Hier presenteren we een protocol voor eenvoudige isolatie van specifieke groepen van levende neuronale cellen die groen fluorescerende eiwitten uit transgene Caenorhabditis elegans lijnen uitdrukken. Deze methode maakt een verscheidenheid van ex vivo studies gericht op specifieke neuronen en heeft de capaciteit om cellen te isoleren voor verdere korte termijn culturing.
Tijdens het verouderingsproces, veel cellen accumuleren hoge niveaus van schade die leidt tot cellulaire dysfunctie, die ten grondslag ligt aan vele geriatrische en pathologische omstandigheden. Post-mitotische neuronen vertegenwoordigen een belangrijk celtype beïnvloed door veroudering. Hoewel meerdere zoogdieren modellen van neuronale veroudering bestaan, ze zijn uitdagend en duur om vast te stellen. De rondworm Caenorhabditis elegans is een krachtig model om neuronale veroudering te bestuderen, omdat deze dieren een korte levensduur hebben, een beschikbare robuuste genetische Toolbox en goed gecatalogeerd zenuwstelsel. De hier gepresenteerde methode zorgt voor naadloze isolatie van specifieke cellen op basis van de uitdrukking van een transgene groene fluorescerende proteïne (GFP). Transgene dieren lijnen die GFP uitdrukken onder verschillende celtypespecifieke promotors worden verteerd om de buitenste cuticula te verwijderen en zachtjes mechanisch verstoord om slurry met verschillende celtypen te produceren. De cellen van belang worden vervolgens gescheiden van niet-doelcellen via fluorescentie-geactiveerde celsortering, of door anti-GFP-gekoppelde magnetische kralen. De geïsoleerde cellen kunnen vervolgens voor een beperkte tijd worden gekweekt of onmiddellijk worden gebruikt voor cel-specifieke ex vivo-analyses, zoals transcriptionele analyse door real-time kwantitatieve PCR. Dit protocol zorgt dus voor een snelle en robuuste analyse van celspecifieke reacties binnen verschillende neuronale populaties in C. elegans.
In de afgelopen decennia, het metazoan modelorganisme Caenorhabditis elegans is een enorme troef in de studie van neuronen, neuronale circuits en haar rol in fysiologische en gedragsmatige reacties, en veroudering-geassocieerde neurodegeneratieve Ziekten. Een unieke eigenschap van C. elegans is dat de dieren transparant zijn, waardoor de afstamming van alle volwassen somatische cellen in kaart kan worden gebracht1. C. elegans herbergt ook beheersbare hoeveelheid neuronen, wat leidt tot de morfologie en connectiviteit van het zenuwstelsel wordt goed begrepen2. De invariante celafstamming, korte levensduur en overvloed aan genetische hulpmiddelen met hoge doorvoer die beschikbaar zijn voor C. elegans maken het een ideaal modelorganisme voor de studie van veroudering binnen verschillende neuronale populaties.
Veroudering van neuronen en neurodegeneratieve aandoeningen zijn complex, en elke stoornis heeft unieke pathologische handtekeningen die ermee verbonden zijn. Echter, voor veel van deze aandoeningen, zoals de ziekte van Parkinson en Alzheimer, een gemeenschappelijk kenmerk is de progressieve belasting van verkeerd gevouwen eiwitten3,4,5. In beide van deze ziekten, eiwitten misvouwen en aggregaat binnen de cel om toxiciteit te veroorzaken, uiteindelijk leiden tot celdood4,5. Voor de juiste veroudering van neuronen, de homeostase van de mitochondriën, meer specifiek eiwit homeostase, is belangrijk, als verstoringen en dyshomeostase kan leiden tot neurodegeneratie6,7,8. Cellen zijn uitgerust met verschillende mechanismen om eiwit homeostase te handhaven, één is de ongevouwen eiwit respons (UPR) ― een klassieke route waarbij signalen van endoplasmisch reticulum (ER) intracellulaire signaal Cascades activeren, wat leidt tot een transcriptionele Response9. Verwant aan deze UPRer, figuur vertonen een soortgelijke reactie op het verlies van mitochondriale eiwit homeostase, de zogenaamde mitochondriale UPR (UPRMT)7,8. C. elegans lijkt het meest basale organisme te zijn dat een bevestigde en goed gedefinieerde UPRMT traject7heeft.
De functie/disfunctie van specifieke neuronale populaties binnen een groter netwerk kan moeilijk te beoordelen zijn vanwege hun intrinsieke connectiviteit en complexiteit3. Echter, er is vaak een behoefte om te bestuderen van verschillende neuronale populaties als gevolg van celtypespecifieke ziekten met complexe pathologieën, zoals die in verband met verminderde cellulaire eiwit homeostase. In C. eleganskunnen specifieke neuronale populaties genetisch gemanipuleerd worden, waardoor faciele observatie in vivo mogelijk is. Het zenuwstelsel van C. elegans bestaat voornamelijk uit neuronen, met een klein percentage gliacellen. Bij volwassen hermafrodiet wormen zijn er ongeveer 302 neuronen, onderverdeeld in meer dan 100 verschillende klassen2,10. Neuronen zoals cholinerge neuronen overheersingen in neuromusculaire knooppunten, terwijl Dopaminerge neuronen voornamelijk betrokken zijn bij sensatie10,11. Aangezien zowel motorische activiteit als zintuiglijke vaardigheden afnemen met de leeftijd, is het belangrijk om mechanistische inzichten over defecten in deze individuele neuronen te detail te bekijken11,12. Als zodanig is er behoefte aan een eenvoudige en robuuste methode om intacte cellen van belang te isoleren voor latere ex vivo-studies.
Hier beschrijven we een geoptimaliseerde effectieve methode voor de snelle isolatie van specifieke neuronale cellen die groene fluorescerende eiwitten (GFP) uitdrukken uit C. elegans. Deze isolatiemethode kan worden uitgevoerd op larvale, juveniele of volwassen wormen. Isolatie van cellen van larvale Worms werd eerder gepubliceerd door Zhang et al.13 en zal hier niet worden besproken. Een belangrijke opmerking hier is dat alle wormen in dezelfde levensfase moeten zijn om overmatige vertering van het dier of besmetting van dieren in verschillende levensstadia te voorkomen. Door zowel enzymatische als mechanische verstoring van de nematode cuticula, een exoskelet hoog in collageen en andere structurele eiwitten, kan een grote verscheidenheid aan cellen worden geïsoleerd13,14. Cellen kunnen vervolgens worden geïsoleerd via Flowcytometrie of antilichaam gelabelde magnetische kralen. Typisch, RNA is geïsoleerd via een fenol en guanidine isothiocyanaat methode om te zorgen voor de verrijking van de gewenste celpopulatie15. Met veel zorg kunnen deze geïsoleerde cellen worden gehandhaafd in een kweek kolf of multi-well gerecht. Deze methode vertegenwoordigt een unieke en krachtige tool in de studie van specifieke neuronen en heeft de capaciteit om te isoleren van levende en functionele cellen voor verdere culturing.
De rondworm C. elegans is een gevestigde en krachtige model voor het bestuderen van de neuronale gezondheid en ziekte2. Met ruime genetische hulpmiddelen om deze dieren te manipuleren en beheersbare hoeveelheid nauwkeurig in kaart gebrachte neuron types, kan een groot deel van de gegevens worden verzameld met een relatief kleine hoeveelheid materiaal. Hier schetsen we een geoptimaliseerde methode om verschillende neuronen van hele dieren te isoleren. Door de buitenste cuticula-eiwitten va…
The authors have nothing to disclose.
We danken Dr. Jennifer Fox en de leden van het Khalimonchuk laboratorium voor inzichtelijke commentaren. We erkennen de steun van de National Institutes of Health (R01 GM108975 tot O.K. en T32 GM107001-01A1 tot E.M.G.).
6-well plate | Fisher Scientific | 12-556-004 | |
Agar, Molecular Biology Grade | VWR | A0930 | |
CaCl2 | Sigma | C5670 | |
Chloroform | Sigma | 496189 | |
Contess Automated Cell Counter | Invitrogen | Z359629 | |
DTT | USBiological | D8070 | |
Ethanol | Decon Labs | 2701 | |
FBS | Omega Scientific | FB-02 | |
Fluorodeoxyuridine | Sigma | F0503 | |
HEPES | Sigma | H3375 | |
Isopropanol | VWR | BDH1133 | |
KCl | Amresco | O395 | |
KH2PO4 | USBiological | P5110 | |
Kimwipes | Kimberly-Clark Professionals | 7552 | |
Leibovitz's L-15 Medium | Gibco | 21083027 | |
MgCl2 | Sigma | M8266 | |
MgSO4 | USBiological | M2090 | |
Na2HPO4·7H2O | USBiological | S5199 | |
NaCl | VWR | X190 | |
NaOCl (Bleach) | Clorox | ||
NaOH | Amresco | O583 | |
Penicillin-Streptomicen | Fisher Scientific | 15140122 | |
Peptone Y | USBiological | P3306 | |
Pronase E | Sigma | 7433 | protease mixture from Streptomyces griseus |
SDS | Amresco | O227 | |
SMT1-FLQC fluorescence stereomicroscope | Tritech Research | ||
Sucrose | USBiological | S8010 | |
SuperScript IV One-Step synthesis kit | ThermoFisher | 12594025 | |
TRIzol | Invitrogen | 15596026 | phenol and guanidine isothiocyanate solution |
Trypan Blue Stain | Invitrogen | T10Z82 | |
α-GFP magnetic beads | MBL | D153-11 |