Summary

Un modèle de souris non aléatoire pour la réactivation pharmacologique de Mecp2 sur le chromosome X inactif

Published: May 22, 2019
doi:

Summary

Ici, nous décrivons un protocole pour générer un modèle de murin femelle viable avec l’inactivation non aléatoire de chromosome x, c.-à-d. le chromosome x maternellement hérité est inactif dans 100% des cellules. Nous décrivons également un protocole pour tester la faisabilité, la tolérabilité et la sécurité de la réactivation pharmacologique du chromosome X inactif in vivo.

Abstract

L’inactivation des chromosomes x (XCI) est le silençage aléatoire d’un chromosome X chez les femelles pour atteindre l’équilibre posologique génique entre les sexes. En conséquence, toutes les femelles sont hétérozygotes pour l’expression génique liée au X. L’un des régulateurs clés de XCI est Xist, qui est essentiel pour l’initiation et la maintenance de XCI. Des études antérieures ont permis d’identifier 13 facteurs d’inactivation des chromosomes X (XCIFs) TRANS-agissant à l’aide d’un écran génétique à grande échelle et à perte de fonction. L’inhibition des XCIFs, tels que ACVR1 et PDPK1, à l’aide d’ARN à courte épingle à cheveux ou d’inhibiteurs de petites molécules, réactive les gènes liés aux chromosomes X dans les cellules cultivées. Mais il reste à déterminer la faisabilité et la tolérabilité de la réactivation du chromosome X inactif in vivo. Vers cet objectif, un modèle de souris Xistδ: Mecp2/Xist: Mecp2-GFP a été généré avec des XCI non aléatoires en raison de la suppression de Xist sur un chromosome X. À l’aide de ce modèle, l’étendue de la réactivation X inactive a été quantitée dans le cerveau de la souris après un traitement par des inhibiteurs de la XCIF. Les résultats récemment publiés montrent, pour la première fois, que l’inhibition pharmacologique de XCIFs réactive Mecp2 du chromosome X inactif dans les neurones corticaux du cerveau de la souris vivante.

Introduction

L’inactivation des chromosomes x (XCI) est un processus de compensation de dosage qui équilibre l’expression génique liée au X en faisant taire une copie du chromosome X chez les femelles1. En conséquence, le chromosome X inactif (XI) accumule les caractéristiques caractéristiques de l’hétérochromatine, y compris la méthylation de l’ADN et les modifications inhibitrices de l’histone, telles que la triméthylation de l’histone H3-lysine 27 (H3K27me3) et l’ubiquitination de l’histone H2A (H2Aub) 2. le régulateur principal du silençage de chromosome x est la région du centre d’inactivation x (XIC), autour de 100 − 500 kb, qui contrôle le comptage et l’appariement des chromosomes x, le choix aléatoire du chromosome x pour l’inactivation, et l’initiation et propagation du silençage le long du chromosome X3. Le processus d’inactivation de X est initié par X transcription spécifique inactive (Xist) qui recouvre le XI dans CIS pour médiate le silençage à l’échelle du chromosome et remodeler la structure tridimensionnelle du chromosome x4. Récemment, plusieurs écrans protéomiques et génétiques ont identifié des régulateurs supplémentaires de XCI, tels que les protéines interdépendantes Xist 5,6,7,8,9 , le 10 , le 11 , 12. par exemple, une étude antérieure utilisant un écran d’interférence d’ARN à l’échelle du génome non biaisé a identifié 13 facteurs XCI TRANS-agissant (xcifs)12. Mécanistiquement, XCIFs réguler l’expression Xist et, par conséquent, interférer avec la fonction xcifs provoque défectueux XCI12. Ensemble, les progrès récents dans le domaine ont fourni des informations importantes sur la machinerie moléculaire qui est nécessaire pour initier et maintenir XCI.

L’identification des régulateurs XCI et la compréhension de leur mécanisme dans XCI est directement pertinente pour les maladies humaines liées aux X, comme le syndrome de Rett (RTT)13,14. La RTT est un trouble neurodéveloppemental rare provoqué par une mutation hétérozygote dans la protéine de liaison méthyl-CpG 2 (MeCP2) liée aux X qui touche principalement les filles15. Parce que MeCP2 est situé sur le chromosome X, les filles de RTT sont hétérozygotes pour la carence de MECP2 avec ~ 50% cellules exprimant le type sauvage et ~ 50% exprimant le mutant MeCP2. Notamment, les cellules mutantes RTT abritent une copie dormante mais sauvage de Mecp2 sur le XI, fournissant une source du gène fonctionnel, qui, si réactivé, pourrait potentiellement atténuer les symptômes de la maladie. En plus de la RTT, il existe plusieurs autres maladies humaines liées à X, pour lesquelles la réactivation de XI représente une approche thérapeutique potentielle, comme le syndrome de DDX3X.

L’inhibition du XCIFs, de la protéine kinase-1 (PDPK1) dépendante du 3-phosphoinositide et du récepteur de type 1 (ACVR1) de l’activine A, soit par l’ARN court en épingle à cheveux (shRNA), soit par des inhibiteurs de petites molécules, réactive les gènes liés au XI12. La réactivation pharmacologique des gènes liés au XI est observée dans divers modèles ex vivo incluant des lignées cellulaires de fibroblastes de souris, des neurones corticaux de souris adultes, des fibroblastes embryonnaires de souris et des lignées cellulaires de fibroblastes dérivées d’un patient de RTT12. Toutefois, il reste à démontrer si la réactivation pharmacologique des gènes liés au XI est réalisable in vivo. L’un des facteurs limitatifs est l’absence de modèles animaux efficaces pour mesurer avec précision l’expression des gènes du XI réactivé. Vers cet objectif, un modèle de souris Xistδ: Mecp2/Xist: Mecp2-GFP a été généré qui porte un Mecp2 génétiquement étiqueté sur XI dans toutes les cellules en raison de la suppression hétérozygote dans Xist sur le chromosome X maternel16. Utilisant ce modèle, l’expression de Mecp2 de XI a été quantitée après traitement avec des inhibiteurs de xcifs dans le cerveau des souris vivantes. Ici, la génération du modèle et de la méthodologie de la souris Xistδ: Mecp2/Xist: Mecp2-GFP pour quantifier la réactivation XI dans les neurones corticaux à l’aide d’essais à base d’immunofluorescence est décrite.

Protocol

Le travail impliquant des souris a été approuvé par le Comité d’utilisation et de protection des animaux de l’Université de Virginie (IACUC; #4112). 1. générer un modèle de souris XCI non aléatoire avec génétiquement étiqueté Mecp2 sur XI Remarque: Les souches de souris utilisées dans l’étude étaient les suivantes: Mecp2-GFP/Mecp2-GFP (Mecp2TM 3.1 Bird, table des matières) e…

Representative Results

Pour démontrer la faisabilité du modèle de souris Xistδ: Mecp2/Xist: Mecp2-GFP pour les études de réactivation XI, la réactivation induite par l’inhibiteur de la xcif du Mecp2-GFP lié au XI a été testée dans des fibroblastes embryonnaires de souris (MEFs). Les MEFs femelles ont été isolées du jour 15,5 Xistδ: Mecp2/Xist: Mecp2-GFP embryons comme décrit dans la section 3 (figure 1a). Les génotypes de la femelle Xistδ: Mecp…

Discussion

Auparavant, les XCIFs qui sont sélectivement requis pour le silençage des gènes liés au XI dans les cellules femelles de mammifères ont été identifiés12. Nous avons également optimisé les puissants inhibiteurs de petites molécules pour cibler les XCIFs, tels que les ACVR1 et les effecteurs en aval de PDPK1, qui réactivent efficacement les Mecp2 liées aux XI dans les lignées cellulaires de fibroblastes de souris, les neurones corticaux de souris et une cellule de fibroblastes…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Les auteurs remercient Antonio Bedalov d’avoir fourni des réactifs; Université de Virginia tissue Histology Core pour la cryosectionnement; Université de Virginie flux cytométrie de base pour l’analyse de cytométrie en flux; Christian Blue et Saloni Singh pour l’assistance technique au génotypage. Ce travail a été appuyé par une subvention de recherche double Hoo à Z.Z., et un prix du programme pilote de projet du prix de l’Université de Virginia-Virginia Tech Seed Fund et le prix de recherche biomédicale individuelle de la Fondation Hartwell à

Materials

MICE
Mecp2tm3.1Bird The Jackson Laboratory #014610
B6;129-Xist (tm5Sado) provided by Antonio Bedalov, Fred Hutchinson Cancer Center, Seattle
REAGENTS
22×22 mm coverslip FISHERfinest (Fisher Scientific) 125488
32% Paraformaldehyde Electron Microscopy Sciences 15714-S
50 ml syringe Medline Industries NPMJD50LZ
60mm culture dish CellStar 628160
7-AAD BioLegend 420403
ammonium chloride (NH4Cl) Fisher Chemical A661-3
anti-GFP-AlexaFluor647 Invitrogen A-31852
anti-MAP2 Aves Labs MAP
BSA Promega R396D
Buprenorphine SR Zoopharm
citric acid Sigma C-1857
DMSO Fisher Bioreagents BP231-100
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) Corning Cellgro 10-013-CV
Ethanol Decon Labs 2701
fetal bovine serum (FBS) VWR Life Science 89510-198
gelatin Sigma-Aldrich G9391
glass slides Fisherbrand 22-034-486
goat anti-chicken FITC-labeled secondary antibody Aves Labs F-1005
GSK650394 ApexBio B1051
hamilton 10μl syringe Hamilton Sigma-Aldrich 28615-U
Hank's Balanced Salt Solution (HBSS) Gibco 14025-092
Ketamine Ketaset NDC 0856-2013-01
Large blunt/blunt curved scissors Fine Science Tools 14519-14
LDN193189 Cayman Chemicals 11802
lodixanol Sigma 1343517
magnesium chloride (MgCl2) Fisher Chemical M35-212
Methylcelulose Sigma M0262-100G
mounting medium with DAPI Vectashield H-1200
Needle tip, 26 GA x 1.25" PrecisionGlide 305111
ophthalmic ointment Refresh Lacri-Lube 93468
optimal cutting temperature (O.C.T.) ThermoFisher
PCR mix
Penicillin/Streptomycin (Pen/Strep) Corning 30-002-Cl
Phosphate buffered saline pH 7.4 (PBS) Corning Cellgro 46-103-CM
Potassium chloride (KCl) Fisher Scientific P330-500
scalpel blades
Shallow glass or plastic tray
skin glue/tissue adhesive 3M Vetbond 1469SB
sodium azide Fisher Scientific CAS 26628-22-8
Sodium chloride (NaCl) Fisher Chemical S642-212
standard hemostat forceps Fine Science Tools 13013-14
Standard tweezers Fine Science Tools 11027-12
Straight iris scissors Fine Science Tools 14058-11
sucrose Fisher Scientific BP220-1
Tris-base Fisher Bioreagents BP152-5
Triton X-100 Fisher Bioreagents BP151-500
Trypsin-EDTA Gibco 15400-054
Xylazine Akorn NDC: 59399-111-50
EQUIPMENT
Zeiss AxioObserver Live-Cell microscope Zeiss Zeiss AxioObserver
0.45mm burr IDEAL MicroDrill 67-1000
BD FACScalibur
centrifuge
glass homogenizer
cell culture incubator Thermo Scientific HERACELL VIOS 160i 13-998-213
Leica 3050S research cryostat
stereotactic platform
thermocycler
Timer
ultracentrifuge Beckman Coulter Optima L-100 XP
Water bath (37 ºC) Fisher Scientific Isotemp 2239

References

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Cite This Article
Przanowski, P., Zheng, Z., Wasko, U., Bhatnagar, S. A Non-random Mouse Model for Pharmacological Reactivation of Mecp2 on the Inactive X Chromosome. J. Vis. Exp. (147), e59449, doi:10.3791/59449 (2019).

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