אנו מציגים פרוטוקולים מפורטים לביצוע ניסויים קטנים בזווית רנטגן באמצעות שרירי השלד בעכבר ללא שינוי. בעזרת הזמינות הרחבה של דגמי העכבר הטרנסגניים למחלות אנושיות, פלטפורמה ניסיונית זו יכולה ליצור מיטת בדיקה שימושית להסבר בסיס מבני של מחלות שרירים גנטיות
מודלים העכבר הטרנסגניים היו כלים חשובים ללימוד הקשר של גנוטיפ כדי פניטיפים עבור מחלות האדם כולל אלה של שריר השלד. שריר השלד העכבר הוכח לייצר באיכות גבוהה X-ray עקיפה דפוסי על הדור השלישי סינכרוטרון beamlines מתן הזדמנות לקשר שינויים ברמה של גנוטיפ לפנוטיפים פונקציונליים בבריאות ומחלה על ידי קביעת ההשלכות המבבניות של שינויים גנטיים. אנו מציגים פרוטוקולים מפורטים להכנת דגימות, איסוף דפוסי רנטגן ומיצוי פרמטרים רלוונטיים מבניים מדפוסי רנטגן שעשויים לסייע להנחות ניסויים לבצע ניסויים כאלה לעצמם.
סינכרוטרון קטן זווית X-ray עקיפה היא שיטת הבחירה עבור לימוד מבנה ננומטר בקנה מידה של הכנות באופן פעיל ההכנות שרירים בתנאים פיסיולוגיים. חשוב מכך, מידע מבני מהחיים או ההכנות לשרירי העור ניתן להשיג בסנכרון עם נתונים פיזיולוגיים, כגון כוח השריר ושינויי אורך. יש כבר עניין גובר על יישום טכניקה זו כדי ללמוד את הבסיס המבני של מחלות שרירים תורשתית כי יש בסיס שלהם מוטציות נקודה בחלבונים sarcomeric. הקהילה ביופיזיקה שרירים היתה פעילה מאוד ביצירת מודלים העכבר הטרנסגניים עבור מצבים אלה המחלה האנושית שיכול לספק מיטות בדיקה אידיאלית למחקרים מבניים. הפרסומים האחרונים של הקבוצה שלנו1,2,3 ואחרים4,5 הראו כי דפוסי רנטגן של העכבר פושט השרירים הארוך (אדי) ושרירי הסוליה יכולים לספק את כל ה מידע עקיפה זמין אורגניזמים מסורתיים יותר מודל כגון צפרדע וארנבת psoas שריר השלד. יתרון של הכנה השלד שריר העכבר הוא הקלות של הניתוח וביצוע ממברנה בסיסית-שלמים, ניסויים פיזיולוגיים שרירים שלמים. הממדים של השריר גזור יש מספיק מסה כדי להניב דפוסי שריר מפורטים מאוד בזמני חשיפה קצרים מאוד רנטגן (~ אלפית שניה לכל מסגרת) על הדור השלישי רנטגן beamlines.
דפוסי עקיפה של רנטגן שרירים מורכבים של הרהורים המשוונית, השתקפויות meridional, כמו גם את השתקפות קו השכבה. יחס האינטנסיביות המשוונית (יחס של האינטנסיביות של 1, 1 ו-1, 0 הרהורים המשוונית, אני11/i10), הוא מתואם באופן צמוד למספר הגשרים המצורפים, אשר פרופורציונאלית לכוח שנוצר בשריר השלד העכבר 2. הרהורים meridional המדווחים על פרידיערים בתוך חוטים עבים ודקים יכולים לשמש להערכת הרחבה פילמנט1,3,6,7. תכונות עקיפה לא על המרידיאן ואת קו המשווה נקראים קווי שכבה, אשר נובעים רירן ראשים המסודרת בקירוב על פני השטח של חוט השדרה עבה, כמו גם חוטים דקים בקירוב המסודרת. העוצמה של קווי רירן שכבה קשורה קשר הדוק לדרגת ההזמנה של ראשי רירן בתנאים שונים2,8. כל מידע זה ניתן להשתמש במחקר התנהגויות של חלבונים sarcomeric באתרו בריאות ומחלות.
סינכרוטרון X-ray עקיפה של השריר כבר נעשה היסטורית על ידי צוותי מומחים מאוד מיוחדים אך התקדמות בטכנולוגיה וזמינות של כלי הפחתת נתונים חדשים מצביעים על כך לא צריך תמיד להיות במקרה. BioCAT Beamline 18 ID במקור פוטון מתקדם, המעבדה הלאומית ארגוננה הקדיש צוות ותמיכה מתקנים לביצוע ניסויים שרירים לעקיפה רנטגן שיכולים לעזור למצטרפים חדשים לשדה להתחיל באמצעות טכניקות אלה. משתמשים רבים בוחרים לשתף פעולה באופן רשמי עם צוות BioCAT, אבל מספר גדל והולך של משתמשים למצוא שהם יכולים לעשות את הניסויים וניתוח עצמם להפחית את הנטל על צוות beamline. המטרה העיקרית של הנייר הזה היא לספק הכשרה המספקת ניסויים פוטנציאליים עם המידע שהם צריכים לתכנן ולבצע ניסיונות על מערכת שריר השלד של העכבר או ב biocat beamline או ב השטף הגבוה אחרים beamline ברחבי ה עולם שבו. הניסויים האלה יהיו אפשריים
פרסומים אחרונים מהקבוצה שלנו הראו כי X-ray דפוסי משריר השלד העכבר ניתן להשתמש כדי לשפוך אור על מידע מבניים sarcomeric משריר בריאות ומחלה1,2,3 במיוחד עם הזמינות מוגברת של מודלים העכבר גנטית שונה עבור myopathies שונים. מחקרים מכניים ברזולוציה גבוהה על סיבים בודדים או צרורות קטנים בשילוב עם עקיפה רנטגן הטוב ביותר נעשה על ידי מומחים. אם, עם זאת, מידע מכני צנוע יותר יספיק למטרותיך, הכנת השריר כולו מאפשר אוסף של דפוסי רנטגן מפורטים מתוך הכנה פשוטה.
ניתוח נקי הוא המפתח לניסוי. מכני ורנטגן מוצלח חשוב מאוד לא למשוך את השריר היעד, כמו גם שרירים אחרים הקשורים שרירי הסוליה או אדי במהלך הניתוח מאז זה יכול לקרוע חלקים של השריר ולהוביל כוח מופחת. זה יכול גם להוביל מבנה פנימי פגום כי לבזות את דפוסי רנטגן. מאז הכל יהיה לפזר את קרן רנטגן, חשוב לנקות כל שומן נוסף, את הקולגן ב fascia, כמו גם שערות או פיסות רופף של רקמות תוך כדי לעשות את הפרוטוקול הבא. כדי להקטין את התאימות הנוספת בהכנת השריר, חשוב גם לקשור את הגידים בצורה מאובטחת ווים, קרוב ככל האפשר לגוף השריר מבלי להזיק לו.
זמני חשיפה שונים של קרני רנטגן יכולים לספק סוגים שונים של מידע מאותו שריר. באמצעות קרן מלא על 18 ID, דפוס המשוונית analyzable ניתן לקבל בחשיפה 1 ms (ראה איור 2ד). עבור analyzable first רירן שכבת השתקפות קו, 10 ms זמן חשיפה כוללת נדרש בדרך כלל. כדי לאסוף הרהורים meridional הסדר גבוה כגון M15 (2.8 nm רירן meridional השתקפות) ו 2.7 ננומטר אקטין meridional השתקפות, בדרך כלל לפחות 1 s החשיפה הכוללת נדרשת אבל יותר 2 החשיפה הכוללת מומלצת לדיוק גבוה דידות.
הבחירה של גלאי הרנטגן האופטימלי לניסוי היא חשובה. עבור תבניות רנטגן המפורט ביותר מזהה CCD מותאם אישית, כגון אחד ב biocat עם ca. 40 יקרומטר פיקסלים ו ~ 65 יקרומטר נקודת התפשטות הפונקציות זרחן, יכול לספק דפוסים עם טווח דינמי גבוה ורזולוציה מרחבית טובה אבל יכול לקחת רק מסגרת אחת בכל פעם. עבור ניסויים בזמן שנפתרו, הפוטון סופר מערך פיקסל גלאי ב BioCAT יכול לאסוף תבניות רנטגן ב 500 Hz. הגודל 172 יקרומטר פיקסל עם גלאי זה, עם זאת, אינו מספק רזולוציה מרחבית מספיק עבור מחקרים מפורטים של החלק הפנימי של מרידיאן אבל הוא הולם למטרות אחרות ביותר. Biocat רכשה גלאי הפוטון ברזולוציה גבוהה המספקת 75 יקרומטר ברזולוציה אמיתית בקצב הפריימים המקסימלי של 9,000 Hz. גלאים דומים מסוג זה צפויים לעבור הגלאים הנוכחי עבור לימודי שרירים במהלך השנים הקרובות.
עם פלקסים גבוהים מאוד של קרני רנטגן בsynchrotrons דור שלישי, נזק הקרינה היא דאגה רצינית. זו תמיד בחירה טובה כדי להחליש את הקרן כדי לספק לא יותר קרן מאשר צריך להתבונן בתכונות עקיפה הרצוי. החשיפה הכוללת של קרני רנטגן יכולה להיות מושגת על ידי הארכת זמן החשיפה מקורה מחליש. יתרון של פוטון ספירת מערך פיקסל גלאי הוא כי מסגרות בודדות ניתן לסכם יחד עם עונש לא רעש. גם אז, נזק לקרינה אפשרי. סימנים של נזק הקרינה כולל ירידה של כוח מירבי של התכווצות, מריחת שכבה קו השתקפויות, אפילו שינוי של צבע שריר.
אחת המגבלות של הכנה שריר השלד שרירי העכבר הוא הקושי בהשגת אורך סרקומר מן השריר שלמים במהלך הניסויים. השרירים עבים מדי עבור מיקרוסקופ וידאו ועקיפה לייזר. בעוד עם התפתחויות עתידיות זה יכול להיות אפשרי להעריך את אורך סרקומר ישירות מדפוסי עקיפה14, בטווח הקרוב האפשרות היחידה היא למדוד את זה אחרי הניסוי כפי שמתואר כאן.
The authors have nothing to disclose.
מחקר זה משמש משאבים של מקור פוטון מתקדם, ארה ב. משרד האנרגיה (DOE) המשרד של מתקן משתמש המדע מופעל עבור המשרד DOE של המדע על ידי המעבדה הלאומית של ארגוננה תחת חוזה לא. דה-AC02-06CH11357. פרויקט זה היה נתמך על ידי גרנט P41 GM103622 מן המכון הלאומי למדעי הרפואה הכללית של המכון הלאומי לבריאות. השימוש של מכונת הפילאטוס 3 1M גלאי סופק על ידי הענקת 1S10OD018090-01 מתוך כמיאמים. התוכן הוא רק באחריות המחברים ואינו משקף בהכרח את ההשקפות הרשמיות של המכון הלאומי למדעי הרפואה הכללית או המוסדות הלאומיים לבריאות.
#5 forceps | WPI | 500342 | |
4/0 surgical suture | Braintree Sci | SUT-S 108 | |
aquarium air stone | uxcell | a regular air stone from a pet store would be fine | |
CaCl2 | Sigma-Aldrich | C5670 | |
CCD detector | Rayonix Inc | MAR 165 CCD | |
data accquisition system | Aurora Scientific Inc | 610A | |
elastomer compound | Dow Corning | Sylgard 184 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
High resolution photon counting detector | Dectris Inc | EIGER X 500K | |
high-power bi-phasic current stimulator | Aurora Scientific Inc | 701 | |
Iris Scissors | WPI | 501263-G | |
KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
MgSO4 | Sigma-Aldrich | M7506 | |
micro scissor | WPI | 503365 | |
motor/force transducer | Aurora Scientific Inc | 300C-LR | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888 | |
petri-dish | Sigma-Aldrich | CLS430167 | |
photon counting detector | Dectris Inc | Pilatus 3 1M | |
Stainless Steel wire | McMaster-carr | 8908K21 | |
Suture Tying Forceps | WPI | 504498 | |
Video sarcomere length measuring system | Aurora Scientific Inc | 900B |