Здесь описан протокол изучения событий, вызванных FcγRIIIa, терапевтическими антителами в клетках-убийцах человека. Эта платформа искусственной стимуляции позволяет исследовать последующие эффекторные функции, такие как дегрануляция, производство хемокина / цитокина и сигнальные пути, опосредованные частями FcγRIIIa и Fc антител, участвующих в связывании.
Одним из механизмов действия клинической эффективности терапевтических антител является стимулирование связанных с иммунитетом функций, таких как секреция цитокинов и цитотоксичность, обусловленных FcγRIIIa (CD16), экспрессируемых на естественных киллерах (NK) клетках. Эти наблюдения привели к исследованиям, сосредоточенным на методах увеличения событий, опосредованных рецепторами Fc, которые включают удаление фрагмента фукозы, обнаруженного на fc-части антитела. Дальнейшие исследования выявили механистические изменения в сигнализации, клеточных процессах и цитотоксических характеристиках, которые увеличивают активность ADCC с афукозилированными антителами. Кроме того, другие исследования показали потенциальные преимущества этих антител в сочетании с ингибиторами малых молекул. Эти эксперименты продемонстрировали молекулярные и клеточные механизмы, лежащие в основе преимуществ использования афукозилированных антител в комбинированных условиях. Многие из этих наблюдений были основаны на искусственном анализе активации in vitro, в котором FcγRIIIa на NK-клетках человека активировался терапевтическими антителами. Этот анализ обеспечил гибкость для изучения последующих эффекторных функций NK-клеток, таких как производство цитокинов и дегрануляция. Кроме того, этот анализ был использован для опроса сигнальных путей и идентификации молекул, которые могут быть модулированы или использованы в качестве биомаркеров. Наконец, другие терапевтические молекулы (т.е. ингибиторы малых молекул) были добавлены в систему, чтобы дать представление о комбинации этих терапевтических средств с терапевтическими антителами, что имеет важное значение в современном клиническом пространстве. Эта рукопись призвана обеспечить техническую основу для выполнения этого искусственного анализа активации NK-клеток человека. Протокол демонстрирует ключевые шаги для активации клеток, а также потенциальные последующие приложения, которые варьируются от функциональных показаний до более механистических наблюдений.
За последние несколько десятилетий огромное внимание уделялось разработке таргетной терапии рака с использованием антител. Терапевтические антитела, такие как трастузумаб и ритуксимаб, действуют через несколько механизмов, включая предотвращение димеризации сигнальных молекул и мобилизацию иммунной системы1,2. Последнее достигается за счет антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC), при которой лимфоциты, называемые естественными киллерами (NK), доводятся до клетки-мишени антителом1,2. Помещая клетки в непосредственной близости друг от друга, NK-клетка активируется и может лизировать опухоль/клетку-мишень посредством секреции эффекторных молекул3.
На молекулярном уровне Fab-часть антитела связывает свой родственный антиген, экспрессируемый на опухолевых клетках, в то время как его часть Fc задействует FcγRIIIa, экспрессируемую на NK-клетках, чтобы объединить две клетки1,2. После вовлечения FcγRIIIa сигнальные пути (т.е. пути MAPK и PI3K) управляют цитоскелетной перестройкой, выработкой цитокинов и цитотоксичностью4,5,6,7,8,9. Таким образом, ADCC является событием, управляемым FcγRIIIa, опосредованным NK-клетками и антителами.
Поскольку ADCC считался механизмом действия этих терапевтических антител, исследователи искали методы увеличения ADCC путем модификации антитела. Одной из модификаций было удаление фукозы на олигосахаридной цепи, прикрепленной к аспарагину 297, что увеличивает сродство связывания Fc-части антитела к FcγRIIIa10,11,12. В исследованиях на животных мыши, получая афукозилированные антитела, демонстрировали более медленный рост опухоли по сравнению с мышами, получавших фукозилированный аналог13. Что еще более важно, обинутузумаб (например, Gazyva, одобренное афукозилированное антитело) показал лучшую эффективность по сравнению с ритуксимабом (например, Ритуксаном, его фукозилированным аналогом) у пациентов с диагнозом хронический лимфоцитарный лейкоз или фолликулярная лимфома14,15.
До недавнего времени механизмы, лежащие в основе повышения ADCC через афукозилированные антитела, были неизвестны. В сочетании с тем фактом, что существуют многочисленные исследовательские программы, разрабатывающие терапевтические антитела для использования механизмов, управляемых FcγRIIIa, для нацеливания на раковые клетки, крайне важно разработать анализы in vitro, которые изучают молекулярные и клеточные аспекты, продвигаемые этими антителами. Это обеспечивает фундаментальное понимание механизмов действия, а также потенциала для обнаружения биомаркеров. Таким образом, был разработан искусственный анализ активации для изучения антителозависимых FcγRIIIa-опосредованных функций в дополнение к сигнальным и клеточным характеристикам8. Благодаря этим исследованиям были выяснены механизмы, лежащие в основе повышения эффективности афукозилированных антител, в которых повышенное сродство связывания увеличивает передачу сигналов для повышения клеточных свойств и цитотоксических характеристик8.
Современной тенденцией в клинических испытаниях является использование комбинации терапевтических молекул16. Одним из наиболее часто мутировавших путей является путь PI3K, который вызвал огромные усилия по разработке ингибиторов малых молекул, которые нацелены на компоненты этого пути17,18,19,20. Тем не менее, как эти молекулы действуют в сочетании с терапевтическими антителами, относительно неизвестно, особенно в комбинациях, где ингибитор может влиять на молекулы, которым требуется путь PI3K для функционирования, например, те, которые управляются терапевтическими антителами.
С этой целью анализ in vitro, используемый для исследований афукозилированных антител, также использовался для изучения комбинации ингибиторов PI3K и терапевтических антител. Эти исследования определили молекулярные характеристики ингибирования PI3K на терапевтических событиях, управляемых антителами PI3K, и описали, как афукозилированные антитела могут компенсировать эту потерю сигналов9. Эти результаты актуальны, поскольку они дают потенциальное руководство для разработки клинических испытаний. Кроме того, эта серия экспериментов также привела к первым описанным наблюдениям за кинетической регуляцией сигнального пути PI3K для модуляции транскрипции и производства хемокина/цитокина, которые могут служить потенциальными биомаркерами9.
Искусственный анализ активации in vitro, используемый для определения сигнальных и клеточных характеристик, описанных выше, был разработан для изучения событий, управляемых FcγRIIIa в NK-клетках, опосредованных антителами в отсутствие клеток-мишеней. Без клеток-мишеней в системе все наблюдаемые сигнальные события и функции могут быть отнесенные непосредственно к NK-клеткам. В представленном анализе антитело добавляют к очищенным NK-клеткам, после чего часть Fc связывает FcγRIIIa. За этим следует сшивание антитела с использованием античеловеческого антитела κ легкой цепи для искусственной стимуляции клеток. Сшивание антитела имитирует связывание целевого антигена для создания сигнальной платформы, которая вызывает последующие события. В зависимости от продолжительности стимуляции исследователи могут оценить сигнальные, клеточные процессы, цитотоксические характеристики и эффекторные функции8,9. Аналогичным образом, этот анализ также обеспечивает гибкость в изучении этих событий, когда антитела объединяются с другими молекулами9.
Вместе это идеальный анализ in vitro для изучения терапевтических антител, которые вызывают реакции NK-клеток через их FcγRIIIa как часть механизма действия. Этот протокол описывает производительность этого анализа активации in vitro и дает представление о различных показаниях, которые могут быть выполнены.
Этот протокол описывает методы изучения событий, управляемых FcγRIIIa, в NK-клетках, опосредованных антителами. Эти методики позволяют оценить потенциальные механизмы действия терапевтических антител, которые предполагается adcc1,2. В частности, эти методы обеспечивают гибкость в изучении основных молекулярных сигнальных путей и клеточных процессов, которые отвечают за ADCC. Они также позволяют наблюдать за другими эффекторными функциями, такими как производство хемокина и цитокинов. Кроме того, эти методы позволяют идентифицировать потенциальные биомаркеры и молекулы, которые могут быть нацелены на модуляцию ADCC.
Основой для этого протокола является искусственная стимуляция NK-клеток через FcγRIIIa антителами при отсутствии клеток-мишеней. Клетки-мишени, связанные с антителами, обычно служат для содействия сшиванию Fc-рецепторов с образованием платформы, которая управляет сигнальными и последующими эффектами. Вместо этого сшивание осуществляется с использованием античеловеческого антитела κ легкой цепи в этом анализе, минуя необходимость в клетках-мишенях для стимуляции NK-клеток. Без клеток-мишеней результаты и наблюдения могут быть отнесены непосредственно к NK-клеткам, предполагая, что процесс очистки будет успешным.
Важно отметить, что использование античеловеческого антитела κ легкой цепи для сшивания антитела не влияет на сродство связывания части Fc для FcγRIIIa, взаимодействие, которое диктует силу ответа10,11,12,13. Действительно, исследования показали, что афукозилированные антитела увеличивают ADCC из-за их повышенного сродства к FcγRIIIa10,11,12,13. Последующие исследования показали, что это повышенное сродство не зависит от античеловеческого κ заменителя вторичных антител легкой цепи и может быть использовано для изучения основы для повышения ADCC8. Чтобы гарантировать, что NK-клетка стимулируется путем сшивания антитела, следует включить два отрицательных контроля: 1) терапевтическое антитело только без вторичного античеловеческого антитела κ легкой цепи и 2) только вторичное античеловеческое антитело κ легкой цепи. В обоих случаях не следует генерировать сигнальную или эффекторную функцию.
Этот метод также обеспечивает гибкость для изучения влияния терапевтических антител на ингибиторы малых молекул. Ингибитор может быть добавлен перед сшивающимся с вторичным антителом, чтобы ингибитор успел зацепиться за свою мишень. Однако следует проводить исследования для определения оптимального времени предварительной обработки ингибитором; таким образом, ингибитор оказывает максимальное влияние на стимуляцию. С этим, исследователи могут также изучить эффекты ингибитора после стимуляции. В этом случае ингибитор может быть добавлен после сшивки для изучения того, как он влияет на сигналы и процессы, которые уже генерируются. В совокупности описанный здесь способ обеспечивает максимальную гибкость в изучении комбинаторных эффектов различных ингибиторов малых молекул с терапевтическими антителами.
Как уже упоминалось выше, после стимуляции могут быть выполнены различные показания. Вестерн-блоттинг может быть выполнен для изучения сигнализации с использованием SDS-PAGE и мембранных систем переноса от различных поставщиков. Аналогичным образом, экспрессия генов также может быть оценена с использованием различных методов экстракции РНК, реагентов обратной транскрипции и инструментов экспрессии генов. Наконец, окрашивание внутриклеточного или внеклеточного белка также может быть выполнено, в котором образцы могут быть проанализированы с использованием различных проточных цитометров. Для внутриклеточного окрашивания цитокином и CD107a (этап 3.4, который может быть оценен одновременно) следует добавлять моненсин и/или брефельдин А для максимизации сигналов. Мы использовали разные платформы для каждой экспериментальной цели и все еще наблюдали аналогичные результаты. Поэтому метод может быть дополнен различными реагентами, платформами и инструментами, в зависимости от исследования.
Время сшивания для стимуляции будет зависеть от цели исследования. Если необходимы сигнальные исследования, типичное время стимуляции сшивки составляет от 2 мин до 10 мин. накопление pAKT, pPRAS40 и pERK1/2 достигает пика через 2 мин и исчезает через 10 мин8,9. Для функциональных исследований (т.е. тех, которые включают выработку хемокина/цитокина) клетки должны стимулироваться в течение не менее 30 мин, в зависимости от анализируемого9. Анализ экспрессии генов также обычно требует 30 минут стимуляции9. Следует проявлять осторожность при использовании экспрессии гена RANTES в качестве считывания, так как продукция мРНК RANTES не зависит от транскрипционной активации, поскольку она уже хранится в клетках для быстрой трансляции и высвобождения белка при стимуляции25. Дегрануляция, напротив, требует не менее 3 ч стимуляции. Несмотря на эти общие наблюдения, исследователи должны выполнить кинетические исследования, чтобы определить оптимальное время стимуляции для конкретных молекул, представляющих интерес.
Аналогичным образом, исследователи должны титровать интересующее антитело, чтобы определить оптимальную концентрацию, потому что антитела с различной специфичностью связываются с FcγRIIIa с разными сродствами, даже если они имеют один и тот же изотип. Например, ритуксимаб и трастузумаб являются изотипом IgG1, но трастузумаб сильнее связывается с валиновым полиморфизмом FcγRIIIa, чем ритуксимаб26,27. Это различие в сродстве может привести к функциональным различиям, таким как дегрануляция, как это наблюдалось в опубликованных исследованиях8.
Определение оптимальной концентрации также важно из-за низкого сродства Fc-части антитела к FcγRIIIa. Это может привести к вымыванию антитела, поскольку протокол включает этапы промывки после связывания антитела с рецептором Fc. Это может привести к отсутствию чувствительности в анализах, о чем свидетельствует низкий процент cd107a положительных клеток после стимуляции(рисунок 5). Однако определение оптимальной концентрации должно обеспечивать уверенность в том, что результаты не обусловлены отсутствием чувствительности. Кроме того, клетки четко активируются в биохимических и функциональных анализах, которые используют объемные ячейки, в отличие от считывания одиночных клеток(Рисунок 2, Рисунок 3, Рисунок 6).
Протокол также ограничен, поскольку он не полностью имитирует то, что происходит физиологически. Вторичное античеловеческое K-антитело, используемое для имитации сшивки, генерируемой целевым антигеном, экспрессируемым на клетках. Здесь добавляется насыщенное количество вторичных антител для генерации максимального ответа. Тем не менее, различные клетки-мишени будут экспрессифицивать различные уровни антигена, что повлияет на сшивание и реакцию. В настоящее время эта платформа не оптимизирована для имитации эффектов различных уровней экспрессии антигена.
Другим фактором, который следует учитывать при проведении этих экспериментов, является изменчивость от донора к донору из-за различного генетического фона и иммунологической истории среди людей. Поэтому необходимо соблюдать осторожность при сравнении ответов NK-клеток от разных доноров в одних и тех же анализах. Аналогичным образом, при использовании различных доноров следует делать только общие выводы.
В целом, описанный метод представляет собой простую и гибкую платформу стимуляции для изучения fcγRIIIa-опосредованных антителами событий в NK-клетках. Он был использован для лучшего понимания основы повышения ADCC и эффективности, наблюдаемой с афукозилированными антителами8. Этот метод также использовался в исследовании, объединяющем терапевтические антитела и ингибиторы малых молекул PI3K9. Кроме того, был идентифицирован ранее неизвестный механизм производства хемокина и цитокинов, регулируемый pS69. Таким образом, будущие исследования с использованием этой искусственной сигнальной платформы могут дополнительно прояснить механизмы регуляции эффекторных функций, управляемых FcγRIIIa. Он также может потенциально идентифицировать новые молекулы, важные для этих механизмов, а также новые роли для известных молекул.
The authors have nothing to disclose.
Авторы благодарят Джеймса Ли и Кристофера Нга за комментарии и редактирование этой рукописи.
16% paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | 50-980-487 | |
Alexa Fluor 488 phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
anti-mouse HRP antibody | Cell Signaling Technologies | 7076 | |
AutoMACS instrument | Miltenyi | NK cell isolation method; another isolation instrument may be used | |
B-mercaptoethanol | Thermo Fisher Scientific | 21985023 | |
Bovine Serum Albumin Fraction V, fatty acid free | Millipore Sigma | 10775835001 | |
CD107a APC antibody | Biolegend | 328620 | |
Cytokine 30-Plex Human Panel | Thermo Fisher Scientific | LHC6003M | chemokine/cytokine method; another chemokine/cytokine analysis method may be used |
FBS | Hyclone | SH30071.01 | |
Goat anti-human κ light chain antibody | Millipore Sigma | AP502 | |
Halt Protease and Phosphatase Inhibitor Cocktail | Thermo Fisher Scientific | 78440 | |
HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630080 | |
High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | Thermo Fisher Scientific | 4368814 | cDNA transcription method; used according to manufacturer's protocol |
IFN-ɣ primers | Thermo Fisher Scientific | Hs00989291_m1 | |
Leukosep tube (50 ml conical with porous barrier) | Greiner | 227290 | |
Lymphoprep (density gradient medium) | Stemcell | 7851 | |
MIP-1⍺ primers | Thermo Fisher Scientific | Hs00234142_m1 | |
MIP-1β primers | Thermo Fisher Scientific | Hs99999148_m1 | |
NK cell isolation kit | Miltenyi | 130-092-657 | NK cell isolation kit; another isolation kit may be used |
NuPAGE 4-12% Bis-Tris Protein Gels | Thermo Fisher Scientific | another protein separation system may be used | |
pAKT (S473) antibody | Cell Signaling Technologies | 4060 | |
pERK1/2 antibody | Cell Signaling Technologies | 4370 | |
pPRAS40 antibody | Cell Signaling Technologies | 13175 | |
PVDF membrane | Thermo Fisher Scientific | nitrocellulose may be used | |
RANTES primers | Thermo Fisher Scientific | Hs00982282_m1 | |
RIPA buffer | Millipore Sigma | R0278 | |
RPMI w/glutamax | Thermo Fisher Scientific | 61870 | |
Sodium pyruvate | Thermo Fisher Scientific | 11360070 | |
TNF-⍺ primers | Thermo Fisher Scientific | Hs00174128_m1 | |
Triton X-100 | Thermo Fisher Scientific | 85111 | |
TRIzol | Thermo Fisher Scientific | 15596018 | RNA isolation method; used according to manufacturer's protocol |
Xcell Blot II Transfer Module | Thermo Fisher Scientific | another protein separation system may be used | |
Xcell SureLock Protein Gel Electrophoresis Chamber System | Thermo Fisher Scientific | another protein separation system may be used | |
β-actin HRP antibody | Abcam | ab6721 | |
β-actin primers | Thermo Fisher Scientific | Hs00982282_m1 |