Cette méthode décrit l’utilisation du modèle de souris R26R-Confetti (Confetti) pour étudier les tissus minéralisés, couvrant toutes les étapes de la stratégie de reproduction aux acquisitions d’images. Inclus est un protocole général qui peut être appliqué à tous les tissus mous et un protocole modifié qui peut être appliqué aux tissus minéralisés.
L’étiquetage d’une cellule individuelle dans le corps pour surveiller les types de cellules qu’elle peut donner lieu à et suivre sa migration à travers l’organisme ou de déterminer sa longévité peut être un moyen puissant de révéler les mécanismes de développement et d’entretien des tissus. L’un des outils les plus importants actuellement disponibles pour surveiller les cellules in vivo est le modèle de souris Confetti. Le modèle Confetti peut être utilisé pour étiqueter génétiquement les cellules individuelles chez les souris vivantes avec diverses protéines fluorescentes d’une manière spécifique au type cellulaire et surveiller leur sort, ainsi que le sort de leur progéniture au fil du temps, dans un processus appelé traçage génétique clonal ou tracé de lignée clonal. Ce modèle a été créé il y a près de dix ans et a contribué à améliorer la compréhension de nombreux processus biologiques, en particulier liés à la biologie des cellules souches, au développement et au renouvellement des tissus adultes. Cependant, la préservation du signal fluorescent jusqu’à la collecte d’images et la capture simultanée de divers signaux fluorescents est techniquement difficile, en particulier pour les tissus minéralisés. Cette publication décrit un protocole étape par étape pour l’utilisation du modèle Confetti pour analyser le cartilage de plaque de croissance qui peut être appliqué à n’importe quel tissu minéralisé ou non minéralisé.
Des méthodes améliorées pour surveiller le comportement cellulaire sont souhaitables pour augmenter l’efficacité expérimentale lors de l’utilisation de modèles animaux. Une des approches les plus informatives pour surveiller le comportement cellulaire in vivo est la lignée cloaque traçant avec des souches de souris journalistemulticolores 1, y compris la souris R26R-Confetti (Confetti) largement utilisé2. En étiquetant génétiquement les cellules individuelles avec des protéines fluorescentes et en suivant ces cellules au fil du temps, les chercheurs dans de nombreux domaines ont utilisé la souris Confetti pour révéler des idées sur une multitude de différents systèmes biologiques.
La souris Confetti est un système de journaliste à base de loxP dans lequel la recombinaison d’ADN dépendante de Cre provoque l’expression permanente de l’une des nombreuses protéines fluorescentes possibles d’une manière stochastique2. L’allèle R26R-Confetti comprend le promoteur CAGG, omniprésent, qui se trouve immédiatement en amont d’un NeoR-cassette2à flanc de loxP, dont la séquence de polyadenylation met fin à la transcription3,suivie de la Brainbow 2.1 construction4. Ainsi, la recombinaison à médiation cre excise simultanément la cassette NeoRet conduit à la production de certaines protéines fluorescentes selon les parties de la construction Brainbow 2.1 sont excisées. Cette fonctionnalité rend la souris Confetti extrêmement adaptable car elle peut être utilisée pour cibler n’importe quelle population cellulaire dans une souris pour laquelle une souche Cre spécifique est disponible. Le croisement d’une souche Cre spécifique aux tissus avec la souche R26R-Confetti fournit la spécificité de l’étiquetage. Cependant, la souche Cre doit également être inductible (par exemple, CreERT ou CreERT2, qui nécessitent une liaison tamoxifène pour leur permettre d’entrer dans le noyau et d’induire une recombinaison d’ADN5) de sorte que l’étiquetage peut être atteint à des moments précis. Ainsi, une population cellulaire peut être étiquetée en injectant la progéniture CreERT-positive/Confetti-positive résultante avec le tamoxifène au point désiré et suivi à un certain âge, quand les tissus d’intérêt peuvent être rassemblés pour l’analyse. Après le traitement des tissus, les cellules étiquetées fluorescentes peuvent être directement visualisées par microscopie confocale de sorte que la progéniture de chaque cellule initialement étiquetée peut être séparée de la progéniture générée par toute autre cellule étiquetée en fonction de leur fluorescent spécifique permettant ainsi d’évaluer la clonnalité (c.-à-d. le tracé génétique clonal).
En raison de la flexibilité du modèle Confetti, il a été appliqué pour étudier le développement et l’entretien de nombreux tissus différents dans la santé et la maladie2,6,7,8,9, 10,11. Une façon courante d’utiliser le modèle est d’étiqueter une certaine population de cellules et de déterminer les tissus auxquels elles (et/ou leur progéniture) ont contribué. Une telle conclusion utilisant cette approche était que la dent adulte est composée des cellules avec une origine gliale6. Une autre application du modèle est d’étudier l’homéostasie des cellules souches. Par exemple, le modèle Confetti a révélé que les niches de cellules souches dans les cryptes intestinales deviennent progressivement monoclonal parce que certains clones de cellules souches sont dominants lors de la compétition entre les cellules souches2. Le modèle peut également être utilisé pour évaluer la prolifération cellulaire, ce qui est particulièrement utile pour étudier les cellules qui se divisent lentement. Par exemple, la formation clonale dans le cartilage articulaire12 a été évaluée, et les effets à court terme d’un antagoniste de hérisson sur des chondrocytes de plaque de croissance dans les souris vieilles de cinq semaines ont été étudiés13.
Malgré la relative simplicité du modèle Confetti, le signal fluorescent peut être techniquement difficile à préserver jusqu’à la collecte d’images, en particulier lors de l’analyse des tissus minéralisés. Ici, le protocole décrit un modèle optimisé pour utiliser la souris Confetti avec l’os postnatal (jusqu’à 6 mois d’âge), permettant aux protéines fluorescentes d’être directement visualisées par microscopie confocale sans avoir besoin d’immunodétection. Ce protocole simplifié peut être appliqué aux tissus non minéralisés. En outre, est inclus une description de la façon de stocker les échantillons afin de préserver le signal fluorescent pour une période prolongée d’au moins 3 ans. Un aperçu du protocole est présenté à la figure 1.
Le modèle de confetti a été employé intensivement pour étudier les tissus minéralisés de cartilage12,13,14 et pour décrire le protocole optimisé. Les sourisconfettis 2 avec une copie ou deux copies de l’allèle R26R-Confetti peuvent être utilisées pour la reproduction et les expériences. La recombinaison chez les souris avec un allèle de la construction Brainbow 2.1 donnera quatre étiquettes potentielles : protéine fluorescente rouge (RP, cytoplasmique), protéine fluorescente jaune (YFP, cytoplasmique), protéine fluorescente cyan (CFP, membrane-localisée), et verte protéines fluorescentes (GFP, noyaux localisés), tandis que la recombinaison chez les souris homozygotes confettis (c.-à-d., contenant deux copies de la construction Brainbow 2.1) donnera 10 sorties de couleurs possibles (RFP-RFP, RFP-YFP, RFP, PFP, PDP, YFP-YFP, YFP GFP, CFP-CFP, CFP-GFP, GFP-GFP). Cependant, parce que les événements d’excision et d’inversion d’ADN se produisent d’une manière stochastique, la recombinaison pour produire le GFP se produit dans seulement une petite fraction de cellules, comme précédemment rapporté2, et diffère apparemment par type de cellule ou ligne de cre utilisé2, 12,13. Par conséquent, étant donné la faible occurrence des événements de recombinaison menant à l’expression de GFP, six sorties de couleur sont les plus communes dans les souris homozygotes de confetti.
Une considération importante lors de la planification des expériences avec la souris Confetti est de trouver une souche Cre approprié. Tout d’abord, puisque l’allèle Confetti a plusieurs sites loxP, un événement de recombinaison n’exclut pas un deuxième4. Cela signifie que si une cellule est étiquetée et se divise pour produire un clone d’une couleur, un deuxième événement de recombinaison dans l’une de ses cellules filles générerait une couleur différente, masquant ainsi la véritable expansion clonale. Ainsi, les souches Cre non inducibles, où l’enzyme est toujours active si le promoteur correspondant est actif, ne sont pas conseillées. Deuxièmement, dans certaines souches, l’expression de Cre recombinase se fait souvent au détriment d’une protéine endogène, créant ainsi un phénotype qui lui est propre (p. ex., pour la souche de souris knock-in Prg4-GFPCreERT2 dans laquelle les souris abritent deux allèles Cre15), donc une seule copie de l’allèle Cre est souhaitable. Dans toutes les expériences décrites, une seule copie du Col2CreERT16 a été portée par le mâle ou le parent femelle pour générer des souris Col2CreERT:Confetti, comme décrit13. Ensuite, la spécificité de la ligne Cre au type de cellule d’intérêt est une considération importante. Par exemple, Col2CreERT est chondrocyte-spécifique, mais étiquette plusieurs populations distinctes de chondrocytes dans le cartilage postnatal tôt17. Enfin, l’activité des différentes souches de Cre peut changer considérablement avec l’âge animal, car l’activité endogène du promoteur utilisé pour les changements d’expression Cre, même dans les cellules du même type (par exemple, Prg4-GFPCreERT2, qui peut nécessiter une augmentation nombre de doses de tamoxifène pour étiqueter les cellules de zone superficielle à mesure que les souris ont15 ans).
Le nombre de cellules étiquetées sera reflété par la quantité de tamoxifène donnée, il n’est donc pas toujours souhaitable de donner la dose maximale parce que distinguer les clones les uns des autres peut être difficile. Parce que l’expression Cre variera sous la réglementation des différents promoteurs ainsi qu’avec l’âge, la dose de tamoxifène devra être ajustée pour optimiser l’étiquetage. Il est important de noter que les cellules ne sont pas immédiatement fluorescentes lors du déclenchement de la recombinaison, car il faut du temps pour que la recombinaison se produise et que les protéines fluorescentes qui en résultent s’accumulent suffisamment pour l’imagerie. Un large éventail d’heures (entre 24 et 72 h) est nécessaire, ce qui semble être influencé par la ligne Cre, le type cellulaire et l’âge des animaux. Puisque le tamoxifène peut être biologiquement actif longtemps après administration18 il est toujours conseillé de vérifier soigneusement l’efficacité de recombinaison dans chaque modèle.
Pendant l’étape de microscopie confocale, l’excitation des protéines fluorescentes de Confetti exige la pénétration du tissu par la lumière de laser. Étant donné que différents tissus ont des propriétés différentes, la lumière laser pourrait ne pas pénétrer 160 m d’épaisseur sections de tous les tissus. Cependant, de telles sections épaisses peuvent être utilisées pour le cartilage de plaque de croissance, tel qu’utilisé dans la figure 2, Figure 3. Notez que chaque microscope est différent, et il est peu probable que les paramètres décrits (Fichier supplémentaire 1) fonctionnera parfaitement sans ajustements mineurs. L’un des principaux défis consiste à distinguer les différentes protéines fluorescentes pour s’assurer qu’il n’y a pas de contamination d’un canal à l’autre. Par exemple, le signal dans le canal YFP causé par la fluorescence provenant de GFP se chevauche entre les canaux YFP et DFP. Les canaux YFP et CFP doivent également être soigneusement vérifiés. Cela peut être fait de plusieurs façons. Tout d’abord, la plage d’émission des longueurs d’onde de lumière fluorescente qui sont enregistrées pour chaque protéine fluorescente peut être réduite. Deuxièmement, l’ajustement de la puissance laser en combinaison avec le gain numérique peut optimiser le signal. Dans cette étude, ces étapes étaient suffisantes, mais elles reposent sur un signal fluorescent fort. Cela signifie qu’en théorie, le traitement inefficace des tissus peut réduire l’activité des protéines fluorescentes, ou une faible source de lumière laser peut altérer la séparation du canal.
Un des avantages de la souris Confetti est qu’elle peut être combinée avec un grand nombre de souches génétiquement mutantes qui sont disponibles de sorte que l’impact de gènes spécifiques sur la dynamique clonale peut être étudié10,11,12 ,13,14,19,20, mais avec quelques limitations. Par exemple, la recombinaison des allèles confettis et du gène d’intérêt ne peut pas être séparée lors de l’utilisation de mutants à base de Cre loxP combinés à des tracés de lignée sclonale. Néanmoins, de tels événements de recombinaison coïncidant peuvent être efficaces10,14,20. Par exemple, cette possibilité a été utilisée pour explorer le nombre accru de cellules dans la zone de repos des souris après l’ablation postnatale chondrocyte-spécifique de TSC1 dans la plaque de croissance21 et a indiqué la relation clonale entre ces cellules au fil du temps 13. En outre, l’analyse clonale spécifique aux tissus à l’aide de souris Confetti peut être utilisée avec des souris mutantes non-Cre loxP11, et il est également possible de combiner ces approches avec pharmacologique8,9 ,13 et/ou modèles chirurgicaux8 pour visualiser les réponses clonales à d’autres perturbations fonctionnelles. D’autres occasions se présentent en combinant des sections étiquetées de Confetti avec l’immunodétection des protéines endogènes par immunofluorescence. Une telle analyse permet l’identification des cellules tracées et leur colocalisation avec un marqueur connu. Avec la méthode de fixation décrite ci-dessus, il est possible de mener l’immunofluorescence et encore visualiser la fluorescence des protéines fluorescentes de Confetti12,13. Cependant, dans les documents mentionnés, la récupération d’antigène n’était pas nécessaire. Les méthodes dures de récupération d’antigène, telles que l’ébullition dans le tampon de citrate, mène à une perte complète de fluorescence de confetti. Bien que les protéines fluorescentes Confetti peuvent alors être détectées en utilisant des anticorps22, une perte d’identité clonale peut se produire.
En résumé, l’utilisation du modèle Confetti pour étiqueter les cellules in vivo est un outil informatif pour analyser le sort de ces cellules au fil du temps. La méthode décrite fournit un moyen rapide et efficace de visualiser directement l’expression des protéines fluorescentes dans les tissus minéralisés.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions le Dr Evgeny Ivashkin pour ses conseils méthodologiques. Ce travail a été soutenu financièrement par le Conseil suédois de la recherche (A.S.C), la Fondation scientifique russe (subvention #19-15-00241 à l’ASC), l’Institut Karolinska (A.S.C.), StratRegen KI et Stiftelsen Konung Gustaf V:s 80-sfond (A.S.C.), Stiftelsen Frimurare Barnhuset et Sallskapet Barnavard (P.T.N.), Chinese Scholarship Council (B.Z.). Le microscope confocal a été financé par la Fondation Knut et Alice Wallenberg.
2,2-thiodiethanol | Sigma | MKCF9328 | |
60 mm-long cover slips | Mendel-Gläzer | 220588 | |
Confocal laser scanning microscope | Zeiss | LSM 710 | |
Corn oil | Sigma | C8267 | |
Cryomold (standard) | Sakura | 4557 | |
Cryostat | Thermo | Model: NX70 | |
Disposable cryostat blades | Histolab | 207500014 | Specifically for use with hard tissue |
EDTA | Scharlan | AC0960005P | |
Formaldehyde concentrate | Merck | 8.18708.1000 | |
Glass bottles | Sigma | V7130 | Can be used for tamoxifen dilution and for tissue fixation and processing |
Imaris software | Oxford Instruments | N/A | Image analysis software for 3D reconstruction |
Isoflurane | Zoetis | 11-8162 | |
OCT | Sakura | 102094-104 | |
Pasteur pipette | Sarstedt | 86.1171 | |
PBS | Gibco | 14200075 | |
Sodium hydroxide | Merck | 1.06498.1000 | |
Sucrose | Sigma | S0389 | |
Superfrost UltraPlus slides | Mendel-Gläzer | J3800AMNZ | |
Tamoxifen | Sigma | T5648 | |
Zen2 software | Zeiss | N/A | Freeware for Confocal laser scanning microscopy |