Für den Einsatz in Verbindung mit einem Einzelsonden-Massenspektrometrie-Setup wird eine integrierte Zellmanipulationsplattform für die Online-Analyse einzelner Suspensionszellen unter Umgebungsbedingungen entwickelt.
Die Einzelzell-Massenspektrometrie (SCMS) ermöglicht eine sensible Detektion und genaue Analyse großer Bereiche zellulärer Arten auf der Ebene der einzelnen Zellen. Die Single-Sonde, eine Mikroskalen-Probenahme- und Ionisationsvorrichtung, kann mit einem Massenspektrometer für die online-schnelle SCMS-Analyse von zellulären Bestandteilen unter Umgebungsbedingungen gekoppelt werden. Zuvor wurde die Single-Sonden-SCMS-Technik hauptsächlich verwendet, um Zellen zu messen, die auf einem Substrat immobilisiert wurden, wodurch die Zelltypen für Studien eingeschränkt wurden. In der aktuellen Studie wurde die Single-Sonden-SCMS-Technologie in ein Zellmanipulationssystem integriert, das typischerweise für die In-vitro-Fertilisation verwendet wird. Diese integrierte Zellmanipulations- und Analyseplattform nutzt eine Zellauswahlsonde, um identifizierte einzelne schwimmende Zellen zu erfassen und die Zellen zur Mikroskalenlyse an die Single-Sondenspitze zu übertragen, gefolgt von einer sofortigen Massenspektrometrieanalyse. Dieser Erfassungs- und Übertragungsprozess entfernt die Zellen vor der Analyse aus der umgebenden Lösung, wodurch die Einführung von Matrixmolekülen in die Massenspektrometrieanalyse minimiert wird. Dieses integrierte Setup ist in der Lage, gezielte patientenisolierte Zellen in Körperflüssigkeitsproben (z. B. Urin, Blut, Speichel usw.) zu analysieren und mögliche Anwendungen der SCMS-Analyse in der Humanmedizin und Krankheitsbiologie zu ermöglichen.
Die Humanbiologie, insbesondere die Krankheitsbiologie, wird zunehmend als das Ergebnis von Aktivitäten auf der Ebene einzelner Zellen verstanden, aber die traditionellen Analysemethoden, wie die Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie (LCMS), werden in der Regel zur Analyse von Proben, die aus Zellpopulationen hergestellt werden, während die erfassten molekularen Informationen die chemischen Prozesse auf der Ebene der einzelnen Zellen nicht genau darstellen können. Diese Standard-, traditionellen Methoden sind nicht in der Lage, die Auswirkungen der zellulären Heterogenität auf eine analytische Messung zu erkennen, und der Prozess der Zerstörung und Mischen der Zellen, um das Lysat vorzubereiten, führt potenziell zur Veränderung oder zum Verlust von zellulären Komponenten1,2. Diese Einschränkungen traditioneller Methoden sind besonders wichtig bei der Analyse von Patientenzellen, bei denen die erhaltenen Proben eine komplexe Mischung aus vielen verschiedenen Zelltypen enthalten können. Um diese Mängel zu beheben, werden einzellige molekulare Analysemethoden, einschließlich Einzelzell-Massenspektrometrie-Methoden (SCMS), zunehmend entwickelt und auf die Bioanalyse angewendet, insbesondere von zellulären Metaboliten und niedermolekularen Biomoleküle3,4.
Die ersten sCMS-Techniken, die entwickelt wurden, verwendeten vakuumbasierte Techniken, um die Analysen unter nicht-Umgebungsbedingungen durchzuführen2,5,6,7,8,9, 10,11. Nicht-Umgebungs-SCMS-Techniken sind in der Lage, zelluläre Lipide und Metaboliten zu analysieren, erfordern jedoch eine Probenvorbehandlung unter künstlichen Bedingungen und sind daher nicht für die Echtzeitanalyse geeignet. Der Probenvorbereitungsprozess für die Nicht-Umgebungsanalyse umfasst die Zugabe von Matrixkomponenten, und diese Zubereitung kann zelluläre Komponenten aus ihrer natürlichen Umgebung verändern12. Daher werden MS-Techniken (Ambient Mass Spectrometry), die für die Samplingumgebung kein Vakuum erfordern, zur Analyse von Zellen in einer nahezu nativen Umgebung verwendet. Das Nicht-Vakuum-Umfeld ermöglicht die Vielseitigkeit im experimentellen Design; Kameras können hinzugefügt werden, um den zellulären Prozess zu überwachen und weichere Ionisationstechniken können mit Trenntechniken kombiniert werden, um bessere Informationen aus jedem Einzelzellexperimentzuerhalten 4,12,13 ,14,15,16,17,18,19,20,21,22 ,23,24,25,26,27,28,29,30,31 ,32,33,34,35,36,37,38,39,40 ,41,42.
Die Single-Probe-SCMS-Methode ist eine Umgebungstechnik, die lebende, Säugetierkrebszelllinien in einer nahezu nativen Umgebung analysiert21,43,44,45,46. Darüber hinaus wurde das Einsondengerät für andere Massenspektrometrieanwendungen eingesetzt, einschließlich der Analyse extrazellulärer Moleküle in mehrzelligen Sphäroiden und ms-Bildgebung von Geweben47,48,49 ,50,51,52. Da jedoch eine Zellimmobilisierung auf Substraten für diese Methode erforderlich ist, können Suspensionszellen mit dieser Technik nicht direkt analysiert werden3,53. Daher konnte das Single-Sonden-SCMS-System nicht direkt zur Probe von nicht haftenden Einzelzellen verwendet werden, wie z. B. nicht haftenden Zelllinien oder Suspensionszellen, die aus dem Blut eines Patienten oder anderen Körperflüssigkeiten isoliert sind54. In dieser Arbeit wird eine integrierte Zellmanipulationsplattform (ICMP) mit der Single-Probe-SCMS-Technik zur Online-Analyse von lebenden Suspensionszellen mit minimaler Probenvorbereitung gekoppelt (Abbildung 1)46. Das ICMP besteht aus einem invertierten Mikroskop zur Überwachung der Zellauswahl, einer Glaszellen-Selektionssonde, einem Mikroinjektor zur Erfassung einzelner schwimmender Zellen, einer beheizten Platte zur Aufrechterhaltung der Zelltemperatur, zwei Zellmanipulationssystemen zur Steuerung räumlicher Bewegungen sowohl der Glaszellen-Selektionssonde als auch der Einzelsonde sowie eines digitalen Mikroskops zur Beobachtung der Zellübertragung von der Zellauswahl-Sondenspitze zur Single-Sondenspitze. Die Herstellung der Single-Probe ist in früheren Veröffentlichungen detailliert und wird hier nicht behandelt21,48. Das ICMP/Single-Sonden-System ist an ein hochauflösendes Massenspektrometer gekoppelt. Dieses integrierte Setup ermöglicht die Probenahme identifizierter Einzelzellen aus komplexen biologischen Proben mit minimalen Effekten von Matrixmolekülen.
Die integrierte Zellmanipulations- und Analyseplattform wurde entwickelt, um die Vielseitigkeit der Single-Probe-MS-Methode zu erweitern und eine onlineschnelle Analyse nicht-anhaftender Zellen in einer nahezu nativen Umgebung zu ermöglichen. Ein großer Vorteil der Technik ist, dass eine minimale Probenvorbereitung erforderlich ist, so dass die Zellen unter Bedingungen analysiert werden, die ihren Standardzustand imitieren. Insbesondere können einzelne von Interesse belangliche Zellen visuell identifiziert und ausgewählt werden, wodurch der Einfluss des Matrixeffekts auf die Effizienz der MS-Ionisation minimiert wird, während die Zellen in ihrer natürlichen Umgebung erhalten bleiben, so dass die Ergebnisse repräsentativer eativ sind. Status (Abbildung S3). Diese Technik kann potenziell verwendet werden, um Patientenzellen zu untersuchen, die in Biofluiden in zukünftigen Studien suspendiert sind. Ein weiterer Vorteil dieser Technik ist die flexible Auswahl des Probenahmelösungsmittels. Es ist wichtig, Acetonitril als Hauptprobelösel einzubeziehen, damit eine mikroskalige Lyse schnell auftreten kann. Potenziell können interne Standards (z. B. isotopisch markierte Wirkstoffverbindungen) in das Probenahmelösungsmittel zur Quantifizierung von Molekülen von Interesse (z. B. Wirkstoffmoleküle) aus einzelnen Zellen aufgenommen werden, einschließlich dieser, die eine Schlüsselrolle bei der Revolutionierung spielen können. Personalisierung von Arzneimittelbehandlungen in der Zukunft54.
Obwohl dieses integrierte System bequem verwendet werden kann, um große Zellbereiche zu analysieren, ist eine Einschränkung der Methode, dass weder die Einzelsonde noch die Zellauswahlsonde kommerziell verfügbar ist; die Notwendigkeit der Optimierung vieler Parameter (z. B. Durchfluss, Spannung, Länge zwischen Nano-ESI-Emitter und Ionenübertragungsschläuchen usw.) vor jedem Experiment. Darüber hinaus kann die Umgebungsstörung (z. B. Luftstrom) aufgrund der Geringen der Einsonden- und Zellselektionssonde zu Schwierigkeiten bei der Herstellung einer Verbindung zwischen den beiden Sonden führen. Eine kurzfristige Lösung ist die Biegung der Zellauswahlsonde in der Nähe des Endes, um die Länge der Verjüngung zu minimieren. Zukünftige Arbeiten umfassen die Entwicklung eines Gehäuses, um die kritischen Teile des Setups einzuschließen, um Umweltauswirkungen zu minimieren. Aufgrund der begrenzten Menge an Zellinhalten und der kurzen Erfassungszeit (ca. 2-3 s) aus einer Zelle kann die MS/MS-Analyse nur für relativ reichlich eitel Arten durchgeführt werden. Andere Faktoren, die die Erkennungsempfindlichkeit beeinflussen, sind die unterdrückte Ionisationseffizienz durch die Einführung der Matrix zusammen mit der Zelle und potenziellen Ionenverlust durch die verlängerten Ionentransferschläuche.
The authors have nothing to disclose.
Die Autoren danken Naga Rama Kothapalli für ihre Arbeit bei der Entwicklung von Probenvorbereitungen sowohl für Suspensionszellen als auch für Zelllysatexperimente. Darüber hinaus danken die Autoren dem NIH (R01GM116116 und R21CA204706) für die Finanzierung.
Acetontrile | Millipore Co. | AX0145-1 | Sampling solvent |
CellTram Vario | Eppendorf | 6221 | ICMP |
Copper wire | stores.ebay.com/jewelerheaven | Dead soft, round, 20 guage, 25 ft | Conductive union setup |
Digital stereomicroscope | Shenzhen D&F Co. | Supereyes T004 | Analysis |
Disposable micropipette, 1-5 µL | Rochester Scientific | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Dual bore quartz tubing, 1.120"x0.005"x12" | Friedrich & Dimmock, Inc. | MBT-005-020-2Q | Single-probe fabrication |
Epoxy resin | Devcon | Part No. 20945 | Single-probe fabrication |
Eppendorf cell manipulation system | Eppendorf | Transferman NK517800397-U.R. | ICMP |
External nut | VALCO*CHEMINERT | EN1 | Ion transfer tube fabrication |
Formic acid | Sigma-Aldrich | 399388-500ML | Sampling solvent |
Fused silica capillary, ID: 40 µm, OD: 100 µm | Polymicro Technologies | TSP040105 | Single-probe fabrication, conductive union setup |
Fused silica capillary, ID: 50 µm, OD: 150 µm | Polymicro Technologies | 1068150015 | Conductive union setup |
HyClone Synthetic fetal bovine serum (FBS) | Fischer Sci | SH3006603 | Cell culture |
Inline MicroFilter | IDEX Health & Science LLC | M-520 | Conductive union setup |
Laser puller | Sutter Instrument Co. | Model P-2000 | Single-probe fabrication |
LED UV lamp | Foshan Liang Ya Dental Equipment | LY-C240 | Single-probe fabrication |
LTQ Orbitrap mass spectrometer | Thermo Scientific | LTQ Orbitrap XL | Analysis |
Microforge | Narishige, Co. | MF-9 | Cell-selection probe fabrication |
Microunion | IDEX Health & Science LLC | M-539 | Conductive union |
PEEK tubing, 1/32×0.005x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1576 | Conductive union setup |
PEEK tubing, 1/32×0.007x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1577 | Conductive union setup |
Penicillin/Streptomycin | Gibco/Life Technologies | 15140-122 | Cell culture |
Petri dish, 35×10 mm | VWR | 25382-334 | Sample preparation |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | VWR | 0780-50L | Cell culture |
Platinum wire | Narishige, Co. | Model PT-A | Microforge |
Power supply | Nikon | PSM-2120 | ICMP |
RPMI, 1X with Corning glutagro | Corning | 10-104-CV | Cell culture |
Single-bore tubes | Boralex | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Stainless steel ferrules, for 1/16" OD | IDEX Health & Science LLC | VHP-200-01x | Ion transfer tube fabrication |
Stainless steel tubing, 1/32x 205 µm x30 cm | IDEX Health & Science LLC | U-1128 | Ion transfer tube fabrication |
Syringe, 250 µL | Hamilton | 1725LTN250UL | Sampling syringe |
T25 flask | CellStar | 690160 | Cell culture |
Thermo LTQ XL ion source interface flange | New Objective | PB5500 | Analysis |
ThermoPlate | TokaiHit | 55R30N | ICMP |
TrypLE Express | Gibco | 12605-010 | Cell culture |
Tube cutter, for 1/16" stainless steel | SUPELCO | 58692-U | Ion transfer tube fabrication |
USB digital photography microscope | dx.com | SO2 25~500X | Analysis |
UV curing resin | Prime Dental | Item No. 006.030 | Single-probe fabrication |
Vertical pipette puller | David Kopf Instruments | Model 720 | Cell-selection probe fabrication |
Voltage housing | PicoChip | PCH-A00120 | ICMP/MS interface |
Wire cutter | Craftsman | 4 1/2 in end nipper | Conductive union setup |