Oikopleura dioica ist ein Tunika-Modellorganismus in verschiedenen Bereichen der Biologie. Wir beschreiben Probenahmemethoden, Artenidentifikation, Kultivierungsaufbau und Kultivierungsprotokolle für die Tiere und Algenfutter. Wir heben Schlüsselfaktoren hervor, die zur Stärkung des Kultursystems beigetragen haben, und diskutieren die möglichen Probleme und Lösungen.
Oikopleura dioica ist ein planktonisches Chordate mit außergewöhnlicher Filter-Fütterungsfähigkeit, schneller Erzeugungszeit, konservierter früher Entwicklung und einem kompakten Genom. Aus diesen Gründen gilt er als nützlicher Modellorganismus für marine ökologische Studien, evolutionäre Entwicklungsbiologie und Genomik. Da die Forschung oft eine stetige Versorgung mit tierischen Ressourcen erfordert, ist es sinnvoll, ein zuverlässiges, wartungsarmes Kultursystem aufzubauen. Hier beschreiben wir eine Schritt-für-Schritt-Methode zur Etablierung einer O. dioica-Kultur. Wir beschreiben, wie potenzielle Probenahmestellen, Sammelmethoden, Zieltieridentifikation und die Einrichtung des Kultivierungssystems ausgewählt werden. Wir beraten Sie bei der Fehlerbehebung auf der Grundlage unserer eigenen Erfahrungen. Wir heben auch kritische Faktoren hervor, die dazu beitragen, ein robustes Kultursystem aufrechtzuerhalten. Obwohl das hier bereitgestellte Kulturprotokoll für O. dioicaoptimiert ist, hoffen wir, dass unsere Probenahmetechnik und unser Kulturaufbau neue Ideen für die Aufrechterhaltung anderer fragiler pelagischer Wirbellose inspirieren werden.
Modellorganismen haben bei der Behandlung vieler biologischer Fragen, einschließlich der Fragen im Zusammenhang mit Entwicklung, Genetik und Physiologie, eine entscheidende Rolle dabei geleistet. Darüber hinaus erleichtern zusätzliche Modellorganismen neue Entdeckungen und sind daher entscheidend, um ein besseres Verständnis der Natur zu erreichen1,2. Marine Zooplankton sind verschiedene Gruppen von Organismen, die eine wichtige Rolle in Ozean-Ökosystemespielen 3,4,5,6. Trotz ihrer Fülle und ökologischen Bedeutung sind gelatinöse Organismen wie planktonische Tunikaten in Plankton-Biodiversitätsstudien oft unterrepräsentiert, weil ihre Transparenz und Fragilität die Feldsammlung und -identifikation zu einer Herausforderung macht7,8. Angepasste Probenahmeverfahren und Laborkultivierung ermöglichen eine genauere Beobachtung der Tiere in vitro, was das Wissen in der Biologie der planktonischen Tunikaten9,10,11,12gefördert hat.
Larvaceans (Appendicularians) sind eine Klasse von freischwimmenden Meerestunika, die rund 70 beschriebene Arten weltweitumfassen 8,13. Da sie eine der am häufigsten vorkommenden Gruppen innerhalb der Zooplanktongemeinschaften14,15,16,17sind, stellen Larven eine primäre Nahrungsquelle für größere planktonische Organismen wie Fischlarven18,19dar. Im Gegensatz zu Ascidians behalten die sessile Tunikaten-Larvaceane eine Kaulquappen-ähnliche Morphologie und bleiben planktonisch ihr ganzes Leben lang20. Jedes Tier lebt in einer selbst gebauten, komplizierten Filter-Fütterungsstruktur, die als Haus bekannt ist. Sie akkumulieren Partikel in ihren Häusern, indem sie Wasserströmungen durch die wellige Bewegung ihrer Schwänze erzeugen21. Verstopfte Häuser werden den ganzen Tag über entsorgt, von denen einige Kohlenstoffaggregate bilden und schließlich auf den Meeresboden sinken22; Daher spielen Larven eine wichtige Rolle beim globalen Kohlenstofffluss23. Die meisten Arten leben berichten, in der pelagischen Zone innerhalb der oberen 100 m der Wassersäule13zu leben; jedoch ist der riesige Larven Bathochordaeus bekannt, die Tiefen von 300 m24bewohnen. Eine Studie über Bathochordaeus in Monterey Bay, Kalifornien, ergab, dass die Tiere auch als biologischer Vektor von Mikroplastik dienen, was auf eine potenzielle Bedeutung für das Verständnis der Rolle von Appendicularians beim vertikalen Transport und vertrieb von Mikroplastik in den Ozeanenhindeutet 25.
Oikopleura dioica, eine Larvenart, hat in den letzten Jahren aufgrund mehrerer bemerkenswerter Eigenschaften als Modellorganismus auf sich aufmerksam gemacht. Es wird häufig in den Weltmeeren berichtet. Es ist besonders reichlich inKüstengewässern 26, die einfache Probenahme von der Küste ermöglicht. Langfristige, stabile Kultivierung ist sowohl mit natürlichem als auch künstlichem Meerwasser27,28,29möglich. Die temperaturabhängigen Erzeugungszeiten sind unter Laborbedingungen bis zu 4-9 Tage. Es hat eine hohe Fruchtbarkeit mit jedem Weibchen in der Lage, >300 Eier das ganze Jahr über zu produzieren. Als Tunikatnimmt es eine wichtige phylogenetische Position für das Verständnis der Chordate-Evolution30,31. Mit 70 Mb hat O. dioica das kleinste identifizierte Genom unter allen Chordaten32. Unter den Larvaceanen ist O. dioica die einzige bisher beschriebene nicht-hermaphroditische Art33.
Die erste erfolgreiche O. dioica Kultur mit im Labor angebauten Mikroalgen berichtete Paffenhöfer34. Das ursprüngliche Kulturprotokoll mit Synchronmotoren und Paddeln wurde von Fenaux und Gorsky35 entwickelt und später von mehreren Laboratorien übernommen. In jüngerer Zeit berichteten Fujii et al.36 über die Kultivierung von O. dioica im künstlichen Meerwasser, ein robustes Kultursystem und eine Feldsammlung wurden von Bouquet et al.27 beschrieben und ein optimiertes Protokoll für ein vereinfachtes, erschwingliches System wurde von Marti-Solans et al.29berichtet. Neben dem traditionellen Oikopleura-Kultursystem hat ein neu gemeldetes Design mit einem Doppelrohr-Aufzuchttank auch das Potenzial, Oikopleura sp zu kultizieren. 37.
Wir präsentieren ein detailliertes Protokoll zur Initiierung einer O. dioica Monokultur auf der Grundlage einer Kombination von Protokollen, die von großen Oikopleura-Forschungsgruppen am Sars International Centre for Marine Molecular Biology27, der Universität Barcelona29, der Osaka University28und unseren eigenen Beobachtungen entwickelt wurden. In zuvor veröffentlichten Kulturprotokollen wurden detaillierte Informationen über die Zusammensetzung von Algenmedien, Küstenprobentechniken und Oikopleura-Identifikation nur grob beschrieben, was eine Menge Unklarheiten hinterließ. Hier haben wir mit Hilfe visueller Informationen im Videoprotokoll alle wichtigen Informationen zusammengestellt, die notwendig sind, um eine O. dioica-Kultur von Grund auf auf einfache, schrittweise Weise aufzubauen. Wir beschreiben, wie man O. dioica von einer anderen häufig gemeldeten Art, O. longicauda, unterscheidet, die einer der anspruchsvollsten Schritte ist. Obwohl die bestehenden Kultursysteme für den weltweiten Anbau von O. dioica anwendbar sind, unterstreichen wir die Bedeutung der Protokollanpassung auf der Grundlage lokaler Umweltbedingungen. Die präsentierten Informationen kombinieren weit veröffentlichte Daten sowie Erfahrungserfahrungen. Das aktuelle Protokoll ist ideal für Forscher geeignet, die eine Kultur von Grund auf neu aufbauen möchten.
Um die Flexibilität bei der Etablierung der O. dioica-Kultur zu erleichtern, ist es wichtig, den natürlichen Lebensraum der Tiere zu verstehen. Saisonale Daten liefern Informationen über die Bereiche der physikalischen Parameter, die verwendet werden können, um Laborkultivierungsbedingungen zu leiten. Es hilft auch, saisonale Schwankungen in der Fülle von Tieren zu verstehen. In Okinawa wird O. dioica am zuverlässigsten von Juni bis Oktober gefunden. In der Bucht von Tokio erreicht die Bevölkerungszahl jedoch im Februar und41.Oktober ihren Höhepunkt. Obwohl die Kultivierung von O. dioica oft bei 20 °C oder niedriger27,28,29berichtet wird, zeigt Okinawan O. dioica ein besseres Überleben bei Temperaturen über 20 °C; dies könnte dadurch erklärt werden, dass die minimale Oberflächentemperatur des Meerwassers in Okinawa 20 °C beträgt (Abbildung 6). Die Fülle von O. dioica könnte auch durch Phytoplanktonblüten42 und RaubtierFülle43,44beeinflusst werden. Unabhängig davon, wo O. dioica gesammelt werden, maximiert das Verständnis der Saisonalität der lokalen Bevölkerung die Chance auf Probenahme und Kultivierung.
Angesichts der geeigneten Jahreszeit und Lage ist die Netzprobe eine effektive Möglichkeit, eine große Anzahl von Oikopleura mit minimalem Aufwand zu sammeln. Planktonnetze mit einer kleineren Maschenweite (60-70 m) können auch verwendet werden, um alle Stufen der Tiere zu sammeln. Vollreife Tiere sind selten im Netz zu finden, vielleicht aufgrund ihrer Fragilität am Ende des Lebenszyklus. Daher wird die Artenidentifikation, gefolgt von einer Probenahme, durch mikroskopische Beobachtung von subchordalen Zellen erreicht. Ältere Individuen erscheinen in der Regel ein oder zwei Tage nach der Probenahme, da die Tiere im Labor weiter wachsen. Obwohl die Netto-Probenahme effizient ist, können unter verschiedenen Umständen alternative Probenahmemethoden erforderlich sein. Zum Beispiel können Netzproben in der Nähe von städtischen Gebieten eine große Anzahl von Phytoplankton sammeln, was es schwierig macht, Oikopleurazu isolieren. In solchen Fällen wird eine einfache Eimerprobenahme zur Erfassung von Oberflächenmeerwasser oder Bootsproben aus Gebieten außerhalb des Hafens empfohlen. Die Ergebnisse zeigten, dass die allmähliche Veränderung des Salzgehalts aufgrund der aufeinanderfolgenden Regentage die Fülle von O. dioicanicht beeinflusste; Uferproben unmittelbar nach extremen Wetterereignissen wie tropischen Wirbelstürmen sollten jedoch vermieden werden. Diese Ereignisse verursachen plötzliche und drastische biogeochemische Veränderungen in einem geschützten Gewässer45,46. Der Regenwasserabfluss kann Schadstoffe, Sedimente und überschüssige Nährstoffe transportieren, die die Trübung erhöhen und die Wasserqualität senken47. Filter-Fütterung Plankton, wie Oikopleura, kann besonders anfällig für diese Veränderungen aufgrund ihrer Art der Fütterung und eingeschränkte Mobilität. In einem solchen Fall empfehlen wir, die Probenahme um einige Tage zu verschieben, bis sich die örtlichen Bedingungen wieder normalisieren.
Die Einführung eines mehrstufigen Filtersystems ist für die Erhaltung kleiner, filterfressender Organismen wie O. dioicaunerlässlich. Mit schlecht gefiltertem Meerwasser (z. B. einem 25-mm-Netz im vorherigen Kultursystem) war die Kultur vor allem im Sommer oft instabil, was möglicherweise auf die höhere Fülle an Phytoplankton zurückzuführen ist. Obwohl einige Phytoplankton sind vorteilhaft für O. dioica Wachstum, andere produzieren Biotoxine, die abnormale Entwicklung von O. dioica Embryonen verursachen können48. Darüber hinaus ist eine hohe Konzentration von Diatomen wie Chaetoceros spp. potenziell schädlich für das O. dioica Wachstum, da sie lange Setae besitzen können, die das Haus verstopfen und eine effiziente Fütterung verhindern können49. Wir beobachteten häufig Häuser von Kleintieren, die von C. calcitrans setae verstopft wurden; Daher füttern wir Jetzt C. calcitrans nur noch an Tiere an Tag 2 und älter (Tabelle 3).
Obwohl es hier kein Problem war, kann die kleine langfristige Kultivierung von O. dioica aufgrund eines genetischen Engpasses plötzliche Bevölkerungsrückgänge erleben; in solchen Fällenempfehlen die Beiden, alle 20 Generationen neue wilde Individuen in die Kultur einzuspeisen.
Das Oikopleura-Kultursystem ist flexibel. Innerhalb einer Woche kann eine stabile Kultur aufgebaut werden. Eine langfristige Kultivierung von O. dioica ist mit einem bescheidenen Budget mit nicht spezialisierter Ausrüstung möglich. Der tägliche Aufwand für die Wartung von 5-10 Bechern von Oikopleura ist in der Regel weniger als 2 Stunden mit 2 Personen. O. dioica kann auch in künstlichem Meerwasser gehalten werden, was für diejenigen, die keinen Zugang zu natürlichem Meerwasser haben, von Vorteil ist28. Langfristige Lagerung von Algennahrung ist mit Feststoffkultur und Kryokonservierungmöglich 29. Darüber hinaus kann O. dioica Sperma kryokonserviert werden, und lebensfähig bleiben für mehr als ein Jahr50. All diese Faktoren bedeuten, dass Kulturen leicht wiederhergestellt werden können. Schließlich, vergangenheitErfahrung mit versehentlicher Kultivierung von Pleurobrachia sp. könnte darauf hindeuten, dass das für Oikopleura entwickelte Kultivierungssystem potenziell auf eine breitere Gemeinschaft empfindlicher pelagischer Organismen ausgedehnt werden könnte.
O. dioica liefert weiterhin kraftvolle Einblicke in verschiedene biologische Felder. Ein Verständnis der lokalen Saisonalität, ein akribisches Kultursystem und ein paar engagierte Individuen ermöglichen es, mit wenig Aufwand eine effektive Kultur zu etablieren. Das Oikopleura-Kultursystem bietet die Basisressourcen, um eine breite Palette biologischer Bereiche in Bezug auf Ökologie, Entwicklung, Genomik und Evolution dieses einzigartigen Marinechorats zu untersuchen.
The authors have nothing to disclose.
Wir danken Garth Ilsley für seine Unterstützung beim Aufbau des Kultursystems. Wir würdigen die Beiträge von Ritsuko Suyama und Sylvain Guillot zu den Bemühungen um frühe Probenahme und Artenidentifizierung. Ein besonderer Dank gilt Hiroki Nishida, Takeshi Onuma und Tatsuya Omotezako für ihre großzügige Unterstützung und Beratung durchweg, einschließlich der Ersteinrichtung des lokalen Kultivierungssystems und des Teilens von Tieren und Mikroalgenkultur. Wir danken auch Daniel Chourrout, Jean-Marie Bouquet, Anne Aasjord, Cristian Caéestro und Alfonso Ferréndez-Roldén für den Austausch ihrer Expertise in den Bereichen Sampling und Kultivierung. Jai Denton, Charles Plessy und Jeffrey Jolly gaben unschätzbares Feedback zu dem Manuskript. Charlotte West formulierte eine verallgemeinerte Gleichung für die Algenberechnung. Abschließend danken wir OIST für die Finanzierung, Mary Collins und dem OIST Fieldwork Safety Committee für die Beratung zu sicheren Probenahmeverfahren, den Mitarbeitern der OIST-Maschinenwerkstatt für den Bau von Kultivierungs- und Probenahmegeräten und Koichi Toda für die Lieferung von Meerwasser.
Activated charcoal | Sigma | C2764-2.5KG | |
Alluminum pulley | Rainbow Products | 10604-10607 | |
Biotin | Sigma | B4501-100MG | |
Boric acid | Wako | 021-02195 | |
Cobalamin (B12) | Sigma | V2876-100MG | |
Cobalt(II) chloride hexahydrate | Wako | 036-03682 | |
Copper(II) sulfate pentahydrate | Wako | 039-04412 | |
Disodium edetate hydrate | Wako | 044-29525 | |
Hexaammonium heptamolybdate tetrahydrate | Wako | 019-03212 | |
Hexagon wrench | Anex | No.6600 | |
Hydrochloric acid | Wako | 080-01066 | |
Iron(III) chloride hexahydrate | Wako | 091-00872 | |
Jebao programmable auto dosing pump | Jebao | DP-4 | |
Magnet pump | REI-SEA | RMD-201 | |
Manganese(II) chloride tetrahydrate | Wako | 134-15302 | |
Polypropylene wound cartridge filter | Advantec | TCW-10N-PPS | |
TCW-5N-PPS | |||
TCW-1N-PPS | |||
Screwless terminal block | SATO PARTS | SL4500 | |
Simple plankton net | RIGO, Japan | 5512-C | |
Sodium metasilicate | Sigma | 307815-1KG | |
Sodium nitrate | Wako | 195-02545 | |
Sodium phosphate monobasic anhydrous | MP Biomedicals | 194740 | |
Streptomycin sulfate salt | Sigma | S6501-25G | |
Synchronous electric motor | Servo | D5N6Z15M | |
Thiamin hydrochloride | Wako | 201-00852 | |
UV sterilizer | Iwaki | UVF-1000 | |
Zinc chloride | MP Biomedicals | 194858 |