Une plate-forme intégrée de manipulation cellulaire est développée pour une utilisation en conjonction avec une configuration de spectrométrie de masse à sonde unique pour l’analyse en ligne des cellules de suspension individuelles dans des conditions ambiantes.
La spectrométrie de masse à cellule unique (SCMS) permet la détection sensible et l’analyse précise de larges gammes d’espèces cellulaires au niveau des cellules individuelles. La sonde unique, un dispositif d’échantillonnage et d’ionisation à micro échelle, peut être couplée à un spectromètre de masse pour l’analyse rapide et en ligne des constituants cellulaires dans des conditions ambiantes. Auparavant, la technique SCMS à sonde unique était principalement utilisée pour mesurer les cellules immobilisées sur un substrat, limitant les types de cellules pour les études. Dans la présente étude, la technologie SCMS à sonde unique a été intégrée à un système de manipulation cellulaire, généralement utilisé pour la fécondation in vitro. Cette plate-forme intégrée de manipulation et d’analyse cellulaire s’emploie à une sonde de sélection cellulaire pour capturer les cellules flottantes individuelles identifiées et transférer les cellules à l’extrémité d’une seule sonde pour la lyse à microéchelle, suivie d’une analyse de spectrométrie de masse immédiate. Ce processus de capture et de transfert élimine les cellules de la solution environnante avant l’analyse, minimisant l’introduction de molécules matricielles dans l’analyse de spectrométrie de masse. Cette configuration intégrée est capable d’analyser sCMS des cellules ciblées de patient-isolés présentes dans des échantillons de fluides corporels (par exemple, urine, sang, salive, etc.), permettant des applications potentielles de l’analyse de SCMS à la médecine humaine et à la biologie de la maladie.
La biologie humaine, en particulier la biologie des maladies, est de plus en plus comprise comme le résultat d’activités au niveau des cellules individuelles, mais les méthodes analytiques traditionnelles, telles que la spectrométrie de masse de chromatographie liquide (LCMS), sont généralement utilisées pour analyser échantillons préparés à partir de populations de cellules, alors que l’information moléculaire acquise ne peut pas représenter avec précision les processus chimiques au niveau des cellules individuelles. Ces méthodes standard et traditionnelles sont incapables de discerner les effets de l’hétérogénéité cellulaire sur une mesure analytique, et le processus de destruction et de mélange des cellules pour préparer le lysate conduit potentiellement à l’altération ou à la perte de la cellule composants1,2. Ces limitations des méthodes traditionnelles sont particulièrement importantes dans l’analyse des cellules des patients, dans laquelle les échantillons obtenus peuvent contenir un mélange complexe de nombreux types de cellules différentes. Pour surmonter ces carences, des méthodes d’analyse moléculaire à cellule unique, y compris des méthodes de spectrométrie de masse à cellule unique (SCMS), sont de plus en plus développées et appliquées à la bioanalyse, en particulier des métabolites cellulaires et du faible poids moléculaire. biomolécules3,4.
Les premières techniques SCMS développées utilisaient des techniques sous vide pour effectuer les analyses dans des conditions non ambiantes2,5,6,7,8,9, 10,11. Les techniques de SCMS non ambiantes sont capables d’analyser les lipides cellulaires et les métabolites, mais nécessitent un prétraitement de l’échantillon dans des conditions artificielles, et ne sont donc pas adaptés à l’analyse en temps réel. Le processus de préparation de l’échantillon pour l’analyse non ambiante comprend l’ajout de composants de matrice, et cette préparation peut modifier les composants cellulaires de leur environnement naturel12. Par conséquent, les techniques de spectrométrie de masse ambiante (SP), qui ne nécessitent pas de vide pour l’environnement d’échantillonnage, sont utilisées pour analyser les cellules dans un environnement proche de la autochtone. Ne pas avoir un environnement sous vide permet la polyvalence dans la conception expérimentale; des caméras peuvent être ajoutées pour surveiller le processus cellulaire et des techniques d’ionisation plus douces peuvent être combinées avec des techniques de séparation pour recevoir de meilleures informations de chaque expérience à celluleunique 4,12,13 ,14,15,16,17,18,19,20,21,22 ,23,24,25,26,27,28,29,30,31 ,32,33,34,35,36,37,38,39,40 ,41,42.
La méthode SCMS à sonde unique est une technique ambiante qui analyse les lignées de cellules cancéreuses vivantes et mammifères dans un environnement quasi-indigène21,43,44,45,46. En outre, le dispositif à sonde unique a été utilisé pour d’autres applications de spectrométrie de masse, y compris l’analyse des molécules extracellulaires dans les sphéroïdes multicellulaires et l’imagerie de la SP des tissus47,48,49 ,50,51,52. Cependant, puisque l’immobilisation cellulaire sur les substrats est nécessaire pour cette méthode, les cellules de suspension ne peuvent pas être directement analysées à l’aide de cette technique3,53. Par conséquent, le système SCMS à sonde unique ne pouvait pas être directement utilisé pour échantillonner les cellules individuelles non adhérentes, telles que les lignées cellulaires non adhérentes ou les cellules de suspension isolées du sang d’un patient ou d’autres fluides corporels54. Dans ce travail, une plate-forme intégrée de manipulation cellulaire (ICMP) est couplée à la technique SCMS à sonde unique pour analyser en ligne les cellules de suspension en ligne en direct avec une préparation minimale de l’échantillon (figure 1)46. L’ICMP se compose d’un microscope inversé pour surveiller la sélection des cellules, d’une sonde de sélection de cellules en verre, d’un micro-injecteur pour capturer des cellules flottantes individuelles, d’une plaque chauffée pour maintenir la température cellulaire, de deux systèmes de manipulation cellulaire pour contrôler mouvements de la sonde de sélection de cellules en verre et d’une sonde unique, et d’un microscope numérique pour observer le transfert cellulaire de l’extrémité de la sonde de sélection cellulaire à l’extrémité à sonde unique. La fabrication de la sonde unique est détaillée dans les publications précédentes et ne sera pas abordée ici21,48. Le système ICMP/single-probe est couplé à un spectromètre de masse à haute résolution. Cette configuration intégrée permet l’échantillonnage de cellules uniques identifiées à partir d’échantillons biologiques complexes avec des effets minimes à partir de molécules matricielles.
La plate-forme intégrée de manipulation et d’analyse cellulaire est conçue pour élargir la polyvalence de la méthode MS à sonde unique, permettant une analyse rapide en ligne des cellules non adhérentes dans un environnement quasi indigène. Un avantage majeur de la technique est que la préparation minimale de l’échantillon est nécessaire, de sorte que les cellules sont analysées dans des conditions qui imitent leur état standard. En particulier, les cellules individuelles d’intérêt peuvent être identifiées visuellement et sélectionnées, minimisant l’influence de l’effet de matrice sur l’efficacité de l’ionisation de la SP tout en maintenant les cellules dans leur environnement naturel, de sorte que les résultats sont plus représentatifs des cellules indigènes statut (Figure S3). Cette technique peut être potentiellement utilisée pour étudier les cellules des patients suspendues dans les biofluides dans de futures études. Un autre avantage de cette technique est la sélection flexible du solvant d’échantillonnage. Il est important d’inclure l’acétonitrile comme solvant d’échantillonnage principal afin que la lyse micro-échelle puisse se produire rapidement. Potentiellement, des normes internes (p. ex., des composés médicamenteux isotopiques) peuvent être ajoutées au solvant d’échantillonnage pour la quantification de molécules d’intérêt (p. ex., des molécules médicamenteuses) à partir de cellules individuelles, y compris celles-ci peuvent jouer un rôle clé dans la révolution personnalisation des traitements médicamenteux à l’avenir54.
Bien que ce système intégré puisse être utilisé commodément pour analyser de larges gammes de cellules, une limitation de la méthode est que ni la sonde à sonde unique ni la sonde de sélection cellulaire n’est disponible dans le commerce; dicter la nécessité d’optimiser de nombreux paramètres (p. ex. débit, tension, longueur entre l’émetteur nano-ESI et les tubes de transfert d’ions, etc.) avant chaque expérience. De plus, en raison de la petitesse de la sonde à sonde unique et de la sonde de sélection cellulaire, la perturbation de l’environnement (p. ex., le débit d’air) peut entraîner des difficultés à établir une jonction entre les deux sondes. Une solution à court terme est la flexion de la sonde de sélection cellulaire près de l’extrémité pour minimiser la longueur de l’effilage. Les travaux futurs comprennent la construction d’un logement pour enfermer les parties critiques de la configuration afin de minimiser les effets environnementaux. En raison de la quantité limitée de contenu cellulaire et du court temps d’acquisition (2-3 s) d’une cellule, l’analyse de la SP/MS ne peut être effectuée que pour des espèces relativement abondantes. D’autres facteurs influençant la sensibilité de détection incluent l’efficacité d’ionisation supprimée due à l’introduction de la matrice avec la perte potentielle d’ions par le tube prolongé de transfert d’ion.
The authors have nothing to disclose.
Les auteurs remercient Naga Rama Kothapalli pour son travail dans le développement de la préparation de l’échantillon pour les deux cellules de suspension et les expériences de lysate cellulaire. De plus, les auteurs remercient les NIH (R01GM116116 et R21CA204706) pour leur financement.
Acetontrile | Millipore Co. | AX0145-1 | Sampling solvent |
CellTram Vario | Eppendorf | 6221 | ICMP |
Copper wire | stores.ebay.com/jewelerheaven | Dead soft, round, 20 guage, 25 ft | Conductive union setup |
Digital stereomicroscope | Shenzhen D&F Co. | Supereyes T004 | Analysis |
Disposable micropipette, 1-5 µL | Rochester Scientific | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Dual bore quartz tubing, 1.120"x0.005"x12" | Friedrich & Dimmock, Inc. | MBT-005-020-2Q | Single-probe fabrication |
Epoxy resin | Devcon | Part No. 20945 | Single-probe fabrication |
Eppendorf cell manipulation system | Eppendorf | Transferman NK517800397-U.R. | ICMP |
External nut | VALCO*CHEMINERT | EN1 | Ion transfer tube fabrication |
Formic acid | Sigma-Aldrich | 399388-500ML | Sampling solvent |
Fused silica capillary, ID: 40 µm, OD: 100 µm | Polymicro Technologies | TSP040105 | Single-probe fabrication, conductive union setup |
Fused silica capillary, ID: 50 µm, OD: 150 µm | Polymicro Technologies | 1068150015 | Conductive union setup |
HyClone Synthetic fetal bovine serum (FBS) | Fischer Sci | SH3006603 | Cell culture |
Inline MicroFilter | IDEX Health & Science LLC | M-520 | Conductive union setup |
Laser puller | Sutter Instrument Co. | Model P-2000 | Single-probe fabrication |
LED UV lamp | Foshan Liang Ya Dental Equipment | LY-C240 | Single-probe fabrication |
LTQ Orbitrap mass spectrometer | Thermo Scientific | LTQ Orbitrap XL | Analysis |
Microforge | Narishige, Co. | MF-9 | Cell-selection probe fabrication |
Microunion | IDEX Health & Science LLC | M-539 | Conductive union |
PEEK tubing, 1/32×0.005x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1576 | Conductive union setup |
PEEK tubing, 1/32×0.007x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1577 | Conductive union setup |
Penicillin/Streptomycin | Gibco/Life Technologies | 15140-122 | Cell culture |
Petri dish, 35×10 mm | VWR | 25382-334 | Sample preparation |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | VWR | 0780-50L | Cell culture |
Platinum wire | Narishige, Co. | Model PT-A | Microforge |
Power supply | Nikon | PSM-2120 | ICMP |
RPMI, 1X with Corning glutagro | Corning | 10-104-CV | Cell culture |
Single-bore tubes | Boralex | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Stainless steel ferrules, for 1/16" OD | IDEX Health & Science LLC | VHP-200-01x | Ion transfer tube fabrication |
Stainless steel tubing, 1/32x 205 µm x30 cm | IDEX Health & Science LLC | U-1128 | Ion transfer tube fabrication |
Syringe, 250 µL | Hamilton | 1725LTN250UL | Sampling syringe |
T25 flask | CellStar | 690160 | Cell culture |
Thermo LTQ XL ion source interface flange | New Objective | PB5500 | Analysis |
ThermoPlate | TokaiHit | 55R30N | ICMP |
TrypLE Express | Gibco | 12605-010 | Cell culture |
Tube cutter, for 1/16" stainless steel | SUPELCO | 58692-U | Ion transfer tube fabrication |
USB digital photography microscope | dx.com | SO2 25~500X | Analysis |
UV curing resin | Prime Dental | Item No. 006.030 | Single-probe fabrication |
Vertical pipette puller | David Kopf Instruments | Model 720 | Cell-selection probe fabrication |
Voltage housing | PicoChip | PCH-A00120 | ICMP/MS interface |
Wire cutter | Craftsman | 4 1/2 in end nipper | Conductive union setup |