هنا, نقدم بروتوكول مفصل لدراسة تراكم العصبية α-synuclein في الخلايا العصبية الدوبامين الماوس الأولية. يتم حث مجاميع α-synuclein الفوسفورية في الخلايا العصبية مع تشكيلها قبل تشكيل α-synuclein فيبريلات. التصوير الآلي للخلايا التي تحمل اسم مناعيا وتحليل الصور غير متحيزة جعل هذا البروتوكول قوية مناسبة للفرز متوسط إلى عالي الإنتاجية من الأدوية التي تمنع تراكم α-synuclein.
الهدف من هذا البروتوكول هو إنشاء نموذج قوي ومستنسخ من تراكم α-synuclein في الخلايا العصبية الأولية. جنبا إلى جنب مع المناعة وتحليل الصور الآلي غير متحيزة, هذا النموذج يسمح لتحليل آثار المخدرات والتلاعب الجيني على تجميع α-synuclein في الثقافات العصبية. الثقافات الأولية في منتصف الفقرات توفير مصدر موثوق به من الخلايا العصبية الدوبامين الجنينية حسن النية. في هذا البروتوكول ، يتم محاكاة علم الأنسجة المميز لمرض باركنسون ، أجسام ليوي (LB) ، بإضافة α-synuclein pre-synuclein fibrils (PFFs) مباشرة إلى وسائط الثقافة العصبية. يتم الكشف عن تراكم الفوسفورية الذاتية α-synuclein في سوما من الخلايا العصبية الدوبامين عن طريق المناعة بالفعل في 7 أيام بعد إضافة PFF. ظروف زراعة الخلايا في المختبر مناسبة أيضاً لتطبيق وتقييم العلاجات التي تمنع تراكم α-سينوكلين، مثل أدوية الجزيئات الصغيرة والعوامل العصبية، وكذلك ناقلات فيروس العدس للتلاعب الجيني (على سبيل المثال، مع CRISPR/Cas9). زراعة الخلايا العصبية في 96 لوحات جيدا يزيد من قوة وقوة الاجهزة التجريبية. في نهاية التجربة ، يتم تثبيت الخلايا مع ما قبل الشكل للكيمياء المناعية والتصوير المجهري للفلوريس. يتم الحصول على صور الفلورس المتعدد الأطياف عن طريق المجهر الآلي لـ 96 لوحة من الآبار. يتم تحديد كمية هذه البيانات (على سبيل المثال، عد عدد الخلايا العصبية التي تحتوي على الدوبامين phospho-α-synuclein في البئر) مع استخدام البرمجيات الحرة التي توفر منصة لتحليل النمط الظاهري عالي المحتوى غير المتحيزة. PFF التي يسببها النمذجة من الفوسفورية α-synuclein تراكم في الخلايا العصبية الدوبامين الأولية يوفر أداة موثوقة لدراسة الآليات الأساسية الوساطة تشكيل والقضاء على إدراجات α-synuclein, مع فرصة لفحص المخدرات عالية الإنتاجية وتحليل الظاهري الخلوية.
مرض باركنسون (PD) هو اضطراب عصبي يتميز بوفاة الخلايا العصبية الدوبامين في منتصف القرن في النيغرا substantia (SN) ، وفقدان لاحق لنبرة الدوبامين في العقد القاعدية ، وما يترتب على ذلك من ضعفات حركية1،2. وهناك سمة الهدولوجية الرئيسية في أدمغة مرضى PD هي البروتين داخل الخلايا / مجاميع الدهون الموجودة في سوما الخلايا العصبية، وتسمى أجسام ليوي (LB)، أو في نيوريت، Lewy neurites (LN)، والمعروفة مجتمعة باسم علم الأمراض ليوي3. يبدو أن علم الأمراض الليو في الدماغ يتقدم مع تقدم PD يشبه انتشار العوامل المسببة للأمراض من خلال الاتصالات العصبية. تم العثور على وفرة علم الأمراض ليوي في الخلايا العصبية الدوبامين في SN والخلايا في مناطق أخرى تتأثر بالانكاد العصبي4. ومع ذلك ، أثناء تطور المرض ، وانتشار وبداية تراكم البروتين لا ترتبط دائما مع الموت العصبي والمساهمة الدقيقة من علم الأمراض ليوي في وفاة الخلايا العصبية لا يزال غير واضح5.
وقد ثبت LB وLN أن تتكون من مكونات membranous والبروتينية3. الأول هي شظايا الغشاء، والهياكل الحويظة (ربما lysosomes و autophagosomes) والميتوكوندريا3. هذا الأخير يتكون من ما لا يقل عن 300 بروتينات مختلفة6. أظهرت دراسة مميزة أجراها Spillantini وآخرون7 أن المكون الرئيسي للبروتين في علم الأمراض الليو هو α-synuclein. أعرب عن ذلك في الخلايا العصبية، ويرتبط مع الانصهار الغشاء والافراج عن الناقل العصبي، α-synuclein في علم الأمراض ليوي موجود في الغالب في شكل مغلوط، فيبرويل اميلويد، الجزء الأكبر منها هو الفوسفور في Ser129 (pS129-αsyn)4،,8.
الأهم من ذلك، كما ثبت أنه نظرا لخصائصه مثل بريون، misfolded α-synuclein قد يكون لها دور السبب في تشكيل علم الأمراض ليوي4. وقد أظهرت خصائص مثل البريون من α-synuclein misfolded مع كل من مستخلصات منتصف البراين من المرضى وإعداد exogenousously α-synuclein فيبريلس preformed (PFFs) للحث على α-synuclein مجاميع في الخلايا العصبية في الثقافة وفي vivo9,10. PFFs تقديم نموذج موثوق بها وقوية لدراسة تطور علم الأمراض α-synuclein في الخلايا العصبية الدوبامين. عندما يتم تطبيق PFFs على الخلايا العصبية الأولية المستزرعة أو حقنها في دماغ الحيوان ، فإنها تؤدي إلى تكوين تضمينات تحتوي على α-synuclein في نيوريت وسوماالخلية 11 التي تُلخِص العديد من الميزات التي شوهدت في علم الأمراض اللويلي. إدراجات لوحظ هي المنظفات غير قابلة للذوبان في تريتون X، في كل مكان، ملطخة صبغة الأميلويد محددة Thioflavin S، وتحتوي على α-synuclein hyperphosphorylated في Ser12911،12. الأهم من ذلك، هذه التضمينات لا تتشكل في α-سينوكلين خروج المغلوب الحيوانات11، مما يدل على الاعتماد على تشكيلها على α-synuclein الذاتية.
ومع ذلك، فمن الصعب أن تقارن مباشرة إدراجات الناجمة عن PFF وعلم الأمراض ليوي وجدت في مرضى PD لأن LBs الإنسان وLNs غير متجانسة للغاية3. قد يكون سبب عدم تجانس علم Lewy Lewy المُلاحظ هو مراحل مختلفة من التكوين أو الموقع التشريحي المختلف أو الاختلافات في تكوين α-synuclein المُختَلَف بشكل خاطئ، مما يؤدي إلى بدء عملية التجميع. قد تؤثر نفس العوامل على التضمينات الإيجابية PS129-αsyn الناتجة عن PFF. في الواقع، في الآونة الأخيرة ثبت أن PFF التي يسببها PS129-αsyn إدراج إيجابية في الثقافات العصبية الأولية تمثل المراحل المبكرة جدا من الأمراض التي يمكن أن تنضج إلى هياكل تشبه بشكل وثيق LB بعد فترة حضانة طويلة12،13.
النمذجة في وقت مبكر من الانتشار وتراكم α-synuclein مغلوطة مع PFFs قيمة لتطوير المخدرات، كما يعتبر انتشار علم الأمراض ليوي واحدة من علامات المرض في مرحلة مبكرة. لذلك، قد تكون العلاجات الوقائية التجميعية واعدة لوقف أو إبطاء تطور PD في المراحل المبكرة جدًا. العديد من التجارب السريرية التي تهدف إلى إبطاء أو وقف تراكم α-synuclein جارية14. للمرضى في مرحلة لاحقة, زرع السلف العصبية الدوبامين يمكن أن يكون أفضل علاج بديل15. ومع ذلك ، تم توثيق علم الأمراض Lewy في الخلايا العصبية الجنينية المزروعة خلال تحليل ما بعد الوفاة لأدمغة المرضى PD16،17، مما يشير أيضًا إلى الحاجة إلى الحماية ضد تراكم α-synuclein.
في المختبر، ومن المعروف α-synuclein PFFs للحث على التجميع في خطوط الخلايا الخالدة، أو أكثر شيوعا، في الحصون الأساسية القوارض أو الخلايا العصبية القشرية. لا أحد من هذه هي قريبة من تلخيص الخلايا العصبية الدوبامين10. زراعة هذه الخلايا العصبية يتطلب الطلاء الكثيفة من أعداد معينة من الخلايا العصبية في المختبر18. لتحقيق كثافة عالية الطلاء مع المواد المحدودة (على سبيل المثال، الخلايا العصبية الدوبامين الأولية)، ويستخدم عادة طريقة زراعة جزيرة صغيرة. في زراعة جزيرة صغيرة، مطلية في البداية الخلايا في قطرة صغيرة من المتوسطة (عادة ما تكون صغيرة قليلة) أبقى معا من قبل التوتر السطحي في وسط بئر كبير18. بعد إرفاق الخلايا العصبية ، يتم تعبئة البئر بأكمله مع الوسط في حين أن الخلايا تظل محصورة في كثافة عالية في منطقة الطلاء الصغيرة. وبالإضافة إلى تحقيق كثافة عالية في الطلاء، تمنع الجزر الصغيرة أيضاً الطلاء بالقرب من حواف الآبار، حيث تكثر الاختلافات في كثافة الخلايا والبقاء على قيد الحياة. وغالبا ما تستخدم الجزر الصغيرة في آبار أو أطباق كبيرة نسبيا؛ ومع ذلك، إنشاء الثقافات العصبية midbrain في الجزر الصغيرة في 96 شكل لوحة جيدا تمكن من دراسة علم الأمراض ليوي في الخلايا العصبية الدوبامين حسن النية مع طاقة متوسطة إلى عالية الإنتاجية. في التجارب المختبرية مع هذه الخلايا العصبية سمح لنا لاكتشاف الخلية الدبقية المشتقة من عامل العصبية (GDNF)، الذي يعزز بقاء الخلايا العصبية الناضجة في المختبر وفي الجسم الحي19،20،21،22 ويمنع أيضا تشكيل مجاميع α-synuclein في الخلايا العصبية الدوبامين23. الإنسان المريض الناجم عن الخلايا العصبية الدوبامين المشتقة من الخلايا الجذعية المشتقة تشكل نموذجا أكثر دقة بسبب أصلها البشري والبقاء على قيد الحياة أطول في المختبر. ومع ذلك ، لوحظ تحريض أمراض α-synuclein في الخلايا العصبية البشرية بعد عدة أشهر ، مقارنة بأسبوع في الخلايا العصبية الجنينية الماوس ، و / أو مع الضغوطات المتعددة (على سبيل المثال ، مزيج من α-synuclein overexpression و PFFs)24،25. وبالإضافة إلى ذلك, صيانة الخلايا العصبية الدوبامين الإنسان هو أكثر تكلفة وشاقة بالمقارنة مع الخلايا العصبية الجنينية الأولية, الحد أساسا استخدامها في تطبيقات عالية الإنتاجية.
وعلاوة على ذلك، يمكن تعديل الثقافات العصبية الدوبامين الأولية وراثيا (على سبيل المثال، مع CRISPR/Cas9) و / أو تعامل مع العوامل الدوائية23. وهي تشكل منصة سريعة وقابلة للاستنساخ لتطبيقات مثل تشريح المسار الجزيئي وفحص مكتبة الأدوية. وعلى الرغم من أنه يمكن الحصول على مواد محدودة من هذه الثقافات، فإنه لا يزال من الممكن إجراء تحليلات صغيرة الحجم للجينوم/البروتوميات. زراعة الخلايا العصبية الأولية في 96 شكل جيدا هو أفضل لتقنيات المناعة والمجهر الفلورسي، تليها تحليل النمط الظاهري عالية المحتوى. ويمكن تحويل الصور الفلورية متعددة الأطياف المستمدة من التصوير الآلي لـ 96 لوحة بئر إلى نتائج كمية (على سبيل المثال، عدد الخلايا العصبية المحتوية على الـ LB في البئر). ويمكن إجراء مثل هذه التحليلات مع البرمجيات الحرة، مثل CellProfiler26،27. عموما، الثقافات المتوسطة الجنينية الأولية مطلية في 96 لوحات جيدا توفير منصة قوية وفعالة لدراسة الخلايا العصبية الدوبامين وتجميع α-synuclein مع فرصة لفحص النمط الظاهري عالية الإنتاجية.
انتشار علم الأمراض ليوي، والتي pS129-αsyn هو المكون الرئيسي، هو السمة المميزة الهدولوجية من PD. وقف أو إبطاء تراكم pS129-αsyn تجميعها قد تبطئ انحطاط الخلايا العصبية الدوبامين وتطور ألفا سينوكلين. ومع ذلك, فهم ميكانيكي لكيفية pS129-αsyn التجميع يساهم في زوال الخلايا العصبية الدوبامين لا يزال يتعين أن تنشأ. الأدلة من الدراسات بعد الوفاة البشرية على عينات الدماغ من المرضى في مراحل مختلفة من المرض، فضلا عن مراقبة إدراج PS129-αsyn الإيجابية في الخلايا العصبية الجنينية المزروعة يوحي بقوة انتشار علم الأمراض ليوي بين الخلايا16,17,33. وبالتالي، فإن انتشار pS129-αsyn الشبيه بريون تم تلخيصه مؤخرًا باستخدام PFFs α-synuclein9،10. إنشاء قوية, فعالة من حيث التكلفة, نسبيا عالية أو متوسطة الإنتاجية نموذج من PS129-αsyn انتشار وتراكم, على وجه التحديد في الخلايا العصبية الدوبامين, يمكن أن تسرع إلى حد كبير في البحث عن العلاجات الجديدة والمركبات تعديل هذه العملية.
لأن فقدان الخلايا العصبية الدوبامين هو السبب الرئيسي للاعراض الحركية في PD وهذه الخلايا تمتلك العديد من الخصائص الفريدة2,34,35, النمذجة من انتشار مثل بريون pS129-αsyn في الخلايا العصبية الدوبامين هو النوع الأكثر صلة من نموذج من منظور الترجمة. وقد وصفت البروتوكولات التي تستخدم الثقافات الجزرية الصغيرة من الخلايا العصبية في منتصف القرنية الجنينية على 4 لوحات جيدا وتكميم نصف آلي سابقا18. تم تكييف البروتوكول الموصوف هنا مع 96 صفيحة بئر ويوفر إعدادًا أقل جهدًا للجزر الصغيرة ، مما يسمح بإعداد ما يصل إلى أربع لوحات تحتوي على 60 بئرًا لكل بئر من قبل باحث متمرس خلال يوم عمل واحد. زراعة الخلايا العصبية الدوبامين في 96 لوحات جيدا يسمح لاختبار المخدرات بكميات أقل وتمكن من معدلات تحويل عالية مع ناقلات فيروس العدس. من الممكن أيضًا الجمع بين العلاجات المختلفة لإجراء تجارب أكثر تعقيدًا.
قبل تطبيق أي علاجات (بما في ذلك PFFs)، يجب التحقق من جودة الاستزراع باستخدام المجهر مشرق المجال. إذا كان نظام المجهر لا يستخدم غرفة CO2 مع التدفئة، وينبغي عدم الاحتفاظ الخلايا خارج الحاضنة لأكثر من بضع دقائق، وذلك لأن الخلايا العصبية الرئيسية الدوبامين الماوس حساسة وشدد بسهولة. لنفس السبب، ينصح بأن التصوير الأول يجب أن يتم بعد 24 ساعة من الحضانة (بين DIV1-DIV3). وينبغي أن تظهر الخلايا على قيد الحياة مع الهيئات الخلية الحالية وتنتشر بشكل متجانس داخل الجزيرة الصغيرة. كانت الخلايا العصبية الأولية قد استقرت على الأرض المغلفة PO وبدأت في إنشاء إسقاطات عصبية. من الممكن ملاحظة كتلة صغيرة من الخلايا (أي قطر أصغر من 150-200 ميكرومتر) التي يمكن تشكيلها إذا لم يتم إجراء عملية التثابت بشكل صحيح أو كانت كثافة الطلاء أعلى من الموصى بها. هذه الكتل الصغيرة لن تؤثر على التجربة، إلا إذا كانت أكثر من عدد قليل في البئر و / أو أكبر. الخلايا المتجمعة تجعل من الصعب جدا تحديد علامات المناعة الكيميائية والخلايا الفردية أثناء تحليل الصورة. فمن الضروري تجنب مثل هذه الكتل عن طريق طلاء دقيق، triturating، والسيطرة على كثافة الطلاء. وإذا تعذر ملاحظة اتساق هذه الظروف في بعض الآبار، فلا تدرج هذه الآبار المعيبة في التجربة. وينبغي أن يتم هذا الاستبعاد قبل تنفيذ أي علاجات.
وعلاوة على ذلك، فإن استخدام 96 لوحة من الآبار يسمح باستخدام الماصات المتعددة القنوات أثناء إجراءات التلطيخ والتصور المباشر مع المجاهر التلقائية للصفائح، مما يزيد من الإنتاجية. ولا غنى عن استخدام القياس الآلي للصورة لتحليل البيانات من منصات التصوير عالية المحتوى. بالإضافة إلى القدرة على معالجة آلاف الصور التي تم الحصول عليها من كل تجربة ، فإنه يضمن تحديدًا كميًا غير متحيزًا مطابقًا لجميع مجموعات العلاج. ويستند سير العمل المقترح لتحليل الصورة على مبادئ بسيطة من تقسيم الخلايا العصبية الدوبامين, تصفية الخلايا المجزأة بشكل صحيح عن طريق التعلم الآلي تحت إشراف, وبعد ذلك quantification من الأنماط الظاهرية (pS129-αsyn إيجابية وpS129-αsyn السلبية), مرة أخرى من خلال التعلم الآلي تحت إشراف. على الرغم من أن العديد من النهج المختلفة لهذه المهمة يمكن تصورها, لقد وجدنا مزيج من تجزئة مع التعلم الآلي لتكون أقوى لثقافات الدوبامين بسبب كثافة الطلاء عالية, الأشكال المتنوعة من الخلايا العصبية الدوبامين, ووجود نيوريت ملطخة بقوة. تم تنفيذ خوارزمية تحليل الصور المقترحة في CellProfiler و CellProfiler المحلل ، مفتوحة المصدر ، متاحة بحرية عالية المحتوى صورة تحليل البرمجيات26،27. ويمكن أيضا تنفيذ الخوارزمية مع برامج أخرى لتحليل الصور، إما مفتوحة المصدر (مثل ImageJ/FIJI، KNIME) أو الملكية. ومع ذلك ، في تجربتنا هذه غالبا ما تضحي قدرات التخصيص لسهولة الاستخدام ، وبالتالي قد لا يكون أداء جيدا في التحليلات المعقدة. لقد وجدنا أن CellProfiler و CellProfiler محلل حزم البرامج تعطي نتائج موثوق بها بشكل خاص من خلال الجمع بين عدد كبير من الخوارزميات المنفذة ، والمرونة القصوى في تصميم سير العمل ، والتعامل مع البيانات ذات المحتوى العالي ومعالجتها بكفاءة.
ويمكن أيضاً تكييف البروتوكول الموصوف لتحديد كميّة الأنماط الظاهرية الخلوية الأخرى التي تتميز بالمناعة مع الأجسام المضادة المختلفة، مثل علامات مجموعات الخلايا العصبية الأخرى (مثل DAT و GAD67 و5-HT إلخ) ومجاميع البروتين (مثل فوسبو تاو، أوبيكيتين). ويمكن أيضاً الجمع بين عدة علامات فلورية للتمييز بين أنماط ظاهرية متعددة (على سبيل المثال، الخلايا التي تحتوي على اضمائر في مراحل مختلفة من النضج). وينبغي أيضا أن يكون من السهل تنفيذ التصنيف الآلي للعلامات الظاهرية المتعددة في خطوط أنابيب تحليل الصور الموصوفة بمجرد إضافة قناة تحتوي على صور مناعية لعلامات إضافية إلى خطوات القياس وفرز الخلايا في صناديق متعددة. ومع ذلك، فإن استخدام علامات متعددة في الوقت نفسه يتطلب تحسين ظروف الكبت المناعي والتصوير. بالإضافة إلى ذلك، لتحسين جودة التصوير المناعي، ينصح باستخدام خاص أسود الجدران 96 لوحات جيدا مصممة خصيصا للمجهر الفلورسنت. ومع ذلك، يمكن أن تكون هذه أكثر تكلفة بكثير من لوحات ثقافة الخلية القياسية، والتي تكون كافية للتحليل الموضح في بروتوكول لدينا.
إن نوع ونوعية PFFs المستخدمة أمران حاسمان بالنسبة لنتائج التجارب. PFFs يمكن أن تؤثر على كل من قوة من المقايسة وتفسير النتائج. وقد تؤثر ظروف التحضير على كفاءة البذر من PFFs ، وبالفعل ، PFF “سلالات” مع خصائص فسيولوجية مختلفة وقد تم الإبلاغ عن36. ومع ذلك، فإن إعداد PFFs والتحقق من صحتها خارج نطاق هذه المقالة وقد تم وصفها في العديد من المنشورات11و28و29و30. وبالإضافة إلى بروتوكول الإعداد، ينبغي النظر في أنواع منشأ α-synuclein في PFFs (مثل الفأر والإنسان) واستخدام النوع البري أو البروتين المتحول (مثل الإنسان A53T α-synuclein) حسب الظروف التجريبية الخاصة. وقد تبين أن تحريض تراكم pS129-αsyn من قبل PFFs يعتمد على عمر الثقافة (أي أيام في المختبر) ، مع ثقافات أكثر نضجا تظهر التعريفي أكثر وضوحا11. وربما يرجع ذلك إلى زيادة عدد الاتصالات العصبية في الثقافات الأكثر نضجا، وزيادة مستويات البروتين α-synuclein. في أيدينا, أعطى العلاج مع PFFs في DIV8 النتائج الأكثر قوة, مع تراكم واضح من pS129-αsyn في السوما الخلايا العصبية الدوبامين, في حين لا المساس البقاء على قيد الحياة العصبية. البروتوكول الموصوف مناسب تمامًا لدراسة العلاجات التي تعدل الأحداث المبكرة مما يؤدي إلى تجميع α-synuclein الذاتية لأننا نقوم بقياس التضمينات الإيجابية pS129-αsyn في وقت مبكر نسبيًا ، بعد 7 أيام من التطعيم مع PFFs. في هذه المرحلة، تكون التضمينات داخل الجسم موجودة في جزء كبير من الخلايا ويمكن تمييزها بسهولة عن طريق الكبت المناعي في حين لا يلاحظ موت الخلايا الناجم عن PFF، مما يبسط تفسير النتائج. الأهم من ذلك، كما يمكن أن تتغير مورفولوجيا وتكوين إدراجات الناجمة عن PFF مع مرور الوقت12،13، البروتوكول الموصوف ، من حيث المبدأ ، يمكن تعديلها لدراسة إدراج أكثر نضجا عن طريق التثبيت والمناعة في وقت لاحق من النقاط. ومع ذلك, الحفاظ على الخلايا العصبية الدوبامين في الثقافة لفترة أطول من 15 يوما يتطلب عناية بالغة, وقد تحفز على الاختلاف إضافية بسبب فشل الخلايا في البقاء على قيد الحياة بشكل مستقل عن التطعيم PFF. وبالإضافة إلى ذلك، فإن الثقافات الأكثر توسعاً تعقد جداول العلاج من المخدرات. العديد من المركبات محدودة أو لا تتميز بشكل سيئ الاستقرار في خلية ثقافة المتوسطة، وتجديد المخدرات ليست تافهة لأن التبادل الكامل للوسط يعرض للخطر بقاء الثقافات الدوبامين.
يتم الإبلاغ عن استقلاب α-synuclein في Ser129 باستمرار في نماذج مستندة إلى PFF من تجميع α-synuclein وتجميل مع علامات من الطي والتجميع مثل ثيوفلافين S، أو ubiquitin، أو الأجسام المضادة للتكين11،12. في أيدينا، والمناعة لpS129-αsyn يعطي أيضا أقوى إشارة مع أدنى الخلفية والأكثر مباشرة لتحليل، وإعطاء نتائج قوية عندما يتم فحص علاجات متعددة. الأهم من ذلك، لا يكشف الكبت المناعي بالأجسام المضادة pS129-αsyn PFFs التي تبقى خارج الخلايا، مما يقلل بشكل كبير من الخلفية. ومع ذلك، من المهم أن نتذكر أن Ser129 الفوسفور هو على الأرجح واحدة من العمليات الأولى المرتبطة باختلال α-synuclein وقد يتم تنظيمها بشكل مختلف في ظل ظروف محددة. ولذلك، ينبغي تأكيد أي نتائج تظهر آثار إيجابية على pS129-αsyn من قبل علامات أخرى.
وينبغي أن يصمم التحليل الإحصائي وفقا للتصميم التجريبي. من الضروري إجراء التجارب في ما لا يقل عن ثلاثة نسخ بيولوجية مستقلة (أي، ثقافات الخلايا العصبية الأولية المنفصلة). وينبغي أن تكون مطلية هذه النسخ المتماثلة على لوحات مختلفة وتعامل بشكل مستقل. نحلل البيانات التي تم الحصول عليها من النسخ المتماثلة على لوحات مختلفة مع تصميم كتلة عشوائية ANOVA37 لتأخذ في الاعتبار الاقتران من البيانات للوحات تجريبية مختلفة.
The authors have nothing to disclose.
نشكر البروفيسور كلفن لوك على هديته السخية من PFFs α-synuclein، وكونجونغ تشنغ لإنشاء واستزراع الخلايا العصبية، ووحدة المجهر الخفيف في معهد التكنولوجيا الحيوية، جامعة هلسنكي، للتصوير الخلايا المناعية. وقد تم دعم هذا العمل بمنح من 3i-التجديد من قبل الأعمال التجارية فنلندا (وكالة التمويل الفنلندية للابتكار) ، أكاديمية فنلندا #309489 ، #293392 ، #319195؛ مؤسسة سيغريد جوسيليوس، والصناديق القانونية للمعهد الرائد لعلم الأدوية، PAS، بولندا.
0.4% Trypan Blue stain | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 15250061 | |
15 ml CELLSTAR Polypropylene tube | Greiner Bio-One GmbH, Frickenhausen, Germany | 188261 | |
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | 10236276001 | |
5 M HCl | N/A | N/A | Media kitchen, Institute of Biotechnology, University of Helsinki |
5 M NaOH | N/A | N/A | Media kitchen, Institute of Biotechnology, University of Helsinki |
96-well ViewPlate (Black) | PerkinElmer, Waltham, Massachusetts, USA | 6005182 | |
99.5% Ethanol (EtOH) | Altia Oyj, Rajamäki, Finland | N/A | |
AquaSil Siliconizing Fluid | Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | TS-42799 | |
Autoclaved 1.5 ml microcentrifuge tube | N/A | N/A | Media kitchen, Institute of Biotechnology, University of Helsinki |
Bioruptor sonication device | Diagenode, Liege, Belgium | B01020001 | |
Ca2+, Mg2+ free Hank’s Balanced Salt Solution (HBSS) | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 14175-053 | |
CellProfiler and CellAnalyst software packages | N/A | N/A | free open-source software |
Centrifuge 5702 | Eppendorf AG, Hamburg, Germany | 5702000019 | |
CO2 Incubator | HeraCell, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | N/A | |
Counting chamber | BioRad Inc., Hercules, California, USA | 1450015 | |
DeltaVision Ultra High Resolution Microscope with air table and cabinet | GE Healthcare Life Sciences, Boston, Massachusetts, USA | 29254706 | |
Deoxyribonuclease-I (Dnase I) | Roche, Basel, Switzerland | 22098700 | |
D-glucose | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | G8769 | |
DMEM/F12 | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 21331–020 | |
donkey anti-mouse AlexaFluor 488 | Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | A21202 | |
donkey anti-rabbit AlexaFluor 647 | Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | A31573 | |
donkey anti-sheep AlexaFluor 488 | Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | A11015 | |
Dulbecco's buffer | N/A | N/A | Media kitchen, Institute of Biotechnology, University of Helsinki |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 10500056 | |
Fisherbrand Plain Economy PTFE Stir Bar | fisher scientific, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 11507582 | |
ImageXpress Nano Automated Imaging System | Molecular Devices, San Jose, California, USA | N/A | |
L-glutamine | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 25030–032 | |
mouse monoclonal anti-tyrosine hydroxylase | Millipore, Merck KGaA, Darmstadt, German | MAB318 | |
N2 supplement | Gibco, Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, USA | 17502–048 | |
Normal Horse Serum | Vector Laboratories Inc., Burlingame, California, United States | S-2000 | |
paraformaldehyde (PFA) | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | 158127 | |
paraformaldehyde powder, 95% | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | 158127 | |
pH-Fix, color-fixed indicator strips | Macherey-Nagel, Düren, Germany | 92110 | |
Phospohate Buffer Saline (PBS) | N/A | N/A | Media kitchen, Institute of Biotechnology, University of Helsinki |
poly-L-ornithine | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | P4957 | |
Primocin | InvivoGen, San Diego, California, USA | ant-pm-1, ant-pm-2 | |
rabbit monoclonal anti-alpha-synuclein filament | Abcam, Cambridge, United Kingdom | ab209538 | |
rabbit monoclonal anti-phospha-serine129-alpha-synuclein | Abcam, Cambridge, United Kingdom | ab51253 | |
RCT Basic, IKA Magnetic Stirrer | IKA®-Werke GmbH, Staufen, Germany | 3810000 | |
recombinant human glia-derived neurotrophic factor (hGDNF) | PeproTech, Rocky Hill, NJ, USA or Prospec, Ness-Ziona, Israel | 450-10 (PeproTech), CYT-305 (Prospec) | |
recombinant mouse alpha synuclein Pre-Formed Fibrils (PFFs) | N/A | N/A | Gift from collaborator, Prof. Kelvin C Luk |
Research Stereomicroscope System | Olympus Corporation, Tokyo, Japan | SZX10 | |
sheep polyclonal anti-tyrosine hydroxylase | Millipore, Merck KGaA, Darmstadt, German | ab1542 | |
TC 20 Automated Cell Counter | BioRad Inc., Hercules, California, USA | 1450102 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | 11332481001 | |
trypsin | MP Biomedicals, Valiant Co., Yantai, Shandong, China | 2199700 |