Een geïntegreerde cel manipulatie platform is ontwikkeld voor gebruik in combinatie met een single-probe massaspectrometrie Setup voor de on-line analyse van individuele schorsing cellen onder omgevingsomstandigheden.
Single cell massaspectrometrie (SCMS) maakt gevoelige detectie en nauwkeurige analyse van de brede waaiers van cellulaire soorten op de individuele-cel niveau. De single-Probe, een Microscale bemonstering en ionisatie-apparaat, kan worden gekoppeld aan een massaspectrometer voor on-line, snelle SCMS analyse van cellulaire bestanddelen onder omgevingsomstandigheden. Voorheen werd de single-probe SCMS techniek voornamelijk gebruikt voor het meten van cellen immobiled op een substraat, het beperken van de soorten cellen voor studies. In de huidige studie, de single-probe SCMS technologie is geïntegreerd met een cel manipulatie systeem, meestal gebruikt voor in vitro fertilisatie. Deze geïntegreerde cel manipulatie en analyse platform maakt gebruik van een cel-selectie sonde vast te leggen geïdentificeerde individuele zwevende cellen en de overdracht van de cellen naar de single-probe tip voor Microscale lysis, gevolgd door onmiddellijke massaspectrometrie analyse. Deze Capture and transferproces verwijdert de cellen uit de omliggende oplossing voorafgaand aan de analyse, het minimaliseren van de invoering van matrix moleculen in de massaspectrometrie analyse. Deze geïntegreerde opstelling is in staat om SCMS analyse van gerichte patiënt-geïsoleerde cellen aanwezig in lichaamsvloeistoffen monsters (bijvoorbeeld urine, bloed, speeksel, enz.), waardoor potentiële toepassingen van SCMS analyse aan de menselijke geneeskunde en de ziekte biologie.
De menselijke biologie, in het bijzonder ziekte biologie, wordt meer en meer begrepen om het resultaat van activiteiten op het niveau van individuele cellen te zijn, maar de traditionele analytische methodes, zoals vloeibare chromatografie massaspectrometrie (LCMS), worden over het algemeen gebruikt om te analyseren monsters bereid uit populaties van cellen, terwijl de verkregen moleculaire informatie niet nauwkeurig kan vertegenwoordigen de chemische processen op de individuele-cel niveau. Deze standaard, traditionele methoden zijn niet in staat om de effecten van cellulaire heterogeniteit te onderscheiden op een analytische meting, en het proces van het vernietigen en mengen van de cellen om de lysate voor te bereiden mogelijk leidt tot de wijziging of het verlies van cellulaire componenten1,2. Deze beperkingen van traditionele methodes zijn vooral belangrijk in de analyse van patiënt cellen, waarin de verkregen steekproeven een complex mengsel van vele verschillende cel types kunnen bevatten. Om deze tekortkomingen te overwinnen, worden de enkelvoudige moleculaire analysemethoden, met inbegrip van SCMS-methoden (single cell Mass spectrometrie), in toenemende mate ontwikkeld en toegepast op bioanalyse, met name van cellulaire metabolieten en laag moleculair gewicht biomoleculen3,4.
De eerste SCMS technieken ontwikkelden gebruikte vacuüm-gebaseerde technieken om de analyses uit te voeren onder niet-omgevingsomstandigheden2,5,6,7,8,9, 10,11. Niet-Ambient SCMS technieken zijn in staat de analyse van cellulaire lipiden en metabolieten, maar vereisen monster voor behandeling onder kunstmatige omstandigheden, en daarom zijn niet geschikt voor real-time analyse. Het monster bereidingsproces voor niet-Ambient analyse omvat de toevoeging van matrix componenten, en deze voorbereiding kan veranderen cellulaire componenten uit hun natuurlijke omgeving12. Daarom, ambient massaspectrometrie (MS) technieken, die niet nodig een vacuüm voor de bemonstering omgeving, worden gebruikt om cellen te analyseren in een bijna-native omgeving. Het niet hebben van een vacuüm milieu staat voor veelzijdigheid in het experimentele ontwerp toe; de camera’s kunnen worden toegevoegd om het cellulaire proces te controleren en de zachtere ionisatie technieken kunnen met scheidingstechnieken worden gecombineerd om betere informatie van elk enig-cel experiment4,12,13 te ontvangen ,14,15,16,17,18,19,20,21,22 ,23,24,25,26,27,28,29,30,31 ,32,33,34,35,36,37,38,39,40 ,41,42.
De single-probe SCMS methode is een ambient techniek die live analyseert, zoogdier kankercellen lijnen in een bijna-native omgeving21,43,44,45,46. Bovendien is de single-probe-apparaat is gebruikt voor andere massaspectrometrie toepassingen, met inbegrip van analyse van extracellulaire moleculen in multicellulaire sferoïden en MS Imaging van weefsels47,48,49 ,50,51,52. Nochtans, aangezien de cel immobilisatie op substraten voor deze methode wordt vereist, kunnen de opschortings cellen niet direct worden geanalyseerdgebruikend deze techniek53. Daarom kan de single-probe SCMS systeem niet direct worden gebruikt om niet-klevende enkele cellen, zoals niet-klevende cel lijnen of schorsing cellen geïsoleerd van het bloed van een patiënt of andere lichaamsvloeistoffen54te proeven. In dit werk, een geïntegreerde Cell manipulatie platform (ICMP) is gekoppeld aan de single-probe SCMS techniek om live te analyseren, schorsing cellen on-line met minimale monstervoorbereiding (Figuur 1)46. De ICMP bestaat uit een omgekeerde Microscoop om cel selectie, een glas cel-selectie sonde, een microinjector om individuele zwevende cellen vast te leggen, een verwarmde plaat te handhaven cellulaire temperatuur, twee cellen manipulatiesystemen te controleren ruimtelijke bewegingen van zowel de glas cel-selectie sonde en single-Probe, en een digitale microscoop om cel overdracht van de cel-selectie sonde Tip observeren om de single-probe tip. De fabricage van de single-probe is gedetailleerd in eerdere publicaties en zal niet worden aangepakt hier21,48. Het ICMP/single-probe systeem wordt gekoppeld aan een hoge resolutie massaspectrometer. Deze geïntegreerde opstelling zorgt voor de bemonstering van geïdentificeerde enkelvoudige cellen van complexe biologische monsters met minimale effecten van matrix moleculen.
De geïntegreerde cel manipulatie en analyse platform is gebouwd om de veelzijdigheid van de single-probe MS-methode uit te breiden, waardoor on-line, snelle analyse van niet-aanhangende cellen in een bijna-native omgeving. Een groot voordeel van de techniek is dat minimale monstervoorbereiding nodig is, zodat de cellen worden geanalyseerd in omstandigheden die hun standaard staat na te bootsen. In het bijzonder, individuele cellen van belang kunnen visueel worden geïdentificeerd en geselecteerd, het minimaliseren van de invloed van matrix effect op MS ionisatie-efficiëntie met behoud van cellen in hun natuurlijke omgeving, zodat de resultaten zijn meer representatieve cellen ‘ native status (figuur S3). Deze techniek kan worden gebruikt voor de studie van patiënt cellen geschorst in biovloeistoffen in toekomstige studies. Een ander voordeel van deze techniek is de flexibele selectie van het sampling oplosmiddel. Het is belangrijk om acetonitril te nemen als de belangrijkste bemonstering oplosmiddel, zodat Microscale lysis kan snel voorkomen. Mogelijk kunnen interne normen (bijv. isotopically-gelabelde geneesmiddelen) worden toegevoegd aan het bemonsterings middel voor de kwantificering van moleculen die van belang zijn (bijv. drug moleculen) uit individuele cellen, waaronder die een sleutelrol kunnen spelen bij een revolutie personaliseren van geneesmiddelen behandelingen in de toekomst54.
Hoewel dit geïntegreerde systeem gemakkelijk kan worden gebruikt om brede waaiers van cellen te analyseren, is een beperking van de methode dat noch de enig-sonde noch cel-selectie sonde commercieel-beschikbaar is; het dicteren van de behoefte aan optimalisering van vele parameters (b.v., stroomtarief, voltage, lengte tussen nano-ESI emitter en ionen overdrachts buizenstelsel, enz.) voorafgaand aan elk experiment. Bovendien, wegens de kleinheid van de enig-sonde en cel-selectie sonde, kunnen de milieuverstoring (b.v., luchtstroom) in moeilijkheden resulteren die een verbinding tussen de twee sondes vestigen. Een oplossing op korte termijn is het buigen van de cel-selectie sonde dicht bij het einde van de lengte van de tapering te minimaliseren. Het toekomstige werk omvat de ontwikkeling van een huisvesting om de kritieke delen van de opstelling te omsluiten om milieugevolgen te minimaliseren. Wegens de beperkte hoeveelheid cellulaire inhoud en de korte verwervings tijd (~ 2-3 s) van een cel, kan de analyse van MS/MS slechts voor vrij overvloedige soorten worden geleid. Andere factoren die de opsporings gevoeligheid beïnvloeden omvatten de onderdrukte ionisatie efficiency toe te schrijven aan de introductie van matrijs samen met de cel en het potentiële ionen verlies door het uitgebreide ionen overdrachts buizenstelsel.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs danken Naga Rama Ninne voor haar werk in het ontwikkelen van sample voorbereiding voor zowel schorsing cellen en cel lysate experimenten. Bovendien, de auteurs bedanken de NIH (R01GM116116 en R21CA204706) voor de financiering.
Acetontrile | Millipore Co. | AX0145-1 | Sampling solvent |
CellTram Vario | Eppendorf | 6221 | ICMP |
Copper wire | stores.ebay.com/jewelerheaven | Dead soft, round, 20 guage, 25 ft | Conductive union setup |
Digital stereomicroscope | Shenzhen D&F Co. | Supereyes T004 | Analysis |
Disposable micropipette, 1-5 µL | Rochester Scientific | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Dual bore quartz tubing, 1.120"x0.005"x12" | Friedrich & Dimmock, Inc. | MBT-005-020-2Q | Single-probe fabrication |
Epoxy resin | Devcon | Part No. 20945 | Single-probe fabrication |
Eppendorf cell manipulation system | Eppendorf | Transferman NK517800397-U.R. | ICMP |
External nut | VALCO*CHEMINERT | EN1 | Ion transfer tube fabrication |
Formic acid | Sigma-Aldrich | 399388-500ML | Sampling solvent |
Fused silica capillary, ID: 40 µm, OD: 100 µm | Polymicro Technologies | TSP040105 | Single-probe fabrication, conductive union setup |
Fused silica capillary, ID: 50 µm, OD: 150 µm | Polymicro Technologies | 1068150015 | Conductive union setup |
HyClone Synthetic fetal bovine serum (FBS) | Fischer Sci | SH3006603 | Cell culture |
Inline MicroFilter | IDEX Health & Science LLC | M-520 | Conductive union setup |
Laser puller | Sutter Instrument Co. | Model P-2000 | Single-probe fabrication |
LED UV lamp | Foshan Liang Ya Dental Equipment | LY-C240 | Single-probe fabrication |
LTQ Orbitrap mass spectrometer | Thermo Scientific | LTQ Orbitrap XL | Analysis |
Microforge | Narishige, Co. | MF-9 | Cell-selection probe fabrication |
Microunion | IDEX Health & Science LLC | M-539 | Conductive union |
PEEK tubing, 1/32×0.005x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1576 | Conductive union setup |
PEEK tubing, 1/32×0.007x 5ft | IDEX Health & Science LLC | 1577 | Conductive union setup |
Penicillin/Streptomycin | Gibco/Life Technologies | 15140-122 | Cell culture |
Petri dish, 35×10 mm | VWR | 25382-334 | Sample preparation |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | VWR | 0780-50L | Cell culture |
Platinum wire | Narishige, Co. | Model PT-A | Microforge |
Power supply | Nikon | PSM-2120 | ICMP |
RPMI, 1X with Corning glutagro | Corning | 10-104-CV | Cell culture |
Single-bore tubes | Boralex | 5065 | Cell-selection probe fabrication |
Stainless steel ferrules, for 1/16" OD | IDEX Health & Science LLC | VHP-200-01x | Ion transfer tube fabrication |
Stainless steel tubing, 1/32x 205 µm x30 cm | IDEX Health & Science LLC | U-1128 | Ion transfer tube fabrication |
Syringe, 250 µL | Hamilton | 1725LTN250UL | Sampling syringe |
T25 flask | CellStar | 690160 | Cell culture |
Thermo LTQ XL ion source interface flange | New Objective | PB5500 | Analysis |
ThermoPlate | TokaiHit | 55R30N | ICMP |
TrypLE Express | Gibco | 12605-010 | Cell culture |
Tube cutter, for 1/16" stainless steel | SUPELCO | 58692-U | Ion transfer tube fabrication |
USB digital photography microscope | dx.com | SO2 25~500X | Analysis |
UV curing resin | Prime Dental | Item No. 006.030 | Single-probe fabrication |
Vertical pipette puller | David Kopf Instruments | Model 720 | Cell-selection probe fabrication |
Voltage housing | PicoChip | PCH-A00120 | ICMP/MS interface |
Wire cutter | Craftsman | 4 1/2 in end nipper | Conductive union setup |