このプロトコルは、孵化前に卵のケース(oothecae)を表面殺菌することによって、グノトビオティックアメリカゴキブリ(ペリプラネタアメリカーナ)を確立し、維持するために使用されます。これらのグノトバイオティクス昆虫は、垂直に伝染した ブラタバクテリウム 内介生物を含むが、無菌の根性を有する。
グノトビオティック動物は、マイクロバイオームの構造と機能に関するコントロールの研究のための強力なツールです。ここで提示は、グノトビオティックアメリカゴキブリの確立と維持のためのプロトコルです (ペリプラネタアメリカーナ).このアプローチには、継続的な品質管理のための組み込みの無菌検査が含まれます。グノトビオティック昆虫は、垂直に透過した内膜バイオエント(Blattabacterium)をまだ含むゴキブリとして定義されていますが、通常は表面とその消化管に存在する他の微生物が欠いています。このプロトコルでは、卵の場合(オテカエ)は、(無菌)ストックコロニーから除去され、表面滅菌される。いったん採取して滅菌すると、オーテカイは、孵化するか、汚染のために除去されるまで、脳心注入(BHI)寒天で約4〜6週間、30°Cでインキュベートされます。孵化したニンフはBHIの床、無菌水および無菌ラットの食糧を含んでいるアーレンマイヤーフラスコに移される。ニンフが所定の条件でBHIで増殖できない微生物を収容していないことを確認するために、追加の品質管理措置は、非endosymbiotic微生物をテストするために制限断片長ポリモーフィズム(RFLP)を使用します。このアプローチを使用して生成されたグノトビオティックニンフは、単純または複雑な微生物群集で接種し、腸内微生物叢研究のツールとして使用することができます。
グノトビオティック動物は、マイクロバイオーム研究1、2、3のための非常に貴重なツールであることが証明されています。無菌および定義された植物相動物は、宿主免疫応答、腸上皮成熟、および宿主代謝1、4、5、6、7を含む宿主微生物相互作用の解明を可能にした。単純化されたコミュニティを接種したグノトビオティック動物はまた、腸内の微生物と微生物の相互作用、特に交差摂食および拮抗関係を解明する際に、8、9、10、11をより完全に理解するのを助けた。哺乳類の腸内微生物叢における研究のための現在の好ましいモデルシステムは、マウスモデルである。このシステムは、上記の発見において不可欠でしたが、重要な欠点は、関連するコストです。特別な装置と高度な訓練を受けた技術者は、グノトバイオティクス施設を設立し、維持する必要があります。これは、動物動物の動物維持のあらゆる側面に与えられなければならない特別な注意と組み合わせて、動物動物を標準的な動物モデル12よりも10〜20倍の費用がかかるグノトビオティック動物を引き起こす。高コストのため, 多くの研究者は、グノトビオティックマウスモデルを買う余裕がないかもしれません.さらに、マウスモデルは、人間の健康に翻訳することを探している研究のための最も広く受け入れられている選択肢かもしれないが、人間とマウスの間の多くの生理学的および形態学的な違いがあります 13.明らかに、腸内微生物叢の多くの側面に関する増え続ける質問に答えるのに十分な特異なモデルはありません。
昆虫モデルは、哺乳類の種と比較してメンテナンスコストが低いため、安価な代替品です。さまざまな昆虫種の広範な無菌およびグノトビオティック研究は、複数の一般的に使用されるモデルの開発につながっている。蚊とショウジョウバエは、世界的な疾患と遺伝的な難病への関連性のために生殖不能な仕事のための一般的なモデルである14,15.もう一つの新興モデルシステムは、ミツバチ(アピス・メリベラ)の、受粉と社会性研究におけるその重要性を考えると16である。しかし、これらの一般的に使用される昆虫の多くは、哺乳類の腸内群17に見られる分類学的複雑さを欠き、より高次の相互作用をモデル化する能力を制限している。アメリカのゴキブリの腸内に見られる微生物の多様性の総量は哺乳類に似ているだけでなく、ゴキブリの腸内に存在する微生物の多くは、哺乳類およびヒトの腸内微生物叢に一般的に見られる家族およびフィラに属する。ゴキブリの後腸はまた、哺乳類の大腸に機能的に類似しており、栄養分19,20の抽出を補助する細菌を密集した発酵室である。最後に、ゴキブリの雑食性は、食事の専門家では不可能であろう食事療法の多様性を可能にします。
アメリカのゴキブリは、高等生物の腸内微生物群集を理解するための有用なモデルシステムであり得るが、ゴキブリの害虫としての地位は、このシステムを害虫駆除21に関連する。腸内のコミュニティのゴキブリの健康と生理学への影響に関する基本的な知識を活用することは、害虫管理のための新しい技術の開発に支援します。
この方法の目的は、グノトビオティックアメリカゴキブリ(ペリプラネタアメリカーナ)の確立と維持の包括的な説明を概説することですが、このプロトコルは、任意の排卵ゴキブリのニンフを生成するために使用することができます。成熟したオテカエの効率的で非侵襲的な収集のための方法と、昆虫22、23、24のグノトバイオティクス状態を監視する非破壊技術が含まれる。グノトビオゴキブリを達成し維持する以前の方法は、oothecaコレクション23、24、25、26、27を記述しているが、ootheca成熟度は、種固有の手がかり(Blattellaゲルマニカ22、24、25)の観点から解釈されるか、または明示的に記述されていない27、28であり、システムに不慣れな人にとっては実装が困難である。ここで説明する方法は自然に落とされたウーテカエを使用するため、卵を早期に除去する誤差は存在しない。このプロトコルには、培養依存的な品質管理方法と文化依存性の両方の方法が含まれ、培養に依存する方法は、昆虫を犠牲にする必要はありません。最後に、この方法は、複数のグノトビオティックゴキブリ研究からの情報をまとめ、Gnotobioticゴキブリを達成し維持するために必要なすべての情報を含む包括的なプロトコルを作成します。
グノトビオゴキブリの生成を記述する他の方法は、オテカ科のコレクションを記述しなかったか、またはオテカエが母親23、25、26からいつ取り除くことができるかを示すために他のゴキブリ種に特有のベンチマークを使用した。もともと、ストックタンクのウッドチップ寝具からオテカエを回収し、非常に低いハッチレート(〜10%)を生み出した。非滅菌オーテカエ(47%)29と比較して。これは、孵化していないウーテカイがストックケージに時間の経過とともに蓄積し、oothecaの年齢や生存率を検証する方法がないためである可能性があります。「産科病棟」アプローチの実施は、既知の年齢の新しく堆積したオテカエの収集を可能にする。これは、研究者が個々のオテカエの可能性が高いハッチ時間を予測することができるので、実験計画をさらに容易にする。初期および公表されたプロトコルからの別の修飾は、過飽和塩化ナトリウム溶液を含む半密封室におけるオテカおよびニンフのインキュベーションを含む。溶液の存在は、約75%30の相対湿度を維持する。Oothecaeは30°Cで日常的にインキュベートされ、インキュベーションに必要な日数を最小限に抑える一方で、胚の生存率およびオオテカ31あたりに産生されるニンフの数を最大化することが示されている。孵化後、グノトビオティックニンフは実験室の室温と周囲の条件でベンチトップで日常的に培養されますが、湿度制御チャンバーは再び重要な実験に利用されます。これらの変更をオテカコレクションおよびインキュベーションに設定した後、ハッチレートは約41%(n = 51)に増加し、汚染によるウーテカを含まない。ハッチレートのさらなる最適化への潜在的な経路は、ウーテカの収集と滅菌の間の時間を延長することを含んでよい。卵ケースのキューティクルは、初期放出32で完全に日焼けしないことがあり、したがって、落とされた24時間以内に殺菌中に使用される溶液に透過性がある。
0.1%過酢酸を用いた殺菌プロトコルをDollらから適合させ、25.他の研究は、oothecae23、26を殺菌するための代替技術を文書化しています。汚染率は、BHI傾斜でオテカエをインキュベートする非破壊法に基づいています。このアプローチは、汚染されたオテカエの迅速な同定と除去を可能にするので非常に有利である。ほとんどの以前のプロトコルは、細菌学的培地上の便またはニンフホモゲネートをめっきし、成長22、23、25、27、28、33をチェックすることによって、伝道可能な生物をテストする。少なくとも1つのケースでは、gnotobioticの状態をテストするための方法は完全に説明されなかった26.ボトル24を飼育するために滅菌検査培地の小さなスラブを添加したクレイトンを除いて、以前の方法22、23は、最初に殺菌プロトコルを評価するために短期間だけ細菌学的培地上にグノトビオティック昆虫を収容した。
組み込みの品質管理措置としてBHI培地に生じるニンフのハウジングを継続することで、そのグノトバイオティクスの状態を半リアルタイムで監視することができます。これは、グノトビオティックニンフにアクセスする必要がある長期実験に特に有用です。ニンフの下のBHI床が細菌または真菌の成長で汚染されているように見える場合、フラスコは廃棄されるべきです。このタイプの汚染は、通常、水のニンフにフラスコを発見するときに発生しますが、不十分に殺菌されたオテカエまたは食品の場合には、便から生じる可能性もあります。水を入れる際の層流フードの使用は、フラスコの発見による汚染率を向上させます。
すべての汚染生物がBHI培地上で好気的に成長するわけではないので、無菌検査の追加の培養非依存的な方法が必要である。考えられるアプローチの 1 つは顕微鏡27ですが、このアプローチは労力を要する場合があります。他のプロトコルは、シーケンスベースの技術を使用して、文化14、23、27、28を逃れる可能性のある生物を検出します。しかし、このようなアプローチは、高スループットシーケンシングアプローチの結果が試薬34およびバーコードホッピング35の低レベル汚染によって容易に影響を受けやすいため、高価で解釈が困難であることが多い。代わりに、16S rRNA遺伝子のPCR増幅と制限断片長多型を組み合わせて、endosymbiontと汚染された腸の共生生物の両方を視覚化する新しいアプローチが開発されました。この技術には、ブラッタバクテリウムの16S遺伝子が配列決定されているため、内部PCRコントロールが含まれており、そのバンディングパターンは、グノトバイオティクスおよび非生殖昆虫の両方に存在すべきである。endosymbiontの制限パターンはそのゲノム配列36から予測することができるので、いかなる汚染物質の同定が望まなければ、アンプリコンまたは制限断片を配列する必要はない。このプロトコルの現行バージョンでは、PCR/RFLPに対してニンフを犠牲にすることが求められていますが、この技術は非破壊対策として便でも使用できます。しかし、それは、便が多くのBlattabacteriumを含んではならないので、組み込みのコントロールを含み込まない。
グノトビオティック動物を飼育する追加の簡単に変更可能でありながら重要なコンポーネントは、食事です。BHI寒天は昆虫の一時的な食料源として機能することができるが、長期間の唯一の食料源として使用すると、ニンフの間で実質的な成長赤字をもたらすことが判明した。多様な食事が試みられてきたが、オートクレーブ可能なラットチャウは、グノトバイオティクス昆虫の維持のための日常的な食事として推奨される。滅菌のために特別に処方されていない食事は、しばしば完全に無菌をレンダリングすることは困難であり、多くの無菌またはオートクレーブ可能な実験室動物の食事は、無菌状態下で急速な真菌の成長を示すことが判明した。この傾向は、非無菌状態下で分解する傾向があり、グノトビオティックと非グノトバイオティクスの昆虫を直接比較する実験では不適当でした。推奨される食事は、2つのグループ間の特性(例えば、成長率)の比較を促進する、gnotobioticと標準ニンフの間で一貫した食事を使用することを可能にします。
他の人が観察しているように 27,グノトバイオティクスニンフは、彼らの非生殖力の対応よりもゆっくりと成長します。.グノトビオティック(n = 105)と無菌ニンフ(n = 50)の体長を比較すると、同じ、オートクレーブげっ歯類の食事を与え、室温に保たれて、無菌ニンフは平均0.059 mm/日に成長し、グノトバイオティックニンフは0.028mm/日(p<000)成長することを明らかにする。P.アメリカーナにおける腸内微生物叢の存在は、昆虫の代謝率37を変化させると示されており、腸内群は一般的に栄養吸収38,39に影響を及ぼすと考えられている。これらの理由は、グノトビオティックと非生殖リンパの成長速度の観察された違いを支持する。
この技術の可能な制限は、最も古い無菌コホートが生後10ヶ月以上であり、体長40に近似された7番目のインスター(10のうち10個、成人期である11)に達しているので、グノトバイオティックニンフが性的成熟に達しない可能性があることである。これらの最も古いコホートは、オートクレーブラットダイエットではなく、照射されたラットチャウ、過剰なカビの成長なしに非生殖コホートに供給するにはあまりにも多くの水分を含む食事を食べます。無滅菌ドッグフードダイエットの無菌ニンフは、実験室の条件(室温と湿度)の下で9〜10ヶ月後に成人に達することが判明しました。共有されたオートクレーブラットチャウのグノトビオティックおよび非無菌ニンフのコホートは現在7ヶ月未満であり、無菌昆虫は7番目のインスター(平均:16.7mm)であると推定され、無菌昆虫は5番目のインスター(平均:11.2mm)であると推定される。その結果、私たちのグノトビオティックゴキブリが正常に再現できるかどうかをまだ確認することはできません。しかし、この方法を用いて新しいグノトビオティックコホートを確立できる容易さを考えると、この方法は、ノトビオティック昆虫の実証された再生がない場合でも大きな約束を示す。
結論として、このプロトコルは、マイクロバイオームの研究者が一般的な実験室材料を使用して独自の低コストのグノトビオティック「施設」を操作することを可能にする汎用性の高いツールを提供します。このアプローチは、宿主の挙動、免疫、発達、およびストレス応答21、26、27の形成における微生物叢の役割を調べる実験のためのグノトビオティックゴキブリを生成するために使用され得る。これらのグノトバイオティクス昆虫はまた、合成または異種生物群集を接種し、その後腸内微生物叢研究23,28の対象として使用することができる。さらに、このアプローチの要素は、組み込みの滅菌検査として細菌学的媒体に並んだインキュベーションチャンバーの使用を含め、他のモデルシステムに一般化可能であり、小規模な施設でのグノトビオティック動物の定期的なメンテナンスを容易にすることができる。
The authors have nothing to disclose.
本書は、国立衛生研究所の国立総合医学研究所が、受賞番号R35GM133789の下で支援を受けました。内容は著者の責任であり、必ずしも国立衛生研究所の公式見解を表すものではありません。著者らは、生殖不能率、ハッチ率、及び生殖神経ゴキブリの増殖率を追跡したジョゼイ・ダイアーを認めさせたい。
2X master mix | New England BioLabs | M0482 | OneTaq MasterMix |
Autoclavable rat chow | Zeigler | NIH-31 Modified Auto | |
Bacterial DNA extraction kit | Omega Bio-Tek | D-3350 | E.Z.N.A. Bacterial DNA kit; includes lysozyme, glass beads, proteinase K, buffers (proteinase K, binding, wash, elution), DNA columns, 2-mL collection tube |
binding buffer | Omega Bio-Tek | PD099 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("HBC" buffer) |
brain-heart infusion (BHI) broth | Research Products International | B11000 | |
Delicate task wipes | KimWipe | JS-KCC-34155-PK | KimWipes |
DNA purification kit | Omega Bio-Tek | D6492 | E.Z.N.A. Cycle Pure kit; D6493 may also be used; includes buffers (purifying ,wash, elution) |
elution buffer | Omega Bio-Tek | PDR048 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
glass beads | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
Hybridization oven | UVP | 95-0330-01 | we use a hybridization oven for preheating elution buffer, but a water bath could probably also be used |
Laminar flow biological safety cabinet | NuAire, Inc. | NU-425-400 | Protocol refers to this as "laminar flow hood" for brevity |
lysozyme | Omega Bio-Tek | n/a | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit |
peracetic acid stock solution (32%) | Sigma-Aldrich | 269336 | |
Petroleum jelly | Vaseline | n/a | |
proteinase K buffer | Omega Bio-Tek | PD061 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("TL buffer") |
purifying buffer | Omega Bio-Tek | PDR042 | included in Omega Biotek's CyclePure kit ("CP" buffer) |
RsaI | New England BioLabs | R0167 | Includes CutSmart (digestion) buffer |
Secondary container | n/a | n/a | a plastic container with a lid (such as a Kritter Keeper) works well for this (25cm long x 15cm wide x 22cm high); it should be large enough to fit BHI slants and test tubes |
spectrophotometer | ThermoFisher | ND-2000 | Catalog info is for NanoDrop2000 |
thermal shaker | Eppendorf | EP5386000028 | Thermomixer R |
Tris-EDTA | Fisher | BP1338-1 | 10 nm Tris, 1 mM EDTA, pH 8 |
wash buffer | Omega Bio-Tek | PDR044 | included in Omega Biotek's bacterial DNA extraction kit ("DNA wash" buffer) |
Woodchip bedding | P.J. Murphy Forest Products | Sani-Chips |