في هذه الدراسة ، ونحن نقدم المثبط-والاستراتيجيات القائمة علي siRNA للتدخل في تدفق التلقائية في فيروس الهربس البسيط نوع-1 (HSV-1)-الخلايا الجذعية المصابة بالبويضات المشتقة.
فيروس الهربس البسيط نوع-1 (HSV-1) يدفع اوتوهاغي في كل من الخلايا الجذعية غير الناضجة (البلدان الجزريه المتوسطة) وكذلك الخلايا الجذعية الناضجة (mDCs) ، في حين ان التدفق الذاتي لا يلاحظ الا في البلدان الجزريه المتوسطة. للحصول علي رؤى ميكانيكيه ، قمنا بتطوير استراتيجيات فعاله للتدخل في دوران التلقائية المستحثة من HSV-1. وتشكل الاستراتيجية القائمة علي المثبطات ، لتعديل HSV-1-التي يسببها اوتوهاغي ، الخيار الأول ، لأنها طريقه سهله وسريعة. للالتفاف علي الآثار المحتملة غير محدده خارج الهدف من هذه المركبات, وضعنا استراتيجية القائمة علي siRNA البديلة, لتعديل دوران اوتوهاغيك في البلدان الجزريه النامية علي عدوي HSV-1. وفي الواقع ، فان الكهرباء من البلدان الجزريه الFIP200ه مع sirna الخاصة قبل العدوى hsv-1 هو طريقه محدده جدا وناجحه لاستئصال FIP200 التعبير البروتين التالي لمنع تدفق التلقائية. وتؤدي كلتا الطريقتين المعروضتين إلى تثبيط فعال للدوران الذاتي المستحث HSV-1 في البلدان الجزريه الأخرى ، حيث تكون التقنية القائمة علي siRNA أكثر تحديدا للهدف. وقد وضع نهج إضافي قائم علي siRNA لإسكات التعبير عن البروتين بشكل انتقائي من KIF1B و KIF2A ، مما يسهل دوران التلقائية علي عدوي HSV-1 في mDCs. وفي الختام ، فان تقنيه siRNA الكهربية تمثل استراتيجية واعده ، لأزاله التعبير عن البروتينات المميزة بشكل انتقائي وتحليل تاثيرها علي عدوي HSV-1.
يشكل جيل الخلايا الجذعية المشتقة من البويضات البشرية (DCs) نموذجا مناسبا في المختبر لدراسة وظائف وبيولوجيا هذا النوع من الخلايا المناعية الهامه. العزلة وكذلك التفريق بين الخلايا الاحاديه في النامية وقد ثبت جيدا في السنوات الاخيره1,2. العدوى من DCs مع α-herpesvirus فيروس الهربس البسيط نوع-1 (hsv-1) بمثابه نظام نموذجي لدراسة hsv-1-التحويرات بوساطة DC البيولوجيا2,3,4,5,6 . وهذا مهم بشكل خاص لتوضيح كيف الفيروسات المتعرجة تثبيط أو تمنع الاستجابات المناعية المضادة للفيروسات قويه ، لإنشاء الكمون في المنافذ المحصنة المتميزة داخل المضيف7،8. في هذا الصدد ، فيروسات الهربس هي مسببات الامراض الناجحة جدا التي تنتشر علي نطاق واسع في جميع انحاء السكان الوصول إلى انتشار مصلي يصل إلى 90 ٪ وفقا للمنطقة الجغرافية9. لفهم وربما منع هذا ، وهناك حاجه إلى مزيد من الرؤى في التحويرات بوساطة HSV-1 من الجهاز المناعي للمضيف ، وخاصه من الخلايا المناعية مثل DCs ، مطلوبه.
ونشرت مؤخرا شركه توران وآخرون10ملاحظه جديده تماما فيما يتعلق بالتفاعل بين المجالات النامية والتي هي من طراز hsv-1. واثبت المؤلفون ان إنجاز النسخ المتماثل HSV-1 يعتمد بشكل صارم علي حاله نضوج الأقاليم النامية. وفي البلدان الجزريه المستقلة ، يتم تيسير النسخ المتماثل الكامل ل HSV-1 بواسطة أليات تعتمد علي الانتقاء الذاتي. وفي حين ان HSV1 يدفع إلى الداخل في كل من البلدان الجزريه القليلة المانحة والصناديق الاستئمانية المستقرة ، يلاحظ التدفق الألى في البلدان الجزريه الوحيدة. وهذا بدوره يسهل الخروج النووي من الفيروسات الفيروسية عن طريق التحلل الألى للأمينات النووية في البلدان الجزريه النامية. للحصول علي رؤى ميكانيكيه في هذا المسار تدهور المستحثة HSV-1 في البلدان الجزريه المتوسطة مقابل mDCs ، استراتيجيات جديده وفعاله هي حاسمه للتحقيق في تدفق التلقائية.
ماكرواوتوهاغي (اوتوهاغي) هي عمليه متعددة الخطوات المحفوظة جيدا تستهدف البروتينات داخل الخلايا أو العضيات كامله لهضم الليسومال11. ببساطه ، يمكن تقسيم اوتوهاغي إلى ‘ 1 ‘ البدء ، ‘ 2 ‘ النواة الغشائية ، ‘ 3 ‘ توسيع الحويصلة ، و ‘ 4 ‘ اوتوسوسوم-lysosome الانصهار المرحلة12. اثناء البدء (i) ، فان مكونات مثل مجمع كيناز ULK1/2 المنشط ، والتي تحتوي علي بروتين التفاعل البؤري المتفاعل مع عائله كيناز من 200 دينار كويتي (FIP200) ، هي عناصر حاسمه لتنشيط مجمع beclin-1-Vps34-AMBRA1. في وقت لاحق ، والنواة غشاء (2) يبدا phagophore تشكيل13، والتي يجتاح الشحنات الخلوية التي تتميز جزيئات مثل p6214. خلال التوسع الحويصلة والتلقائية النضج (iii) ميكروتوبولي-المرتبطة سلسله ضوء البروتين 3 (LC3)-I يتم تحويلها إلى شكلها الليبيداتيد LC3 التي يتم ادراجها في الغشاء التلقائي. التالي ، فان معدلات التحويل LC3 إلى II هي مؤشر لاستقراء الانتقاء الذاتي عن طريق عكس تشكيل النضج الذاتي الناضج15،16. علي اوتوسوسوم-lysosome فيوجن (iv) ، وليس فقط البضائع اوتوهاغيك ولكن أيضا المرتبطة p62 والبروتينات LC3 الخضوع للتدهور (علي سبيل المثال ، عن طريق التحلل). وهكذا ، فان فقدان p62 و LC3 بمثابه علامات للتدفق الذاتي17. الانصهار من [اوتوسوسومس] مع [ليسسوميس], ولذلك يتبع دوران [اوتوهريك], جدا متدلية علي التعريب داخل الخلايا [ليسسومال]. هذا هو ، من بين أمور أخرى ، التي ينظمها افراد الاسره كينيسن KIF1B و KIF2A ، والتي أظهرت ان تؤثر سلبا اوتوسوسوم-lysosome فيوجن18. ومن المثير للاهتمام ، والتعبير عن البروتين من KIF1B و KIF2A هو المستحث علي نضوج العاصمة التالي مسؤوله عن تدفق التلقائية غير كفء في mDCs-1 المصابة ، الذي يعوق كامله HSV-1 النسخ المتماثل10.
وتشمل المحاولات التجريبية لتعديل اوتوهاغي استخدام المركبات المعروفةللحث علي أو تمنع هذا المساربالذات 19,20,21. في هذه الدراسة ، ونحن وصف اثنين من الاستراتيجيات القائمة علي المثبط لمنع دوران التلقائية في البلدان الجزريه التي تصيب الفيروسات المصابة. المركب الأول المستخدمة في تجاربنا هي محدده وقويه المثبط التلقائي-1 (spautin-1) ، والتي وصفت لتعزيز Vps34-AMBRA1 تدهور معقده خلال مرحله البدء من اوتوهاغي22. المركب الثاني المستخدم في هذه الدراسة هو بافيلوميسين-A1 (BA1) ، وهو مثبط الخامس-atpase الذي يمنع الاحداث التلقائية في وقت متاخر (اي، اوتوسوسوم-lysosome الانصهار فضلا عن تحمض التلقائي)23،24. استخدام اي من هذه المثبطات اثنين قبل العدوى iDC مع HSV-1 بشكل بونتلي يمنع اوتوهاغي ، ولكن لا يزعج التعبير الجيني الفيروسي فعاله. وهكذا ، فان هذه الاستراتيجية القائمة علي المثبطات قبل العدوى HSV-1 يوفر أداه قويه لكبح التدفق الذاتي المستحث HSV-1 التي يمكن بسهوله توسيعها لعدد كبير من أنواع الخلايا المختلفة والفيروسات ، والتي يحتمل أيضا ان تحفز اوتوهاغي.
وللتغلب علي الجانب السلبي الرئيسي للنهج القائم علي المثبطات(اي الآثار غير المحددة خارج الهدف) ، وضعنا أسلوبا يستند إلى sirna لمنع التدفق الذاتي في البلدان الجزريه النامية (hsv-1-المصابة). وتمثل تقنيه siRNA الكهربائية استراتيجية بديله قويه ، عن طريق الاجتثاث الانتقائي للتعبير عن البروتينات المتميزة (اي المكونات التلقائية). في تجاربنا البلدان الجزريه التي كانت كهربية مع siRNA FIP200 محدده باستخدام جهاز الكهرباء انا (انظر جدول المواد) وبروتوكول معدله وصفتها gerer وآخرون (2017) و Prechtel وآخرون (2007) ، لمنع اوتوهاغي خلال بدءالمرحلة 25 ،26. هذا الأسلوب يسمح لنا علي وجه التحديد الضربة القاضية FIP200 التعبير في البلدان الجزريه الامريكيه ، دون التدخل في بقاء الخلية والنمط الظاهري غير ناضجه يومين بعد الكهربية. جدير بالذكر, وقد أنشئت عدوي HSV-1 في هذه البلدان الجزريه الغنية بالكهرباء التي تعكسها التعبير عن البروتين الفيروسي فعاله. هذه التقنية المستندة إلى siRNA تقدم فائده فريدة من نوعها (اي ان مجموعه متنوعة من المكونات التلقائية المختلفة ، حتى في تركيبه) ، يمكن ان تستهدف علي وجه التحديد لاستئصال التعبير عنها.
في هذه الدراسة ، ونحن أيضا وصف طريقه المستندة إلى siRNA للحث علي تدفق اوتوسيريك أيضا في mDCs المصابة-1. وفي هذه الحالة ، كانت البلدان الجزريه القائمة بالكهرباء مع سيرنا تستهدف KIF1B و KIF2A قبل نضوج العاصمة باستخدام الجهاز الكهربي الثاني (انظر جدول المواد). منذ كلا البروتينات هي اوبريجولاتيد خلال نضوج العاصمة والمعروف انها تنظم بشكل سلبي الانصهار من اوتوسوسوميس مع التماثيل10،18، ضربه قاضيه بقوة المستحثة التدفق الذاتي في mdcs علي hsv-1 العدوى. التالي ، فان تقنيه المستندة إلى siRNA مكنتنا من الحث علي وجه التحديد دوران التلقائية عن طريق التدخل مع التعبير بروتين KIF في mDCs ، التالي يمكن ان تحاكي مستويات التعبير في البلدان الجزريه المتوسطة.
وباختصار ، نقدم طريقتين متميزتين لكبح التدفق الذاتي في البلدان الجزريه التي تصيبها العدوى. وفي حين ان النهج الأول القائم علي المثبطات يشكل وسيله سهله ورخيصه وسريعة للتدخل في تدهور التلقائية ، والتقنية الثانية القائمة علي siRNA هي أكثر تحديدا وطريقه مناسبه جدا لدعم والتحقق من نتائج المثبطة القائمة علي التجارب. الاضافه إلى ذلك ، فاننا وصف طريقه للحث علي التدفق الذاتي أيضا في mDCs المصابة HSV-1 ، عن طريق الضربة القاضية بوساطة siRNA من اثنين من البروتينات KIF.
ويشمل نطاق هذا البروتوكول ‘ 1 ‘ مناوله البلدان الجزريه الوحيدة التي تستمد منها البويضات البشرية ، وكذلك الفيروسات المتوسطة الحجم ، و ‘ 2 ‘ اصابتها بالعدوى بالمركب HSV-1 ، و ‘ 3 ‘ معالجتها بمركبات معروف انها تمنع التفريغ الذاتي ، و ‘ 4 ‘ مختلف الاجهزه التقنية. وباستخدام هذا البروتوكول ، يمكن اما حظر التدفق الذاتي للعدوى في البلدان الجزريه الام المصابة بفيروس اتش اس-1 ، أو المستحث في الصناديق الاستئمانية المصابة بالفيروس HSV-1.
ونظرا لان البلدان النامية ، ولا سيما منها ، هي خلايا ضعيفه جدا ، فان العمل مع هذه الخلايا ينطوي علي خطوات حساسة إلى حد ما. للجيل العاصمة ، ونحن نوصي لاستخدام الطازجة المعزولة Pbmmmcmcmcmcmcmcm، وتجنب بالتبريد ، من أجل الحصول علي اعلي غله الخلية. وعلاوة علي ذلك ، عند مناوله البلدان الجزريه الضارة اثناء التجارب ، بما في ذلك زراعتها لاحقا ، منع التعديلات القاسية أو المطولة للحرارة. وبخلاف ذلك ، قد تخضع البلدان الجزريه الأخرى لتغيرات النمط الظاهري ، التالي فمن الضروري التحقق من النمط الظاهري غير الناضج عن طريق قياس التدفق الخلوي. وعلي النقيض من نظرائهم الناضجين ، تفتقر البلدان الجزريه المستقلة إلى علامات مميزه ، مثل CD80 ، CD83 ، و CD8628،29. والعدوى بين البلدان الجزريه القليلة المنشا و mdcs مع hsv-1 هي طريقه راسخة2،3،4،5،6،10. وأظهرنا نحن وغيرنا ان البلدان النامية شديده التعرض للاصابه بعدوي الفيروس HSV-1 ، عندما استخدمت وزاره الداخلية من 1 أو 2 (الشكل 2). في ايدينا ، والحفاظ علي حجم المتوسطة العدوى في مستويات منخفضه (1-3 x 106 خلايا في 250-350 μl) سوف يؤدي إلى تحسين كفاءه العدوى.
والنهج التقليدي للتدخل في مسار خلوي متميز معين هو استخدام مركبات محدده. مجموعه متنوعة من المغيرين مختلفه من اوتوهاغي ، اي المنشطات ، فضلا عن مثبطات ، وتتوفر حاليا30. وفيما يتعلق HSV-1-المستحثة اوتوهالهاي في البلدان النامية ، توران وآخرون ، (2019) أظهرت مؤخرا الآثار المثبطة من spautin-1 و بافيلوميسين-A1 (BA1) علي دوران اوتوهاغيك في الجزيرة المتوسطة10. هذا الأسلوب لتثبيط الغيار التلقائية هو مناسبه للجمع مع عدوي HSV-1 اللاحقة ، لأنه لا يوجد معدل الاصابه ولا حاله نضوج DCs (وخاصه البلدان الجزريه النامية) هو ضعف. وفي التطبيقات المستقبلية ، يمكن تطبيق هذا النهج القائم علي المثبطات أيضا بالاقتران مع العوامل المعدية الأخرى ، وظروف الإجهاد ، مثل المجاعة ، فضلا عن أنواع الخلايا المختلفة. ومع ذلك ، عند استخدام مثبطات ، تنشا القيود في تحديد التركيز المناسب لتثبيط التلقائية كفاءه ، دون التاثير بشده علي سلامه الخلية. ومع ذلك ، فان القيد الرئيسي عند استخدام مثبطات هو حدوث الآثار المحتملة خارج الهدف أو السلبية ، والتي يمكن ان تؤدي إلى نتائج مضلله31،32.
النهج الثاني للتدخل في اوتوهاغي ، التي يغطيها هذا البروتوكول ، هو ضربه قاضيه محدده باستخدام sirna33،34،35. من ناحية ، استخدمنا جهاز الكهرباء I لاستئصال علي وجه التحديد التعبير عن FIP200 ، التالي تثبيط hsv-1-المستحثة دوران اوتوهاغيك في البلدان الجزريه الأخرى. من ناحية أخرى ، ونحن إسكات اثنين من البروتينات KIF مختلفه (اي ، KIF1B و KIF2A) ، وذلك باستخدام الجهاز الكهربائي الثاني ، لتسهيل تدفق الغيار الذاتية في HSV-1-mDCs المصابة. وأسفرت كل من بروتوكولي الكهرباء عن استئصال كامل تقريبا لFIP200 في البلدان الجزريه المستقلة ، و KIF1B/KIF2A في mDCs ، التي تم التحقق منها عن طريق تحليلات لطخه غربيه (الشكل 4ا، الشكل 5ا). وعلي النقيض من الجهاز الكهربي الأول ، الذي لا يؤثر علي مقومات البقاء للبلدان النامية ، فان الكهرباء من mDCs باستخدام الجهاز الكهربي الثاني يؤدي إلى معدلات اعلي قليلا من الخلايا الميتة (الشكل 4ب، الشكل 5ب ). التالي ، في التطبيقات المستقبلية ، وجهاز الكهرباء وانا ينبغي ان تستخدم بشكل تفضيلي لكلا البلدان الجزريه القريبة القادمة و mDCs. وبشكل ملحوظ ، فان كلا من التقنيات المستندة إلى siRNA ، لتعديل التدفق الذاتي ، متوافقة مع عدوي HSV-1 اللاحقة من البلدان الجزريه المتوسطة أو mDCs. وعلاوة علي ذلك ، لا يتم تغيير النمط الظاهري غير ناضجه من البلدان الجزريه الأخرى ولا النمط الظاهري ناضجه من mDCs بعد كهربية.
الكهرباء من البلدان الجزريه المستقلة التي تستخدم siRNA FIP200 الخاصة هو وسيله فعاله ومحدده للغاية لضربه قاضيه الجينات ، فضلا عن تثبيط تدفق اوتوهاليك علي عدوي HSV-1. بالاضافه إلى إسكات محدده من FIP200 ، يمكن تكييف هذا البروتوكول لإسكات المكونات التلقائية الأخرى ، والمشاركة في خطوات مختلفه خلال تتالي اوتوهاليك. ومع ذلك ، فان تحديد الهدف المناسب لتثبيط الكفاءة الذاتية بوساطة سيرنا يشمل عده جوانب من القلق. أولا ، الكفاءة الضربة القاضية المتعلقة بالجينات المتصلة (ATG) لا ترتبط بالضرورة بشكل إيجابي مع تثبيط كفاءه الغيار الذاتية وتعتمد اعتمادا كبيرا علي البروتين ATG محدده التي يتم إسكات36. ثانيا ، وتشارك البروتينات atg متميزة بالاضافه إلى ذلك في مسارات متميزة من اوتوهاغي ، التالي يمكن ان يؤدي الاجتثاث أيضا إلى الآثار الجانبية السلبية37،38،39. ثالثا ، قد يكون ATGs مختلفه وظائف زائده عن الحاجة ، التالي الضربة القاضية من عنصر واحد قد لا تكون كافيه لمنع اوتوهاغي (علي سبيل المثال، beclin-1 و beclin-2)40.
الاضافه إلى ذلك ، فان الجهاز الكهربائي القائم علي بروتوكول الكهربائية التي تعتمد عليها Dc هو أيضا مناسبه ل mRNAs ، ويمكن استخدامها لمجموعه متنوعة من أنواع الخلايا الاساسيه اضافيه ، مثل Pbmcms25. التالي فان هذا النظام يوفر استراتيجية عامه لتقديم أنواع مختلفه من الحمض الريبي النيبالي إلى أنواع الخلايا الاوليه. وفي الختام ، فاننا نقدم بروتوكولين لمنع التدفق الذاتي ، اما باستخدام المثبط-أو نهج القائم علي siRNA مع عدوي HSV-1 اللاحقة من البلدان الجزريه المستقلة. وعلاوة علي ذلك ، فاننا وصف النهج الكهربي siRNA للحث علي تدفق التلقائية في mDCs علي عدوي HSV-1.
The authors have nothing to disclose.
تم دعم هذا العمل من قبل مجلس البحوث ألماني (DFG) عن طريق المشروع STE 432/11-1 الممنوحة ل AS وبرنامج ELAN من كليه الطب (فريدريش-الكسندر-جامعه ارلنجن-نورنبيرغ) عبر المشروع 18-12-21-1 ، الممنوحة ل LG.
4D-Nucleofector Core Unit (electroporation apparatus II) | Lonza (Basel, Switzerland) | AAF-1002B | |
AB-Serum | Sigma Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | H4522 | Dendritic cell cultivation |
ACD-A | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | 9007281 | |
Amaxa P3 Primary Cell 4D-Nucleofector X Kit L (electroporation kit apparatus II) | Lonza (Basel, Switzerland) | V4XP-3024 | |
Amersham ECL Prime Western Blotting Detection Reagent | GE Healthcare (Solingen, Germany) | RPN2232 | Western Blot Detection |
Ammonium persulfate (APS) | Sigma Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | A3678 | |
anti-mouse-IgG (mouse, polyclonal, HRP) | Cell Signaling (Leiden, Netherlands) | 7076 | Western Blot detection |
anti-rabbit-IgG (goat, polyclonal, HRP) | Cell Signaling (Leiden, Netherlands) | 7074 | Western Blot detection |
Bafilomycin A1 | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | tlrl-baf1 | inhibition of autophagy and lysosomal degradation |
BD FACS Canto II Flow Cytometer | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 338962 | |
Benzonase | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | E1014 | |
Blotting Chamber Fastblot B44 | Biometra (Göttingen, Germany) | 846-015-100 | |
CCR7 (mouse, Pe-Cy7) | BioLegend (Fell, Germany) | 557648 | Flow cytometry Dilution: 1:100 Clone: G043H7 |
CD11c (mouse, Pe-Cy5) | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 561692 | Flow cytometry Dilution: 1:100 Clone: B-ly6 |
CD14 (mouse, PE) | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 555398 | Flow cytometry Dilution: 1:100 Clone: M5E2 |
CD3 (mouse, FITC) | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 555332 | Flow cytometry Dilution: 1:100 Clone: UCHT1 |
CD80 (mouse, V450) | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 560442 | Flow cytometry Dilution: 1:100 Clone: L307.4 |
CD83 (mouse, APC) | eBioscience Thermo Fisher Scientific (Langenselbold, Germany) | 17-0839-41 | Flow cytometry Dilution: 1:200 Clone: HB15e |
CD86 (mouse, PE) | BD Biosciences (Heidelberg, Germany) | 553692 | Flow cytometry Dilution: 1:100 |
EVOS FL Cell Imaging | System AMG/Life Technologies (Carlsbad, USA) | AMF4300 | |
FIP200 (rabbit) | Cell Signaling (Leiden, Netherlands) | 12436 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: D10D11 |
GAPDH (mouse) | Merck Millipore (Massachusetts, USA) | AB2302 | Western Blot detection Dilution: 1:5000 Clone: MAB374 |
Gene Pulser II apparatus (electroporation apparatus I) | BioRad Laboratories GmbH (München, Germany) | 165-2112 | |
GM-CSF (4×104 U/mL) | Miltenyi Biotec (Bergisch Gladbach, Germany) | 130-093-868 | |
HLA‐DR (mouse, APC-Cy7) | BioLegend (Fell, Germany) | 307618 | Flow cytometry Dilution: 1:200 Clone: L243 |
HSV-1/17+/CMV-EGFP/UL43 | BioVex | DC infection |
|
ICP0 (mouse) | Santa Cruz Biotechnology (St. Cruz; Dallas, Texas, USA) | sc-53070 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: 11060 |
ICP5 (mouse) | Santa Cruz Biotechnology (St. Cruz; Dallas, Texas, USA) | sc-56989 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: 3B6 |
IL-1β (0.1×106 U/mL) | Cell Genix GmbH (Freiburg, Germany) | 1411-050 | |
IL-4 (1×106 U/mL) | Miltenyi Biotec (Bergisch Gladbach, Germany) | 130-093-924 | |
IL-6 (1×106 U/mL) | Cell Genix GmbH (Freiburg, Germany) | 1404-050 | |
ImageQuant LAS 4000 | GE Healthcare (Solingen, Germany) | 28955810 | |
KIF1B (mouse) | Santa Cruz Biotechnology (St. Cruz; Dallas, Texas, USA) | sc-376246 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: E-12 |
KIF2A (mouse) | Santa Cruz Biotechnology (St. Cruz; Dallas, Texas, USA) | sc-271471 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: D-7 |
LC3B (rabbit) | Cell Signaling (Leiden, Netherlands) | 3868 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: D11 |
L-glutamine | Lonza (Basel, Switzerland) | 17-605E | |
LIVE/DEAD Fixable Violet dead cell stain kit | Life Technologies (Carlsbad, CA, USA) | L34964 | L/D staining in Flow cytometry |
Lymphoprep | Alere Technologies AS (Oslo, Norway) | 04-03-9391/01 | |
Magnesiumchloride | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | A537.1 | |
Megafuge 2.0 RS | Heraeus (Hanau, Germany) | 75015505 | |
N, N, N', N'-Tetramethylethylendiamine (TEMED) | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | T9281 | |
Neubauer counting chamber | Brand (Wertheim, Germany) | 717805 | |
Nunc Cell culture flasks (175.0 cm2) | Thermo Scientific (Rockford, USA) | 159910 | |
p62 (rabbit) | Cell Signaling (Leiden, Netherlands) | 88588 | Western Blot detection Dilution: 1:1000 Clone: D5L7G |
PageRuler prestained protein ladder | Thermo Fisher Scientific (Langenselbold, Germany) | 26616 | |
Paraformaldehyde, 16 % | Alfa Aesar, Haverhill, USA | 43368.9M | |
PerfectSpin 24 Plus | Peqlab (Erlangen, Germany) | C2500-R-PL | |
PGE2 (1 mg/mL) | Pfizer (Berlin, Germany) | BE130681 | |
Phosphate buffered saline (PBS) | Lonza (Basel, Switzerland) | 17-512F | |
Protein gel system MiniProtean II | Bio-Rad Laboratories GmbH (München, Germany) | 1652960 | |
RestoreTM Western Blot Stripping Buffer | Thermo Scientific, Rockford, USA | 21059 | |
Rocking Platform wt 15 | Biometra (Göttingen, Germany) | 042-590 | |
RotiBlock | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | A151.4 | |
Roti-Load 1 (4x) | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | K929.3 | |
Rotiphorese Gel 30 (37.5:1) | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | 3029.1 | |
RPMI 1640 | Lonza (Basel, Switzerland) | 12-167F | |
Sodium dodecyl Sulfate (SDS) | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | 2326.2 | |
Thermomixer comfort | Eppendorf (Hamburg, Germany) | 5355 000.011 | |
TNF-α (10 μg/mL) | Peprotech (Hamburg, Germany) | 300-01A | |
Tris | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | 4855.3 | |
Trypan blue solution (0.4 %) | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Steinheim, Germany) | T8154 | |
Tween 20 | Carl Roth GmbH (Karlsruhe, Germany) | 9127.1 | |
Whatman 0.2 μm nitrocellulose membrane | GE Healthcare (Solingen, Germany) | 10600001 | |
WhatmanTM Chromatography Paper 3 mm Chr | Fisher Scientific GmbH (Schwerte, Germany) | 3030917 |