Клеточные деления могут быть визуализированы в режиме реального времени с помощью флуоресцентно помеченных белков и замедленной микроскопии. Используя представленный здесь протокол, пользователи могут анализировать динамику синхронизации деления клеток, митотические сборки шпинделей, а также хромосомные конгрессионы и сегрегацию. Дефекты в этих событиях после РНК-интерференции (РНК) опосредованного гена нокдаун может быть оценена и количественно.
Дрозофила Клетки S2 являются важным инструментом в изучении митоза в культуре тканей, обеспечивая молекулярное понимание этого фундаментального клеточного процесса быстрым и высокой пропускной способом. S2 клетки оказались поддаются как фиксированной и живой клетки изображений приложений. Примечательно, что живая клеточная визуализация может дать ценную информацию о том, как потеря или нокдаун гена может повлиять на кинетику и динамику ключевых событий во время деления клеток, включая митотический шпиндельный сбор, хромосомный конгрессион и сегрегацию, а также общее время цикла ячейки. Здесь мы используем S2 клетки stably трансфицируется флуоресцентно помечены mCherry: я-тубулин, чтобы отметить митотический шпиндель и GFP: CENP-A (называется “CID” ген в Drosophila) для обозначения центром для анализа последствий ключевых митотических генов на время деления клеток, от профазы (в частности, при разбивке ядерного конверта; НЭБД) к началу анафазы. Этот протокол изображения также позволяет визуализировать динамику микротрубока шпинделя и хромосомы на протяжении всего митоза. В этом и заключается цель обеспечить простой, но всеобъемлющий протокол, который позволит читателям легко адаптировать клетки S2 для живых экспериментов по визуализации. Результаты, полученные в результате таких экспериментов, должны расширить наше понимание генов, участвующих в делении клеток, определяя их роль в нескольких одновременных и динамических событиях. Наблюдения, сделанные в этой системе культуры клеток, могут быть проверены и дополнительно исследованы in vivo с использованием впечатляющего инструментария генетических подходов у мух.
Cell Division является процессом, критически важным для всех многоклеточных организмов, как в их развитии и гомеостаза1. Дрозофила уже давно используется в качестве модели для изучения деления клеток, с экспериментами в различных типах тканей и генетических условий, обеспечивая ключевое понимание процесса. Хотя многие из этих идей приходят из фиксированных клеточных условий, деление клеток является динамической процедурой со многими движущимися частями, что делает визуализацию живых клеток неотъемлемой частью оценки РНК или генетических эффектов нокаута на многочисленных частях деления клеток, в том числе образование шпинделя, хромосома конгресса и сегрегации, и цитокинез.
Многие протоколы были разработаны и использованы на протяжении многих лет, чтобы визуализировать дризофилы деления клеток in vivo. Различные группы культивировали методы разделения изображений как в личиальных ими, так и в личинок мозгах2,3,4,5,6,7,8 . Эти методы, хотя и полезны для визуализации в конкретных тканях, ограничены в пропускной состоянии и часто требуют генерации и поддержания генетических запасов для генерации флуоресцентных компонентов и изменения экспрессии генов, представляющих интерес. Культивированные клетки S2 из Дрозофилы обеспечивают более высокую пропускную возможность для быстрого тестирования влияния различных генов в делении клеток. Кроме того, с возможностью трансфектировать различные флуоресцентные белки, S2 клетки могут быть быстро изменены, чтобы определить влияние РНК нокдаун на многочисленные компоненты деления клеток. Флуоресцентно помеченные гены, представляющие интерес, также можно наблюдатьв делении клеток, что позволяет динамическую характеристику их функции 9.
Здесь мы предоставляем подробный протокол для живой визуализации митотических клеток S2 с использованием методов, которые мы недавно описали10. Наш метод использует стабилизированные клетки с флуоресцентными маркерами для микротруби и центрометров, выражение которых находятся под контролем медно-индуцируемого промотора (металлотионеин; pMT). Эта методология может быть использована для изображения спинели и хромосомы динамики на всех этапах митоза с использованием относительно простого флуоресцентного микроскопа с основным программным обеспечением изображений. Она может быть дополнительно настроена в соответствии с индивидуальными потребностями исследования, с переходной преображая и РНК предлагает расширенные возможности для определения роли генов-кандидатов в митозе. Из-за относительной простоты протокола, он может быть использован для небольших экранов потери функции для определения генов, для которых дальнейшее изучение in vivo было бы полезным, что позволило бы более целенаправленные усилия и эффективность с последующим генетическим манипуляции мухами.
Определение соответствующей ячейки
Ключом к визуализации, разделяющей клетки S2, является первое обнаружение правильной клетки. Время может быть потрачено впустую, чтобы элементарные клетки, которые ошибочно считаются готовыми к разделению, но не делают этого в разумные сроки. Клетки должны быть определены, которые имеют две различные и видимые центросомы и неповрежденное ядро. Центросомы должны иметь микротрубочные волокна, иснижающие их, придавая им “звездоподобный” внешний вид. Неповрежденное ядро преломляет свет при регулировке фокуса, а также делает приблизительный центр клетки темнее по внешнему виду. Ядро будет также содержать GFP: CID “точки”, еще одна отличительная черта, чтобы помочь в его идентификации. Клетки с юgt;2 центросомы, тубулин пункту без трубулин волокон, исходящих из них, или клетки только с одной центросомой следует избегать. Кроме того, если две центросомы видны, но ядро не является, NEBD уже произошло, и ячейка слишком далеко продвинулись в своем делении, чтобы быть изображены, если полный анализ M-фазы желательно. Как только соответствующая ячейка найдена, скорость в запуске изображения имеет решающее значение, как NEBD происходит быстро (обычно в течение 3-5 минут) и задержки начала изображения может привести к упущенным возможностям. Сосредоточьте ячейку в программном обеспечении для визуализации быстро, так что обе центросомы видны, или если центросомы находятся вне плоскости друг с другом, установите координационный центр между ними, так что каждый из них может быть захвачен, когда стеки собраны выше и ниже определенного центра Точки. После сосредоточения, немедленно установить смещение между этапом и поверхности камеры живой клетки с помощью инфракрасного фокуса проверки (если таковой) и начать программу визуализации. Хотя представленный здесь протокол специально разработан для экспериментов по оценке динамики NEBD-к-анафазе, простые модификации могут подойти читателям, изучающим альтернативные митотические события. Для визуализации NEBD-to-metaphase и анафазы к телофазе мы предлагаем интервалы захвата изображения в 10 с, поскольку эти процессы очень динамичны и быстро происходят в клетках S2 (5-10 мин). Метафазный переход к анафазе (наш типичный экспериментальный фокус) представляет собой более длительный процесс (20-30 мин) в клетках S2, и мы собираем изображения с интервалом в 30 с. Наконец, телофаза через цитокинез происходит довольно медленно в клетках S2, и мы предлагаем 60 с интервалами обеспечения достаточного разрешения для этого приблизительного часового процесса.
Поддержание фокусировки на протяжении всей программы визуализации
Если инфракрасное устройство проверки фокусировки недоступно, не забудьте избежать натыкаясь на микроскоп или стол, на который он сидит, так как это может привести к тому, что клетка выйдет из фокуса во время программы визуализации, что приведет к неоднозначным, неинтерпретируемым результатам. Предварительное покрытие живых клеточных камерных колодцев поли-L-лизин может помочь в присоединении клеток, которые могут помочь избежать движения клеток и особенно полезно для установки без инфракрасных проверок фокусировки. Кроме того, установки, включая ударопоглощающие платформы или воздушные столы, могут дополнительно помочь избежать того, чтобы ячейки не смогли выйти из фокуса. Наконец, некоторые программы имеют функции паузы, позволяющие пользователю переориентироваться и возобновить программу.
Изображение нескольких ячеек
Полезно для накопления данных, что часто несколько клеток, готовых к разделению могут быть помещены в одном поле зрения для визуализации. Это может быть особенно полезно для экспериментов, в которых клетки имеют длительные длительности M-фазы или длительный арест (например, условия, которые вызывают активацию SAC). Для этих клеток, мы обычно изображения до клетки photobleached (примерно 2-3 ч), но полное время арестованных клеток должно быть на усмотрение исследователя. Иногда несколько предразделяющих ячеек могут находиться в разных фокусных плоскостях, и в этом случае может быть полезно добавить z-стеки для размещения всех ячеек. Добавление большего количества стеков z также может помочь улучшить разрешение. Следует проявлять осторожность при этом, однако, как это будет подвергать клетки больше излучения и привести к более быстрой фотоотбелении, а также привести к большим размерам файлов на жестких устройствах хранения дисков.
Как избежать фотоотбелевания и фототоксичности
Наш метод описывает конкретные настройки для времени экспозиции, интервалы изображения, z стеки, и процент передачи для нашего источника светодиодных источников света, которые обычно работают для нашей экспериментальной установки и желаемых результатов. Поскольку микроскопы и экспериментальные цели могут варьироваться, то, что может хорошо работать для нашей системы, может привести к преждевременному отбеливанию фотоилиаза или фототоксичности в других. Фотоповреждение может представлять отсутствие движения шпинделя, фрагментацию микротрубок, неполноценную динамику микротрубок и длительную активацию контрольно-пропускного пункта. Одним из потенциальных методов, чтобы избежать таких ловушек, является ограничение времени воздействия. Большинство современных камер в настоящее время обладают широкими динамическими диапазонами, и гистограммы могут быть скорректированы для визуализации структур даже при очень низких экспозициях. Другой метод заключается в увеличении интервала изображения (например, до нескольких минут между изображениями), так что количество раз, когда клетка подвергается воздействию света в течение всего интервала сбора уменьшается. Это выгодно, особенно в визуализации в течение более длительных периодов времени (много часов), и может дополнительно помочь в уменьшении размера файла таких экспериментов. Ограничение количества z стеков, принятых также может помочь уменьшить воздействие света, используя 2 или даже только 1 вместо 3. Кроме того, регулировка процентной передачи света (для светодиодных источников света) или использование фильтров нейтральной плотности (ND) (как для галогенной лампы, так и для светодиодных источников света) снизит интенсивность света и в сочетании с более длительным временем экспозиции может сохранить видимость . Выбирая клетки с уже разделенными центросомы, общее воздействие может быть ограничено в том, что эти клетки обычно попадают в митоз быстро (в течение минуты или двух) после начала визуализации. Можно также ограничить время, что клетки могут быть изображены до NEBD. Наша лаборатория обычно устанавливает это время на 10 минут, но более консервативный предел может быть легко введен пользователем. Кроме того, более “инвазивной” мерой, которая мы рекомендуем, является лечение dsRNA, нацеленное против компонента SAC (например, Rod или Mad2). Если фенотип ареста вызван неспецифическим повреждением клеток (например, дефектной динамикой микротрубок), такое лечение с меньшей вероятностью подавляет арест по сравнению с добросовестным эффектом гена, интересуемого в первоначальном эксперименте.
Будущие направления
Описанный здесь метод может быть использован на относительно простом эпифлуоресцентном микроскопе для быстрого изображения живых клеточных делений и может быть легко адаптирован в соответствии с конкретным экспериментальным дизайном и целями исследователя. Несколько отличных методов для культивирования, RNAi нокдаун подходы, переходные прерывистой, и флуоресценции микроскопии были опубликованы для S2 и других клеток Drosophila 9,14,15, 16 Год , 17. Наш протокол предлагает несколько преимуществ. (1) Использование двойной стабильной клеточной линии (GFP:CID, mCherry:-Tubulin) одновременно отмечает два ключевых митотических структур, позволяет избежать хлопот и потенциальных осложнений переходного преображенского, и гарантирует, что почти все клетки будут выражать флуоресцентные маркеры как потенциальных кандидатов на визуализацию. (2) Адаптация к митозу добавляет к опубликованным протоколам изучения динамики цитоскелета в подвижной, не разделяющей клетки и распространяется на изучение митотических событий в режиме реального времени. Хотя мы считаем, что наша является мощным методом, который добавляет к репертуару других, всегда могут быть улучшения. Одной из особенностей деления клеток, которую мы обнаружили, трудно представить, является деление центросомного. Это происходит до NEBD и трудно определить, когда одна центросома готова разделить на две части. Использование флуоресцентных маркеров цикла клеток (Циклин А и Циклин B) может помочь решить эту проблему, но происходит за счет каналов, которые могут быть использованы для визуализации компонентов деления клеток. Наша лучшая стратегия для попытки визуализировать разделение центросомного заключается в добавлении многоточечного приобретения в программу визуализации (определение различных точек в плоскости XY к изображению), но это может привести к большим файлам, а также может потребовать (в зависимости от количества точек) увеличение интервала между сбором изображений, уменьшение времени разрешения результирующего фильма. Другим решением может быть синхронизация клеток на желаемом этапе клеточного цикла с использованием препаратов, которые нацелены на регуляторы клеточного цикла, а затем последующее вымывание до визуализации, хотя эти методы не могут быть надежными в клетках S2 в частности.
Представленный здесь протокол также закладывает основу для будущих применений в живой визуализации клеток. Благодаря усовершенствованию технологий визуализации и программного обеспечения, возможно по-настоящему высокой пропускной способности этого протокола с использованием более высокой емкости, многокамерные пластины. Такие нововведения сделали бы крупномасштабные ЭКРАНы RNAi, такие как те, которые уже достигнуты в фиксированной подготовке12,18, более уступчивым в формате живой ячейки. Малые молекулы наркотиков экраны также могут быть предусмотрены в качестве средства выявления новых соединений ориентации клеточного процесса деления. Улучшение флюорофоров и оптических фильтров может также привести к визуализации нескольких митотических компонентов (а не только два мы описываем), что позволяет изображение конкретных митотических регуляторов и их взаимодействия с ДНК и / или шпинделя. Например, генерация клеток с флуоресцентными репортерами, которые выражают после повреждения ДНК или во время апоптоза, будет полезным инструментом для выявления новых генов, участвующих в этих процессах. Аналогичные подходы могут быть использованы для изучения динамики клеточного цикла с использованием выражения флуоресцентно помеченных циклинов19.
The authors have nothing to disclose.
Эта работа финансировалась Национальными институтами здравоохранения (R01 GM108756). Мы благодарны Гэри Карпен (Калифорнийский университет, Беркли) за щедрое предоставление нам GFP: CID S2 ячейки линии запасов, из которых наш GFP: CID/mCherry: “Тубулин линия была создана10.
Bright-Line Hemacytometer | Sigma-Aldrich | Z359629-1EA | for cell counting |
cellSens imaging software | Olympus | ||
CELLSTAR Cell Culture Flask, 50ML, 25 CM2, PS, Red Filter Screw Cap, Clear, Sterile, 10PCS/BAG | Greiner Bio-One | 690175 | |
CELLSTAR Cell Culture Multiwell Plate, 6 well, PS, Clear, TC, Lid with condensation rings, sterile, single packed | Greiner Bio-One | 657160 | |
Centrifuge 5804 R | eppendorf | Cat. 022623508 | |
Copper(II) sulfate pentahydrate, minimum 98% | Sigma-Aldrich | C3036-250G | |
Corning Fetal Bovine Serum | Fisher Scientific | MT35015CV | |
Effectene Transfection Reagent 1 mL | Qiagen | 301425 | for transient transfection |
IX-83 Inverted Epifluorescent Microscope | Olympus | ||
LabTek Chambered Slide Insert | Applied Scientific Instruments | I-3016 | |
MEGAscript T7 Transcription Kit | Thermo Fisher Scientific | AM1334 | For dsRNA production |
MOXI Z Mini Automated Cell Counter Kit | ORFLO | MXZ001 | for cell counting |
MS-2000 XY Flat-Top Automated Stage and Controller | Applied Scientific Instruments | ||
Nunc Lab-Tek II Chambered Coverglass (no 1.5 borosilicate glass) 8-well | Thermo Fisher Scientific | 155409 | |
Orca-Flash 4.0 LT Camera | Hammamatsu Photonics K.K. | C11440-42U | |
pMT/V5-His A Drosophila Expression Vector | Thermo Fisher Scientific | V412020 | |
Poly-L-Lysine | Cultrex | 3438-100-01 | |
Purifier Logic+ Class II, Type A2 Biosafety Cabinets | Labconco | 302310000 | |
Schneider's insect medium | Sigma-Aldrich | S0146-100ML | |
Spectra Tub Centrifuge Tubes | VWR | 470224-998 | |
Uner Counter BOD Incubator | Sheldon manufacturing (VWR) | 89409-346 | |
X-CITE 120 LED | ExcelitasTechnologies | Led light source | |
Z -Drift Compensator (ZDC) | Olympus | infrared focus check |