כאן אנו מציגים פרוטוקול המשמש לביצוע ניסויי מיקרוסקופ כוח גרירה על תאי B. אנו מתארים את הכנת ג’לים פוליקרילאמיד רכים ואת הפונקציונליזציה שלהם, כמו גם רכישת נתונים במיקרוסקופ וסיכום של ניתוח נתונים.
מיקרוסקופ כוח משיכה (TFM) מאפשר מדידה של כוחות המיוצרים על ידי תא עלמצע. טכניקה זו מסיקה מדידות כוח משיכה מתוך שדה עקירה שנצפה באופן ניסיוני המיוצר על ידי תא מושך על שקוע אלסטי. כאן, התאמנו TFM לחקור את המבנה המרחבי והזמני של שדה הכוח המופעל על ידי תאי B כאשר מופעל על ידי מעורבות אנטיגן של קולטן תא B. קשיחות ג’ל, צפיפות חרוזים, ופונקציונליזציה חלבון חייב להיות אופטימיזציה למחקר של תאים קטנים יחסית (~ 6 μm) כי אינטראקציה עם, ולהגיב במיוחד ליגנדים עבור קולטני פני השטח של התא.
תאי B הם התאים המייצרים נוגדנים של המערכת החיסונית. כדי להפעיל את התגובה החיסונית הסתגלנית, הם רוכשים תחילה את האנטיגן בצורה מקורית (כלומר, לא מעובד) באמצעות קולטן ספציפי הנקרא קולטן תא B (BCR)1. תהליך זה מתרחש באזור תא צומת הלימפה B. גם אם כמה אנטיגן יכול להגיע לתא B באמצעות נוזלים לימפה, רוב האנטיגן, במיוחד עם משקל מולקולרי גבוה (>70 kDa, שהוא גודל המגבלה עבור מוליכים לימפה) אכן מוצגים בצורתם המקורית על פני השטח של תא אנטיגן מציג (APC), בדרך כלל מקרופאג סינוס תת-קספרלי או תא דנדריטי זקיק, באמצעות קולטני לקטין או FC (לא ספציפי). הקשר עם תא זה מוביל להיווצרות סינפסה חיסונית שבה BCR מפעיל כוח על אנטיגן הקשורים APC. הכריכה של אנטיגן ל-BCR יוזמת איתות BCR, אשר עשוי להפעיל מנגנונים ליצירת כוח. כוחות אלה יכולים להיות חשובים להגברת איתות BCR, אבל הם גם חיוניים עבור תאי B לחלץ ולאחר מכן להפנים את האנטיגן.
מחקרים שנעשו לאחרונה הראו כי BCR הוא אכן mechanosensitive2. לדוגמה, מצעים נוקשים יותר מעוררים איתות BCR משופר3. יתר על כן, כוח שנוצר על סינפסה חיסונית מושך על BCRs יחיד כדי לחקור את זיקתו אנטיגן ובכך להבטיח אפליה זיקה4. לכן מעניין לחקור את התגובה המכנית של תאי B למצגת אנטיגן ול לנתח תגובה זו במונחים של סוג של קולטנים מעורב (IgG /IgM)5,מולקולות הדבקה (ליגנדים אינטגריים) או בתאים מהונדסים גנטית ורוקמטית (כלומר, השתקת חלבון במורד הזרם של דינמיקת איתות BCR או ציטוסקלטון)6.
שיטה פשוטה כדי לבחון את התגובה של תא למצע של קשיחות פיזיולוגית, באותו זמן, כוחות מחקר המופעלים על המצע הוא מיקרוסקופ כוח משיכה (TFM). TFM מורכב מהתבוננות בשדה העקירה המיוצר על ידי התא מושך עלמצע אלסטי. במקור העיוות של הג’ל נצפתה באמצעות קמטים של elastomer עצמו על ידימיקרוסקופית ניגודיות שלב 7, אבל הכניסה של microbeads פלואורסצנס כמו סמנים fiducial מותר רזולוציה טובה יותר ומאזהפך תקן 8. שיטה זו שימשה כדי לחקור את כוח המתיחה המופעל על ידי תאים דבקים, רקמות, ואפילו אורגנואידים מוטבעים ג’לים. מספר וריאציות של TFMפותחו 9 כולל, בשילוב עם מיקרוסקופית superresolution (כלומר, STED10 או SRRF11),שינוי של אינדקס שבירה של הג’ל כדי לאפשר מיקרוסקופ TIRF12, החלפת חרוזים על ידי דפוסי ננומודפסים 13, ושימוש nanopillars במקוםמשטח שטוח 14. לסקירה מלאה של וריאציות אלה, ראה קולין-יורק ואח ‘15.
הפרוטוקול המוצג כאן מתאר הליך למדוד כוחות המופעלים על ידי תאי B על בהצעה מצופה אנטיגן. כוחות אלה מוחלים על הליגנדים (אנטיגן) על מנת לאגבר אותם ולאחר מכן לחלץ אותם מהמצע מציג אנטיגן. התאמנו את פרוטוקול TFM הסטנדרטי כדי לחקות את הקשיחות של מצעים פיזיולוגיים להצגת אנטיגן, את הגודל ואת הציפוי הרלוונטי לתאי B. פרוטוקול זה מאפשר לחקור מספר תאים בו זמנית, ניתן להשתמש בשילוב עם טכניקות מיקרוסקופיות פלואורס הצפי וטיפולים כימיים. עם זאת, היא אינה שואפת לחקור מדידות כוח מולקולה אחת, שעבורןפינצטה אופטית 16,בדיקות מתח מולקולרי 17,18, בדיקות כוח ביומברנה19, ומיקרוסקופ כוחאטומי 20 הם טכניקות מתאימות יותר. בהשוואה לשיטות מדידה אחרות של כוח תא יחיד (לדוגמה, micropipettes21 או microplates22)TFM מאפשר שחזור של מפה מלאה של הכוחות המופעלים על הסינסה עם רזולוציה של כ-300 00 00 00 00:00.00. זה שימושי כדי לזהות דפוסי spatio-זמני בכוחות המופעלים על פני השטח, כמו הג’ל תואם עם הדמיה confocal, כדי לתאם אותם עם גיוס של חלבונים ספציפיים (למשל, cytoskeleton וחלבונים איתות).
למרות TFM 3D אפשרי, זה אינו תואם את הקשיחות ואת ההתקנה שהשתמשנו. עיוותים ב3D הם בר השגה על ידי הגדרות מורכבות יותר כגון מיקרוסקופ כוח בורה (AFM סריקת קרום מעוות שבו התאים מצופים)23,24 ו הפרעות מהדהד אלסטיות מיקרוסקופיות מתח (ERISM, ג’ל הפועל כמו חלל מהדהד לאור והדגשת עיוותים של הצוללת עם דיוק של כמה ננומטר)25. למרות טכניקות אלה מבטיחות מאוד, הם עדיין לא הועסקו בתאי B. סוגים אחרים של TFM, כגוןבננו-פיילים 14, יכולים לשמש למצעים לשחזור. עם זאת, גיאומטריה זו אינה מותאמת לתאים רכים כאשר התא מצטלב בין העמודים, מה שמסבך את הניתוח. גישה זו אכן שימשה בתאי T כדי לבחון את היכולת של התא לבנות מבנים סביב העמודים26.
למרות הפשטות שלה, TFM באמצעות ג’לים polyacrylamide מאפשר תצפית בו זמנית של תאים רבים, ניתן ליישם בקלות ובמחיר בכל מעבדה מצויד ספסל מיקרוסקופ epifluorescence (אם כי אנו ממליצים על דיסק confocal / ספינינג).
כדי לחקות את הקשיחות הפיזיולוגית של APC, השתמשנו ג’לים polyacrylamide עם קשיחות של ~ 500 Pa27 ופונקציונלי הג’ל עם הפעלת אנטיגן. בפרוטוקול זה, פונקציונלינו את פני השטח של ג’ל polyacrylamide עם לייזום ביצת תרנגולת (HEL). הדבר מאפשר מדידה של כוחות שנוצרו על ידי גירוי של BCR באמצעות מעורבות של אתר מחייב אנטיגן. השימוש אנטיגן זה ותאי B ספציפיים HEL מעכברי MD4 מבטיח ייצור כוח אחיד יחסית בתגובה לרצועות אנטיגן28. עם זאת, מולקולות אחרות (כגון אנטי-IgM לעכברי B6) ניתן להשתיל על הג’ל, אבל הכוחות שנוצרו במקרים אלה יכול להיות הטרוגני יותר ופחות אינטנסיבי. מכיוון שתאי B הם תאים קטנים (קוטר ~ 6 μm), מספר החרוזים כבר אופטימיזציה להיות מקסימלי אך עדיין למעקב. עבור תאים גדולים המפעילים ~ kPa כוחות על מצעים שלהם, אחד יכול להשיג תוצאות משביעות רצון באמצעות חרוזים ודליל יחסית או ביצוע מהירות תמונה חלקיקים פשוטה (PIV) כדי לשחזר את שדה עיוות. עם זאת, עבור תאים קטנים כגון לימפוציטים B המפעילים מתח קטן כמו ~ 50 הרשות, השימוש מעקב חלקיקים יחיד נדרש (מהירות מעקב חלקיקים, PTV) כדי להשיג את הדיוק הרצוי בעת שחזור שדה עיוות. על מנת לעקוב באופן אמין אחר חרוזים בנפרד, ההגדלה של העדשה האובייקטיבית צריכה להיות לפחות פי 60 ואת הצמצם המספרי שלה בסביבות 1.3. לכן, הג’לים חייבים להיות דקים יחסית (<50 μm), אחרת החרוזים אינם גלויים כפי שהם מעל מרחק העבודה של המטרה.
הפרוטוקול העיקרי מורכב משלושה סעיפים: הכנת ג’ל, תפקוד ג’ל והדמיה; שני חלקים נוספים הם אופציונליים ומוקדשים לכמות והדמיה של תאי פלורסנט אנטיגן.
שיטת TFM המתוארת כאן מאפשרת מחקר שיטתי של היכולות המכניות הפעילות של תאי B. בהקשר של תאי B, זה קשור ליכולת לחלץ ולהפנים את האנטיגן. בהשוואה לשיטות TFM אחרות, הפרוטוקול המוצג כאן הוא פשוט ולא לשחזור: הקשיחות, נמדד על ידי חריץ של מיקרוספירה זכוכית ובשימוש מודל הרץ, הוא בין 400 ו 600 הרשות הפלסטינית. פרוטוקולים דומים שימשו בהצלחה לא רק עבור תאי B35 אלא גם עבור תאי T36. בהשוואה nanopillars (משמש גם עבור לימפוציטים T37)הוא מספק משטח הומוגני שטוח, ולכן התוצאות קל יותר לפרש כמו האינטראקציה של הג’ל מוגבלים בעיקר להיות משיק על פני השטח.
הפרוטוקול שתיארנו נותן גישה לדינמיקה של הכוחות המופעלים על ידי תאי ב’ על מצעים מציגי אנטיגן. ברמה המרחבית זה מספק מידע על ההתקליזציה של כוחות, ובשילוב עם מיקרוסקופ פלואורסצנט, מאפשר לנסוי לתאם כוחות מקומיים עם נוכחות של מולקולות ספציפיות (כלומר, רכיבים של השלד ציטוסק או BCR איתות מפל). ברמת הזמן, ניתן לשלב כמויות (כגון אנרגיה כוללת או מתח כולל) כדי לספק ערך אחד לכל נקודת זמן ולהפחית את הרעש. הדבר מאפשר התבוננות באבולוציה של כוח המתיחה בזמן (צמיחה ומישור) ונוכחות של דפוסי פועם.
היבטים ניסיוניים קריטיים לניתוח מתוארים כהודעה הבאה. (i) צפיפות תאים: כדי לבצע ניתוח נכון, יש להפריד את התאים במידה מספקת. אנו מחשיבים תא שניתן לנתחו אם יש לו אזור ריק בגודלו סביבו. (2) תמונת שידור: מומלץ לאסוף לפחות תמונת שידור של התאים במהלך הניסוי שישמש כמסכה בניתוח. (iii) מספר החרוזים בתמונה: אנו מציעים לנתח רק תמונות שבהן מספר החרוזים בסינפסה הוא בין 30 ל-200 (כלומר, 1-8 חרוזים/μm²). צפיפויות נמוכות יותר אינן מאפשרות שחזור עקירת מפה הולם. צפיפויות חרוזים גבוהות הופכות מעקב אחר חלקיקים בודדים ללא אמין. (4) מספר החרוזים צריך להיות קבוע במהלך הניסוי; עם זאת, תנודות עלולות להתרחש עקב שונות קטנה בתנאי ההדמיה (במיוחד בחרוזים הקרובים מדי זה לזה). יש לתקן את הסחף של המוקד, אם מתרחש, ויש למחוק מסגרות בעייתיות. (v) איכות ג’ל: ג’לים עם סדקים רבים מדי, שונות בחלוקת חרוזים או ג’לים עבים מדי יש להשליך. (vi) בהתאם לסוג התא, לאחר חשיפות חוזרות ונשנות, תאים בנקודות זמן מאוחרות (>300 מסגרות) עלולים לסבול מאפקטים פוטוטוקסיים. מומלץ להפעיל את התוכנית על מסיכה נטולת תאים כ”בסיס” להשוואה עם הנתונים. זה מספק גודל של רמת הרעש אך ורק בשל התנאים הניסיוניים.
ג’לים המשמשים למדד כוח משיכה בהדבקה קלאסית מאפשרים חקירה של תהליכים המתרחשים בהדבקה המוקדית (זרמי א-אקטין וגיוס מולקולות איתות)– הנקודות שבהןמוחלים כוחות 38,39. עם זאת, כוחות בסינופסה אינם מיושמים באמצעות הידבקויות מוקד. דפוס spatiotemporal של דור כוח ב סינפסה חיסונית תא B לא נחקר באופן כמותי באמצעות שיטה זו עד לאחרונה. באמצעות TFM, הבחנו בפעם הראשונה, דפוס כוח בסינפסה חיסונית תא B, כפי שהוצג במחקר האחרון שלנו 6 ,פתיחת פרספקטיבות מעודדותבמחקר של לימפוציטים.
במיוחד, שיטה זו משתמשת בתמונה שצולמה לפני הגעת התאים על הג’ל כתדמית התייחסות לחישוב הכוח. פרוטוקולי TFM הרגילים מציעים לקחת את תמונת ההפניה בסוף הניסוי, לאחר נתק התאים עם trypsin; הדבר מאפשר לנסוי לחפש אזור עשיר בתאים. למרות שזה אפשרי גם כאן, trypsin הוא יעיל למדי בניתוק תאי B מג’ל מצופה אנטיגן, אחד צריך לחכות זמן רב לניתוק ואת הסיכון של שינוי ג’ל ותנועות (מה שהופך את כל הנתונים להגדיר בלתי מוסבר) הוא גבוה יותר.
השיטה המוצגת כאן היא גמישה, ניתן להחיל כדי ללמוד את ההשפעה של אותות אחרים על סינפסה חיסונית כפי שהוא מאפשר השתלת חלבונים אחרים על פני השטח של הג’ל (למשל, ליגנדים אינטגרין ו immunoglobulins נבדקו) ואפילו אנטיגן פלורסנט (ראה סעיף 4). יתר על כן, תאים נשארים נגישים לנסוי לטיפול תרופתי וturturbations מקומי. לבסוף, השיטה תואמת גם עם תאים קבועים הדמיה. עבור תצפיות אלה, מומלץ לעשות את הג’ל על כיסוי, להכתים את התאים, להדביק את כיסוי על שקופית ורק אז להוסיף מדיה הרכבה וכיסוי אחר. לאחר מכן התצפית תיעשה עם הג’ל למעלה כדי למנוע את ההשפלה של התמונה דרך הג’ל.
מלכודות אפשריות הן השונות בג’ל בפולימר וציפוי. בעיות פולימר הן בעיקר בשל איכות היוזם / זרז. כמו כן, הג’ל יכול לנפח, במיוחד אם לא נעשה שימוש מיד לאחר ההרכבה. בעיה זו לא נראה להשפיע באופן דרמטי על המאפיינים המכניים של הג’ל, אבל זה יכול להפוך את שכבת החרוז בלתי נגיש עבור המטרה, ביעילות מה שהופך את הג’ל חסר תועלת. אנו ממליצים להכין ג’לים נוספים עבור כל תנאי כאשר בעיה זו מופיעה. ייתכן שיש גם שונות מסוימת בציפוי, וזה חיוני יש מדולל טרי Sulfo SANPAH.
לסיכום, תיארנו שיטה פשוטה, זולה וניתנת לשחזור כדי למדוד את הכוחות המופעלים על ידי תאי B בסינפסה החיסונית כאשר הופעלו על ידי BCR ליגנד. זה יכול להיות מותאם ללמוד את התגובה ליגנדים אחרים סוגים אחרים של לימפוציטים (תאי זיכרון B, תאי T, וכו ‘) עם השימוש ליגנד קולטן הנכון.
The authors have nothing to disclose.
המחברים מודים M. בולג’ר-מונרו על קריאה ביקורתית ולהכיר ניקון הדמיה Center@CNRS-InstitutCurie ו PICT-IBiSA, המכון קירי, פריז, חבר תשתית המחקר הלאומי צרפת-BioImaging, לתמיכה ברכישת תמונה ואת מתקן בעלי חיים קירי. PP נתמך על ידי CNRS. AK ו-JP נתמכו על ידי מלגת הדוקטורט של פריז דקארט ו-Ecole Doctorale FIRE – תוכנית בטנקורט. פרויקט זה מומן על ידי מענקים ל- PP (ANR-10-JCJC-1504-Immuphy) ו-AMLD (ANR-PoLyBex-12-BSV3-0014-001, ERC-Strapacemi-GA 243103).
3-aminopropyltrimethoxysilane (APTMS) | Sigma-Aldrich | 281778 | Store aliquoted, protected from humidity |
40% Acrylamide Solution | Biorad | 1610140 | |
Alexa555 microscale protein labeling kit | Molecular Probes | A30007 | |
Ammonium Persulfate (APS) | Sigma-Aldrich | A3678 | |
B cell Isolation Kit, Mouse | Miltenyi Biotec | 130-090-862 | |
B-mercaptoethanol | Gibco | 31350-010 | |
2% Bis Solution | Biorad | 161-0142 | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Euromedex | 04-100-812-C | |
Coverslip 18mm | VWR | 631-1580 | |
Fetal calf serum | PAA | A15-151 | Decomplemented (40min @56°C) |
Fluorodishes FD35 | World Precision Instruments, Inc | FD35100 | |
Fluosphere: carboxylate-modified, 0.2um, dark red | Molecular Probes | F8807 | |
Hen Egg Lysozyme | Sigma-Aldrich | L6876 | Stocked in aliquote 100mg/ml |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100X) | Thermofisher/Gibco | 11140035 | |
N,N,N',N'-tetrametiletilendiammine (TEMED) | Euromedex | 50406-B | |
PBS (Phosfate Buffer Saline) | Gibco | 10010-015 | |
Penicillin–streptomycin | Gibco | 15140-010 | |
RMPI 1640 – Glutamax I | Thermofisher | 61870-010 | |
Sigmacote | Sigma-Aldrich | SL2 | |
Sodium pyruvate | Gibco | 11360-039 | |
sulfosuccinimidyl 6-(4'-azido-2'-nitrophenylamino)hexanoate (Sulfo-SANPAH) | Thermo Scientific | 22589 |