Summary

Ein verbessertes Protokoll zur Reinigung und direkt Mono-Biotinylat Rekombinanten BDNF in einer Tube für Zelllandhandel Studien in Neuronen

Published: July 11, 2020
doi:

Summary

Rekombinantes BDNF, das eine Avi-Sequenz (BDNFAvi) enthält, wird in HEK293-Zellen kostengünstig hergestellt und durch Affinitätschromatographie gereinigt. BDNFavi wird dann direkt mit dem Enzym BirA in einer Röhre mono-biotinyliert. BDNFavi und monobiotinyd BDNFavi behalten ihre biologische Aktivität im Vergleich zu kommerziell erhältlichen BDNF.

Abstract

Rekombinantes BDNF, das eine Avi-Sequenz (BDNFAvi) enthält, wird in HEK293-Zellen hergestellt und dann kostengünstig durch Affinitätschromatographie gereinigt. Ein reproduzierbares Protokoll wurde entwickelt, um BDNFAvi direkt mit dem Enzym BirA in einer Röhre zu monobiotinylatieren. In dieser Reaktion behält monobiotinylierte BDNFAvi seine biologische Aktivität bei.

Neurotrophine sind zielorientierte Wachstumsfaktoren, die eine Rolle bei der neuronalen Entwicklung und Wartung spielen. Sie erfordern schnelle Transportmechanismen entlang des endozytischen Weges, um Fernsignale zwischen verschiedenen neuronalen Kompartimenten zu ermöglichen. Die Entwicklung molekularer Werkzeuge zur Untersuchung des Handels mit Neurotrophinen hat die präzise Verfolgung dieser Proteine in der Zelle mit Hilfe von In-vivo-Aufnahmen ermöglicht. In diesem Protokoll haben wir ein optimiertes und kostengünstiges Verfahren zur Herstellung von monobiotinyliertem BDNF entwickelt. Eine rekombinante BDNF-Variante, die eine biotinylable Avi-Sequenz (BDNFAvi) enthält, wird in HEK293-Zellen im Mikrogrammbereich hergestellt und dann in einem leicht skalierbaren Verfahren mittels Affinitätschromatographie gereinigt. Der gereinigte BDNF kann dann durch eine direkte In-vitro-Reaktion mit dem Enzym BirA in einer Röhre homogen mono-biotinyliert werden. Die biologische Aktivität des monobiotinylierten BDNF (mbtBDNF) kann zu Streptavidin-konjugiert werden. BDNFAvi und mbtBDNF behalten ihre biologische Aktivität, die durch den Nachweis nachgeschalteter phosphorylierter Targets unter Verwendung von Western Blot bzw. Aktivierung des Transkriptionsfaktors CREB nachgewiesen wurde. Mit Streptavidin-Quantenpunkten konnten wir mbtBDNF-Internalisierung gleichzeitig mit der Aktivierung von CREB visualisieren, die mit einem Phospho-CREB-spezifischen Antikörper nachgewiesen wurde. Darüber hinaus eignete sich mbtBDNF konjugiert zu Streptavidin-Quantenpunkten für retrograde Transportanalysen in kortikalen Neuronen, die in mikrofluidischen Kammern angebaut wurden. So ist mbtBDNF in Derröhre ein zuverlässiges Werkzeug, um physiologische Signalisierungsdynamik und Handel mit Neuronen zu untersuchen.

Introduction

Neuronen sind die funktionellen Einheiten des Nervensystems, die über eine komplexe und spezialisierte Morphologie verfügen, die synaptische Kommunikation und damit die Erzeugung von koordiniertem und komplexem Verhalten als Reaktion auf verschiedene Reize ermöglicht. Neuronale Projektionen wie Dendriten und Axone sind kritische strukturelle Merkmale, die in der neuronalen Kommunikation beteiligt sind, und Neurotrophine sind entscheidende Akteure bei der Bestimmung ihrer Morphologie und Funktion1. Neurotrophine sind eine Familie von sezernierten Wachstumsfaktoren, die NGF, NT-3, NT-4 und Gehirn-abgeleiteten neurotrophen Faktor (BDNF)2umfassen. Im Zentralnervensystem (ZNS) beteiligt sich BDNF an verschiedenen biologischen Prozessen wie Neurotransmission, dendritische Arborisierung, Reifung der dendritischen Stacheln, Langzeitpotenzierung, unter anderem3,4. Daher spielt BDNF eine entscheidende Rolle bei der Regulierung der neuronalen Funktion.

Verschiedene zelluläre Prozesse regulieren die Dynamik und Funktion des BDNF. Auf der neuronalen Oberfläche bindet BDNF die Tropomyosin-Rezeptorkinase B (TrkB) und/oder den p75-Neurotrophinrezeptor (p75). BDNF-TrkB und BDNF-p75 Komplexe sind endocytosed und sortiert in verschiedenen endozytischen Organellen5,6,7,8. Korrekter intrazellulärer Handel des BDNF/TrkB-Komplexes ist für die korrekte BDNF-Signalisierung in verschiedenen neuronalen Schaltkreisen9,10,11erforderlich. Aus diesem Grund ist ein tiefes Verständnis der BDNF-Handelsdynamik und ihrer Veränderungen in pathophysiologischen Prozessen unerlässlich, um BDNF-Signale in Gesundheit und Krankheit zu verstehen. Die Entwicklung neuer und spezifischer molekularer Instrumente zur Überwachung dieses Prozesses wird dazu beitragen, diesen Bereich voranzubringen und ein besseres Verständnis der beteiligten Regulierungsmechanismen zu ermöglichen.

Es gibt mehrere Werkzeuge für die Studie des BDNF-Handels mit Neuronen. Eine häufig verwendete Methodik beinhaltet die Transfektion von rekombinantem BDNF, das mit fluoreszierenden Molekülen wie grünem fluoreszierendem Protein (GFP) oder der monomeren fluoreszierenden rot verschiebbaren Variante von GFP mCherry12,13getaggt ist. Jedoch, ein großes Manko der BDNF Überexpression ist, dass es die Möglichkeit der Bereitstellung bekannter Konzentrationen dieses Neurotrophin eliminiert. Auch, Es kann zu zellulären Toxizität führen, verdecken die Interpretation der Ergebnisse14. Eine alternative Strategie ist die Transfektion eines mit Epitopen markierten TrkB, wie Flag-TrkB. Diese Methode ermöglicht die Untersuchung der TrkB Internalisierungsdynamik15, aber es beinhaltet auch Transfektion, die zu veränderten TrkB-Funktion und zellulärer Toxizität führen könnte. Um diese methodischen Hürden zu überwinden, wurden rekombinante Varianten von NGF und BDNF mit einer Avi-Sequenz (BDNFAvi), die durch das Biotinligase-Enzym BirA monobiotinyliert werden kann,entwickelt 16,17. Biotinyliertes rekombinantes BDNF kann mit verschiedenen Streptavidin-gebundenen Werkzeugen gekoppelt werden, darunter Fluorophore, Perlen, paramagnetische Nanopartikel, unter anderem zum Nachweis. In Bezug auf die Live-Zell-Bildgebung sind Quantenpunkte (QD) häufig verwendete Fluorophore geworden, da sie wünschenswerte Eigenschaften für die Verfolgung von Einzelpartikeln haben, wie erhöhte Helligkeit und Beständigkeit gegen Photobleichungen im Vergleich zu kleinen Molekülfluorophoren18.

Die Produktion von monobiotinyliertem BDNF (mbtBDNF) mit BDNFAvi wurde durch ko-Transfektion von Plasmiden erreicht, die die Expression von BDNFAvi und BirA antreiben, gefolgt von der Reinigung des rekombinanten Proteins durch Affinitätschromatographie mit einer Ausbeute von 1-2 g BDNF pro 20 ml HEK293-konditionierte Kulturmedien17. Hier schlagen wir eine Änderung dieses Protokolls vor, die eine BDNFAvi-Reinigung von 500 ml HEK293-konditionierten Medien ermöglicht, die darauf abzielt, die Proteinrückgewinnung in einem chromatographie-spaltenbasierten Protokoll zu maximieren, um die Manipulation zu erleichtern. Das verwendete Transfektionsmittel Polyethylenimimin (PEI) sorgt für ein kostengünstiges Verfahren ohne Einbußen bei der Transfektionsausbeute. Der Monobiotinylisierungsschritt wurde an eine In-vitro-Reaktion angepasst, um die Mittransfektionen zu vermeiden und eine homogene Kennzeichnung von BDNF zu gewährleisten. Die biologische Aktivität des mbtBDNF wurde durch western blot und fluorescence mikroskopische Experimente demonstriert, einschließlich der Aktivierung von pCREB und Live-Zell-Bildgebung, um retrograde axonale Transport von BDNF in mikrofluidischen Kammern zu untersuchen. Die Verwendung dieses Protokolls ermöglicht eine optimierte, ertragreiche Produktion homogener monobiotinylierter und biologisch aktiver BDNF.

Protocol

Alle Versuche wurden in Übereinstimmung mit den genehmigten Leitlinien von CONICYT (Chilean National Commission for Scientific and Technological Research) durchgeführt. Die in dieser Studie verwendeten Protokolle wurden von den Ausschüssen für Biosicherheit und Bioethik und Tierschutz der Pontificia Universidad Catélica de Chile genehmigt. Versuche mit Wirbeltieren wurden vom Ausschuss für Bioethik und Tierschutz der Pontificia Universidad Catélica de Chile genehmigt. HINWEIS: Das folge…

Representative Results

Die Verwendung eines chromatographischen säulenbasierten Protokolls ermöglicht die Verarbeitung signifikanter Volumina von HEK293 konditionierten Medien. In Abbildung 1werden die Ergebnisse der Reinigung von BDNFAvi aus 500 ml konditionierter Medien dargestellt. Konselutionen von BDNFAvi aus den Ni-NTA Agarose Perlen ergeben abnehmende Konzentrationen von BDNFAvi (Abbildung 1A). Nach vier aufeinanderfolgenden Elutionen (jeweils 15 min) wird der Großteil der v…

Discussion

In diesem Artikel wird eine optimierte Methodik für die Herstellung und Reinigung von mbtBDNF in einem Affinitätschromatographie-basierten Verfahren beschrieben, basierend auf der Arbeit von Sung und Mitarbeitern17. Die Optimierungen umfassen die Verwendung eines kostengünstigen Transfektionsreagenzes (PEI) unter Beibehaltung der Effizienz teurerer Transfektionsmethoden wie Lipofectamin. Diese Optimierung führt zu einer erheblichen Kostensenkung im Protokoll, die Skalierbarkeit bei gleichzeiti…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Die Autoren würdigen die finanzielle Unterstützung von Fondecyt (1171137) (FCB), dem Basal Center of Excellence in Science and Technology (AFB 170005) (FCB), Millenium-Nucleus (P07/011-F) (FCB), dem Wellcome Trust Senior Investigator Award (107116/Z/15/Z) (GS) und einem UK Dementia Research Foundation (GS). Diese Arbeit wurde von der Unidad de Microscopa Avanzada UC (UMA UC) unterstützt.

Materials

2 way stopcock BioRad 7328102 Chromatography apparatus component
2-mercaptoethanol Sigma M6250 BDNF elution buffer
Acrylamide/Bisacrylamide BioRad 1610154 SDS-PAGE gel preparation
Amicon Ultra-15 10K Millipore UFC901024 BDNF concentration
Ammonium Persulfate Sigma A9164 SDS-PAGE gel preparation
anti B-III-Tubulin antibody Sigma T8578 Western blot assays for BDNF biological activity detection
anti BDNF antibody Alomone AGP-021 Western blot assays for BDNF quantification
anti BDNF antibody Alomone ANT-010 Western blot assays for BDNF quantification
Anti ERK antibody Cell Signaling 9102 Western blot assays for BDNF biological activity detection
anti pCREB antibody (S133) Cell Signaling 9198 Western blot assays for BDNF biological activity detection
anti pERK antibody (T202, Y204) Cell Signaling 4370 Western blot assays for BDNF biological activity detection
anti pTrkB antibody (Y515) Abcam ab109684 Western blot assays for BDNF biological activity detection
Antibiotic/Antimycotic Gibco 15240-062 HEK293 maintenance
ATP Sigma A26209 BDNF monobiotinylation buffer
B-27 Supplement Gibco 17504-044 Neuron maintenance
Bicine Sigma B3876 BDNF monobiotinylation buffer
BirA-GST BPS Bioscience 70031 Enzyme for BDNF AviTag monobiotinylation
Bovine Fetal Serum HyClone HC.SH30396.02 HEK293 maintenance
Bovine Serum Albumin Jackson ImmunoResearch 001-000-162 BDNF buffer modification component, blocking buffer for western blot and immunofluorescence
D-Biotin Sigma B4639 BDNF monobiotinylation buffer
Dithiothreitol Invitrogen 15508-013
DMEM High Glucose Medium Gibco 11965-092 Neuron seeding
DMEM Medium Gibco 11995-081 HEK293 maintenance
Econo Column Funnel BioRad 7310003 Chromatography apparatus component
EDTA Merck 108418
EZ-ECL Kit Biological Industries 1633664 Protein detection by western blotting
Glutamax Gibco 35050-061 Neuron and HEK293 maintenance
Glycerol Merck 104094 BDNF elution buffer, lysis buffer for western blot assays
Hettich Rotina 46R Centrifuge Hettich Discontinued Centrifuge used for clearing the medium of debris
Hettich Universal 32R Centrifuge Hettich Discontinued Centrifuge used for protein concentrator centrifugation
Horse Serum Gibco 16050-122 Neuron seeding
ImageQuant LAS 500 GE Healthcare Life Sciences 29005063 Western blot image acquisition
Imidazole Sigma I55513 BDNF buffer modification component
KCl Winkler BM-1370 PBS component
KH2PO4 Merck 104873 PBS component
Laminin Invitrogen 23017-015 Cover coating for compartmentalized neurons
Luer Tubing Adaptor BioRad 7323245 Chromatography apparatus component
Luminata™ Forte Western HRP Substrate Millipore WBLUF0100 Protein detection by western blotting
Mg(CH3COO)2 Merck 105819 BDNF monobiotinylation buffer
Mowiol 4-88 Calbiochem 475904 Mounting reagent for immunofluorescence assays
MyOne C1 Streptavidin Magnetic Beads Invitrogen 65001 Biotinylation verification
Na2HPO4 Merck 106586 BDNF buffer modification component
NaCl Winkler BM-1630 PBS component, BDNF buffer modification component
NaH2PO4 Merck 106346 BDNF buffer modification component
Neurobasal Medium Gibco 21103-049 Neuron maintenance
Ni-NTA Agarose Beads Qiagen 30210 BDNF AviTag purification
Nikon Ti2-E Nikon Microscope for fluorescence imaging
Nitrocellulose Membrane BioRad 1620115 Protein transfer for western blotting
ORCA-Flash4.0 V3 Digital CMOS camera Hamamatsu C13440-20CU Camera for epifluorescence imaging
P8340 Protease Inhibitor Cocktail Sigma P8340 BDNF buffer modification component
Paraformaldehyde Merck 104005 Fixative for immunofluorescence assays
Penicillin/Streptomycin Gibco 15140-122 Neuron maintenance
Poli-D-Lysine Corning DLW354210 Cover coating for compartmentalized neurons
Poli-L-Lysine Millipore P2363 Cover coating for non-compartmentalized neurons
Poly-Prep Chromatography Column BioRad 7311550 Chromatography apparatus component
Polyethyleneimine 25K Polysciences Inc. PLY-0296 HEK293 transfection
Quantum Dots 655 streptavidin conjugate Invitrogen Q10121MP Monobiotinylated BDNF AviTag label for live and fixed cell experiments
Saponin Sigma S4521 Detergent for immunofluorescence assays
Sucrose Merck 107687
Syldgard 184 silicone elastomer base Poirot 4019862 Microfluidic chamber preparation
TEMED Sigma T9281 SDS-PAGE gel preparation
Tris Winkler BM-2000 Lysis buffer component
Triton X100 Merck 108603 Cell permeabilization in immunofluorescence and western blot assays
Trypsin-EDTA 0.5% Gibco 15400-054 HEK293 passaging

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Stuardo, N., Moya-Alvarado, G., Ramírez, C., Schiavo, G., Bronfman, F. C. An Improved Protocol to Purify and Directly Mono-Biotinylate Recombinant BDNF in a Tube for Cellular Trafficking Studies in Neurons. J. Vis. Exp. (161), e61262, doi:10.3791/61262 (2020).

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