Nous présentons un protocole pour étudier la distribution des mitochondries et du réticulum endoplasmique dans les cellules entières après modification génétique utilisant la lumière corrélative et la microscopie électronique de volume comprenant la peroxidase d’ascorbate 2 et la coloration de peroxidase de raifort, sectionnement en série des cellules avec et sans le gène cible dans la même section, et imagerie en série par microscopie électronique.
Les organites cellulaires, tels que les mitochondries et le réticulum endoplasmique (ER), créent un réseau pour effectuer une variété de fonctions. Ces structures très courbes sont repliées en différentes formes pour former un réseau dynamique en fonction des conditions cellulaires. La visualisation de ce réseau entre les mitochondries et les urgences a été tentée à l’aide de l’imagerie par fluorescence à super résolution et de la microscopie légère; cependant, la résolution limitée est insuffisante pour observer les membranes entre les mitochondries et les urgences en détail. La microscopie électronique de transmission fournit le bon contraste de membrane et la résolution nanométrique-échelle pour l’observation des organelles cellulaires ; cependant, il prend exceptionnellement de temps lors de l’évaluation de la structure tridimensionnelle (3D) des organites très incurvés. Par conséquent, nous avons observé la morphologie des mitochondries et des er par l’intermédiaire de la microscopie corrélative de lumière-électron (CLEM) et des techniques de microscopie électronique de volume utilisant le peroxidase d’ascorbate amélioré 2 et la coloration de peroxidase de raifort. Une méthode de coloration en bloc, la section série ultramince (tomographie de tableau), et la microscopie électronique de volume ont été appliquées pour observer la structure 3D. Dans ce protocole, nous suggérons une combinaison de CLEM et de microscopie électronique 3D pour effectuer des études structurelles détaillées des mitochondries et des urgences.
Les mitochondries et les réticulums endoplasmiques (ER) sont des organites cellulaires liés à la membrane. Leur connexion est nécessaire pour leur fonction, et les protéines liées à leur réseau ont été décrites1. La distance entre les mitochondries et les urgences aété rapportée comme étant d’environ 100 nm à l’aide de la microscopie légère 2; cependant, des études récentes de microscopie de super résolution3 et de microscopie électronique (EM)4 ont révélé qu’elle était considérablement plus petite, à environ 10-25 nm. La résolution obtenue dans la microscopie de super-résolution est inférieure à EM, et l’étiquetage spécifique est nécessaire. L’EM est une technique appropriée pour atteindre un contraste à résolution suffisamment élevée pour les études structurelles des connexions entre les mitochondries et les urgences. Cependant, un inconvénient est l’information limitée de z-axe parce que les sections minces doivent être approximativement 60 nm ou plus minces pour la microscopie électronique conventionnelle de transmission (TEM). Pour une imagerie suffisamment em z-axe, la microscopie électronique tridimensionnelle (3DEM) peut être utilisée5. Cependant, cela implique la préparation de centaines de sections minces série de cellules entières, ce qui est un travail très délicat que seuls quelques technologues qualifiés ont maîtrisé. Ces fines sections sont collectées sur des grilles TEM d’un trou enduites de forme fragiles. Si le film se brise sur une ceinture, l’imagerie en série et la reconstruction de volume n’est pas possible. La microscopie électronique à balayage par blocs en série (SBEM) est une technique populaire pour 3DEM qui utilise la section destructrice en bloc à l’intérieur de la chambre à vide du microscope électronique à balayage (SEM) avec un couteau diamant (Dik-SBEM) ou un faisceau d’ions focalisés (FIB-SEM) 6. Cependant, parce que ces techniques ne sont pas disponibles à toutes les installations, nous suggérons la tomographie de tableau7 utilisant la sectionde série et SEM. Dans la tomographie de tableau, les sections série coupées à l’aide d’un ultramicrotome sont transférées sur un bordereau de verre au lieu d’une grille TEM et visualisées par microscopie légère et SEM8. Pour améliorer le signal pour l’imagerie par électron de rétrodiffusion (ESB), nous avons utilisé un protocole de coloration EM en bloc utilisant des cellules fixes d’osmium (OsO4) avec thiocarbohydrazide osmiophilique (TCH)9, nous permettant d’obtenir des images sans post-embedding double coloration.
En outre, le marqueur mitochondrial SCO1 (cytochrome c oxidase protéine d’assemblage 1)MD ascorbate peroxidase 2 (APEX2)10 étiquette moléculaire a été utilisé pour visualiser les mitochondries au niveau EM. APEX2 est d’environ 28 kDa et est dérivé de soja ascorbate peroxidase11. Il a été développé pour montrer l’emplacement détaillé de protéines spécifiques au niveau EM de la même manière que la protéine fluorescente verte marquée par la protéine est utilisée dans la microscopie légère. APEX2 convertit 3,3′ -diaminobenzidine (DAB) en polymère osmiophilique insoluble sur le site de l’étiquette en présence du cofactor peroxyde d’hydrogène (H2O2). APEX2 peut être utilisé comme une alternative à l’étiquetage des anticorps traditionnels dans EM, avec une localisation des protéines dans toute la profondeur de la cellule entière. En d’autres termes, la protéine APEX2-étiquetée peut être visualisée par osmication spécifique11 sans étiquetage et perméabilisation d’immunogold après ultra-cryosectioning. Le peroxidase de raifort (HRP) est également une étiquette sensible qui catalyse la polymérisation H2O2-dépendante du DAB en un précipité localisé, offrant un contraste EM après le traitement avec OsO4. La séquence peptide cible ER HRP-KDEL (lys-asp-glu-leu)12 a été appliquée pour visualiser les urgences dans une cellule entière. Pour évaluer notre protocole d’utilisation des étiquettes génétiques et de la coloration en bloc avec l’osmium réduit et TCH (méthode rOTO), en utilisant l’effet d’osmication en même temps, nous avons comparé le contraste de membrane avec et sans l’utilisation de chaque étiquette génétique dans la coloration rOTO en bloc. Bien que 3DEM avec la tomographie de tableau et la coloration de DAB avec APEX et HRP aient, respectivement, été employées pour d’autres buts, notre protocole est unique parce que nous avons combiné la tomographie de réseau pour la coloration 3DEM et DAB pour des mitochondries et l’étiquetage d’ER. Plus précisément, nous avons montré cinq cellules avec et sans gènes APEX-marqués dans la même section, qui a aidé à étudier l’effet de la modification génétique sur les cellules.
Déterminer la localisation cellulaire de protéines spécifiques à une résolution nanométrique à l’aide de l’EM est crucial pour comprendre les fonctions cellulaires des protéines. En général, il existe deux techniques pour étudier la localisation d’une protéine cible via EM. L’une est la technique immunogold, qui a été utilisée en EM depuis 1960, et l’autre est une technique utilisant récemment développé des étiquettes génétiquement codées16. Les techniques traditionnelles d’i…
The authors have nothing to disclose.
Cette recherche a été soutenue par le programme de recherche fondamentale KBRI par l’intermédiaire du Korea Brain Research Institute financé par le Ministère des sciences et des TIC (19-BR-01-08), et par la subvention de la National Research Foundation of Korea (NRF) financée par le gouvernement coréen (MSIT)(No. 2019R1A2C1010634). SCO1-APEX2 et HRP-KDEL plasmides ont été gentiment fournis par Hyun-Woo Rhee (Seoul National University). Les données TEM ont été acquises dans les installations de base de recherche cérébrale de KBRI.
Glutaraldehyde | EMS | 16200 | Use only in fume hood |
Paraformaldehyde | EMS | 19210 | Use only in fume hood |
Sodium cacodylate | EMS | 12300 | |
Osmium tetroxide 4 % aqueous solution | EMS | 16320 | Use only in fume hood |
Epon 812 | EMS | 14120 | EMbed 812- 20 ml/ DDSA- 16 ml/ NMA- 8 ml/ DMP-30 – 0.8 ml |
Ultra-microtome Leica ARTOS 3D | Leica | ARTOS 3D | |
Uranyl acetate | EMS | 22400 | Hazardous chemical |
Lead citrate | EMS | 17900 | |
35mm Gridded coverslip dish | Mattek | P35G-1.5-14-CGRD | |
Glow discharger | Pelco | easiGlow | |
Formvar carbon coated Copper Grid | Ted Pella | 01805-F | |
Hydrochloric acid | SIGMA | 258148 | |
Fugene HD | Promega | E2311 | |
Glycine | SIGMA | G8898 | |
3,3′ -diaminobenzamidine (DAB) | SIGMA | D8001 | Hazardous chemical |
30% Hydrogen peroxide solution | Merck | 107210 | |
Potassium hexacyanoferrate(II) trihydrate | SIGMA | P3289 | |
0.22 um syringe filter | Sartorius | 16534 | |
Thiocarbonyldihydrazide | SIGMA | 223220 | Use only in fume hood |
Potassium hydroxide | Fluka | 10193426 | |
L-aspartic acid | SIGMA | A9256 | |
Ethanol | Merck | 100983 | |
Transmission electron microscopy | FEI | Tecnai G2 | |
Indium tin oxide (ITO) coated glass coverslips | SPI | 06489-AB | fragil glass |
Isopropanol | Fisher Bioreagents | BP2618-1 | |
Diamond knife | Leica | AT-4 | |
Inveted light microscopy | Nikon | ECLipse TS100 | |
Scanning electron microscopy | Zeiss | Auriga |