Este protocolo é usado no estabelecimento e manutenção de baratas americanas gnotobióticas(Periplaneta americana)por superfície esterilizando as caixas de ovos (oothecae) antes da eclosão. Estes insetos gnotobióticos contêm seus endosímbiontos blattabacterium transmitidos verticalmente, mas têm tripas axenicas.
Os animais gnotobióticos são uma ferramenta poderosa para o estudo de controles sobre estrutura e função de microbioma. Apresentado aqui é um protocolo para o estabelecimento e manutenção de baratas gnotobióticas americanas (Periplaneta americana). Esta abordagem inclui verificações de esterilidade incorporadas para controle de qualidade contínuo. Os insetos gnotobióticos são definidos aqui como baratas que ainda contêm seu endossímbionte transmitido verticalmente (Blattabacterium), mas não possuem outros micróbios que normalmente residem em sua superfície e em seu trato digestivo. Para este protocolo, os casos de ovos (oothecae) são removidos de uma colônia de estoque (não estéril) e superfície esterilizada. Uma vez coletada e esterilizada, a oothecae é incubada a 30 °C por aproximadamente 4-6 semanas em ágar de infusão cérebro-coração (BHI) até que eles eclodam ou são removidos devido à contaminação. Ninfas escotadas são transferidas para um frasco de Erlenmeyer contendo um piso BHI, água estéril e alimentos de rato estéreis. Para garantir que as ninfas não estejam abrigando micróbios que não são capazes de crescer em BHI nas condições dadas, uma medida adicional de controle de qualidade usa o polimorfismo de comprimento de fragmento (RFLP) para testar micróbios não-simbióticos. As ninfas gnotobióticas geradas usando essa abordagem podem ser inoculadas com comunidades microbianas simples ou complexas e usadas como ferramenta em estudos de microbioma intestinal.
Animais gnotobióticos provaram ser ferramentas inestimáveis para estudos de microbioma1,2,3. Animais sem germes e de flora definida permitiram a elucidação de interações hospedeira-micróbios, incluindo respostas imunológicas hospedeiras, maturação epitelial intestinal e metabolismo hospedeiro1,4,5,6,7. Animais gnotobióticos inoculados com uma comunidade simplificada também têm auxiliado em uma compreensão mais completa das interações micróbios-micróbios em uma comunidade intestinal, especificamente na desvendação de relações transversais e antagônicas8,9,10,11. O atual sistema modelo preferido para estudos no microbioma intestinal dos mamíferos é o modelo murino. Embora este sistema tenha sido vital nas descobertas acima descritas, uma deficiência fundamental é o custo envolvido. Equipamentos especializados e técnicos altamente treinados são necessários para estabelecer e manter uma instalação gnotobiótica. Isso, em combinação com cuidados extras que devem ser dados a todos os aspectos da manutenção animal gnotobiótica, faz com que o animal gnotobiótico custe de dez a vinte vezes mais para procriar do que um modelo animal padrão12. Devido aos altos custos, muitos pesquisadores podem não conseguir pagar um modelo gnotobiótico de murina. Além disso, embora os modelos murine possam ser a escolha mais amplamente aceita para estudos que buscam traduzir para a saúde humana, ainda existem muitas diferenças fisiológicas e morfológicas entre as entranhas humanas e do camundongo13. Claramente nenhum modelo singular é suficiente para responder ao número cada vez maior de perguntas sobre os muitos aspectos do microbioma intestinal.
Os modelos de insetos são uma alternativa mais barata devido ao seu menor custo de manutenção em comparação com as espécies de mamíferos. Extensa pesquisa sem germes e gnotobióticas em uma variedade de espécies de insetos levou ao desenvolvimento de múltiplos modelos comumente usados. Mosquitos e Drosophila são modelos comuns para o trabalho sem germes devido à sua relevância para doenças globais e tratos genéticos14,15. Outro sistema de modelo emergente é o da abelha-,dada a sua importância na pesquisa de polinização e socialidade16. No entanto, muitos desses insetos comumente usados não têm a complexidade taxonômica vista nas comunidades intestinais de mamíferos17,limitando sua capacidade de modelar interações de ordem mais alta. Não só a diversidade total de micróbios encontrados no intestino de baratas americanas é mais semelhante aos mamíferos, mas muitos dos micróbios presentes no intestino das baratas pertencem a famílias e filos que são comumente encontrados na microbiota intestinal de mamíferos e humanos18. O hindgut da barata também é funcionalmente análogo ao intestino grosso dos mamíferos, pois é uma câmara de fermentação densamente embalada com bactérias para auxiliar na extração de nutrientes19,20. Finalmente, a natureza onívora das baratas permite uma diversidade de regimes alimentares que não seria possível com especialistas dietéticos.
As baratas americanas podem ser um sistema modelo útil para a compreensão das comunidades microbianas intestinais em organismos superiores, mas o status da barata como praga também torna esse sistema relevante para o controle de pragas21. Aproveitar o conhecimento fundamental da influência da comunidade intestinal na saúde das baratas e na fisiologia auxilia no desenvolvimento de novas técnicas para o manejo de pragas.
O objetivo deste método é traçar uma descrição abrangente do estabelecimento e manutenção de baratas gnotobióticas americanas(Periplaneta americana),mas este protocolo poderia ser usado para gerar ninfas de qualquer barata oviparada. Inclui um método para uma coleta eficiente e não invasiva de oothecae maduro, e uma técnica não destrutiva para monitorar o estado gnotobiótico dos insetos22,23,24. Enquanto métodos anteriores de alcançar e manter baratas gnotobióticas descrevem a coleção ootheca23,24,25,26,27, a maturidade ootheca é interpretada em termos de pistas específicas de espécies (em Blattella germanica22,24,25), ou não explicitamente descrita27,28, dificultando a implementação para aqueles que não estão familiarizados com o sistema. Uma vez que o método descrito aqui usa oothecae naturalmente descartado, o erro de remover ovos prematuramente está ausente. Este protocolo contém métodos de controle de qualidade dependentes da cultura e independentes da cultura, e o método dependente da cultura não requer sacrificar insetos. Finalmente, este método reúne informações de múltiplos estudos de baratas gnotobióticas para criar um protocolo abrangente e abrangente com todas as informações necessárias para alcançar e manter baratas gnotobióticas.
Outros métodos que descrevem a geração de baratas gnotobióticas não descreveram a coleta de oothecae ou usaram referências específicas para outras espécies de baratas para indicar quando a oothecae poderia ser removida da mãe23,25,26. Originalmente, oothecae foram coletados da cama de cavacos de madeira nos tanques de estoque, resultando em taxas de escotilha muito baixas (~10%) em comparação com oothecae não esterilizado (47%)29. Isso é provável devido ao fato de que oothecae não-esqueca se acumula ao longo do tempo na gaiola de estoque, e não há nenhuma maneira de verificar a idade ou viabilidade da ootheca. A implantação da abordagem “maternidade” permite a coleta de oothecae recém-depositado de idade conhecida. Isso facilita ainda mais o planejamento experimental, já que o pesquisador pode antecipar tempos prováveis de eclosão para oothecae individual. Outra modificação dos protocolos iniciais e publicados inclui a incubação de oothecae e ninfas em câmaras semi-seladas também contendo uma solução de cloreto de sódio supersaturado. A presença da solução mantém uma umidade relativa de aproximadamente 75%30. Oothecae são rotineiramente incubados a 30 °C, o que tem sido mostrado para minimizar o número de dias necessários para a incubação, ao mesmo tempo em que maximiza a viabilidade dos embriões e o número de ninfas produzidas por ootheca31. Após a eclosão, as ninfas gnóbiticas são rotineiramente cultivadas no banco a temperatura ambiente de laboratório e condições ambientais, embora as câmaras controladas pela umidade sejam novamente utilizadas para experimentos críticos. Após o estabelecimento dessas alterações na coleta e incubação da ootheca, as taxas de escotilha aumentaram para aproximadamente 41% (n = 51), sem incluir a oothecae removida devido à contaminação. Uma rota potencial para maior otimização das taxas de escotilha pode incluir a ampliação do tempo entre a coleta de ootheca e a esterilização. A cutícula da caixa do ovo pode não ser totalmente bronzeada na versão inicial32, e, portanto, pode ser permeável para soluções utilizadas durante a esterilização dentro de 24 horas após a queda.
O protocolo de esterilização utilizando ácido peracético de 0,1% foi adaptado de Doll et al.25. Outros estudos documentaram técnicas alternativas para esterilizar oothecae23,26. As taxas de contaminação baseiam-se no método não destrutivo de incubação da oothecae em uma inclinação bhi. Esta abordagem é altamente vantajosa, pois permite a identificação rápida e a remoção de oothecae contaminado. A maioria dos protocolos anteriores testa organismos culturaláveis, emplacando fezes ou homogeneizando ninfa em mídia bacteriológica e verificando o crescimento22,23,25,27,28,33. Em pelo menos um caso, o método para testar o estado gnotobiótico não foi totalmente descrito26. Exceto Clayton, que adicionou uma pequena laje de teste de esterilidade de garrafas médias para a criação24, métodos anteriores22,23 insetos gnóbitos alojados em mídia bacteriológica apenas por curtos períodos de tempo para avaliar inicialmente o protocolo de esterilização.
A habitação contínua das ninfas resultantes no meio BHI como medida de controle de qualidade incorporada permite que seu status gnotobiótico seja monitorado em tempo semirreal — uma técnica não vista na maioria dos métodos anteriores22,23. Isso é especialmente útil para experimentos de longo prazo que requerem acesso a ninfas gnotobióticas. Se o piso BHI sob ninfas aparecer contaminado com crescimento bacteriano ou fúngico, o frasco deve ser descartado. Esse tipo de contaminação normalmente ocorre ao descobrir os frascos em ninfas de água, mas também pode surgir das fezes no caso de oothecae ou alimentos insuficientemente esterilizados. O uso de uma coifa de fluxo laminar ao regar melhora a taxa de contaminação causada pela descoberta de frascos.
Como nem todos os organismos contaminantes podem crescer aerobicamente no meio BHI, é necessário um método adicional independente de cultura de teste de esterilidade. Uma abordagem potencial é a microscopia27,mas essa abordagem pode ser intensiva em mão-de-obra. Outros protocolos utilizam técnicas baseadas em sequências para detectar organismos que podem escapar da cultura14,23,27,28. No entanto, tais abordagens são muitas vezes caras e difíceis de interpretar, pois os resultados de abordagens de sequenciamento de alto rendimento podem ser facilmente impactados pela contaminação de baixo nível dos reagentes34 e do código de barraspulando 35. Em vez disso, foi desenvolvida uma nova abordagem que usa amplificação PCR do gene 16S rRNA em combinação com o polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição para visualizar tanto o endossímbionte quanto qualquer siríionto intestinal contaminante. Esta técnica inclui um controle interno de PCR, uma vez que o gene 16S de Blattabacteriumfoi sequenciado, e seu padrão de banda deve estar presente tanto em insetos gnóbitos quanto não téris. Como o padrão de restrição do endossímbionte pode ser previsto a partir de sua sequência de genoma36,não há necessidade de sequenciar os amplicons ou os fragmentos de restrição, a menos que a identificação de qualquer contaminante seja desejada. A versão atual deste protocolo exige que uma ninfa seja sacrificada para PCR/RFLP, mas essa técnica também poderia ser usada em fezes como medida não destrutiva. No entanto, não incluirá um controle embutido, pois as fezes não devem conter muito Blattabacterium.
Um componente facilmente modificável, mas crítico, da criação de animais gnóbitos é a dieta. Embora o ágar bhi possa servir como uma fonte temporária de alimento para os insetos, descobriu-se que resulta em déficits de crescimento substanciais entre as ninfas quando usado como a única fonte de alimento por longos períodos. Embora dietas diversas tenham sido testadas, a comida de rato autoclavável é recomendada como uma dieta de rotina para a manutenção de insetos gnóbitos. Dietas não especificamente formuladas para esterilização eram muitas vezes difíceis de tornar totalmente estéreis, e muitas dietas animais de laboratório estéreis ou autoclaváveis foram encontradas para exibir um rápido crescimento fúngico em condições não estéreis. Essa tendência de degradação sob condições não estérias tornou-os inadequados para uso em experimentos que comparavam diretamente insetos gnóbitos e nãognóbitos. A dieta recomendada permite o uso de uma dieta consistente entre ninfas gnotobióticas e padrão, facilitando a comparação de características — como taxas de crescimento — entre os dois grupos.
Como outros observaram27,as ninfas gnotobióticas crescem mais lentamente do que suas contrapartes não-ostúris. Uma comparação entre os comprimentos do corpo de gnotobióticas (n = 105) e ninfas nãosterianas (n = 50) alimentou o mesmo, a dieta autoclaved roedor e mantida à temperatura ambiente revela que as ninfas não-orínias crescem em média 0,059 mm/dia, enquanto as ninfas gnotobióticas crescem 0,028 mm/dia (p < 0,0001)(Figura 5). A presença de microbiota intestinal em P. americana tem sido demonstrada para alterar a taxa metabólica dos insetos37, e as comunidades intestinais em geral são pensadas para afetar a absorção de nutrientes38,39. Essas razões suportam as diferenças observadas na taxa de crescimento das ninfas gnóbiticas e não asséiles.
Uma possível limitação a essa técnica é que as ninfas gnotobióticas podem não atingir a maturidade sexual, pois as coortes estéreis mais antigas têm mais de 10 meses e atingiram apenas a sétima estrela (de 10; 11 na idade adulta) como aproximadas pelo comprimento corporal40. Essas coortes mais antigas não estão na dieta autoclaved de ratos, mas, em vez disso, comem comida de rato irradiada, uma dieta que contém muita umidade para alimentar coortes não-estérias sem crescimento excessivo de moldes. Ninfas não-árteis em uma dieta alimentar de cães não esterilizadas foram encontradas para atingir a idade adulta após 9-10 meses em condições laboratoriais (temperatura ambiente e umidade). Coortes de ninfas gnóbóticas e não-ostúiles na comida de rato compartilhada e autoclavada têm atualmente menos de 7 meses de idade, estima-se que os insetos não-estéreis sejam o sétimo instar (média: 16,7 mm) enquanto os insetos estéreis são estimados como quintos instar (média: 11,2 mm). Como resultado, não podemos, ainda, verificar se nossas baratas gnotobióticas podem se reproduzir com sucesso. No entanto, dada a facilidade com que novas coortes gnotobióticas podem ser estabelecidas usando essa abordagem, este método mostra grande promessa mesmo na ausência de reprodução comprovada de insetos gnótobitos.
Em conclusão, este protocolo fornece uma ferramenta versátil que permite aos pesquisadores de microbioma operar sua própria “instalação” gnotobiótica de baixo custo usando materiais de laboratório comuns. Essa abordagem pode ser usada para gerar baratas gnotobióticas para experimentos que examinam o papel da microbiota na formação do comportamento hospedeiro, imunidade, desenvolvimento e respostas ao estresse21,26,27. Esses insetos gnotobióticos também podem ser inoculados com comunidades sintéticas ou xenobióticas e posteriormente utilizados como sujeitos para estudos de microbioma intestinal23,28. Além disso, elementos dessa abordagem, incluindo o uso de câmaras de incubação bacteriológicas alinhadas à mídia como uma verificação de esterilidade incorporada, são generalizáveis a outros sistemas de modelo e podem facilitar a manutenção rotineira de animais gnóbitos em instalações de menor escala.
The authors have nothing to disclose.
Esta publicação foi apoiada pelo Instituto Nacional de Ciências Médicas Gerais dos Institutos Nacionais de Saúde sob o prêmio número R35GM133789. O conteúdo é de responsabilidade exclusiva dos autores e não representa necessariamente a visão oficial dos Institutos Nacionais de Saúde. Os autores gostariam de reconhecer Josey Dyer por rastrear taxas de esterilização, taxas de escotilha e taxas de crescimento das baratas gnotobióticas.
2X master mix | New England BioLabs | M0482 | OneTaq MasterMix |
Autoclavable rat chow | Zeigler | NIH-31 Modified Auto | |
Bacterial DNA extraction kit | Omega Bio-Tek | D-3350 | E.Z.N.A. Bacterial DNA kit; includes lysozyme, glass beads, proteinase K, buffers (proteinase K, binding, wash, elution), DNA columns, 2-mL collection tube |
binding buffer | Omega Bio-Tek | PD099 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("HBC" buffer) |
brain-heart infusion (BHI) broth | Research Products International | B11000 | |
Delicate task wipes | KimWipe | JS-KCC-34155-PK | KimWipes |
DNA purification kit | Omega Bio-Tek | D6492 | E.Z.N.A. Cycle Pure kit; D6493 may also be used; includes buffers (purifying ,wash, elution) |
elution buffer | Omega Bio-Tek | PDR048 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
glass beads | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
Hybridization oven | UVP | 95-0330-01 | we use a hybridization oven for preheating elution buffer, but a water bath could probably also be used |
Laminar flow biological safety cabinet | NuAire, Inc. | NU-425-400 | Protocol refers to this as "laminar flow hood" for brevity |
lysozyme | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
peracetic acid stock solution (32%) | Sigma-Aldrich | 269336 | |
Petroleum jelly | Vaseline | n/a | |
proteinase K buffer | Omega Bio-Tek | PD061 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("TL buffer") |
purifying buffer | Omega Bio-Tek | PDR042 | included in Omega Biotek's CyclePure kit ("CP" buffer) |
RsaI | New England BioLabs | R0167 | Includes CutSmart (digestion) buffer |
Secondary container | n/a | n/a | a plastic container with a lid (such as a Kritter Keeper) works well for this (25cm long x 15cm wide x 22cm high); it should be large enough to fit BHI slants and test tubes |
spectrophotometer | ThermoFisher | ND-2000 | Catalog info is for NanoDrop2000 |
thermal shaker | Eppendorf | EP5386000028 | Thermomixer R |
Tris-EDTA | Fisher | BP1338-1 | 10 nm Tris, 1 mM EDTA, pH 8 |
wash buffer | Omega Bio-Tek | PDR044 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("DNA wash" buffer) |
Woodchip bedding | P.J. Murphy Forest Products | Sani-Chips |