גלוטתיון S-transferases (GSTs) הם אנזימי גמילה מעורב בחילוף החומרים של תרופות כימותרפיות רבות. דיכוי יתר של GSTs הוא בקורלציה עם התנגדות כימותרפיה סרטן. דרך אחת להתמודד עם פנוטיפ זה היא להשתמש במעכבים. פרוטוקול זה מתאר שיטה באמצעות אסיוג ספקטרופוטומטרי כדי לסנן מעכבי GST פוטנציאליים.
גלוטתיון S-transferases (GSTs) הם אנזימים מטבוליים האחראים לחיסול של תרכובות אלקטרופיליות אנדוגניים או אקסוגניים על ידי התייחדות גלוטתיון (GSH). בנוסף, GSTs הם רגולטורים של קינאז חלבון המופעל על ידי מיטוגן (MAPKs) המעורבים במסלולים אפופטוטיים. דיכוי יתר של GSTs הוא בקורלציה עם יעילות טיפולית מופחתת בקרב חולים שעברו כימותרפיה עם חומרים אלקטרופיליים alkylating. שימוש מעכבי GST עשוי להיות פתרון פוטנציאלי כדי להפוך את הנטייה הזאת ועוצמת טיפול מוגבר. השגת מטרה זו דורשת גילוי של תרכובות כאלה, עם גישה מדויקת, מהירה וקלה לאנזים. פרוטוקול ספקטרופוטומטרי באמצעות 1-כלורו-2,4-dinitrobenzene (CDNB) כמו הצוללת היא השיטה המועסקת ביותר בספרות. עם זאת, כבר מתוארים ניסויי עיכוב GST אינם מספקים פרוטוקול המפרט כל שלב של אחסון עיכוב אופטימלי, כגון המדידה של קבוע Michaelis-Menten (Km) עבור CDNB או אינדיקציה של ריכוז האנזימים המועסקים, פרמטרים קריטיים כדי להעריך את העוצמה העיכוב של תרכובת נבדק. לפיכך, עם פרוטוקול זה, אנו מתארים כל שלב של אסייג אנזים GST ספקטרופוטומטרי אופטימיזציה, כדי לסנן ספריות של מעכבים פוטנציאליים. אנו מסבירים את החישוב של ריכוז מעכב חצי מקסימלי (IC50) ואת הקבוע של עיכוב (Ki) – שני מאפיינים המשמשים כדי למדוד את העוצמה של מעכב אנזים. השיטה המתוארת ניתן ליישם באמצעות מאגר של GSTs שחולצו מתאי או GSTs אנושי רקומביננטי טהור, כל שם GST אלפא 1 (GSTA1), GST mu 1 (GSTM1) או GST pi 1 (GSTP1). עם זאת, אין אפשרות להחיל פרוטוקול זה על תטא GST 1 (GSTT1), מכיוון ש- CDNB אינו מקום עבור isoform זה. שיטה זו שימשה כדי לבדוק את העוצמה העיכוב של כורכומין באמצעות GSTs מכבד סוסים. כורכומין היא מולקולה המציגה תכונות אנטי סרטניות והראתה זיקה כלפי isoforms GST לאחר בתחזיות עגינה silico. הוכחנו כי כורכומין הוא מעכב GST תחרותי חזק, עם IC50 של 31.6 ± 3.6 μM ו Ki של 23.2 ± 3.2 μM. כורכומין יש פוטנציאל להיות משולב עם תרופות כימותרפיות אלקטרופיליות כדי לשפר את יעילותה.
גלוטתיון Cytosolic S-transferase אנזימים (GSTs, EC 2.5.1.18) למזת את ההתייחדות של גלוטתיון (GSH) לתוך תרכובות אלקטרופיליות שונות, כגון סוכנים כימותרפיים, כדי לטהר ולחסל אותם בקלותמהגוף 1. שבעה isoforms של GST cytosolic זוהו אלפא, מו, פאי, סיגמה, אומגה, תטא, וזטה. GSTs באים לידי ביטוי בעיקר בכבד, אשכים, ריאות, ומערכת העיכול2. ISOform אלפא GST 1 (GSTA1) מבוטא מאוד hepatocytes. הגוף מבטא באופן הטרוגני תת סוגים אחרים, כולל GST pi 1 (GSTP1) בעיקר במוח, לב, וריאות, ו GST mu 1 (GSTM1) בכבד ואתיכים3. למרות שיש הומולוגיה רצף גבוה בין isoforms GST, כל תערוכות ספציפיות של ההתבססות והוא מעורב בחילוף חומרים של סמים וסרטן בדרכים שונות, על פי הביטוי ההפרנציאלישלה 4,5.
תרכובות אלקטרופיליות להיכנס לגוף אקסוגני או מיוצרים אנדוגני. חומרי הדברה, פרוסטגלנדינים, מסרטנים, ותרופות כימותרפיות הם חלק מה המצעים הפוטנציאליים לתגובות התייחדות גלוטתיון6. לדוגמה, כל תרכובת תגובתית לקויה אלקטרונים שנוצרה בתוך תא עשויה להפוך למלת אלקטרופילית. סוכני Alkylating כגון כלורמבוציל או melphalan מסולקים כמו התייחדות של GSH זירז על ידי GSTs, ורמות מוגברות של אנזימים אלה היו בקורלציה עם התנגדות לתרכובות אלה6,7.
תפקיד חשוב נוסף של GSTs cytosolic הוא ויסות הפעילות של קינאזות חלבון המופעלות על-ידי מיטוגן (MAPK) כגון MAPK8 (המכונה גם c-Jun N-מסוף קינאז, או JNK1) ו MAP3K5 (המכונה גם apoptosis אות ויסות קינאז 1, או ASK1)8. איזופורמים מסוימים בהקונפורמציה החד-מרית שלהם ייקשרו לחלבונים אלה ובכך יחסמו את מפל הפוספורילציה. בתנאים רגילים, isoform GSTP1 יבודד MAPK8 (מפעיל של חלבון c-Jun). שילוב c-Jun עם חלבון c-Fos יוצר את גורם שעתוק חלבון מפעיל 1 (AP-1), אשר אחראי על תמלול גנים פרו אפופטוטיים. בתאים לחוצים, המתחם שנוצר על ידי GSTP1 ו MAPK8 dissociates, c-Jun מופעל, ואת הגנים המובילים אפופטוזיס להתחיל לבוא לידיביטוי 9. ביטוי גדול יותר של isoform GST זה עשוי אפוא לחסום את המסלול, המוביל כדאיות תאים מוגברת, התפשטות תאית יותר, ורגישות תאית נמוכה יותר כימותרפיה. תרחישים דומים עלולים להתרחש עם פרלוגים של GSTP1, לדוגמה, GSTM1, המקיים אינטראקציה עם MAP3K510.
התפקידים שיחק על ידי GSTs בחילוף החומרים של התרופה ובבידוש של MAPKs הובילו להשערה כי ביטוי גדול יותר של GSTs עשוי להיות סימן של מנגנון התנגדות גידולית לטיפולכימותרפי 6,,11. לדוגמה, GSTP1 הוא בהגזמה בסרטן רבים ונוכחותו כבר בקורלציה עם פרוגנוזה עניים שכיחות מוגברת של נסיגה8. פולימורפיזם בגנים אלה הראה גם חשיפה דיפרנציאלית לסמים שיעורי הישרדות עבור חולים מציגים מחלות שונות, חיזוק הרעיון כי אנזימים אלה הם קריטיים למנגנונים של עמידות לתרופות. לדוגמה, אנשים עם הגנוטיפ NULL GSTM1 קשורים עם סיווג סמים נמוך יותרוהישרדות טובה יותר 12,13. ישנם מספר אמצעים פוטנציאליים של נגד דיכוי יתר זה, כגון השימוש של אנלוגיות GSH, prodrugs המופעלים על ידי התייחדות עם GSTs, או מעכבי GSTישיר 14,15.
כל השיטות האלה נמצאות כעת תחת חקירה, וכמה תרכובות החלו בניסויים קליניים לשימוש הפוטנציאלי שלהם בקרב חולים. עם זאת, למיטב ידיעתנו, אין תרכובות בשימוש כמעכבי GST בהגדרות קליניות15. אכן, חוסר ספציפיות עבור איזופורמים מסוימים או דלדול של GSH בתאים נורמליים, אשר עלול להוביל רעילות הנגרמת על ידי הצטברות של מיני חמצן תגובתי (ROS) במערכות איברים, הם רק חלק מהחסרונות אשר להפחית את הפוטנציאל של מעכבי GST14,15. הסיכון כי תרכובות אלה עשויים להפעיל השפעות פרמקודינמיות אחרות על הגוף גם מגבילים את השימוש שלהם. חומצה אתקרינית, למשל, הוא מעכב GST הנחקר ביותר בסביבות מעבדה, אבל בגלל שהוא משמש בעיקר כמשתן חזק, נכס זה מגביל את השימוש בו בשילוב עם תרופות אחרות בהגדרות קליניות. כורכומין הוא עוד תרכובת טבעית מוקרן בהצלחה כמעכב GST. מולקולה זו היא אתר פוליפנול שחולץ ממין כורכום לונגה של כורכום. זה הראה תוצאות מבטיחות כאפשרות טיפול אפשרי נגד סרטן על ידי גורם אפופטוזיס של סוגים שונים של קוויתא סרטניים 16,17. המתחם יכול לווסת מסלולים סלולריים מגוונים, כגון קינאז טירוסין18 או מסלול GST. מחקרים עם חלבונים טהורים הראו את העוצמה המעכבת שלה על GSTA1, GSTM1 ו GSTP119,20. עם זאת, תוצאות סותרות נצפו בתאים סרטניים, שם פעילות GST תאית גדולה נמדדה כאשר תאים טופלו עם כורכומין21. לכן, חשוב לחקור ריכוז מעכב חצי-מקסימלי (IC50) ואת הקבוע של עיכוב (Ki)של כל מעכב GST putative באמצעות פרוטוקול המתואר בבירור עם פקדים מתאימים לפני תכנון כל ניסויים תאיים נוספים.
סינון ובדיקה מעכבי GST חדשים פוטנציאליים הוא ולכן עניין קליני משמעותי, וכל תרכובת חדשה שנמצאה חייבת להיות בטוחה ויעילה לשימוש בשילוב עם תרופות אלקטרופיליות. התמקדות במחקר על מעכבי isoform ספציפי עשוי לאפשר עיכוב GST ברקמות הגידול המציגות דפוסים ספציפיים של ביטוי GST, ובכך לאפשר פיתוח של טיפול משולב יעיל. מציאת מעכבים עם מצבים דיפרנציאליים של עיכוב עשוי גם להיות עניין. לדוגמה, מעכב תחרותי המשתמש GSH כצע יכול לגרום דלדול שלה. הפחתה זו של ריכוז GSH בתאים הוצגה כדי לגרום סטרס חמצוני בנוירונים, המוביל אפופטוזיס. מצב נפוץ נוסף של עיכוב – עיכוב לא תחרותי – לא ניתן להפוך גם אם ההווה בריכוזים גבוהים.
קצב הפעילות האנזימטית מיוצג על-ידי הקבוע מיכאליס-אנטן (Km)והמהירות המרבית (Vmax),שניתן לקבוע על-ידי התוויית גרף מיכאליס-מאנטן, עם ריכוז ההתבססות כנגד מהירותהתגובה 23. Km הוא ריכוז של ההתבססות הנדרשת כדי לכבוש מחצית האתרים הפעילים אנזימטיים, כלומר Km גבוה מייצג פחות זיקה. Vmax מייצג את המהירות המרבית של התגובה, אליה הגיע כאשר כל האתרים הפעילים מאוכלסים על ידי הצוללת. Km שווה לחצי Vמקסימום. ישנם שלושה מצבי העכבה הנפוצים ביותר: תחרותי, לא תחרותי ולא תחרותי. במקרה של עיכוב תחרותי, המדכא נקשר לאתר הפעיל של האנזים ומתחרה עם הצוללת. לפיכך, Vmax לא משתנה לאחר תוספת של מעכב, אבל Km מגביר, כמו יותר בטוב נדרש כדי להתמודד עם העיכוב. עיכוב לא תחרותי מתרחש רק כאשר העיטורי יוצר תסביך עם האנזים. במקרה זה, כמו רמת העיכוב תלוי בריכוז המצע והאנזימים, Vמקסימום ו Km להקטין כאשר מעכב מתווסף לתגובה. המצב האחרון של עיכוב הוא לא תחרותי והוא שילוב של שני דפוסי עכבה אחרים. המדכא יכול להיקשר לאתר הפעיל של האנזים אם האנזים קשור למצוע שלו או לא. כאן Vמקסימום פוחת לאחר תוספת של המדכא, אבל Km לא לשנות24.
אסייג ספקטרופוטומטרי שמדד את פעילות GST פותח לראשונה על ידי Habig et al. בשנת 1974 באמצעות 1-כלורו-2,4-dinitrobenzene (CDNB) כמצע לתגובה22. התייחדות בין GSH ו- CDNB יוצרת GS-DNB, המציגה ספיגת אור מקסימלית באורך הגל של 340 מילי-מ”ר, הניתנת לצריבה עם ספקטרופוטומטר. רוב הטכניקה המוסברת להלן נגזרת Habig et al., כולל מידע על ההגדרות הטובות ביותר ונקודות אופטימיזציה חשובות עבור אחסון מעכב. הטכניקה יכולה להיות מיושמת על הקרנת מעכבי GST פוטנציאליים, אם נבחר על ידי בחירת תרופות רציונליות באמצעות תחזיות חישוביות או על ידי סקירת ספרות. כיצד להתאים את הפרוטוקול חלבוני GST מסונתז חדש או isoforms ספציפיים נדון גם. לדוגמה, בדיקת העוצמה המעכבת של isoforms GST המציגים פולימורפיזם רלוונטי קלינית או של פולימורפיזם נוקלאוטיד יחיד (SNPs) יכול להיות שימושים פוטנציאליים עבור פרוטוקול זה, מיקוד GSTs ספציפי למטופל.
פרוטוקול זה מספק שיטה מהירה, אפשרית ויעילה להקרנה של מעכבי GST פוטנציאליים במבחנה לפני כל מחקרים פונקציונליים אחרים. השלבים הדרושים כדי להעריך את המאפיינים הנמדדים הנפוצים ביותר של מעכב אנזימטי מתוארים: הריכוז מעכב 50 (IC50) כי הוא ריכוז של מעכב הנדרש כדי להקטין את הפעילות האנזימטית על ידי מחצית; ואת הקבוע של עיכוב (Ki)המייצג את קבוע שיווי המשקל של הדיסוציאציה בין מעכב האנזים, האופייני של הזיקה בין שתי מולקולות אלה. שני ערכים אלה נמדדים על-ידי רגרסיה לא ליניארית ושימוש במשוואות ספציפיות לכל מצב של עיכוב, בהתאמה. אנו גם מדגימים את ההערכה של דפוס זה של עיכוב, באמצעות מזימות Michaelis-Menten כדי לקבוע את השינוי של Vמקס ו Km לאחר תוספת שלמעכב 23,,25,,26.
אנו מספקים פרוטוקול המתאר כל שלב של אסייג אנזים GST ספקטרופוטומטרי, כדי לסנן מעכבי putative (איור 1, טבלה 1) ולכימת את העוצמה המעכבת שלהם. כמו כן הדגשנו את הקריטריונים הקריטיים ביותר שיש לשקול עבור אנזימים מדויקים המספקים תוצאות לשחזור. היתרונות העיקריים של הפרוטוקול המתואר על פני שיטות צבע אחרות או ספקטרומטריה מסה הוא כי פרוטוקול זה הוא מהיר וקל לביצוע ולספק מדידות כמותיות של פעילות GST, כמו גם את העוצמה העיכוב של מולקולות מוקרנות.
אנו מציגים את הדרך של חישוב שני הפרמטרים החשובים ביותר מיכאליס-אנטן של מעכב אנזים: IC50 ו Ki. מעכב חזק יפעיל את Ki ו IC50 הנמוך ביותר האפשרי, המציין כי הזיקה בין מעכב האנזים הוא גבוה30. כמו IC50 תלוי ריכוז אנזיםותנאי אסה 33, ייתכן שיהיה קשה להשתמש בערך זה כדי להשוות מעכבים מניסויים שונים או הושג באמצעות תנאי אסאיאחרים 34. באמצעות הקבוע של עיכוב Kאני הוא אינדיקטור טוב יותר של העוצמה המעכבת של תרכובות פוטנציאליות. Kאני יכול לשמש כדי להשוות שני מעכבים עם מצבים שונים של עיכוב, כפי שהוא מסתמך אך ורק על הזיקה בין מעכב האנזים. עם זאת, כדי לקבל מושג ברור של אופי העיכוב אחד חייב לקבוע את שני הפרמטרים של המדכא30. מדדנו IC50 של כורכומין ו Ki כמו 31.6 ± 3.6 μM ו 23.2 ± 3.2 μM, בהתאמה, המציין כי מתחם זה הוא מעכב GST חזק. תוצאות אלה אישרו את התחזיות silico, כי העריך את ערכי Ki בין 27.4 כדי 78.1 μM עבור isoforms GST אנושי שונים כורכומין.
פעילות אנזימטית או קצב תגובה וכמות אנזים
כאמור, IC50 תלוי בריכוז האנזימים, וביצוע ניסוי ברמה לא ידועה של פעילות אנזימטית עלול להוביל למסקנותשגויות 33. כדי לשלוט על גורמים אחרים, אשר עשוי להפחית פעילות מעכבת, יש לשקול גם למדוד פעילות אנזימטית עבור כל קבוצה חדשה של GSTs. לדוגמה, השפלה של אצווה אנזימטית, הנגרמת על ידי מחזורי הקפאה/הפשרה רבים מדי, עשויה להקטין את הפעילות ובכך להוביל ל-IC50 נמוך יותר גם אם הניסוי נוהל באותם תנאים. במילים אחרות, שימוש 0.01 יחידות של אנזים לא ייתן את אותן תוצאות כמו באמצעות יחידה אחת. שימוש באנזימים רבים מדי עלול להוביל לדלדול מהיר של הצוללת ולתגובה לא תהיה צורה ליניארית. פרמטר זה עלול להוביל אפוא לתוצאה לא מדויקת, מכיוון שלא ניתן יהיה לראות שינוי בספיגה לאחר זמן דגירה ארוך.
ערךK מ’
כדי להבטיח את התנאים הטובים ביותר להערכת סוג העכבה המוצגת על ידי מעכב, ריכוז המצוע חייב להיות שווה או מתחת לקבוע מיכאליס-מאנטן (Km). Km מיוצג על ידי ריכוז של העשמי הנדרש לכבוש מחצית מהאתרים הפעילים על האנזים28. לדוגמה, ריכוז טוב יותר יכול לנטרל מעכב תחרותי והערכת סוג זה של עיכוב יהיה קשה בסביבה כזו. לכן, אחד השלבים המכריעים ב מתודולוגיה זו היא קביעת Km של האנזים עבור הצוללת שנבחרה (כאן CDNB). במחקרים מסוימים, ערך זה לא נקבע וזה יכול להוביל למסקנות כוזבות על דפוס העכבה שנגרם על ידי המדכא, ואם מצב העיכוב שגוי, Kאני יחושב באופן שגוי כמו המשוואה מסתמכת על דפוסשל עיכוב 26,28. אם isoform GST שונה נבדק, הערכה חדשה של ערך Km היא חובה, כמו ערך זה הוא ייחודי עבור זוג אנזים ליגנד. כפי שהשתמשנו בריכוז של CDNB מעט נמוך יותר Km (0.2 mM), כי אנו הגדירו כמו 0.26 ± 0.08 mM, המצב התחרותי הצפוי של עיכוב כורכומין על GST נקבע במדויק.
IC50 (IC50)
השגת עקומת סיגמואידית טובה שבה ניתן להעריך את IC50 דורשת מציאת הרמה התחתונה והן ברמה העליונה. הרמה התחתונה מייצגת את הריכוזים של מעכב המספקים את הפעילות המעכבת המרבית. במקרים מסוימים, תרכובת לא יכול לעכב את האנזים באופן מלא, אפילו בריכוזים גבוהים, בגלל בעיות טכניות כגון מסיסות. עם זאת, כלים כמו פריזמה GraphPad יכול להתאים את הרמה התחתונה די מדויק. הרמה העליונה מורכבת מריכוזים של המדכא, שאינם מספיקים כדי לעכב את האנזים, ולכן הפעילות היא מקסימלית. שתי מישור אלה חיוניות לקביעת IC50, כמו גם ריכוזים בין לבין, על מנת למצוא את השיפוע של העקומה – אז IC50 ניתן לגזור מצורת עקומת סיגמואיד35. כורכומין הוא מסיס בצורה גרועה במים, ולכן הריכוז המרבי המשמש בהסכם זה מוגבל, כדי למנוע משקעים בתמיסת ההסתה. לכן, פתרונות מרוכזים פחות, אשר אינו מעכב באופן מלא את פעילות GST, שימשו. זה העלה סוגיות לקביעת הרמה התחתונה. כדי להתמודד עם בעיה זו, חזינו ערכים תחתונים בהתבסס על גרף רגרסיה לא ליניארי, אשר סיפק IC50 של 31.6 ± 3.6 μM עבור כורכומין (איור 3A). עבור חומצה אתקרינית, לא היה צורך לחזות את הערכים עבור הרמה התחתונה כמו תרכובת זו היא מסיסה בתמיסת ההסתה וIC50 נמדד ב 6.6 ± 1.1 μM.
ניתן להחיל שיטה זו על isoforms GST המבוטא ביותר באדם, כלים GSTA1, GSTM1 או GSTP1. עם זאת, פרוטוקול זה אינו מתאים לכמת את הפעילות של isoform GSTT1, כמו CDNB אינו שקוע עבור סוג משנה זה. הציון כולל 36, 37 בינתיים, ניתן לשנות במקצת את הפרוטוקול כדי להתמודד עם בעיה זו. לדוגמה , שימוש 1,2-אפוקסי-3-(4′-nitrophenoxy)פרופן (ENPP) כמצע עבור GSTT1 ומדד את כמות ההתייחדות ב 360nm במקום 340nm. 37 (37)
שלבי פרוטוקול יכול להיות מותאם ומיושם כדי לבדוק פעילות GST ובדיקות מעכב בניסויים תרבות התא. מדידה של פעילות GST על תאים שטופלו עם ובלי מעכב GST יציין אם תרכובת זו יכולה לשמש בסביבה ניסיונית כזו. זה מעניין במיוחד כאשר המדכא הוא ליפופילי. למשל, הגנו כי כורכומין הוא מעכב GST חזק באמצעות פרוטוקול זה. אף על פי כן, היישום שלה ללימודי סלולר עשוי להיות מוגבל, כמו המולקולה היא מסיסה בצורה גרועה במים ומשפיל במהירות בינוני. 31 התבוללות נוספת של פרוטוקול זה אפשרית לגבי ספציפיות אי-isoform של ה-CDNB של הצוללת. שימוש בפרוטוקול זה במחקרי תאים ייתן מידע רק על פעילות GST הכוללת, אך לא על הפעילות של סוג משנה GST מדויק. הוספת isoform ספציפית לשקוע ו/או באמצעות isoform GST רקומביננטי ספציפי יאפשר לבדוק מעכבי GST ספציפיים isoform.
לסיכום, אנו מתארים הליך מלא כדי לבדוק מעכבי GST שיש להם פוטנציאל לשמש בשילוב עם כימותרפיה אלקטרופילית. הדגשנו את השלבים הקריטיים של אנזים GST ועיכוב assay, כדי לבדוק מולקולה מעניינת פוטנציאלית ולקבוע את היעילות שלהם כמעכב עם ערכים כמותיים, IC50 ו Ki. שיטה זו יכולה להיות מיושמת על כל תרכובת putative ומבוצעת על איזופורמים GST האנושי המבוטא ביותר (GSTA1, GSTM1 ו GSTP1), או מותאם מעט לבצע מחקרי תרבות תאים עם מעכבי GST או למדוד את הפעילות של איזופורם GST מעניין אחר של בחירה.
ריאגנטים | שם | ריכוז בתמיסת ההסתה | אחרים |
המצע | CDNB (CDNB) | נמדד Km (mM) | מדולל ב-95% אתנול. ריכוז האתנול הסופי צריך להיות ≤ 5% (v/v) |
התקהלות של התקהלות | ג’י.ש.ש. | 2.5 מיליון מ’ | מדולל במים. |
הריכוז חייב לרוויה את הפתרון. | |||
מאגר | Pbs | – | pH = 7.1 |
אנזים | מאגר של isoforms GST או isoform טהור | 0.01 יחידה/מ”ל, נקבע באופן ניסיוני. | מדולל במים. |
מעכב GST | תרכובת פוטנציאלית של בחירה | IC50: 3 ריכוזים שמעכבים באופן מקסימלי, 3 שמעכבים באופן מינימלי, ו-3 באמצע. | מדולל DMSO ולאחר מכן במים, יש ריכוז סופי של DMSO ≤ 1% (v / v) |
Ki:3 ריכוזים סביב IC50. | |||
פרמטרים | |||
טמפרטורת החדר (25°C) | |||
pH = 7.1 | |||
DMSO ≤ 1% (v/v) | |||
אתנול ≤ 5% (v/v) |
טבלה 1: סיכום של reagents והפרמטרים שיש לקחת בחשבון במהלך תוואי עיכוב GST.
The authors have nothing to disclose.
עבודת מחקר זו נתמכה על ידי קרן CANSEARCH. המחברים רוצים להכיר בגברת לורנס לסן ומר יון סרמינטו לסיוע טכני, במיוחד בביצוע הניסויים המשכפלים תוך סטנדרטיזציה של ההתייענות עם מעכבים. דיונים ותשומות פוריים של מר דניס מרינו, ד”ר סימונה מלקר וד”ר ויד מלקר מוכרים מאוד. אנו מודים לד”ר פטרישיה הואזו-דיאז קרטיס על עזרתה בהקריינות של הסרטון. אנו מודים לד”ר מוטוקומאר על תשומותיו בתחזיות סיליקו. אנו מודים גם למר דארן הארט על עזרתו בקריאה של כתב היד הזה.
1-Chloro-2,4-dinitrobenzene (CDNB) | Sigma-Aldrich | 237329 | Substrate used for the GST enzymatic assay |
Corning UV-Transparent Microplates | Sigma-Aldrich | CLS3635 | Transparent plate to perform the enzymatic assay. When using 200 ul, the pathlength is 0.552 cm for this plate. |
Curcumin | Sigma-Aldrich | 8511 | Used for the results section, to test the inhibition potency of curcumin |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650 | To prepare the stock of the putative inhibitor |
DPBS | Sigma-Aldrich | D8537 | Buffer for the enzymatic reaction |
Ethanol 95% | Fisher scientific | 10542382 | To dilute the CDNB |
Glutathione S-Transferase from equine liver | Sigma-Aldrich | G6511 | Used for the results section, to test the inhibition potency of curcumin |
L-glutathione reduced (GSH) | Sigma-Aldrich | G4251 | Co-substrate for the GST enzymatic assay |
Pierce BCA Protein Assay Kit | ThermoFisher | 23225 | To quantify the amount of protein present in the enzymatic solution |
Spectramax iD3 | Molecular devices | To do spectrophotometric measurments |