We presenteren gedetailleerde protocollen voor het uitvoeren van Small-angle röntgendiffractie experimenten met behulp van intact muis skeletspieren. Met de brede beschikbaarheid van transgene muismodellen voor menselijke ziekten, kan dit experimentele platform een nuttig testbed vormen om de structurele basis van genetische spierziekten te verhelderend
Transgene muismodellen zijn belangrijke hulpmiddelen geweest voor het bestuderen van de relatie van genotype tot fenotype voor menselijke ziekten, waaronder die van de skeletspieren. Muis skeletspier is aangetoond dat het produceren van hoge kwaliteit X-Ray diffractie patronen op de derde generatie Synchrotron lijnen bieden de mogelijkheid om veranderingen op het niveau van het genotype te koppelen aan functionele fenotypes in gezondheid en ziekte door te bepalen de structurele gevolgen van genetische veranderingen. We presenteren gedetailleerde protocollen voor de bereiding van specimens, het verzamelen van de Röntgen patronen en het extraheren van relevante structurele parameters uit de Röntgen patronen die kunnen helpen bij het begeleiden van onderzoekers die dergelijke experimenten voor zichzelf willen uitvoeren.
Synchrotron Small-angle X-Ray diffractie is de methode van keuze voor het bestuderen van de nm-schaal structuur van actieve contracterende spier preparaten onder fysiologische omstandigheden. Belangrijk is dat structurele informatie van levende of gevilde spier preparaten kan worden verkregen in Synchrony met fysiologische gegevens, zoals spierkracht en lengte veranderingen. Er is steeds meer belangstelling voor het toepassen van deze techniek om de structurele basis te bestuderen van erfelijke spierziekten die hun basis hebben in puntmutaties in sarcomerische eiwitten. De spier biofysica Gemeenschap is zeer actief in het genereren van transgene muismodellen voor deze menselijke ziekte omstandigheden die ideale test bedden voor structurele studies kunnen bieden. Recente publicaties van onze groep1,2,3 en andere4,5 hebben aangegeven dat de Röntgen patronen van de muis extensor digitorum Longus (EDL) en soleus-spieren alle diffractie informatie beschikbaar van meer traditionele model organismen zoals kikker en konijn Fes skeletspieren. Een voordeel van de muis skeletspieren voorbereiding is het gemak van dissectie en het uitvoeren van elementaire membraan-intact, hele spier fysiologische experimenten. De afmetingen van de ontleed spier hebben voldoende massa om zeer gedetailleerde spier patronen te leveren in zeer korte blootstellings tijden van röntgenstralen (~ milliseconde per frame) op de derde generatie X-Ray beamlines.
Spier röntgendiffractie patronen bestaan uit de equatoriale reflecties, de Meridionale reflecties en de laag lijn reflecties. De equatoriale intensiteits ratio (ratio van de intensiteit van de 1, 1 en 1,0 equatoriale reflecties, I11/i10), is nauw gecorreleerd met het aantal bijgevoegde dwars bruggen, dat evenredig is aan de kracht die wordt gegenereerd in de skeletspieren van de muis 2. de Meridionale reflecties die de periodenheid van de dikke en dunne filamenten rapporteren, kunnen worden gebruikt om de filament uitbreidbaarheid te schatten1,3,6,7. Diffractie-functies die niet op de meridiaan en de evenaar staan, worden laag lijnen genoemd, die voortvloeien uit de ongeveer helisch geordende myosin-koppen op het oppervlak van dikke filament ruggengraat, evenals de ongeveer helisch geordende dunne filamenten. De intensiteit van myosin laag lijnen is nauw verwant aan de mate van ordening van myosin hoofden onder verschillende omstandigheden2,8. Al deze informatie kan worden gebruikt onderzoek het gedrag van sarcomeric eiwitten in situ in gezondheid en ziekte.
Synchrotron röntgendiffractie van de spier is historisch gedaan door teams van zeer gespecialiseerde deskundigen, maar vooruitgang in de technologie en de beschikbaarheid van nieuwe datareductie tools geven aan dat dit niet altijd het geval hoeft te zijn. De BioCAT Beamline 18ID bij de Advanced photon source heeft het Argonne National Laboratory toegewijde staf-en ondersteuningsfaciliteiten voor het uitvoeren van spier röntgendiffractie-experimenten die nieuwkomers in het veld kunnen helpen om aan de slag te gaan met het gebruik van deze technieken. Veel gebruikers kiezen formeel samen te werken met BioCAT-medewerkers, maar een toenemend aantal gebruikers vindt dat ze de experimenten en analyses zelf kunnen uitvoeren om de lasten op beamline-medewerkers te verminderen. Het primaire doel van dit artikel is om training te bieden die potentiële experimenteurs voorziet van de informatie die ze nodig hebben om experimenten op het skeletspier systeem van de muis te plannen en uit te voeren, hetzij op de biocat beamline of bij andere hoge flux lijnen rond de wereld waar deze experimenten mogelijk zouden zijn.
Recente publicaties van onze groep toonde aan dat Röntgen patronen van de muis skeletspieren kunnen worden gebruikt om licht te werpen op sarcomeric structurele informatie van spier in gezondheid en ziekte1,2,3 vooral met de toegenomen beschikbaarheid van genetisch gemodificeerde Muismodellen voor verschillende myopathieën. Hoge resolutie mechanische studies op enkelvoudige vezels of kleine bundels gecombineerd met röntgendiffractie is best gedaan door experts. Als, echter, meer bescheiden mechanische informatie zal volstaan voor uw doeleinden, de hele spier voorbereiding maakt het verzamelen van gedetailleerde Röntgen patronen van een eenvoudige voorbereiding.
Een clean dissectie is de sleutel tot een succesvol gecombineerd mechanisch en Röntgen experiment. Het is zeer belangrijk niet te trekken op de doel-spier, alsmede andere spieren in verband met de soleus of EDL spieren tijdens dissectie omdat dit kan scheuren delen van de spier en leiden tot verminderde kracht. Het kan ook leiden tot beschadigde interne structuur die de Röntgen patronen zal degraderen. Aangezien alles in de röntgenstraal zal verstrooien, is het belangrijk om elk extra vet, het collageen in de fascia en alle haren of losse stukjes weefsel weg te poetsen terwijl u het volgende protocol doet. Om extra compliance in de spier bereiding te verminderen, is het ook belangrijk om de pezen veilig aan de haken te binden, zo dicht mogelijk bij het spier lichaam zonder het te beschadigen.
Verschillende X-Ray blootstellings tijden kunnen verschillende soorten informatie van dezelfde spier bevatten. Met behulp van de volledige bundel op 18ID, kan een analyseerbaar equatoriale patroon worden verkregen in een blootstelling van 1 MS (Zie Figuur 2D). Voor een analyseerbaar eerste myosin laag lijn reflectie, is een totale blootstellingstijd van 10 MS meestal vereist. Om een hogere orde Meridionale reflecties te verzamelen, zoals de M15 (2,8 nm myosin Meridionale reflectie) en de 2,7 nm actine Meridionale reflectie, is doorgaans ten minste 1 s totale blootstelling vereist, maar meer dan 2 s totale blootstelling wordt aanbevolen voor hoge nauwkeurigheid Metingen.
De keuze van de optimale Röntgen detector voor het experiment is belangrijk. Voor de meest gedetailleerde Röntgen patronen kan een op maat gemaakte CCD-detector, zoals die bij BioCAT met ca. 40 μm pixels en ~ 65 μm punt spreidings functies in de fosfor, patronen bieden met een hoog dynamisch bereik en een goede ruimtelijke resolutie, maar kan slechts één frame tegelijk duren. Voor tijd opgeloste experimenten kan de foton Counting pixel array detector bij biocat X-Ray patronen verzamelen bij 500 Hz. De pixelgrootte van 172 μm met deze detector biedt echter niet voldoende ruimtelijke resolutie voor gedetailleerde studies van het binnenste gedeelte van de meridiaan, maar is geschikt voor de meeste andere doeleinden. BioCAT verwierf een high-resolution fotonen teldetector met een reële resolutie van 75 μm met een maximale framesnelheid van 9.000 Hz. soortgelijke detectoren van dit type worden verwacht dat ze de huidige detectoren voor spier studies in de komende jaren te supplanten.
Met de zeer hoge fluxen van röntgenstralen bij de derde generatie synchrotrons is stralings schade een ernstige zorg. Het is altijd een goede keuze om de bundel te verzachten om geen straal meer te leveren dan nodig is om de gewenste diffractie-functies te observeren. Dezelfde totale blootstelling aan röntgenstraling kan worden bereikt door de belichtingstijd te verlengen van een verzwakte straal. Een voordeel van foton tellen pixel array detectoren is dat individuele frames samen kunnen worden opgeteld zonder geluidsoverlast. Zelfs dan is stralings schade mogelijk. Tekenen van stralings schade omvat een daling van de maximale kracht van contractie, het uitsmeren van de laag lijn reflecties, zelfs verandering van spier kleur.
Een van de beperkingen van de intacte muis skeletspieren voorbereiding is de moeilijkheid in het verkrijgen van sarcomere lengte van de intact spier tijdens de experimenten. De spieren zijn te dik voor video microscopie en laserdiffractie. Terwijl met toekomstige ontwikkelingen kan het mogelijk zijn om sarcomere lengte direct te schatten uit de diffractie patronen14, in de nabije toekomst is de enige optie om het te meten na het experiment zoals hier beschreven.
The authors have nothing to disclose.
Dit onderzoek gebruikte middelen van de Advanced photon source, een Amerikaanse afdeling van het ministerie van energie van de v.s., die voor het DOE-kantoor van de wetenschap door Argonne National Laboratory werd geëxploiteerd onder contract nr. DE-AC02-06CH11357. Dit project werd gesteund door Grant P41 GM103622 van het National Institute of General Medical Sciences van de National Institutes of Health. Gebruik van de Pilatus 3 1M detector werd geleverd door Grant 1S10OD018090-01 van NIGMS. De inhoud is uitsluitend de verantwoordelijkheid van de auteurs en weerspiegelt niet noodzakelijkerwijs de officiële standpunten van het National Institute of General Medical Sciences of de National Institutes of Health.
#5 forceps | WPI | 500342 | |
4/0 surgical suture | Braintree Sci | SUT-S 108 | |
aquarium air stone | uxcell | a regular air stone from a pet store would be fine | |
CaCl2 | Sigma-Aldrich | C5670 | |
CCD detector | Rayonix Inc | MAR 165 CCD | |
data accquisition system | Aurora Scientific Inc | 610A | |
elastomer compound | Dow Corning | Sylgard 184 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | |
HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
High resolution photon counting detector | Dectris Inc | EIGER X 500K | |
high-power bi-phasic current stimulator | Aurora Scientific Inc | 701 | |
Iris Scissors | WPI | 501263-G | |
KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
MgSO4 | Sigma-Aldrich | M7506 | |
micro scissor | WPI | 503365 | |
motor/force transducer | Aurora Scientific Inc | 300C-LR | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888 | |
petri-dish | Sigma-Aldrich | CLS430167 | |
photon counting detector | Dectris Inc | Pilatus 3 1M | |
Stainless Steel wire | McMaster-carr | 8908K21 | |
Suture Tying Forceps | WPI | 504498 | |
Video sarcomere length measuring system | Aurora Scientific Inc | 900B |