С учетом того, что GPCRs являются привлекательными целевыми показателями, пригодными для наркотиков, скрининг лиганда GPCR, таким образом, необходим для идентификации свинцовых соединений и для проведения исследований по дефанфанизации. К этим усилиям мы описываем PRESTO-Tango, ресурсную платформу с открытым исходным кодом, используемую для одновременного профилирования переходного набора на работу в формате приблизительно 300 GPCRs с использованием речевого агентства TEV.
Как крупнейшая и наиболее универсальная генная суперсемейство и посредники гаммы клеточных сигнальных путей, G-белковые рецепторы (GPCRs) представляют собой одну из наиболее перспективных целей для фармацевтической промышленности. Ergo, дизайн, реализация и оптимизация GPCR лиганд скрининга анализы имеет решающее значение, так как они представляют собой дистанционного управления инструментами для обнаружения наркотиков и для манипулирования GPCR фармакологии и результатов. В прошлом, G-белковых ипотеческих анализов типифицировали эту область исследований, обнаружения лиганд-индуцированных событий и количественного поколения вторичных посланников. Однако, с появлением функциональной избирательности, а также повышение осведомленности о нескольких других G белка независимых путей и ограничения, связанные с G-белок зависимых анализов, есть больший толчок к созданию альтернативных GpCR лиганд скрининга анализы. Для этого мы описываем применение одного такого ресурса, платформы PRESTO-Tango, системы на основе репортеров, которая позволяет параллельно и одновременно проводить допрос человека GPCR-ome, подвиг, который ранее считался технически и экономически неосуществимым. Основываясь на независимом исследовании вербовки G-protein, при посредничестве группы по борьбе с торговлей людьми и сигнализации в GPCRs делает PRESTO-TANGO подходящим инструментом для изучения примерно 300 необоняемых ГПКР, в том числе около 100 сиротских рецепторов. Чувствительность и надежность PRESTO-Tango делают его пригодным для первичных высокопроизводительных экранов с использованием сложных библиотек, используемых для выявления новых целей GPCR для известных препаратов или для открытия новых лиганд для рецепторов сирот.
G-белковые рецепторы (GPCRs) представляют собой самое большое и разнообразное семейство трансмембранных белков, работающих в качестве связующих интерфейсов между клеткой и ее окружающей средой1. Универсальность GPCRs подчеркивается их способность обнаруживать разнообразный спектр лигандов от нейротрансмиттеров до нуклеотидов, пептидов до фотонов, и многое другое, а также их способность регулировать многочисленные вниз по течению сигнальных каскадов, участвующих в клеточном росте, миграции, дифференциации, апоптоза, стрельбы клеток и т.д.2,3. Учитывая их повсеместность и участие во множестве физиологических процессов, это семейство рецепторов имеет первостепенное терапевтическое значение, продемонстрированное тем фактом, что более трети имеющихся в настоящее время предписанных лекарств нацелены на GPCRs4. Тем не менее, эти существующие терапевтические только целевой небольшой подмножество суперсемьи (по оценкам, 10%), и фармакология многих GPCRs остается необезвеченной. Кроме того, более 100 GPCRs существуют как сиротские рецепторы, так как они не были сопоставлены с эндогеннымлигандом 5. Таким образом, скрининг GPCR ligand имеет решающее значение в дефанфанизации и разработке лекарств, поскольку он прокладывает путь к открытию и оптимизации свинца, и, возможно, к стадии клинических испытаний.
Методы скрининга GPCR ligand традиционно упали в одной из двух категорий, G-белковая зависимость или G-белок независимых функциональных анализов6. Сигнализация GPCR регулируется гетеротримыми G-белками (ГЗЗ), которые активируются в виде обмена GTP на ВВП, связанных на субъединице7. Сигналы от активированного рецептора передаются G-белками через вторичные посланники, такие как cAMP, Кальций, DAG и IP3, чтобы посредничать вниз по течению сигнализации на вниз по течению эффекторов8. Характер функциональных последствий G-белковой сигнализации был использован для создания клеточных анализов, которые отражают активацию рецепторов. Эти методы, которые измеряют проксимальные (прямые) или дистальные (косвенные) события в G-белковой сигнализации, наиболее часто используются для скрининга лиганд GPCR и в основном используются в исследованиях десиротенизации6. Примеры анализов, которые непосредственно измеряют активацию G-белка при посредничестве GPCR, включают в себя связывающую асссид «35S»GTP-S, которая измеряет связывание радиомаркированных и негидроизируемых аналогов GTP с субъединицей ГЗ, и Фюрстер/биолюминесценционный резонансный рецензионный перенос энергии (FRET/BRET, соответственно) зонды для мониторинга GPCR-G и ГЗ /ГЗ взаимодействий, которые набирают больше тяги на протяжении9лет,10. Анализы, которые отслеживают дистальные события, являются наиболее часто используемыми инструментами для профилирования GPCR; например, анализы cAMP и IP1/3 измеряют внутриклеточное накопление G-белковых зависимых вторичных посланников, в то время как «Ca2»– поток и репортирующие анализы, связанные с конкретными элементами реакции, вовлеченными в активацию G-белка (CRE, NFAT-RE, SRE, SRF-RE), изучают события, далее вниз по течению сигнального каскада11. В то время как большинство вышеупомянутых анализов могут быть выполнены на высоком уровне пропускной записи, являются довольно чувствительными, и похвастаться определенными ассаем-специфических преимуществ (например, дискриминация между полными / частичными агонистов, нейтральных антагонистов и обратных агонистов в случае связывания GTP, или анализ функциональности на живых клетках, таких как “Ca2″и IP1/3)6, Есть, к сожалению, нет существующих G белково-зависимых методов быть подходящим допроса всего druggable GPCR.ru. Это в значительной степени связано с родной связи нескольких G-белковых подсемейств с GPCRs, в результате чего сигнализации на нескольких каскадах и неизвестных G-белков ойс на сиротах GPCRs. Чтобы смягчить эту проблему, анализы были разработаны, чтобы заставить беспорядочную G-белок связи через один общий сигнализации считывания, такие как cAMP, и Ca2 “,хотя большинство из них имеют низкую пропускную силу12.
Важным аспектом жизненного цикла GPCR является прекращение G-белково-зависимой сигнализации, которая происходит в значительной степени за счет набора q-arrestins, который вызывает диссоциацию G-белка, и в конечном итоге десенсибилизации рецептора, который предназначен для клатрин покрытием интернализации13. Наиболее повсеместно выраженными изоформами з-арестина являются невизуальные q-arrestin1 и q-arrestin2, также обозначенные как arrestin-2 и arrestin-3, соответственно14. Введите G-протеиновые независимые анализы на основе клеток, которые добавляют новое измерение скринингу лиганда GPCR; торговля рецепторами, без этикетки целые ячейки, и к-арестин вербовки анализы все примечательные примеры. GPCR торговли анализы использовать флюорофор помечены лиганды или совместно интернализированных антител, направленных на рецептор15, в то время как этикетка свободных целых клеток анализы использовать биосенсоры, которые переводят клеточные изменения, вызванные лиганд связывания в количественных выходов, таких как электрические или оптические сигналы16. Примечательно, что квинтэссенцией GPCR– – арестин взаимодействий моды на набор анализ q-arrestin как привлекательный инструмент в репертуаре функциональных анализов17. Система танго, впервые разработанная Барнеа и др. всего десять лет назад, включает в себя введение трех экзогенных генетических элементов: синтез белка, состоящий из q-arrestin2 с протеазой вируса табачного etch (TEVp), тетрациклинового трансактиватора (tTA), который привязан к GPCR через табак etch вирус протеаза расщепления сайта (TEVcs) и предшествует последовательность из C-терминус V2 вазопрессин рецептор (V2 хвост) для содействия арестин вербовки, и репортер luciferase гена, транскрипция которого вызвана tTA транскрипции фактор транскрипции транскрипции транслокации в ядро, которое освобождается от мембраны якорь после q-arrestin2 вербовки (Рисунок 1)18. Количественные показания активации GPCR и набора q-arrestin2 могут быть впоследствии определены путем чтения для люминесценции. Заметным отличием является то, что в то время как торговля рецепторами и этикетки свободных целых клеточных методов являются относительно низкой пропускной способом, танго имеет ряд преимуществ, в том числе селективного чтения, что характерно для целевого рецептора и чувствительность из-за интеграции сигнала, которые делают его подходящим кандидатом для лиганда скрининга в большей шкале18.
В связи с этими стратегическими особенностями, Kroeze et al. разработаны PRESTO-Tango (Параллельное выражение и скрининг рецепторов и скрининг атлетизм через транскрипционный выход-Танго), высокопроизводительная платформа с открытым исходным кодом, которая использует подход Tango для профиля наркотического GPCR-ome в параллельной и одновременной манере19. Используя «неразборчивый» набор q-arrestin2 почти для всех GPCRs, PRESTO-Tango является первым в своем роде с точки зрения функциональных анализов на основе клеток, что позволяет быстро “первый раунд” скрининга малых молекулных соединений почти на всех необонятельных GPCRs, в том числе сирот, независимо от G-белка подсемейства.
Конформно динамические GPCRs являются электростанциями трансдукции сигналов. Физиохимические свойства связывающих карманов этих гептахелевых рецепторов, а также их физиологическая актуальность подчеркивают необходимость инструментов скрининга лиганда GPCR. Как указано выше, престо-Та…
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана Канадскими институтами исследований в области здравоохранения (CIHR грант #MOP142219).
384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, BLACK, with lid, Sterile | NUNC | 12-566 | |
384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, White, with lid, Sterile | NUNC | 12-566-1 | |
384 Well Round Bottom, Polypropylene, Non-Treated, Blue, non-sterile, without lid | ThermoFisher | 12-565-390 | |
Antibiotic-Antimycotic | Wisent | 450-115-EL | |
D-Luciferin, sodium salt | GoldBio | LUCNA | |
DMEM with L-Glutamine, 4.5g/L Glucose and Sodium Pyruvate | Corning | 10-013-CV | |
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 15–300 µL | Eppendorf | 4861000155 | |
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 5–100 µL | Eppendorf | 4861000139 | |
Matrix Platemate 2×3 | ThermoFisher | 801-10001 | |
MicroBeta 1450 Wallac | Perkin Elmer | ||
Penicilin-Streptomycin | Wisent | 450-201-EL | |
Poly-L-Lysine hydrobromide | Millipore-Sigma | P2636-500MG | |
Roth Lab PRESTO-Tango GPCR Kit | Addgene | Kit #1000000068 |