פלטפורמת מניפולציה משולבת תא מפותחת לשימוש בשילוב עם התקנה בודדת המסה בדיקה מאסיבית עבור ניתוח מקוון של תאים ההשעיה בודדים תחת תנאי הסביבה.
הספקטרומטר המסה של התא היחיד (SCMS) מאפשר זיהוי רגיש וניתוח מדויק של טווחים רחבים של מינים סלולריים ברמת התא הבודד. התקן יחיד, דגימה מיקרוסקאלה ומכשיר אינון, יכול להיות ביחד עם ספקטרומטר מסה עבור מקוון, ניתוח SCMS מהירה של המרכיבים הסלולריים תחת תנאי הסביבה. בעבר, הטכניקה בודדת SCMS השתמשו בעיקר כדי למדוד את התאים מקיבוע על מצע, הגבלת סוגי התאים ללימודים. במחקר הנוכחי, טכנולוגיית SCMS חד החללית כבר שולבו עם מערכת מניפולציה התא, בדרך כלל משמש הפריה חוץ גופית. זה משולב תא מניפולציה ופלטפורמת ניתוח משתמש בדיקה תא בחירה כדי ללכוד תאים מזוהים בודדים צף להעביר את התאים לקצה בדיקה יחידה עבור הליזה מיקרוסקאלה, ואחריו ניתוח מיידי ספקטרומטר המסה. תהליך הלכידה וההעברה מסיר את התאים מהפתרון שמסביב לפני ניתוח, וממזער את המבוא של מולקולות המטריצה בניתוח הספקטרומטר המסה. התקנה זו משולבת מסוגל ניתוח SCMS של המטופל ממוקד תאים מבודדים נוכח בדגימות נוזלי הגוף (למשל, שתן, דם, רוק, וכו ‘), המאפשר יישומים פוטנציאליים של ניתוח SCMS לרפואה אנושית וביולוגיה של המחלה.
ביולוגיה אנושית, בעיקר ביולוגיה של המחלה, מובנת יותר ויותר על מנת להיות תוצאה של פעילות ברמה של תאים בודדים, אך השיטות האנליטיות המסורתיות, כגון ספקטרומטר מסה של כרומטוגרפיה נוזליים (LCMS), משמשות בדרך כלל לניתוח דגימות המוכנות מאוכלוסיות של תאים, ואילו המידע המולקולרי הנרכש אינו יכול לייצג במדויק את התהליכים הכימיים ברמת התא הבודד. אלה סטנדרטיים, שיטות מסורתיות אינם יכולים להבחין את ההשפעות של טרוגניות הסלולר על מדידה אנליטית, ואת תהליך של השמדת וערבוב התאים כדי להכין את הליפוסט עשוי לגרום לשינוי או אובדן של הסלולר רכיבים1,2. מגבלות אלה של שיטות מסורתיות חשובות במיוחד בניתוח של תאי החולה, שבו הדגימות המתקבלות יכול להכיל תערובת מורכבת של סוגים רבים של תאים שונים. כדי להתגבר על ליקויים אלה, תא בודד שיטות ניתוח מולקולרי, כולל בודד תא המסה ספקטרומטריה (SCMS) שיטות, הם יותר ויותר להיות מפותח ולהחיל בדיקות ביולוגי, במיוחד של מטבוליטים סלולריים משקל מולקולרי נמוך biomolecules3,4.
טכניקות scms הראשון שפותחו בשימוש ואקום מבוססי טכניקות כדי לבצע את הניתוחים תחת תנאים שאינם סביבה2,5,6,7,8,9, 10,11. שיטות SCMS לא מקיף מסוגלים לנתח שומנים סלולריים מטבוליטים, אבל דורשים לדוגמה טרום טיפול בתנאים מלאכותיים, ולכן אינם מתאימים ניתוח בזמן אמת. תהליך ההכנה לדוגמה לניתוח שאינו מקיף כולל הוספת רכיבי מטריצה, והכנה זו יכולה לשנות רכיבים סלולריים מסביבתם הטבעית12. לכן, טכניקות הסביבה הספקטרום של המסה (MS), אשר אינם דורשים ואקום לסביבת הדגימה, מנוצלים לניתוח תאים בסביבה כמעט טבעית. אין סביבה ואקום מאפשר רב-תכליתיות בעיצוב ניסיוני; ניתן להוסיף מצלמות כדי לפקח על התהליך הסלולר וטכניקות אינון רך יותר ניתן לשלב עם טכניקות הפרדה כדי לקבל מידע טוב יותר מכל ניסוי תא בודד4,12,13 ,14,15,16,17,18,19,20,21,22 ,23,24,25,26,27,28,29,30,31 ,32,33,34,35,36,37,38,39,40 ,41,42.
השיטה בודדת scms היא טכניקת הסביבה כי מנתח חי, סרטן היונקים התאים בסביבה כמעט יליד21,43,44,45,46. בנוסף, התקן בדיקה יחידה שימש עבור יישומים אחרים ספקטרומטר המסה, כולל ניתוח של מולקולות החילוץ באמצעות מספרי העברה רב-תאיים ו MS הדמיה של רקמות47,48,49 ,50,51,52. עם זאת, מאחר שלאפשר להשתמש בתאי ההשעיה בשיטה זו, לא ניתן לנתח באופן ישיר את התאים התלויים בטכניקה זו3,53. לכן, המערכת בודדת SCMS לא יכול לשמש ישירות לדוגמה תאים בודדים שאינם חסיד, כגון קווי התאים הלא מחסיד או תאים ההשעיה מבודדים דם של המטופל או נוזלי גוף אחרים54. בעבודה זו, פלטפורמת מניפולציה משולבת של תאים (ICMP) היא ביחד עם הטכניקה בודדת SCMS לנתח בשידור חי, תאים ההשעיה ב-line עם הכנה לדוגמה מינימלית (איור 1)46. ה-ICMP מורכב ממיקרוסקופ הפוך כדי לפקח על בחירת התא, תא זכוכית בחירה בדיקה, מיקרו מזרק ללכוד תאים צפים בודדים, צלחת מחוממת כדי לשמור על הטמפרטורה התאית, שתי מערכות מניפולציה תאים לשלוט מרחבי תנועות של החללית בחירת תא זכוכית, יחיד לווין, ומיקרוסקופ דיגיטלי להתבונן העברת התא מקצה בחירת התא לקצה הבדיקה היחידה. הייצור של לווין יחיד מפורט בפרסומים הקודמים ולא יטופל כאן21,48. מערכת ה-ICMP/יחיד לבדיקה מצמידים ספקטרומטר מסה ברזולוציה גבוהה. התקנה משולבת זו מאפשרת דגימה של תאים בודדים שזוהו מדגימות ביולוגיות מורכבות עם השפעות מינימליות ממולקולות מטריקס.
מניפולציה תא משולבת פלטפורמת ניתוח נבנה כדי להרחיב את רב-תכליתיות של שיטת יחיד לבדוק MS, המאפשר on-line, ניתוח מהיר של תאים שאינם חסיד בסביבה כמעט טבעית. היתרון העיקרי של הטכניקה היא כי הכנה לדוגמה מינימלית נדרש, כך התאים נותחו בתנאים המחקים את המצב הרגיל שלהם. במיוחד, תאים בודדים של עניין ניתן לזהות ולבחור באופן חזותי, למזער את ההשפעה של אפקט מטריצה על יעילות MS יינון תוך שמירה על התאים בסביבה הטבעית שלהם, כך התוצאות הם יותר תאים מייצגים ‘ יליד מצב (S3 איור). טכניקה זו יכולה לשמש פוטנציאלית לחקר תאי החולה שהושעו ביולואידים במחקרים עתידיים. יתרון נוסף של טכניקה זו הוא מבחר גמיש של ממיס הדגימה. חשוב לכלול acetonitrile כמו הממס העיקרי הדגימה כך לפירוק מיקרוסקאלה יכול להתרחש במהירות. באופן פוטנציאלי, סטנדרטים פנימיים (למשל, isotopically התוויות תרופות) ניתן להוסיף לתוך ממיס הדגימה עבור כימות של מולקולות של עניין (למשל, מולקולות תרופה) מתאים בודדים, כולל אלה יכולים לשחק תפקיד מפתח למהפיכה התאמה אישית של טיפולי הסמים בעתיד54.
למרות מערכת משולבת זו ניתן להשתמש בנוחות כדי לנתח טווחי רחב של תאים, מגבלה של השיטה היא כי לא בדיקה יחידה או תא בחירת החללית היא זמינה מסחרית; הכתבת את הצורך אופטימיזציה של פרמטרים רבים (למשל, שיעור הזרימה, מתח, אורך בין הפולט ננו-ESI והעברת יונים, וכו ‘) לפני כל ניסוי. בנוסף, בשל הקטנות של הבדיקה היחידה ובחירת התא, הפרטורציה הסביבתית (למשל, זרימת האוויר) עלולה לגרום לקשיים בהקמת צומת בין שני הבדיקות. פתרון לטווח קצר הוא כיפוף של הגשוש בחירת התא קרוב לסוף כדי למזער את אורך הזמן. העבודה העתידית כוללת פיתוח של דיור להקיף את החלקים הקריטיים של הכיוונון כדי למזער את ההשפעות הסביבתיות. בשל כמות מוגבלת של תוכן הסלולר זמן רכישה קצר (~ 2-3 s) מתא, ניתוח MS/MS ניתן לנהל רק עבור מינים שופע יחסית. גורמים אחרים המשפיעים על רגישות לזיהוי כוללים את היעילות האינון מודחק בשל המבוא של מטריקס יחד עם התא ואת הפסד פוטנציאל יון דרך אבובים העברת יונים מורחבת.
The authors have nothing to disclose.
המחברים מודים לנאגה ראמה Kothapalli אלי עבור עבודתה בפיתוח הכנה לדוגמא עבור תאי ההשעיה וניסויים ליפוסט תאים. בנוסף, המחברים מודים ל-NIH (R01GM116116 ו-R21CA204706) למימון.
Acetontrile | Millipore Co. | AX0145-1 | Sampling solvent |
CellTram Vario | Eppendorf | 6221 | ICMP |
Copper wire | stores.ebay.com/jewelerheaven | Dead soft, round, 20 guage, 25 ft | Conductive union setup |
Digital stereomicroscope | Shenzhen D&F Co. | Supereyes T004 | Analysis |
Disposable micropipette, 1-5 µL | Rochester Scientific | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Dual bore quartz tubing, 1.120"x0.005"x12" | Friedrich & Dimmock, Inc. | MBT-005-020-2Q | Single-probe fabrication |
Epoxy resin | Devcon | Part No. 20945 | Single-probe fabrication |
Eppendorf cell manipulation system | Eppendorf | Transferman NK517800397-U.R. | ICMP |
External nut | VALCO*CHEMINERT | EN1 | Ion transfer tube fabrication |
Formic acid | Sigma-Aldrich | 399388-500ML | Sampling solvent |
Fused silica capillary, ID: 40 µm, OD: 100 µm | Polymicro Technologies | TSP040105 | Single-probe fabrication, conductive union setup |
Fused silica capillary, ID: 50 µm, OD: 150 µm | Polymicro Technologies | 1068150015 | Conductive union setup |
HyClone Synthetic fetal bovine serum (FBS) | Fischer Sci | SH3006603 | Cell culture |
Inline MicroFilter | IDEX Health & Science LLC | M-520 | Conductive union setup |
Laser puller | Sutter Instrument Co. | Model P-2000 | Single-probe fabrication |
LED UV lamp | Foshan Liang Ya Dental Equipment | LY-C240 | Single-probe fabrication |
LTQ Orbitrap mass spectrometer | Thermo Scientific | LTQ Orbitrap XL | Analysis |
Microforge | Narishige, Co. | MF-9 | Cell-selection probe fabrication |
Microunion | IDEX Health & Science LLC | M-539 | Conductive union |
PEEK tubing, 1/32×0.005x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1576 | Conductive union setup |
PEEK tubing, 1/32×0.007x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1577 | Conductive union setup |
Penicillin/Streptomycin | Gibco/Life Technologies | 15140-122 | Cell culture |
Petri dish, 35×10 mm | VWR | 25382-334 | Sample preparation |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | VWR | 0780-50L | Cell culture |
Platinum wire | Narishige, Co. | Model PT-A | Microforge |
Power supply | Nikon | PSM-2120 | ICMP |
RPMI, 1X with Corning glutagro | Corning | 10-104-CV | Cell culture |
Single-bore tubes | Boralex | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Stainless steel ferrules, for 1/16" OD | IDEX Health & Science LLC | VHP-200-01x | Ion transfer tube fabrication |
Stainless steel tubing, 1/32x 205 µm x30 cm | IDEX Health & Science LLC | U-1128 | Ion transfer tube fabrication |
Syringe, 250 µL | Hamilton | 1725LTN250UL | Sampling syringe |
T25 flask | CellStar | 690160 | Cell culture |
Thermo LTQ XL ion source interface flange | New Objective | PB5500 | Analysis |
ThermoPlate | TokaiHit | 55R30N | ICMP |
TrypLE Express | Gibco | 12605-010 | Cell culture |
Tube cutter, for 1/16" stainless steel | SUPELCO | 58692-U | Ion transfer tube fabrication |
USB digital photography microscope | dx.com | SO2 25~500X | Analysis |
UV curing resin | Prime Dental | Item No. 006.030 | Single-probe fabrication |
Vertical pipette puller | David Kopf Instruments | Model 720 | Cell-selection probe fabrication |
Voltage housing | PicoChip | PCH-A00120 | ICMP/MS interface |
Wire cutter | Craftsman | 4 1/2 in end nipper | Conductive union setup |