Summary

לימוד זיהום הצפנה ברקמה תלת-ממדית-מערכות תרבות מיקרואיד של האדם הנגזר על ידי מיקרו-הזרקה

Published: September 14, 2019
doi:

Summary

אנו מתארים פרוטוקולים כדי להכין זיהומים ולטהר את הנבגים עבור לימוד זיהום של המעי האנושי ואורגאואידים על ידי הקריפטוספורידיום parvum. אנו מדגימים את ההליכים למיקרו הזרקה של טפילים לתוך מעיים אורגנואיד וכתמים של אורגנואידים. לבסוף, אנו מתארים את הבידוד. של ציסטות שנוצרו מהאורגנואידים

Abstract

קריפטוספורידיום parvum הוא אחד הגורמים העיקריים של מחלת diarrheal אנושי. כדי להבין את הפתולוגיה של הטפיל ולפתח תרופות יעילות, מערכת תרבות מבחנה המהווה את התנאים במארח יש צורך. אורגנואידים, הדומה מאוד לרקמות המוצא שלהם, הם אידיאליים ללימוד אינטראקציות מארחים-פרזיאליות. אורגנואידים הם תלת-ממדיים (3D) מבנים מבוססי רקמה הנגזרים מתאי גזע בוגרים וגדלים בתרבות לפרקי זמן ארוכים מבלי לעבור סטייה גנטית או טרנספורמציה. יש להם קוטביות מוגדרת היטב עם משטחי פסגה וגם בזלת צלעות. אורגנואידים יש יישומים שונים בדיקות סמים, ביו בנקאות, ומידול מחלות ומארח-חיידק אינטראקציה לימודים. כאן אנו מציגים פרוטוקול צעד אחר צעד של איך להכין את הנבגים ואת הספוראוזוטים של קריפטוספורידיום לזיהום המעי האנושי אורגנואידים. אנו לאחר מכן להדגים כיצד מיקרוהזרקה ניתן להשתמש כדי להזריק את החיידקים לתוך אורגאיד לומן. ישנן שלוש שיטות עיקריות שבהן ניתן להשתמש באורגנואידים למחקרים מארחים-חיידק-מיקרוהזרקה, הטיה מכנית וציפוי, ועל ידי ביצוע monolayers. מיקרוהזרקה מאפשרת תחזוקה של המבנה התלת-ממדי ומאפשרת שליטה מדויקת באמצעי הטפיל והמגע הישיר הרשמי של החיידקים. אנו מספקים פרטים עבור צמיחה אופטימלית של אורגנואידים עבור הדמיה או הייצור הoocyst. בסופו של דבר, אנו גם להדגים כיצד אאוציסטות שנוצר לאחרונה ניתן מבודד אורגאיד עבור המשך עיבוד וניתוח במורד הזרם.

Introduction

התפתחות של תרופות או חיסונים לטיפול ומניעה של הדבקת הצפנה היתה מעכבת היעדר מערכות מבחנה אשר לחקות בדיוק את המצב vivo בבני אדם1,2. רבים מהמערכות הזמינות כעת רק לאפשר זיהום לטווח קצר (< 5 ימים) או לא לתמוך במחזור החיים המלא של הטפיל3,4. מערכות אחרות המאפשרות התפתחות מלאה של הטפיל מבוססים על קווי תאים מונצח או תאים סרטניים שאינם בנאמנות המצב הפיזיולוגי של בני אדם5,6,7 . אורגנואידים או ‘ מיני איברי ‘ הם 3D רקמות נגזרות מבנים אשר גדלים במטריצה מתוך החילוץ שנוספו עם רקמות שונות מסוימים הצמיחה גורמים. אורגנואידים פותחו מאיברים שונים ורקמות. הם יציבים מבחינה גנטית ומוארכים את רוב התפקודים של אברי המוצא שלהם, ויכולים להישמר בתרבות לפרקי זמן ארוכים. פיתחנו שיטה לזיהום המעי האנושי והריאות אורגנואידים עם Cryptosporidium המספקת מודל מדויק של מבחנה למחקר של אינטראקציות מארח טפיל רלוונטי מעיים והצפנת הנשימה8 ,9,10,11,12,13. בניגוד לדגמים אחרים של תרבות שפורסמו, מערכת האורגנואיד מייצגת אינטראקציות טפיל מארח של החיים האמיתיים, מאפשרת השלמת מחזור החיים כך שכל השלבים של מחזור החיים הטפיל ניתן ללמוד, ושומר על התפשטות הטפיל עד 28 ימים10.

Cryptosporidium parvum הוא טפיל apicom, אשר מדביק את האפיתל של הנשימה ומעיים שדות, גרימת מחלה diarrheal ממושכת. השלב הסביבתי עמיד הוא oocyst, נמצא מזון מזוהם מים14. לאחר שבלע או שאפה, את הריזוטו ומשחרר ארבעה sporozoites כי לצרף לתאי אפיתל. Sporozoites להחליק על תאים מארחים ולעסוק קולטנים תא מארח, אבל הטפיל לא לפלוש באופן מלא לתא, והוא מופיע כדי לגרום לתא המארח להפרץ15. הטפיל, שהופנמו בתוך תא פנימי, אך ממוכך, נשאר על פני השטח הרשמי של התא, ומשכפל בתוך החללים הפרזיטואטיים. הוא עובר שני סיבובים של רבייה לא-מינית – תהליך הנקרא merogony. במהלך המראווני, הסוג שאני מפתח מפתחים אשר מכילים שמונה merozoites המשוחררים לפלוש לתאים חדשים. אלה merozoites לפלוש תאים חדשים כדי להתפתח סוג II meronts המכיל ארבעה merozoites. Merozoites אלה, כאשר הם משתחררים, להדביק תאים ולהתפתח מאקרוגמונטים ומיקרוגמבטים. מיקרוגיים משתחררים ומדשן את המקגיים המייצרים זיטים שבוגרים לתוך ציסטות. בוגרת האוציסטות משתחררים לאחר מכן לתוך לומן. האוציסטות הן דקות-חומה אשר מיד מייבאות להדביק את האפיתל, או מוקף חומה עבה אשר משתחררים לתוך הסביבה כדי להדביק את המארח הבא14. כל שלבי הצפנת מחזור החיים זוהו במערכת התרבות האורגאידית שפותחה בעבר על ידי הקבוצה שלנו10.

מאז בנאמנות האדם אורגנואידים שכפול רקמות האדם9,11,13, ותמיכה בכל השלבים replicative הצפנה10, הם מערכת התרבות האידיאלית רקמה ללמוד קריפטוספטורידיום ביולוגיה ואינטראקציות מארחים-טפיל. כאן אנו מתארים את ההליכים לזיהום אורגנואידים עם שני ציסטות קריפטוגנטים ו-הצפנה , ובידוד החדש אאוציסטות המיוצר במערכת זו תרבות רקמה.

Protocol

כל טיפול ברקמות וכריתה בוצעה תחת הלוח סקירה מוסדית (IRB) מאושר פרוטוקולים עם הסכמת המטופל. 1. הכנה של C. parvum אוציסטות עבור הזרקה הערה: הצפנת הקריפטוספדיום נרכשו ממקור מסחרי (ראה את הטבלה של חומרים). אלה האוציסטות מיוצרים עגלים מאוחסנים ?…

Representative Results

הפרוטוקולים המוצגים כאן התוצאה היא טיהור יעיל של האוציסטות והספורזוטים (איור 1A) מוכן הזרקת מיקרו. הפרוטוקול בתחנת המשטרה מביא לשחרורו של הספוראוזוטים מ-70%-80% מהציסטות, ולכן חיוני לסנן את שאר הפגזים והצדפים דרך מסנן של 3 יקרומטר. הסינון מביא כמעט 100% לטיהור הספוראוזוט (<strong class…

Discussion

תרבות של הצפנת הצפנה טפילים במעי ואורגנואידים הנשימה מספק מודל מדויק ללמוד אינטראקציות מארח טפיל10 אבל יש גם יישומים רבים אחרים. לדוגמה, השיטות הנוכחיות של בחירת והפצת הצפנה מהונדסים גנטית טפילים דורשים מעבר בעכברים19 אשר אינו מאפשר בידוד של טפילים כי י?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

אנו אסירי תודה לדבורה א. שפר מבית הספר של בעלי חיים ומדעי ביורפואי השוואתי, המכללה לחקלאות ומדעי החיים, אוניברסיטת אריזונה, טוסון, AZ, ארה ב על שסייע לנו עם ייצור וניתוח הoocyst. כמו כן, אנו מודים לגבי מיקרוסקופ ומרכז ההדמיה ו-d. d Mullendore באוניברסיטת וושינגטון לקראת הכנה והדמיה של ציסטות מבודדות של אורגנואיד.

D.D. הוא המקבל של מענק בני מארגון הולנד למחקר מדעי (NWO-ALW, 016.171.015). I.H. הוא המקבל של מענק בני מארגון הולנד למחקר מדעי (NWO-ALW, 863.14.002) ונתמך על ידי מלגות מארי קירי מהוועדה האירופית (הצעה 330571 FP7-אנשים-2012-IIF). המחקר המוביל לתוצאות אלה קיבל מימון ממועצת המחקר האירופית תחת הסכם מתקדם המענק של ERC no. 67013 ו-NIH NIAIH תחת R21 AT009174 כדי RMO. עבודה זו היא חלק ממכון Oncode, אשר ממומן חלקית על ידי האגודה ההולנדית לסרטן ומומן על ידי מענק של האגודה ההולנדית לסרטן.

Materials

Basement membrane extract (extracellular matrix) amsbio 3533-010-02  
Crypt-a-Glo antibody (Oocyst specific antibody) Waterborne, Inc A400FLR-1X Final Concentration = Use 2-3 drops/slide
Crypto-Grab IgM coated Magnetic beads Waterborne, Inc IMS400-20  
Dynamag 15 rack Thermofisher Scientific 12301D  
Dynamag 2 rack Thermofisher Scientific 12321D  
EMD Millipore Isopore Polycarbonate Membrane Filters- 3µm EMD-Millipore TSTP02500  
Fast green dye SIGMA F7252-5G    
Femtojet 4i Microinjector Eppendorf 5252000013  
Glass capillaries of 1 mm diameter WPI TW100F-4  
Matrigel (extracellular matrix) Corning 356237  
Microfuge tube 1.5ml Eppendorf T9661-1000EA  
Micro-loader tips Eppendorf 612-7933  
Micropipette puller P-97 Shutter instrument P-97  
Normal donkey Serum Bio-Rad C06SB  
Penstrep Gibco 15140-122  
Sodium hypoclorite (use 5%) Clorox 50371478  
Super stick slides Waterborne, Inc S100-3  
Swinnex-25 47mm Polycarbonate filter holder EMD-Millipore SX0002500  
Taurocholic acid sodium salt hydrate SIGMA T4009-5G  
Tween-20 Merck 8221840500  
Vectashield mounting agent Vector Labs H-1000  
Vortex Genie 2 Scientific industries, Inc SI0236  
Adv+++ (DMEM+Penstrep+Glutamax+Hepes)     Final amount
DMEM Invitrogen 12634-010 500ml
Penstrep Gibco 15140-122 5ml of stock in 500ml DMEM
Glutamax Gibco 35050038 5ml of stock in 500ml DMEM
Hepes Gibco 15630056 5ml of stock in 500ml DMEM
INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OME (Expansion media)     Final concentration
A83-01 Tocris 2939-50mg 0.5µM
Adv+++     make upto 100 ml
B27 Invitrogen 17504044 1X
EGF Peprotech AF-100-15 50ng/mL
Gastrin Tocris 3006-1mg 10 nM
NAC Sigma A9125-25G 1.25mM
NIC Sigma N0636-100G 10mM
Noggin CM In house*   10%
P38 inhibitor (SB202190) Sigma S7076-25 mg 10µM
PGE2 Tocris 2296/10 10 nM
Primocin InvivoGen ant-pm-1 1ml/500ml media
RSpoI CM In house*   20%
Wnt3a CM In house*   50%
In house* – cell lines will be provided upon request      
INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OMD (Differentiation media)     To differentiate organoids, expanding small intestinal organoids were grown in a Wnt-rich medium for six to seven days after splitting, and then grown in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, prostaglandin E2 from a Wnt-rich medium or OME)
LUNG ORGANOID MEDIA- LOM (Differentiation media)     Final concentration
Adv+++     make upto 100 ml
ALK-I A83-01 Tocris 2939-50mg 500nM
B27 Invitrogen 17504044 0.0763888889
FGF-10 Peprotech 100-26 100ng/ml
FGF-7 Peprotech 100-19 25ng/ml
N-Acetylcysteine Sigma A9125-25G 1.25mM
Nicotinamide Sigma N0636-100G 5mM
Noggin UPE U-Protein Express Contact company directly 10%
p38 MAPK-I Sigma S7076-25 mg 1µM
Primocin InvivoGen ant-pm-1 1:500
RhoKI Y-27632 Abmole Bioscience M1817_100 mg 2.5µm
Rspo UPE U-Protein Express Contact company directly 10%
Reducing buffer (for resuspension of oocysts and sporozoites for injection)     Final concentration
L-Glutathione reduced Sigma G4251-10MG 0.5 μg/μl of OME/OMD/LOM
Betaine Sigma 61962 0.5 μg/μl of OME/OMD/LOM
L-Cysteine Sigma 168149-2.5G 0.5 μg/μl of OME/OMD/LOM
Linoleic acid Sigma L1376-10MG 6.8 μg/ml of OME/OMD /LOM
Taurine Sigma T0625-10MG 0.5 μg/μl of OME/OMD/LOM
Blocking buffer (for immunoflourescence staining)     Final concentration
Donkey/Goat serum Bio-Rad C06SB 2%
PBS Thermo-Fisher 70011044 Make upto 100ml
Tween 20 Merck P1379 0.1%
List of Antibodies used      
Alexa 568 goat anti-rabbit Invitrogen A-11011 Dilution-1:500; RRID: AB_143157
Crypt-a-Glo Comprehensive Kit- Fluorescein-labeled antibody Crypto-Glo Waterborne, Inc A400FLK Dilution- 1:200
Crypta-Grab IMS Beads- Magnetic beads coated in monoclonal antibody reactive Waterborne, Inc IMS400-20 Dilution-1:500
DAPI Thermo Fisher Scientific D1306 Dilution-1:1000; RRID : AB_2629482
Phalloidin-Alexa 674 Invitrogen A22287 Dilution-1:1000; RRID: AB_2620155
Rabbit anti-gp15 antibody generated by R. M. O’Connor (co-author). Upon request Upon request Dilution-1:500
Sporo-Glo Waterborne, Inc A600FLR-1X Dilution- 1:200

References

  1. Checkley, W., et al. A review of the global burden, novel diagnostics, therapeutics, and vaccine targets for Cryptosporidium. The Lancet Infectious Diseases. 15 (1), 85-94 (2015).
  2. Bones, A. J., et al. Past and future trends of Cryptosporidium in vitro research. Experimental Parasitology. 196, 28-37 (2018).
  3. Muller, J., Hemphill, A. In vitro culture systems for the study of apicomplexan parasites in farm animals. International Journal for Parasitology. 43 (2), 115-124 (2013).
  4. Karanis, P., Aldeyarbi, H. M. Evolution of Cryptosporidium in vitro culture. International Journal for Parasitology. 41 (12), 1231-1242 (2011).
  5. Morada, M., et al. Continuous culture of Cryptosporidium parvum using hollow fiber technology. International Journal for Parasitology. 46 (1), 21-29 (2016).
  6. DeCicco RePass, M. A., et al. Novel Bioengineered Three-Dimensional Human Intestinal Model for Long-Term Infection of Cryptosporidium parvum. Infection and Immunity. 85 (3), (2017).
  7. Miller, C. N., et al. A cell culture platform for Cryptosporidium that enables long-term cultivation and new tools for the systematic investigation of its biology. International Journal for Parasitology. 48 (3-4), 197-201 (2018).
  8. Sachs, N., et al. Long-term expanding human airway organoids for disease modelling. bioRxiv. , (2018).
  9. Dutta, D., Clevers, H. Organoid culture systems to study host-pathogen interactions. Current Opinion in Immunology. 48, 15-22 (2017).
  10. Heo, I., et al. Modelling Cryptosporidium infection in human small intestinal and lung organoids. Nature Microbiology. 3 (7), 814-823 (2018).
  11. Dutta, D., Heo, I., Clevers, H. Disease Modeling in Stem Cell-Derived 3D Organoid Systems. Trends in Molecular Medicine. 23 (5), 393-410 (2017).
  12. Clevers, H. Modeling Development and Disease with Organoids. Cell. 165 (7), 1586-1597 (2016).
  13. Sato, T., et al. Long-term expansion of epithelial organoids from human colon, adenoma, adenocarcinoma, and Barrett’s epithelium. Gastroenterology. 141 (5), 1762-1772 (2011).
  14. O’Hara, S. P., Chen, X. M. The cell biology of Cryptosporidium infection. Microbes and Infection. 13 (8-9), 721-730 (2011).
  15. Lendner, M., Daugschies, A. Cryptosporidium infections: molecular advances. Parasitology. 141 (11), 1511-1532 (2014).
  16. Feng, H., Nie, W., Sheoran, A., Zhang, Q., Tzipori, S. Bile acids enhance invasiveness of Cryptosporidium spp. into cultured cells. Infection and Immunity. 74 (6), 3342-3346 (2006).
  17. O’Connor, R. M., Kim, K., Khan, F., Ward, H. Expression of Cpgp40/15 in Toxoplasma gondii: a surrogate system for the study of Cryptosporidium glycoprotein antigens. Infection and Immunity. 71, 6027-6034 (2003).
  18. Wilke, G., et al. Monoclonal Antibodies to Intracellular Stages of Cryptosporidium parvum Define Life Cycle Progression In Vitro. mSphere. 3 (3), (2018).
  19. Vinayak, S., et al. Genetic modification of the diarrhoeal pathogen Cryptosporidium parvum. Nature. 523 (7561), 477-480 (2015).
  20. Dijkstra, K. K., et al. Generation of Tumor-Reactive T Cells by Co-culture of Peripheral Blood Lymphocytes and Tumor Organoids. Cell. 174 (6), 1586-1598 (2018).

Play Video

Cite This Article
Dutta, D., Heo, I., O’Connor, R. Studying Cryptosporidium Infection in 3D Tissue-derived Human Organoid Culture Systems by Microinjection. J. Vis. Exp. (151), e59610, doi:10.3791/59610 (2019).

View Video