClear 3D printable material | Stratasys | RGD810 | |
Vialmix microbubble activation device | Lantheus | VMIX | |
Vibrating microtome | Compresstome | VF-300 | |
Xylazine | Sigma-Aldrich | X1251-1G |