Summary

חקירה מקבילה של גיוס β-Arrestin2 עבור ליגיון הקרנה בקנה מידה מוקטן של הסרט באמצעות שיטת הטנגו-פרסטו

Published: March 10, 2020
doi:

Summary

בהינתן כי GPCRs הם מטרות druggable אטרקטיבי, gpcr ליגנד הקרנה היא הכרחית ובכך לזיהוי תרכובות עופרת ולמחקרים de aniטיזציה. לקראת מאמצים אלה, אנו מתארים את פרסטו-טנגו, פלטפורמת משאב מקור פתוח המשמש ליצירת פרופיל סימולטני של גיוס β-arrestin2 ארעי ב כ 300 GPCRs באמצעות שיטת העיתונאי מבוסס TEV.

Abstract

כמו הגדול ביותר ואת המגוונת ביותר גן המשפחה ומגשרים של סולם הצבעים של מסלולים איתות סלולרי, G-חלבון מצמידים קולטנים (GPCRs) מייצגים אחד היעדים המבטיחים ביותר עבור תעשיית התרופות. מכאן, העיצוב, יישום, אופטימיזציה של gpcr ליגנד הקרנת ההקרנה הוא קריטי, כפי שהם מייצגים כלי בקרה מרחוק עבור גילוי סמים ולטיפול בפרמקולוגיה gpcr ותוצאות. בעבר, ה-G-חלבון התלוי מאופיין בתחום זה של מחקר, גילוי אירועים המושרה וכימות הדור של שליחים משניים. עם זאת, מאז הופעתו של בסלקטיביות תפקודית, כמו גם מודעות מוגברת של מסלולים אחרים חלבון בלתי תלוי בחלבונים והמגבלות הקשורות ל-G-חלבון תלוי assays, יש דחיפה גדולה יותר לקראת יצירת חלופה GPCR ליגיון. לקראת מאמץ זה, אנו מתארים את היישום של משאב כזה, פלטפורמת הטנגו פרסטו, מערכת מבוססת כתבת לוציפראז המאפשרת את החקירה המקבילה והזמנית של GPCR של האדם, הישג שנחשב בעבר . טכנית ובלתי אפשרי מבחינה כלכלית מבוסס על מערכת הגיוס העצמאית של G-חלבון β-arrestin2, אוניברסליות של β-arrestin2 בתיווך הסחר ואיתות ב GPCRs עושה פרסטו-טנגו כלי מתאים ללמוד כ 300 האדם שאינו הריח, כולל כ 100 קולטנים יתומים. לפרסטו-רגישות של טנגו וחוסן להפוך אותו מתאים מסכי תפוקה גבוהה הראשי באמצעות ספריות מורכבות, מועסק לחשוף מטרות GPCR חדש עבור סמים ידועים או כדי לגלות ליגטים חדשים עבור קולטנים יתומים.

Introduction

G-חלבון מצמידים קולטנים (GPCRs) מהווים את המשפחה הגדולה והמגוונת ביותר של חלבונים transממברני, הפעלה כממשקי תקשורת בין תא לסביבתו1. רב-תכליתיות של GPCRs מודגשת על ידי היכולת שלהם לזהות מגוון מגוון של ליגנדס – מ נוירוטרנסמיטורים כדי נוקלאוטידים, פפטידים לפוטונים, ועוד רבים – כמו גם היכולת שלהם להסדיר מפלים רבים במורד הזרם מעורב בצמיחה תאית, הגירה, בידול, אפופטוזיס, תא ירי, וכו ‘2,3. בהתחשב הייתה שלהם ומעורבות בהמון תהליכים פיסיולוגיים, משפחת הקולטן הזאת היא בעלת חשיבות טיפולית מירבית, לראווה על ידי העובדה כי יותר משליש של כרגע זמין תרופות מרשם היעד GPCRs4. עם זאת, הtherapeutics הקיימים האלה מכוונים רק לקבוצת משנה קטנה של סופרמשפחה (מוערך של 10%), והפרמקולוגיה של GPCRs רבים נותרה ללא מובהר. יתר על כן, יותר מ 100 GPCRs להתקיים כמו קולטנים יתומים, כפי שהם לא התאימו עם ליגני אנדוגניים5. כך, gpcr ליגנד הקרנה היא קריטית בדאוראנזציה ופיתוח התרופה, כפי שהוא מפעיל את הדרך לקראת גילוי המוביל ואופטימיזציה, ואולי לשלב ניסוי קליני.

שיטות ל-gpcr ליגנד ההקרנה באופן מסורתי נפלו באחת משתי קטגוריות, g-חלבון תלוי או g-חלבון בלתי תלוי תפקודית מספר6. האיתות gpcr מוסדר על ידי heterotrimeric G-חלבונים (Gαβγ), אשר מופעלים על ידי חילופי gtp עבור התוצר המאוגד על gα יחידת7. אותות מן הקולטן המופעל הם התמרה ידי G-חלבונים באמצעות שליחים משניים, כגון מחנה, סידן, דאג, ו IP3, כדי לתווך איתות במורד הזרם במורד הזרם8. האופי של ההשלכות הפונקציונליות של מאותת G-חלבון נוצל כדי ליצור תא מבוסס בחני כי לשקף את הפעלת הקולטן. שיטות אלה, אשר למדוד הקרובות (ישיר) האירועים (עקיף) מערכת איתות G-חלבון, הם בשימוש התכוף ביותר GPCR ליגיון ו כבר המועסקים בעיקר במחקרים deהניניזציה6. דוגמאות של בחני אומר כי באופן ישיר למדוד gpcr-מתווך G-חלבון הפעלה כוללים את שיטת הכריכה של [35s] GTPγS, אשר מודד את הכריכה של רדיויניום ו-hydrolyzable gtp אנלוגי ליחידת המשנה gα, ו förster/ביולומינסנציה העברת אנרגיה (לדאוג/ברט, בהתאמה) רגשים כדי לנטר gpcr-gα ו gα/Gγ אינטראקציות, אשר כבר צובר המתיחה על השנים9,10. Assays כי ניטור האירועים הם הכלים הנפוצים ביותר עבור פרופיל GPCR; לדוגמה, מחנה ו IP1/3 בחני למדוד תאיים הצטברות של G-חלבון שליחים משניים תלויים, בעוד [Ca2 +] השטף הכתב בחני מעורבים אלמנטים תגובה ספציפיים מעורב בהפעלת G-חלבון (היצור, nfat-RE, sre, srf-re) לבחון את האירועים עוד במורד הזרם איתות1 בעוד שרוב האמור לעיל ניתן לבצע ברמת תפוקה גבוהה, הם רגישים למדי, ומתגאים ביתרונות מסוימים של שיטה מסוימת (למשל, הפליה בין האגוניסטים מלאים/חלקיים, אנטוניסטים ניטרליים ו אגוניסטים הופכי במקרה של איגוד GTPγS, או לספק פונקציונליות על תאים חיים כגון [Ca2 +] ו IP1/3)6, למרבה הצער לא קיים שיטות התלויות g-חלבון ההולם את החקירה זה בעיקר בשל צימוד מקורי של משפחות משנה G-חלבון GPCRs, וכתוצאה מכך איתות על מפלי מספר וצימוד G-חלבון לא ידוע ב GPCRs יתום. כדי להמתיק את הבעיה, שפותחה כדי לכפות צימוד G-חלבון מופקר באמצעות איתות יחיד משותף הקריאה-out, כגון מחנה, ו-Ca2 +, למרות שרובם הם תפוקה נמוכה12.

היבט חשוב של מחזור החיים GPCR הוא לסיום של האיתות התלוי בחלבון G, אשר מתרחשת בחלק הגדול באמצעות גיוס של β-הפיגור אשר מעורר את הדיסוציאציה של G-חלבון, ובסופו של דבר הפחתת הרגישות של הקולטן, אשר מיועדת עבור הפנמה מצופה קלטרין13. הבלתי-מβ ביותר בעלי הצורה האוביייתית ביותר, הם הβ-arrestin1 וβ-arrestin2, מסומנים גם כפיגור של 2 ופיגור-3, בהתאמה ל-14. הזן G-חלבון עצמאי מבוסס תא המבוסס, אשר מוסיפים ממד חדש GPCR ליגיון והקרנה; הקולטן הסחר, תא שלם ללא תווית, ו β מפיגור הגיוס מוסר הם כל הדוגמאות הבולטות. Gpcr סחר בחני מעסיקים שימוש fluorophore מתויג ליגטים או שיתוף הפניהפנטים מיקוד הקולטן15, ואילו התווית של תא שלם חינם השימוש בביוחיישנים לתרגם שינויים סלולריים המושרה על ידי ligands קשירה לתוך כימות תפוקות, כגון אותות חשמליים או אופטיים16. בעיקר, התמציתי gpcr-β-מפיגור האינטראקציות אופנה הβ מפיגור שיטת הגיוס ככלי אטרקטיבי ברפרטואר של בחני פונקציונלי17. מערכת הטנגו, שפותחה לראשונה על ידי ברנע ואח ‘. רק לפני עשור, כרוכה המבוא של שלושה אלמנטים גנטיים אקסוסוגני: היתוך חלבון המורכב β-arrestin2 עם וירוס איכול הטבק פרוטאז (tevp), טטרציקלין transactivator (tTA) כי הוא קשור gpcr באמצעות וירוס איכול הנגיף פרוטאז באתר (בטביה) והוא לפניו על ידי רצף מ-C הטרמינוס של הקולטן v2 וזופרסין סין (v2 זנב) כדי לקדם את הגיוס הפיגור, ואת הכתב הגן לוציפראז אשר שעתוק מופעלות על ידי ה tTA שעתוק גורם הטרנסלוקציה לגרעין, אשר שוחרר מן הקרום עיגון בעקבות גיוס β-arrestin2 (איור 1)18. קריאות כמותי של הפעלה GPCR ו-β-arrestin2 ניתן לקבוע לאחר מכן על ידי קריאה לאור. הבחנה בולטת היא שבזמן הסחר בקולטן ושיטות התא ללא תווית שלמות הם בעלי תפוקה נמוכה יחסית, לטנגו יש מספר יתרונות, כולל לקריאה סלקטיבית כי הוא ספציפי קולטן היעד ואת הרגישות בשל שילוב אותות, מה שעושה את זה מועמד מתאים עבור ליגיון הקרנה בקנה מידה גדול יותר18.

לאור התכונות האסטרטגיות הללו, Kroéet al. פיתח-טנגו (קולטן מקבילי-ביטוי ome והקרנה דרך Transcript פלט-טנגו), פלטפורמת הקוד הפתוח של תפוקה גבוהה המשתמשת בגישה טנגו לפרופיל druggable GPCR-ome באופן מקבילי וסימולטני19. ניצול “מופקר” הגיוס של β-arrestin2 כמעט כל GPCRs, פרסטו-טנגו הוא הראשון-של-שלה מסוג במונחים של מבוסס התא assays, הפעלת מהירה “בסיבוב הראשון” הקרנה של תרכובות מולקולה קטנה בכמעט כל הריח הGPCRs, כולל יתומים, עצמאית של G-חלבון צימוד משפחה.

Protocol

1. הקרנה ראשונית: תרבית תאים וזריעת צלחות כדי להכין פולי-L-ליזין (PLL) לוחות מצופים, לוותר 20 μL/טוב של 25 μg/mL פתרון מניות של PLL ב לבן או שחור 384-היטב אופטי לוחות באמצעות פיפטה מרב-ערוצי אלקטרוניים או מנפק מגיב. מודב את הצלחות בטמפרטורת החדר עבור 0.5 – 2 h.הערה: אם השימוש בלוחות הצבע השחור 384-היט?…

Representative Results

באמצעות פרוטוקול הטנגו פרסטו הציג לעיל, chromaffin גרגר עושה (CG) תמצית הוקרן נגד 168 מטרות gpcr לא הריח, עם רוב להיות קולטנים יתומים. יצירת פרופיל של תמצית שנאמר בוצעה על ידי בחינת β-arrestin2 הגיוס על הקולטנים שנבחרו, על בסיס העיקרון שתוכנן על ידי ברנע ואח ’18 (איור 1). פלמיד cDNA …

Discussion

הGPCRs הדינמיים הם בתים. מכוח הקליטה המאפיינים הפיזיוכימיים של כיסי הכריכה של קולטני האלה, כמו גם הרלוונטיות הפיזיולוגית שלהם מדגישים את הצורך בכלי הסינון של GPCR. כפי שהוצג לעיל, שיטת הטנגו פרסטו מהירה, רגישה וידידותית למשתמש, ומשאילה את עצמה לפיתוח סמים. לא רק שאלה מדידה הפעלה אגוניסט המושרה,…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

עבודה זו נתמכת על ידי המכונים הקנדיים לחקר הבריאות (מענק CIHR #MOP142219).

Materials

384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, BLACK, with lid, Sterile NUNC 12-566
384 Well Optical Bottom Plates, Polystyrene Polymer Base, Cell Culture Treated, White, with lid, Sterile NUNC 12-566-1
384 Well Round Bottom, Polypropylene, Non-Treated, Blue, non-sterile, without lid ThermoFisher 12-565-390
Antibiotic-Antimycotic Wisent 450-115-EL
D-Luciferin, sodium salt GoldBio LUCNA
DMEM with L-Glutamine, 4.5g/L Glucose and Sodium Pyruvate Corning 10-013-CV
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 15–300 µL Eppendorf 4861000155
Eppendorf Xplorer, 12-channel, variable, 5–100 µL Eppendorf 4861000139
Matrix Platemate 2×3 ThermoFisher 801-10001
MicroBeta 1450 Wallac Perkin Elmer
Penicilin-Streptomycin Wisent 450-201-EL
Poly-L-Lysine hydrobromide Millipore-Sigma P2636-500MG
Roth Lab PRESTO-Tango GPCR Kit Addgene Kit #1000000068

References

  1. Liapakis, G., et al. The G-protein coupled receptor family: actors with many faces. Current pharmaceutical design. 18 (2), 175-185 (2012).
  2. Pierce, K. L., Premont, R. T., Lefkowitz, R. J. Seven-transmembrane receptors. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 3 (9), 639-650 (2002).
  3. Kroeze, W. K., Sheffler, D. J., Roth, B. L. G-protein-coupled receptors at a glance. Journal of cell science. 116, 4867-4869 (2003).
  4. Rask-Andersen, M., Almén, M. S., Schiöth, H. B. Trends in the exploitation of novel drug targets. Nature Reviews Drug Discovery. 10 (8), 579-590 (2011).
  5. Ngo, T., et al. Identifying ligands at orphan GPCRs: current status using structure-based approaches. British journal of pharmacology. 173 (20), 2934-2951 (2016).
  6. Zhang, R., Xie, X. Tools for GPCR drug discovery. Acta pharmacologica Sinica. 33 (3), 372-384 (2012).
  7. Kimple, A. J., Bosch, D. E., Giguere, P. M., Siderovski, D. P. Regulators of G-Protein Signaling and Their G Substrates: Promises and Challenges in Their Use as Drug Discovery Targets. Pharmacological Reviews. 63 (3), 728-749 (2011).
  8. Wettschureck, N., Offermanns, S. Mammalian G Proteins and Their Cell Type Specific Functions. Physiological Reviews. 85 (4), 1159-1204 (2005).
  9. Denis, C., Saulière, A., Galandrin, S., Sénard, J. -. M., Galés, C. Probing heterotrimeric G protein activation: applications to biased ligands. Current Pharmaceutical Design. 18 (2), 128-144 (2012).
  10. Yin, H., et al. Lipid G protein-coupled receptor ligand identification using beta-arrestin PathHunter assay. The Journal of Biological Chemistry. 284 (18), 12328-12338 (2009).
  11. Cheng, Z., et al. Luciferase Reporter Assay System for Deciphering GPCR Pathways. Current Chemical Genomics. 4, 84-91 (2010).
  12. Roth, B. L., Kroeze, W. K. Integrated Approaches for Genome-wide Interrogation of the Druggable Non-olfactory G Protein-coupled Receptor Superfamily. The Journal of Biological Chemistry. 290 (32), 19471-19477 (2015).
  13. Jean-Charles, P. -. Y., Kaur, S., Shenoy, S. K. G Protein-Coupled Receptor Signaling Through β-Arrestin-Dependent Mechanisms. Journal of Cardiovascular Pharmacology. 70 (3), 142-158 (2017).
  14. Smith, J. S., Rajagopal, S. The β-Arrestins: Multifunctional Regulators of G Protein-coupled Receptors. The Journal of Biological Chemistry. 291 (17), 8969-8977 (2016).
  15. Böhme, I., Beck-Sickinger, A. G. Illuminating the life of GPCRs. Cell Communication and Signaling. 7 (1), 16 (2009).
  16. Fang, Y. Label-Free Receptor Assays. Drug discovery today. Technologies. 7 (1), 5-11 (2011).
  17. Wang, T., et al. Measurement of β-Arrestin Recruitment for GPCR Targets. Assay Guidance Manual. Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences. , (2004).
  18. Barnea, G., et al. The genetic design of signaling cascades to record receptor activation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (1), 64-69 (2008).
  19. Kroeze, W. K., et al. PRESTO-Tango as an open-source resource for interrogation of the druggable human GPCRome. Nature Structural & Molecular Biology. 22 (5), 362-369 (2015).
  20. Jordan, M., Schallhorn, A., Wurm, F. M. Transfecting Mammalian Cells: Optimization of Critical Parameters Affecting Calcium-Phosphate Precipitate Formation. Nucleic Acids Research. 24 (4), 596-601 (1996).
  21. Baker, J. M., Boyce, F. M. High-throughput functional screening using a homemade dual-glow luciferase assay. Journal of Visualized Experiments. (88), 50282 (2014).
  22. Li, H., Eishingdrelo, A., Kongsamut, S., Eishingdrelo, H. G-protein-coupled receptors mediate 14-3-3 signal transduction. Signal Transduction and Targeted Therapy. 1 (1), 16018 (2016).
  23. Walther, C., Ferguson, S. S. G. Minireview: Role of intracellular scaffolding proteins in the regulation of endocrine G protein-coupled receptor signaling. Molecular Endocrinology. 29 (6), 814-830 (2015).
  24. Gurevich, E. V., Benovic, J. L., Gurevich, V. V. Arrestin2 expression selectively increases during neural differentiation. Journal of Neurochemistry. 91 (6), 1404-1416 (2004).
  25. Shaikh, S., Nicholson, L. F. B. Optimization of the Tet-On system for inducible expression of RAGE. Journal of Biomolecular Techniques JBT. 17 (4), 283-292 (2006).
  26. Blau, H. M., Rossi, F. M. Tet B or not tet B: advances in tetracycline-inducible gene expression. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (3), 797-799 (1999).
  27. Roche, O., et al. Development of a Virtual Screening Method for Identification of “Frequent Hitters” in Compound Libraries. Journal of Medicinal Chemistry. 45 (1), 137-142 (2002).

Play Video

Cite This Article
Zeghal, M., Laroche, G., Giguère, P. M. Parallel Interrogation of β-Arrestin2 Recruitment for Ligand Screening on a GPCR-Wide Scale using PRESTO-Tango Assay. J. Vis. Exp. (157), e60823, doi:10.3791/60823 (2020).

View Video