Summary

Isolatie van specifieke neuron populaties van Roundworm Caenorhabditis elegans

Published: August 06, 2019
doi:

Summary

Hier presenteren we een protocol voor eenvoudige isolatie van specifieke groepen van levende neuronale cellen die groen fluorescerende eiwitten uit transgene Caenorhabditis elegans lijnen uitdrukken. Deze methode maakt een verscheidenheid van ex vivo studies gericht op specifieke neuronen en heeft de capaciteit om cellen te isoleren voor verdere korte termijn culturing.

Abstract

Tijdens het verouderingsproces, veel cellen accumuleren hoge niveaus van schade die leidt tot cellulaire dysfunctie, die ten grondslag ligt aan vele geriatrische en pathologische omstandigheden. Post-mitotische neuronen vertegenwoordigen een belangrijk celtype beïnvloed door veroudering. Hoewel meerdere zoogdieren modellen van neuronale veroudering bestaan, ze zijn uitdagend en duur om vast te stellen. De rondworm Caenorhabditis elegans is een krachtig model om neuronale veroudering te bestuderen, omdat deze dieren een korte levensduur hebben, een beschikbare robuuste genetische Toolbox en goed gecatalogeerd zenuwstelsel. De hier gepresenteerde methode zorgt voor naadloze isolatie van specifieke cellen op basis van de uitdrukking van een transgene groene fluorescerende proteïne (GFP). Transgene dieren lijnen die GFP uitdrukken onder verschillende celtypespecifieke promotors worden verteerd om de buitenste cuticula te verwijderen en zachtjes mechanisch verstoord om slurry met verschillende celtypen te produceren. De cellen van belang worden vervolgens gescheiden van niet-doelcellen via fluorescentie-geactiveerde celsortering, of door anti-GFP-gekoppelde magnetische kralen. De geïsoleerde cellen kunnen vervolgens voor een beperkte tijd worden gekweekt of onmiddellijk worden gebruikt voor cel-specifieke ex vivo-analyses, zoals transcriptionele analyse door real-time kwantitatieve PCR. Dit protocol zorgt dus voor een snelle en robuuste analyse van celspecifieke reacties binnen verschillende neuronale populaties in C. elegans.

Introduction

In de afgelopen decennia, het metazoan modelorganisme Caenorhabditis elegans is een enorme troef in de studie van neuronen, neuronale circuits en haar rol in fysiologische en gedragsmatige reacties, en veroudering-geassocieerde neurodegeneratieve Ziekten. Een unieke eigenschap van C. elegans is dat de dieren transparant zijn, waardoor de afstamming van alle volwassen somatische cellen in kaart kan worden gebracht1. C. elegans herbergt ook beheersbare hoeveelheid neuronen, wat leidt tot de morfologie en connectiviteit van het zenuwstelsel wordt goed begrepen2. De invariante celafstamming, korte levensduur en overvloed aan genetische hulpmiddelen met hoge doorvoer die beschikbaar zijn voor C. elegans maken het een ideaal modelorganisme voor de studie van veroudering binnen verschillende neuronale populaties.

Veroudering van neuronen en neurodegeneratieve aandoeningen zijn complex, en elke stoornis heeft unieke pathologische handtekeningen die ermee verbonden zijn. Echter, voor veel van deze aandoeningen, zoals de ziekte van Parkinson en Alzheimer, een gemeenschappelijk kenmerk is de progressieve belasting van verkeerd gevouwen eiwitten3,4,5. In beide van deze ziekten, eiwitten misvouwen en aggregaat binnen de cel om toxiciteit te veroorzaken, uiteindelijk leiden tot celdood4,5. Voor de juiste veroudering van neuronen, de homeostase van de mitochondriën, meer specifiek eiwit homeostase, is belangrijk, als verstoringen en dyshomeostase kan leiden tot neurodegeneratie6,7,8. Cellen zijn uitgerust met verschillende mechanismen om eiwit homeostase te handhaven, één is de ongevouwen eiwit respons (UPR) ― een klassieke route waarbij signalen van endoplasmisch reticulum (ER) intracellulaire signaal Cascades activeren, wat leidt tot een transcriptionele Response9. Verwant aan deze UPRer, figuur vertonen een soortgelijke reactie op het verlies van mitochondriale eiwit homeostase, de zogenaamde mitochondriale UPR (UPRMT)7,8. C. elegans lijkt het meest basale organisme te zijn dat een bevestigde en goed gedefinieerde UPRMT traject7heeft.

De functie/disfunctie van specifieke neuronale populaties binnen een groter netwerk kan moeilijk te beoordelen zijn vanwege hun intrinsieke connectiviteit en complexiteit3. Echter, er is vaak een behoefte om te bestuderen van verschillende neuronale populaties als gevolg van celtypespecifieke ziekten met complexe pathologieën, zoals die in verband met verminderde cellulaire eiwit homeostase. In C. eleganskunnen specifieke neuronale populaties genetisch gemanipuleerd worden, waardoor faciele observatie in vivo mogelijk is. Het zenuwstelsel van C. elegans bestaat voornamelijk uit neuronen, met een klein percentage gliacellen. Bij volwassen hermafrodiet wormen zijn er ongeveer 302 neuronen, onderverdeeld in meer dan 100 verschillende klassen2,10. Neuronen zoals cholinerge neuronen overheersingen in neuromusculaire knooppunten, terwijl Dopaminerge neuronen voornamelijk betrokken zijn bij sensatie10,11. Aangezien zowel motorische activiteit als zintuiglijke vaardigheden afnemen met de leeftijd, is het belangrijk om mechanistische inzichten over defecten in deze individuele neuronen te detail te bekijken11,12. Als zodanig is er behoefte aan een eenvoudige en robuuste methode om intacte cellen van belang te isoleren voor latere ex vivo-studies.

Hier beschrijven we een geoptimaliseerde effectieve methode voor de snelle isolatie van specifieke neuronale cellen die groene fluorescerende eiwitten (GFP) uitdrukken uit C. elegans. Deze isolatiemethode kan worden uitgevoerd op larvale, juveniele of volwassen wormen. Isolatie van cellen van larvale Worms werd eerder gepubliceerd door Zhang et al.13 en zal hier niet worden besproken. Een belangrijke opmerking hier is dat alle wormen in dezelfde levensfase moeten zijn om overmatige vertering van het dier of besmetting van dieren in verschillende levensstadia te voorkomen. Door zowel enzymatische als mechanische verstoring van de nematode cuticula, een exoskelet hoog in collageen en andere structurele eiwitten, kan een grote verscheidenheid aan cellen worden geïsoleerd13,14. Cellen kunnen vervolgens worden geïsoleerd via Flowcytometrie of antilichaam gelabelde magnetische kralen. Typisch, RNA is geïsoleerd via een fenol en guanidine isothiocyanaat methode om te zorgen voor de verrijking van de gewenste celpopulatie15. Met veel zorg kunnen deze geïsoleerde cellen worden gehandhaafd in een kweek kolf of multi-well gerecht. Deze methode vertegenwoordigt een unieke en krachtige tool in de studie van specifieke neuronen en heeft de capaciteit om te isoleren van levende en functionele cellen voor verdere culturing.

Protocol

1. voorbereiding en verzameling van oude wormen voor celisolatie Opmerking: hieronder wordt uitgelegd is de isolatie van cholinerge neuronen van de transgene UNC-17:: GFP stam (OH13083) verkregen uit de Caenorhabditis genetica Center (CGC) stam repository aan de Universiteit van Minnesota. Het is noodzakelijk om steriele omstandigheden te handhaven om besmetting van schimmels of bacteriën te voorkomen. Bereid en synchroniseer wormen via de bleken methode zoals besc…

Representative Results

Het hier beschreven protocol zorgt voor specifieke isolatie van UNC-17:: GFP-positieve cholinerge neuronen van de rondworm C. elegans voor latere ex vivo studies zoals celtypespecifieke genexpressie profilering en uiteindelijke kortdurende kweek voor Patch-clamp elektrofysiologie metingen. Figuur 1 toont UNC-17:: GFP-positieve cholinerge neuronen in hun normale instelling….

Discussion

De rondworm C. elegans is een gevestigde en krachtige model voor het bestuderen van de neuronale gezondheid en ziekte2. Met ruime genetische hulpmiddelen om deze dieren te manipuleren en beheersbare hoeveelheid nauwkeurig in kaart gebrachte neuron types, kan een groot deel van de gegevens worden verzameld met een relatief kleine hoeveelheid materiaal. Hier schetsen we een geoptimaliseerde methode om verschillende neuronen van hele dieren te isoleren. Door de buitenste cuticula-eiwitten va…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We danken Dr. Jennifer Fox en de leden van het Khalimonchuk laboratorium voor inzichtelijke commentaren. We erkennen de steun van de National Institutes of Health (R01 GM108975 tot O.K. en T32 GM107001-01A1 tot E.M.G.).

Materials

6-well plate Fisher Scientific 12-556-004
Agar, Molecular Biology Grade VWR A0930
CaCl2 Sigma C5670
Chloroform Sigma 496189
Contess Automated Cell Counter Invitrogen Z359629
DTT USBiological D8070
Ethanol Decon Labs 2701
FBS Omega Scientific FB-02
Fluorodeoxyuridine Sigma F0503
HEPES Sigma H3375
Isopropanol VWR BDH1133
KCl Amresco O395
KH2PO4 USBiological P5110
Kimwipes Kimberly-Clark Professionals 7552
Leibovitz's L-15 Medium Gibco 21083027
MgCl2 Sigma M8266
MgSO4 USBiological M2090
Na2HPO4·7H2O USBiological S5199
NaCl VWR X190
NaOCl (Bleach) Clorox
NaOH Amresco O583
Penicillin-Streptomicen Fisher Scientific 15140122
Peptone Y USBiological P3306
Pronase E Sigma 7433 protease mixture from Streptomyces griseus
SDS Amresco O227
SMT1-FLQC fluorescence stereomicroscope Tritech Research
Sucrose USBiological S8010
SuperScript IV One-Step synthesis kit ThermoFisher 12594025
TRIzol Invitrogen 15596026 phenol and guanidine isothiocyanate solution
Trypan Blue Stain Invitrogen T10Z82
α-GFP magnetic beads MBL D153-11

References

  1. Sulston, J. E., Schierenberg, E., White, J. G., Thomson, J. N. The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans. Developmental Biology. 100, 64-119 (1983).
  2. White, J. G., Southgate, E., Thomson, J. N., Brenner, S. The structure of the nervous system of the nematode Caenorhabditis elegans. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 314, 1-340 (1986).
  3. Zeng, H., Sanes, J. R. Neuronal cell-type classification: challenges, opportunities and the path forward. Nature Reviews in Neuroscience. 18, 530-546 (2017).
  4. Selkoe, D. J. Cell biology of protein misfolding: The examples of Alzheimer’s and Parkinson’s disease. Nature Cell Biology. 6, 1054-1061 (2004).
  5. Choi, M. L., Gandhi, S. Crucial role of protein oligomerization in the pathogenesis of Alzheimer’s and Parkinson’s disease. FEBS Journal. 285, 3631-3644 (2018).
  6. Burman, J. L., et al. Mitochondrial fission facilitates the selective mitophagy of protein aggregates. Journal of Cell Biology. 210, 3231-3247 (2017).
  7. Shpilka, T., Haynes, C. M. The mitochondrial UPR: mechanisms, physiological functions and implications. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 19, 109-120 (2018).
  8. Haynes, C. M., Petrova, K., Benedetti, C., Yang, Y., Ron, D. ClpP mediates activation of a mitochondrial unfolded protein response in C. elegans. Developmental Cell. 13, 467-480 (2007).
  9. Walter, P., Ron, D. The unfolded protein response: from stress pathway to homeostatic regulation. Science. 334, 1081-1086 (2011).
  10. Chen, C., Chen, Y., Jiang, H., Chen, C., Pan, C. Neuron aging: learning from C. elegans. Journal of Molecular Signal. 8 (14), 1-10 (2013).
  11. Germany, E. M., et al. The AAA-ATPase Afg1 preserves mitochondrial fidelity and cellular health by maintaining mitochondrial matrix proteostasis. Journal of Cell Science. 131, jcs219956 (2018).
  12. Zhang, S., Banerjee, D., Kuhn, J. R. Isolation and culture of larval cells from C. elegans. PLOS One. 6 (4), e19505 (2011).
  13. Morley, J. F., Morimoto, R. I. Regulation of longevity in Caenorhabditis elegans by heat shock factor and molecular chaperones. Molecular Biology of the Cell. 15, 657-664 (2004).
  14. Pereira, L., et al. A cellular regulatory map of the cholinergic nervous system of C. elegans. eLife. 4, e12432 (2015).

Play Video

Cite This Article
Germany, E. M., Zahayko, N., Khalimonchuk, O. Isolation of Specific Neuron Populations from Roundworm Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (150), e60145, doi:10.3791/60145 (2019).

View Video