Nous décrivons des protocoles pour évaluer le degré de transduction par des peptides cellulaires pénétrant utilisant des systèmes d’imagerie ex vivo suivis de l’incorporation de paraffine, de section et de microscopie fluorescente confocale utilisant le peptide de ciblage cardiaque comme exemple. Dans notre protocole, un seul animal peut être utilisé pour acquérir les deux types d’évaluation d’imagerie des mêmes organes, réduisant ainsi de moitié le nombre d’animaux nécessaires aux études.
Depuis la description initiale des domaines de transduction de protéines, également connus sous le nom de peptides pénétrants cellulaires, il y a plus de 25 ans, il y a eu un vif intérêt pour le développement de ces peptides, en particulier spécifiques aux cellules, comme nouveaux vecteurs pour la fourniture de matériaux diagnostiques et thérapeutiques. Nos travaux passés impliquant l’affichage de phage ont identifié un nouveau, non nonaturally se produisant, 12 peptide d’acide aminé-long que nous avons nommé peptide de ciblage cardiaque (CTP) en raison de sa capacité à transduce le tissu cardiaque normal in vivo avec l’absorption de crête vue dans aussi peu que 15 min après une injection intraveineuse. Nous avons entrepris des études détaillées de biodistribution en injectant CTP étiqueté avec la cyanine de fluorophore5.5, lui permettant de circuler pendant diverses périodes de temps, et l’euthanasie, la fixation, et la section des organes multiples suivis par l’imagerie fluorescente de microscopie. Dans cette publication, nous décrivons ces processus ainsi que l’imagerie ex vivo des organes récoltés à l’aide d’un système d’imagerie in vivo en détail. Nous fournissons des méthodologies et des pratiques détaillées pour entreprendre des études de transduction ainsi que des études de biodistribution en utilisant CTP comme exemple.
La membrane plasmatique cellulaire est une barrière semi-perméable qui est essentielle pour l’intégrité et la survie des cellules et sert à réguler l’intérieur de la cellule en contrôlant le mouvement des substances dans la cellule. Bien que vitale pour la survie, il présente également un obstacle à la livraison de la cargaison à la cellule. En 1988, le trans-activateur de la protéine de transcription (Tat) du virus de l’immunodéficience humaine a été montré pour entrer dans les cellules cultivées et promouvoir l’expression virale des gènes1,2, avec les domaines responsables de cette transduction limitée à une région riche en 13 acides aminés riches en arginine et lysine de la troisième hélice3 Ceux-ci ont été ainsi nommés peptides cellulaires pénétrants (PPC). Ceci a été suivi par la recherche montrant la capacité du peptide de Tat de transporter le β-galactosidase fonctionnel dans plusieurs types de cellules4. Depuis la description initiale, le nombre de peptides pénétrant dans les cellules a augmenté de façon spectaculaire. Ces domaines de transduction sont des peptides courts d’origine naturelle ou synthétique, généralement de 6 à 20 acides aminés de long, qui sont capables de transporter des cargaisons fonctionnelles à travers les membranes cellulaires. Ces cargaisons peuvent s’étendent d’autres petits peptides, protéines pleine longueur, acides nucléiques, nanoparticules, particules virales, molécules fluorescentes, et radioisotopes5. Les premiers CPP décrits n’étaient pas spécifiques aux cellules, tat étant pris par plusieurs types de cellules et même en traversant la barrière hémato-encéphalique4, limitant ainsi son potentiel thérapeutique. Afin d’identifier les CPP spécifiques aux cellules, les chercheurs ont entrepris l’affichage phage en utilisant de grandes bibliothèques de phages disponibles dans le commerce6. Notre propre travail utilisant une méthodologie d’affichage de phage in vitro et in vivo combinatoire a mené à l’identification d’un peptide de ciblage cardiaque (CTP)7, un peptide de 12 acides aminés, non naturel (NH2-APWHLSSQYSRT-COOH) qui cible le coeur avec l’absorption de pointe à 15 min après une injection intraveineuse périphérique8. En utilisant la colocalisation immunofluorescente avec l’actine, un marqueur intracellulaire, et l’exclusion de la laminine, un marqueur de membrane cellulaire, nous avons montré que CTP est intériorisé en cardiomyocytes de souris après une injection intraveineuse7. En outre, nous avons incubé des cardiomyocytes de battement pluripotents induits par l’homme de cellules souches avec CTP double-étiqueté, étiquetés avec la 6-carboxyfluorescéine à son C-terminus et rhodamine à son N-terminus par un lien d’ester qui ne pouvait être clivé par des esterases intracellulaires. L’accumulation rapide de rhodamine dans les cardiomyocytes de battement a été observée dans les 15 min sur la microscopie confocale8.
Dans cet article, nous présentons deux méthodologies complémentaires qui peuvent être utilisées pour suivre la biodistribution et confirmer l’internalisation spécifique aux tissus des PCP en utilisant CTP comme exemple. Pour ces méthodologies, CTP a été synthétisé, fluorescent étiqueté au N-terminus avec la cyanine5.5 (CY5.5), et amide-plafonné au C-terminus pour une plus grande stabilité de peptide. Les deux méthodes utilisées sont les systèmes d’imagerie optique fluorescente in vivo et la microscopie fluorescente des sections de tissu. Les deux méthodes sont très utiles pour étudier la biodistribution, l’absorption et l’élimination des CPP étiquetés fluorescents. L’avantage d’évaluer la biodistribution à l’aide de ces méthodes par rapport à d’autres, comme la tomographie par émission de photons simples (SPECT) ou la tomographie par émission de positrons (PET), est qu’il n’est pas nécessaire d’étiqueter les CPA à durée de vie par rapport à l’étiquetage fluorescent, qui est relativement facile et utilisé de façon routinière dans toutes les installations de synthèse de peptides. L’utilisation de l’imagerie in vivo produit rapidement des données de biodistribution dans le contexte d’un système vivant, tandis que la section fournit une plus grande information approfondie sur l’absorption et la localisation des peptides dans les cellules par la préservation des détails morphologiques. Ce protocole peut être appliqué à une grande variété d’organes et de tissus tels que le cœur, le poumon, le foie, les reins, le cerveau, la rate, l’estomac, le gros intestin, l’intestin grêle, le muscle squelettique, les os, les testicules/ovaires et les yeux.
Les modèles animaux sont essentiels pour le développement de médicaments précliniques à chaque étape du processus, de l’identification de nouveaux PCP, des études de biodistribution, du mécanisme de transduction, à l’essai final de l’efficacité de la cargaison livrée en utilisant ces nouveaux CPP comme vecteurs. Il existe de nombreuses méthodes couramment utilisées pour évaluer la biodistribution comme l’histologie, l’imagerie en médecine nucléaire (SPECT et PET) et l’imagerie optique in vivo12. Les méthodes d’imagerie nucléaire peuvent être lourdes en raison de la disponibilité limitée des systèmes SPECT et PET pour petits animaux, ainsi que de la capacité de produire des conjugués radiolabel-médicaments, qui nécessitent l’expertise d’un radiochimiste. En revanche, les étiquettes fluorescentes sont beaucoup plus simples et peuvent être rentables pour travailler avec. Le protocole décrit dans cet article permet une analyse rapide de la biodistribution à l’aide de multiples méthodes. L’imagerie optique fluorescente ex vivo permet la comparaison immédiate de la fluorescence entre différents tissus et groupes de traitement et peut identifier l’absorption d’organes et le temps de pic d’absorption dans l’organe d’intérêt d’une manière semi-quantitative. L’histologie quantitative des tissus nécessite un traitement plus étendu pour traiter, sectionr, imager et analyser les tissus, mais elle fournit plus de données au niveau microscopique et est une technique standard actuelle. Il est utile de noter que la comparaison directe et quantitative entre les deux techniques n’est pas possible, parce que l’autofluorescence observée avec chaque technique pour différents organes et longueurs d’onde d’excitation varie considérablement.
Une partie importante de ce protocole consiste à choisir le fluorophore droit pour étiqueter les CPP candidats pour les expériences. Un problème potentiel est le chevauchement des spectres, qui peut être problématique lorsque plusieurs fluorophores sont nécessaires. Les supports de montage fluorescent DAPI et le Cy5.5 n’ont pas de spectres qui se chevauchent. Toutefois, pour certaines applications où de multiples fluorophores sont nécessaires, le risque de chevauchement spectral doit être soigneusement pris en considération. Selon le système utilisé, la sélection des fluorophores peut être limitée. Par conséquent, la connaissance des capacités du système est essentielle. Les systèmes optiques fluorescents sont mieux utilisés avec des fluorophores infrarouges lointains ou proches en raison de l’absorption élevée des tissus des longueurs d’onde plus courtes13. Les fluorophores de la gamme des protéines fluorescentes vertes améliorées ont une limitation majeure, parce qu’il y a l’autofluorescence significative d’organe vu à sa longueur d’onde d’excitation, spécifiquement dans le cerveau et le tissu de foie. Selon les conditions d’une expérience, il est préférable d’éviter certains fluorophores. Certains fluorophores organiques solubles dans l’eau ont une forte interaction avec les bicouches lipidiques, ce qui peut causer de faux positifs. Par conséquent, il est conseillé de prendre des mesures pour déterminer si un fluorophore a une forte affinité avec le tissu d’intérêt14. Un autre facteur à considérer est la sélection de la méthode appropriée de conjugaison de fluorophore, qui peut être un paramètre important affectant les résultats. Les CPP peuvent être étiquetés fluorescents au terminus N ou C par un lien covalent entre le terminus N du peptide et le groupe carboxyle du colorant tel que Cy5.5-NHS. Il faut faire attention, parce que le mécanisme de transduction de la plupart des CPP n’est pas compris en détail et la conjugaison à une extrémité peut affecter le mécanisme d’absorption plus qu’à l’autre extrémité. Une autre possibilité pour l’étiquetage des CPP est de biotinyler le N-terminus pour la conjugaison à la streptavidine fluorescente étiquetée. L’utilisation de cette stratégie a la commodité de permettre différents conjugués fluorescents streptavidin d’être utilisés. Cependant, une limitation possible de cette stratégie est qu’un complexe de biotine-streptavidine est une grande construction, qui pourrait potentiellement interférer avec la transduction.
Les systèmes d’imagerie optique fluorescente sont une stratégie efficace pour générer une comparaison efficace de la fluorescence entre différents organes et traitements, mais ils sont incapables de produire une mesure quantitative des concentrations absolues dans les tissus. Ceci est dû aux effets de diffusion de la lumière dans le tissu, qui est encore aggravée par la variété naturelle dans les tailles et les densités de tissus, et les différences dans la vascularité, avec la dispersion variable de fluorescence. L’autofluorescence des tissus peut également être un facteur, en raison de sources biochimiques naturelles telles que le collagène, ou des sources alimentaires comme la chlorophylle dans les aliments13.
L’histologie est la méthode la plus couramment utilisée pour mesurer la biodistribution et peut potentiellement être utilisée pour mesurer et comparer avec précision l’absorption entre différents tissus au fil du temps. Les problèmes de diffusion de la lumière sont évités en utilisant cette méthode parce que tous les tissus sont sectionnés à la même épaisseur15. Un avantage majeur de cette méthode est la capacité d’inclure des étiquettes fluorescentes supplémentaires postsection pour l’immunohistorichimie. Bien que l’ajout d’un autre fluorophore puisse rendre l’imagerie plus difficile, l’utilisation d’étiquettes fluorescentes peut être utile pour la localisation d’un RPC dans des compartiments intracellulaires particuliers, comme les lysosomes ou les mitochondries. Un anticorps pourrait être utilisé dans une expérience de microscopie confocale pour déterminer si un candidat transduqué CPP colocalise avec une structure d’intérêt, ce qui peut montrer le potentiel d’un RPC en tant qu’agent de livraison. Une limitation de cette méthode est que la préparation des diapositives à partir d’échantillons d’organes peut prendre beaucoup de temps, la main-d’œuvre, et sujette à l’erreur humaine12,15. Lors de l’imagerie des diapositives, il faut prendre soin de ne pas imager le même endroit trop longtemps pour éviter le photobleaching. Certains photobleaching sera inévitable, en fonction de la sensibilité de la fluorophore. Il faut faire attention à chaque étape de ce protocole pour protéger les échantillons de la lumière ambiante et les stocker correctement16. Nous recommandons que les diapositives soient stockées à 4 °C, protégées par la lumière, pour l’imagerie future.
Il existe une variété de méthodes disponibles pour mesurer la biodistribution d’un RPC candidat qui nécessitent de l’équipement spécialisé et peuvent produire des résultats comparables, bien qu’elles puissent nécessiter une étiquetage plus complexe du RPC. Le protocole décrit dans cet article utilise deux méthodes compatibles pour produire efficacement des données de biodistribution dans le contexte d’un système vivant tout en permettant l’acquisition d’informations plus approfondies sur l’internalisation des peptides dans les cellules à partir du même échantillon, réduisant ainsi de moitié le nombre d’animaux nécessaires à une étude. Ces méthodes ont été utilisées pour générer les données ci-dessus, qui démontrent que les deux méthodes peuvent être utilisées séquentiellement chez le même animal, et la qualité des données générées par chacun. Nos résultats mettent également en évidence l’incapacité de corréler directement les résultats entre les deux techniques d’une manière quantitative.
The authors have nothing to disclose.
M.Z. et K.S.F. sont soutenus par l’American Heart Association Scientist Development Award 17SDG333411180, et par une subvention accordée dans le cadre du Pitt Innovation Challenge (PInCh®), par l’intermédiaire du Clinical and Translational Science Institute de l’Université de Pittsburgh.
10% Buffered Formalin Phosphate | ThermoFisher | SF100-4 | |
10x Tris Buffered Saline (TBS) | ThermoFisher | BP2471-1 | |
12-well Cell Culture Plate | ThermoFisher | 353043 | |
1x TBS Solution | 10x TBS is diluted 1:10 with deionized water. This solution can be stored at room temperature. | ||
20 mL Scintillation Vials | Wheaton | 334173 | |
26G Needles | Becton Dickinson | 305110 | |
28G 0.5ml Insulin syringes | Becton Dickinson | 329461 | |
3mL Syringe | Becton Dickinson | 309657 | |
CD1 Mice | Charles River | 022 | 6 to 12 week old albino, female mice |
Cover Glass | ThermoFisher | 12-544-14 | |
Cy5.5-CTP-amide | Prepared by peptide synthesis, conjugated with Cy5.5 fluorophore, and purified using HPLC. Lyophilized powder is reconstituted in DMSO at 10mM concentration. After reconstituting, store at -80 °C. | ||
Dapi Fluoromount G | SouthernBiotech | 0100-20 | |
Dumont #5 Forceps | Fine Science Tools | 99150-20 | |
Ethanol | |||
Extra Fine Bonn Scissors | Fine Science Tools | 14084-08 | |
Ketamine HCl 100mg/mL | KetaVed | NDC 50989-161-06 | |
Ketamine/Xylazine Solution | Ketamine HCl is mixed with Xylazine 1:1 to produce a stock solution containing 50mg/mL ketamine and 10mg/mL Xylazine. This solution is made fresh before each use. | ||
Leica RM2235 Rotary Microtome | Leica | RM2235 | |
Microscope Slides | ThermoFisher | B9992000TN | |
Paraplast X-TRA | Sigma | P3808-1KG | |
Perkin Elmer Lumina S5 IVIS | Perkin Elmer | CLS148588 | |
Sparkle Optical Lens Cleaner | ThermoFisher | NC0090079 | |
Tissue-Tek Processing/Embedding Cassettes | ThermoFisher | NC9499605 | |
Tissue-Tek VIP Processing machine | Tissue-Tek | VIP 5A-F1 | |
Xylazine 20 mg/mL | AnaSed | NDC 59399-110-20 | |
Xylenes | ThermoFisher | X5-4 |