אנו מתארים את השימוש של רומן, תדר-תחום מצלמה לאורך החיים עבור מיפוי 2D O2 הפצות עם משטח חיישן אופטי. מערכת המצלמה וניתוח התמונה הליכים מתוארים יחד עם ההכנה, כיול ויישום של כנפונים חיישן עבור המחשה O2 מיקרו הסביבה בריזוספירה של צמחים ימיים.
אנו מתארים שיטה התמונה מומס חמצן (O2), ב 2d ב מרחבית גבוהה (< 50-100 μm) ו הזמני (< 10 s) החלטה. השיטה מעסיקה O2 בעלי חיישן האור הזורח רגיש (אלקטרואופטיקה מישורי) בשילוב עם מערכת מצלמה מיוחדת עבור הדמיה לאור החיים בתחום התדר. אלקטרואופטיקה מישורי מוכנים על ידי המסת הצבע O2רגיש אינדיקטור פולימר והפצת התערובת על תמיכה מוצקה בעובי מוגדר באמצעות ציפוי סכין. לאחר אידוי של הממס, אלקטרואופטיקה מישורי ממוקם במגע קרוב עם מדגם של עניין-כאן הפגינו עם שורשי הצמח הימי המים הקטנים Orella. O2 שינוי תלוי ריכוז במשך החיים לאור של צבע מחוון בתוך אלקטרואופטיקה מישורי היא התמונה באמצעות הישבן של הנושא שקוף רדיד הקיר אקווריום באמצעות מצלמה מיוחדת. מצלמה זו מודדת את אורך החיים האור (μs) באמצעות משמרת בזווית הפאזה בין אות עירור מאופנן ואות פליטה. שיטה זו עדיפה על האור האור שיטות הדמיה, כמו האות אינו תלוי בריכוז הצבע או האינטנסיביות של מקור עירור, והוא מסתמך אך ורק על הזמן ניוון הלומיאלי, שהוא פרמטר מיסודה ההפניה. כתוצאה מכך אין צורך להוסיף צבע התייחסות נוסף או אמצעים אחרים להפניה. אנו להדגים את השימוש במערכת עבור מאקרוסקופי O2 הדמיה של הצמח הריון, אבל מערכת המצלמה יכול גם בקלות להיות מצמידים למיקרוסקופ.
התפלגות ודינמיקה של גזים ויונים מומס במשקעים וקרקעות מספקים מידע מרכזי על תהליכים ביו-כימיים כגון נשימה מיקרוביאלית1,2, או אובדן חמצן רדיאלי משורשי צמחים3,4,5, ומיקרואקולוגיה כימית של חיידקים6,7, צמח כדורים5,8,9 בעלי חיים בורוז10, 11,12. פעילות ביולוגית וכימית בסביבות מוגבלות מסוג זה יכולים ליצור מעברי צבע תלולים של מצעים כימיים או מוצרים של תהליכים ביוגיאוכימיים. במיוחד, O2 זמינות יש השפעה עצומה על תהליכים ביוגיאוכימיים ולכן ביולוגיה ואקולוגיה של מערכת13. משום כך, ניתוח O2 ריכוזי מרחבי המרחב הגבוה והרזולוציה הטמפורלית הוא בעל חשיבות עליונה במדעי המים והיבשה. ראשון, אלקטרוכימי מיקרוחיישנים אופטיים14,15 פותחו כדי למדוד את זה האנליטה חשוב. מאוחר יותר, 2 מימדי (2d) הדמיה של O2 עם אלקטרואופטיקה מישורי הוצגה12,16,17,18,19, אשר איפשר את ההדמיה ואת הקוונפיקציה של התפלגות o2 הטרוגנית קרקעות משקעים.
מישורי O2 אלקטרואופטיקה מורכב o2רגיש אינדיקטור מחוון20, אשר מומס פולימר מתאים21. צבע האינדיקטור נרגש באורכי גל אופטי מסוים ופולט אור אדום הוזז על הרפיה בצורה של לומינציה. בנוכחות O2, צבע מחוון נרגש יכול להעביר את האנרגיה שלה למולקולה O2 על התנגשות, אשר המכונה התנגשות מבוססי מבוסס לומיצ’ינג22. לכן, את עוצמת האור כמו גם את החיים האור מופחת עם הגדלת O2 ריכוז23. במקרה אידיאלי השינוי בעוצמה ובמשך החיים עוקב אחר משוואת שטרן-וולמר (משוואה 1) תוך שימוש בעוצמת האור או החיים בהעדר (אני0; τ0) או נוכחות (i, τ) של O2 בריכוז נתון [Q]. קבוע שטרן-Volmer (Ksv) הוא מדד לרגישות של האופדה לכיוון O2; KSV תלוי במשתנים סביבתיים כגון טמפרטורה ולחץ.
1
הקלטת שינויים כאלה באור השמש חיישן מישורי עם מערכת המצלמה ניתן להשתמש כדי להמחיש את השינויים המתאימים בהתפלגות O2 . בתחילה, הדמיה פשוטה המבוססת על O2 דימות היה בשימוש18. עם זאת, מתודולוגיה כזו רגישה מאוד לאינטרפרעות חיצוניות, אשר מתפשרים על אמינות התוצאות בשל תאורה הטרוגנית, תנודות במקור העירור או המצלמה, כמו גם התפלגות אחידה של צבע האינדיקטור בתוך אלקטרואופטיקה מישורי.
חלק ממגבלות אלה ניתן להקל על ידי שימוש אלקטרואופטיקה מישורי עבור הדמיה טימטרי17,24, שם מחוון O2רגיש אינדיקטור הוא co-קיבוע בשכבת הפולימר של אלקטרואופטיקה מישורי עם צבע התייחסות רגיש פולט בטווח ספקטרלי שונה מאשר O2אינדיקטור. בהתבסס על תמונות פליטה שנרכשו בשני חלונות ספקטרלי, אות הפליטה הרגיש O2מחולק באות ההתייחסות, יצירת תמונת יחס שנוטה פחותלתוךהפרעות שהוזכרו לעיל 5,17. השיטה דורשת שימוש בצבע השני, אשר באופן אידיאלי יכול להיות נרגש על ידי אותו מקור עירור, אבל פולט באורך גל שונה (ללא חפיפה משמעותית ספקטרלי), בחלון ספקטרלי אחר של המצלמה (למשל, בערוץ צבע אחר של מצלמת RGB).
לחילופין, O2 הדמיה יכולה להיות מבוססת על ככמת את שינוי O2תלוי במשך החיים הזוהר של צבע מחוון, אשר אינו מושפע התאורה לא אחידה או הטרוגננים בריכוז אינדיקטור25. ראשון לומינסנציה החיים מבוסס O2 מערכות הדמיה היו מבוססים על מדידות בתחום הזמן עם שער ניתן טעונה מצמידים המכשיר (CCD) מערכת מצלמה26, שם מקור עירור פעמו משמש ותמונות לאור הם נלקחים על מרווחי זמן מוגדרים בתוך עירור או פליטה של המחוון8,23,27. מתוך תמונות כאלה, אורך חיים האור יכול להיקבע ומתואם הריכוז O2 המתאים בכיול. לאחר מכן, תמונות במשך החיים של האור עבור מדגם נתון לחצה נגד אלקטרואופטיקה מישורי ניתן להמיר תמונות של התפלגות דו-ממדית התואמת O2 ריכוז. מערכת זו נעשה שימוש ביישומים רבים הן במעבדה באתרו16,28, אבל מצלמת מצלמות חיוניות שער מסוגל הוא כבר לא זמין מסחרית.
לאחרונה, שוחרר מערכת מצלמת חיים שונה לאור השנים, הרוכשת תמונות בתדר-דומיין8. המערכת מסתמכת על מקור אור ברציפות מאופנן לעירור. זה יכול להיות גל sinusoidal או מרובע במקום עירור פעמו, אשר משמש לרכישת תמונה בתחום הזמן. אפנון זה מביא לפליטת הזדקנות מאופנן של צבע O2 מחוון, שהוא שלב מוזז על ידי זווית, φ, אשר תלויה בחיים האור של צבע מחוון (τ) (ראה משוואה 2).
2
השינוי בין עירור לשרעת הפליטה (כלומר, מדד האפנון או העומק (משרעת המחולקת לאור מתמשך)) תלוי גם באורך החיים של האור. כך, על ידי הגדרת תדירות אפנון הידוע חיישן cmos מיוחד בתוך המצלמה הוא מסוגל למדוד את החיים לומינסנציה ב-ns לטווח μs כמתואר בפירוט במקום אחר 8,29,30. מדריך כללי על עקרון הפעולה ניתן למצוא (באמצעות הקישור הבא https://www.youtube.com/watch?v=xPAB_eVWOr8).
בפרוטוקול הבא, אנו מדגימים את השימוש במערכת המצלמה הרומן לדימות התפלגות של O2 ריכוז סביב השורשים של הצמח מים מתוקים מימיים ליטל orella אניפלורה ב 2d9,31. היינו רוצים להדגיש כי שיטה זו היא בשום דרך לא מוגבלת יישום זה. אופדות רגישים לחמצן או חלקיקי חיישן27 בשילוב עם שיטות דימות שונות שימשו במחקר רפואי32, ב ביורינטינג33, עבור צבעים רגישים ללחץ34,35, או ללמוד מערכות פוטוסינתטית2,36,37, רק לתת שם כמה תחומים אחרים של יישום.
בפרוטוקול זה, זרימת העבודה כולה מן ההכנה של אלקטרואופטיקה ל-O2 ניתוח תמונה מכוסה. על-ידי ביצוע פרוטוקול זה, ניתן להשיג תמונות כימיות באמצעות תדירות הרומן המבוססת על מצלמת המשך חיים מבוססי-תחום. בהתאם ליישום, אלקטרואופטיקה מישורי יכול להיות מפוברק בגדלים שונים ועובי שכבה של שכבת החיישן החל חזק 50-100 יקרומטר מישורי עבה בעובי של מספר עשיריות של סנטימטר מרובע כדי לכסות מיקרוסקופ כיסוי עם < 1 יקרומטר שכבות חיישן עבה6,40. הפוטנציאל של שיטה זו הוכח עם יישום מסוים, אבל הוא לא רק מוגבל O2 הדמיה במפעל ריזודורים12,28.
שיטה זו יש מספר יתרונות כאשר לעומת שיטות הדמיה כימית טהורה המבוססת על עוצמה. לומינסנציה הדמיה של חיים לא, או לפחות הרבה פחות, מושפע תאורה מחוספס, עובי אלקטרואופטיקה מחוספס, צילום הלבנת25. כמו כן, שיטה זו מונעת את השימוש בצבע התייחסות נוסף המשותף בהדמיה של טימטרי17,37. בהשוואה למערכות מבוססות חיים אחרות המבוססות על מערכות, כגון מצלמות בתחום הזמן הנפוץ מגודרת8,26, מערכת המצלמה הרומן ופרוטוקול הציג כאן יכול לספק תוצאות דומות. בפרסום האחרונות, המאפיינים האנליטיים של שתי מערכות אלה הושוו והוא נמצא כי התדר-התחום מבוסס על מערכת החיים מבוססי המצלמה היא לפחות להשוות את הזמן הופסק-תחום הפעילות הקדם8.
הצגנו את הפשוט ביותר O2 אלקטרואופטיקה המורכב רק מחוון במטריצה פולימר. מלבד מספר רב אחרים אפשריים O2 אינדיקטורים שעשויים לשמש תוספים ניתן לכלול, כלומר, פיזור סוכנים כגון TiO2 או אבקת יהלום2 כדי להגדיל את האות חיישן תוך הפחתת שקיפות של אלקטרואופטיקה. גם צבעים נוספים עשויים לשמש כדי לשפר את עוצמת האות באמצעות העברת אנרגיה41.
לייצור אלקטרואופטיקה מישורי, אנו ממליצים להשתמש בפער במכשיר ציפוי סכין של 75-120 יקרומטר כדי להניב עובי שכבת החיישן הסופי של סביב 7.5 כדי 12 יקרומטר לאחר אידוי הממס (סביב 10% הפער המשמש), כאשר באמצעות הרכב חיישן התיאור המתואר. זוהי פשרה טובה בין עוצמת האות, אשר ניתן לשנות על ידי טעינת צבע גבוה יותר, או על ידי בחירה של אינדיקטור וצבע התייחסות של בהירות גבוהה יותר, ואת זמן התגובה. עלייה בעובי השכבה גורמת לעלייה בזמן התגובה, כאשר טווח הזמן הנדרש עבור האנליטה להגיע לשיווי משקל תרמודינמי בשכבת החישה עם המדיה המקיפה מגביר12.
אלקטרואופטיקה, כפי שמתואר כאן, מגיבים לשינויים ב-O2 ריכוז בתוך כמה שניות17 תוך שהוא עדיין בעל אות האור חזק מספיק. ציפוי חיישן ultrathin עם זמני תגובה תת שנייה ניתן להבין עם ציפוי ספין6. אם התמיכה או המכשיר ציפוי סכין אינם מנוקים היטב, זה עלול לגרום לשכבות חיישן הומוגנית. כמו כן, כאשר הקוקטייל אינו הומוגנית לחלוטין או מוחל במהירות רבה מדי לאחר התפשטות מול המכשיר ציפוי כגון תוצאה לא רצויה ניתן לצפות. לכן, ייתכן שיהיה צורך בתרגול כדי להכין אופדים אופטימליים.
השיטה יכולה לשמש דגימות תמונה אשר ניתן לשים במגע קרוב אלקטרואופטיקה, כגון בעלי חיים ימיים מסוימים42, ביוילאמים6 ו קרקעות31 רק שם כמה. אנו מציגים התקנה עצמאית באמצעות מטרה, עם זאת, המצלמה יכולה בקלות להיות מצמידים למיקרוסקופ עבור הדמיה כימית ברזולוציה גבוהה43.
בזמן שהתחום הזמני המבוסס על חיים הדמיה מופעלת הדיכוי של הרקע הזריחה26, זה בעיה בעת שימוש בתדר חדש-מבוססי מערכת המחשבים המבוססת8. בשל רכישת תמונה רציפה, המצלמה הזאת יהיה להקליט כל הזריחה הרקע של המדגם שיכול להיות נרגש על ידי LED שנבחרו פולט בחלון ספקטרלי שנבחר כפי שהוגדר על ידי מסנן פליטה על המטרה המצלמה. הדבר יגרום לתקופת חיים נמוכה ככל הנראה, וכתוצאה מכך בקריאות שווא. במקרה שאתה עובד עם דגימות עם חופף משמעותי מהותי חופפים עם הריגוש O2 חיישן ופליטה, חיוני להחיל בידוד אופטי נוסף על גבי אלקטרואופטיקה, על ידי ציפוי שכבה נוספת המכילה פחמן שחור2,17. כך, רק לומינסנציה הנפלטת מן האופדה מישורי יגיע המצלמה. כדי לבדוק את האור ברקע תמונה ללא אלקטרואופטיקה ניתן לקחת, אשר באופן בלעדי להראות האור הפנימי של המדגם. ניתן גם להוסיף חומרים פיזור כגון TiO2 או אבקת יהלומים2,44, כדי קוקטייל חיישן, כדי להגדיל את עוצמת האור של המחוון צבע. עם זאת, זה יכול גם להוביל מהיר יותר צילום הלבנת ו-TiO2 הוא צילום זרז ידוע, אשר יכול לפגוע ביציבותphotostabilityלצבוע. היבט נוסף לשקול הוא אור הרקע. בעת הדמיה של תקופות חיים, יש להימנע מתאורת רקע באופן היעיל ביותר האפשרי. לכן, שיטת דימות זו מחייבת שההתקנה תוצב בסביבה חשוכה וכל מקור האור החיצוני צריך להיות מכובה זמנית במהלך רכישת תמונה.
לסיכום, הדמיה לכל החיים ההדמיה היא שיטת הדמיה כימית חזקה שניתן להתאים יישומים שונים רבים. פרוטוקול זה (ראה סעיף 1-5) מכסה את כל הצעדים החיוניים כדי ליצור תמונה O2 ומשתמש בתדירות הגמישה ביותר לתחום הדמיה מערכת הגלגול החיים, אשר יכול להחליף את מצלמה הזמן הופסק מתחם המחשב עבור 2D O2 דימות עם אלקטרואופטיקה מישורי.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים לסופי לינדארד יאקובסן (אוניברסיטת קופנהגן) ולארס בורראשארד פדרסן (אוניברסיטת אורהוס) לקבלת סיוע טכני. מימון עבור מחקר זה הושג מענק סאפרה-Aude מתוך קרן מחקר עצמאית דנמרק (DFF-1323-00065B; MK), מענקי הפרויקט מקרן המחקר העצמאי דנמרק | מדעי הטבע (DFF-8021-00308B; MK) & מדעי הטכנולוגיה וההפקה (DFF-8022-00301B ו-DFF-4184-00515B; MK), הקרן הלאומית למחקר של דנמרק (DNRF136), ו-Poul Due ינסן קרן (KK).
Air pump with air stone and water pump | Local aquarium store | ||
Chloroform | Sigma Aldrich | 67-66-3 | |
DC4 silicone compound | Dow Corning GmbH | 2793695 | |
Gas mixer | Vögtlin Instruments GmbH | red-y compact meter GCM | This is just one possible instrument. Several companies offer gas mixing devices |
Glass plates and aquaria | Local aquarium or hardware store | ||
ImageJ Software | ImageJ | Freely available imaging software (imagej.nih.gov/ij/index.html) | |
Knife-coating device | BYK-GARDNER GMBH byk.com |
2021 | This is a four sided film applicator enabling easy variation of the film thickness. Other versions are also available. We recommend a thickness of the applied film between 75-120 µm, which yields a final sensor layer thickness of ~10% of the applied thickness before solvent evaporation. |
LED lamp, Reflector PAR38 | Megaman | MM17572 | |
LED LEDHUB | Omicon Laserage, Germany | Can be configured with a variety of LEDs. For the presented example, the green LED (528 nm) is essential | |
LOCTITE AA 3494 | Henkel AG & Co. KGaA | NA | Acrylic-based instant adhesive |
NIS Elements AR Software | Nikon Inc | Software package used for image acquisition | |
pco.flim | PCO AG, Germany | Frequency domain based luminescence lifetime camera | |
platinum(II)-5,10,15,20-tetrakis-(2,3,4,5,6-pentafluorphenyl)-porphyrin (PtTFPP) | Frontier Scientific | PtT975 | O2 indicator |
polyethylene terephthalate (PET) foil | Goodfellow | 320-992-72 | Such foils might also be found from other providers and serve as solid support |
Polystyrene (PS) | Sigma Aldrich | 9003-53-6 | Polymer matrix |
Schott RG610 filter | www.uviroptics.com | Here 52mm screw on Filters can obtained. Other sources offer square glass filters from Schott glass that can be fixed in front of the objective | |
Vinyl electrical tape | Scotch, Super 33+ | NA | |
Zeiss Makro Planar 2/100 with Hama C for Nikon adaptor | delivered with the camera | Here any other objective might also be used in combination with an adaptor if the objective does not have a C-mount |