Summary

iPSC由来筋前駆体におけるジストロフィン発現の回復に関するCRISPR/Cas9技術

Published: September 14, 2019
doi:

Summary

ここでは、Dmdmdxマウス由来皮膚線維芽細胞からiPSC中のジストロフィン発現を復元し、Tet-on MyoD活性化システムを用いてiPSCを筋原性前駆細胞(MPC)に直接分化させるCas9ベースのexon23欠失プロトコルを提示する。

Abstract

デュシェンヌ筋ジストロフィー(DMD)は、ジストロフィン遺伝子の突然変異によって引き起こされる重度の進行性筋疾患であり、最終的には筋前駆細胞の枯渇につながる。クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリドロミックリピート/CRISPR関連9(CRISPR/Cas9)遺伝子編集は、ジストロフィン遺伝子の発現を回復させる可能性を有する。自家誘導多能性幹細胞(iPSC)由来の筋肉前駆細胞(MPC)は、幹/前駆細胞プールを補充し、損傷を修復し、免疫応答を引き起こさずにDMDのさらなる合併症を防ぐことができます。本研究では、CRISPR/Cas9と非統合iPSC技術を組み合わせて、回復したジストロフィンタンパク質発現を持つ筋肉前駆体を得ることを紹介する。簡単に言えば、非積分センダイベクターを用いて、Dmdmdxマウスの真皮線維芽細胞からiPSCラインを確立する。次に、CRISPR/Cas9欠失戦略を使用して、再フレームされたジストロフィン遺伝子の非相同末結合を通じてジストロフィン発現を回復させます。94個のピックiPSCコロニーから3つのコロニーにおけるexon23枯渇のPCR検証後、筋分化の調節に重要な役割を果たす重要な転写因子であるMoDのドキシサイクリン(Dox)誘導発現により、iPSCをMPCに分化する。我々の結果は、DMD治療のための将来の治療法を開発する上で大きな可能性を有するiPSC由来MPCにおけるジストロフィン発現を回復させるためにCRISPR/Cas9欠失戦略を用いることを可能にすることを示した。

Introduction

デュシェンヌ筋ジストロフィー(DMD)は、最も一般的な筋ジストロフィーの一つであり、ジストロフィンの不在によって特徴付けられており、世界中の約5,000人の新生児の1人に影響を与える。ジストロフィン遺伝子機能の喪失は、進行性筋線維変性1、2につながる構造的な筋肉欠損をもたらす。組換えアデノ関連ウイルス(rAAV)媒介遺伝子治療システムは、ジストロフィン発現を回復させ、マイクロジストロフィン(μ-Dys)を用いて遺伝子置換などの筋肉機能を改善するために試験された。しかしながら、rAAVアプローチは、機能性タンパク質3、4の発現を維持するために繰り返し注射を必要とする。したがって、DMD患者においてジストロフィン遺伝子発現を効果的かつ永続的に回復できる戦略が必要である。DMDのマウスモデルであるDmdmdxマウスは、早期終了コドンを導入するジストロフィン遺伝子のエキソン23に点変異を有し、C末端ジストログリカン結合ドメインを欠く非機能的切り捨てタンパク質をもたらす。最近の研究は、小・大型動物5、6、7における正確な遺伝子矯正または変異性エキソン欠失によるジストロフィン遺伝子発現を回復させるCRISPR/Cas9技術の使用を実証した。Long et al.8は、相同性修復(HDR)ベースのCRISPR/Cas9ゲノム編集によりDmdmdxマウス生殖細胞系におけるジストロフィン遺伝子変異を修正する方法を報告した。El Refaey et al.9は、rAAVがジストロフィーマウスで変異型エキソン23を効率的に排除できると報告した。これらの研究では、gRNAは、非相同末端接合(NHEJ)を介してDNA修復後にジストロフィン発現を部分的に回復させた二本鎖DNA切断を引き起こすために、イントロン20および23で設計された。さらにエキサイティングな、Amoasii et al.10は最近、イヌモデルにおけるジストロフィン発現の復元におけるrAAV媒介性CRISPR遺伝子編集の有効性と実現可能性を報告した。

DMDはまた、幹細胞障害11を引き起こす。筋肉の損傷のために, 住宅の筋肉幹細胞は、筋肉分化後に死にかけている筋肉細胞を補充します。.しかしながら、損傷および修復の連続したサイクルは、筋幹細胞12におけるテロメアの短縮、および幹細胞プール13、14の早期枯渇につながる。したがって、自家幹細胞療法とジストロフィン発現を回復させるゲノム編集の組み合わせは、DMDを治療するための実用的なアプローチでありうたることができる。CRISPR/Cas9技術は、機能的な筋肉再生のための自己的に修正された多能性幹細胞(iPSC)を生成し、免疫拒絶反応を引き起こさずにDMDのさらなる合併症を防ぐ可能性を提供します。しかし、iPSCは腫瘍形成のリスクがあり、筋原性前駆細胞へのiPSCの分化によって緩和される可能性がある。

このプロトコルでは、非統合センダイウイルスを用いてDmdmdxマウスの真皮線維芽細胞をiPSCに再プログラミングし、CRISPR/Cas9ゲノム欠失によりジストロフィン発現を回復することを説明する。ジェノタイピングによるiPSCにおけるExon23欠失の検証後、筋染発性筋原分化によりゲノム補正iPSCを筋原性前駆体(MPC)に分化した。

Protocol

すべての動物の取り扱いと外科的処置は、オーガスタ大学機関動物ケアおよび使用委員会(IACUC)によって承認されたプロトコルによって行われました。マウスに標準食と水のアドリビタムを与えた。 1. 成体Dmdmdxマウスからの一次マウス線維芽細胞の単離 ジョージア州立医科大学(オーガスタ大学)が承認したIACUCに従い、CO2窒息および胸部切診により…

Representative Results

dmdmdx皮膚線維芽細胞由来iPSCの確立我々は、統合フリーのリプログラミングベクターを用いてDmdmdxマウス由来皮膚線維芽細胞からマウスiPSCを生成する効率を実証した。図1Aは、感染後3週間で胚性幹細胞(ESC)様コロニーの出現を実証した。生きたアルカリホスファターゼ(AP)染色によるiPSC誘導の効率を評価する。図1B</strong…

Discussion

デュシェンヌ筋ジストロフィー(DMD)は、ジストロフィンの欠如を特徴とする破壊的で最終的に致命的な遺伝性疾患であり、進行性筋萎縮症1、2を引き起こす。我々の結果は、CRISPR/Cas9媒介exon23欠失のアプローチにより、Dmdmdx iPSC由来筋原性前駆細胞におけるジストロフィン遺伝子発現の回復を実証した。この方法には 3 つの利点があります。<…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

タンとワイントラウブは、NIH-AR070029、NIH-HL086555、NIH-HL134354によって部分的にサポートされました。

Materials

Surgical Instruments
31-gauge needle Various 
Sharp Incision Various 
Sterile Scalpels Various 
Tweezers Various 
Fibroblast medium (for 100 mL of complete medium) Company Catalog Number Volume
2-Mercaptoethanol (55 mM) Gibco 21-985-023 0.1 mL
Antibiotic Antimycotic Slution 100x CORNING MT30004CI 1 mL
Dulbecco's Modified Eagle's Medium – high glucose SIGMA D6429 87 mL
Fetal Bovine Serum Characterized HyClone SH30396.03 10 mL
L-Glutamine solution SIGMA G7513 1 mL
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x)  Gibco 11140076 1 mL
TVP solution (for 500 mL of complete solution) Company Catalog Number Volume
Chicken Serum Gibco 16110-082 5 mL
EDTA Sigma-Aldrich E6758 186 mg
Phosphat-buffered saline to 500 mL
Trypsin (2.5%) Thermo 15090046 5 mL
mES growth medium(for 500 mL of complete solution) Company Catalog Number Volume
2-Mercaptoethanol (55 mM) Gibco 21-985-023 0.5 mL
Antibiotic Antimycotic Slution 100x CORNING MT30004CI 5 mL
Dulbecco's Modified Eagle's Medium – high glucose SIGMA D6429 408.5 mL
Fetal Bovine Serum Characterized HyClone SH30396.03 75 mL
L-Glutamine solution SIGMA G7513 5 mL
Mouse recombinant Leukemia Inhibitory Factor (LIF), 0.5 x 106 U/mL EMD Millipore Corp CS210511 500 μL
MEK/GS3 Inhibitor Supplement EMD Millipore Corp CS210510-500UL 500 μL
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x)  Gibco 11140076 5 mL
The ES cell media should not be stored for more than 4 weeks and with inhibitors not more than 2 weeks.
mES frozen medium(for 50 mL of complete solution) Company Catalog Number Volume
Dimethyl sulfoxide (DMSO) SIGMA D2650 5 mL
Dulbecco's Modified Eagle's Medium – high glucose SIGMA D6429 24.9 mL
Fetal Bovine Serum Characterized HyClone SH30396.03 25 mL
Mouse recombinant Leukemia Inhibitory Factor (LIF), 0.5 x 106 U/mL EMD Millipore Corp CS210511 50 μL
Name of Material/ Equipment Company Catalog Number RRID
0.05% Trypsin/0.53 mM EDTA CORNING 25-052-CI
4% Paraformaldehyde Thermo scientific J19943-k2
Accutase solution SIGMA A6964 Cell detachment solution
AgeI-HF NEB R3552L
Alexa488-conjugated goat-anti-mouse antibody Invitrogen A32723 AB_2633275
Alexa488-conjugated goat-anti-rabbit antibody Invitrogen A32731 AB_2633280
Alexa555-conjugated goat-anti-rabbit antibody Invitrogen A32732 AB_2633281
anti-AFP Thermo scientific RB-365-A1 AB_59574
anti-α-Smooth Muscle Actin (D4K9N) XP CST 19245S AB_2734735
anti-Dystrophin Thermo PA5-32388 AB_2549858
anti-LIN28A (D1A1A) XP    CST 8641S AB_10997528
anti-MYH2 DSHB mAb2F7 AB_1157865
anti-Nanog-XP CST 8822S AB_11217637
anti-Oct-4A (D6C8T) CST 83932S AB_2721046
anti-Sox2 abcam ab97959 AB_2341193
anti-SSEA1(MC480)  CST 4744s AB_1264258
anti-TH (H-196) SANTA CRUZ  sc-14007 AB_671397
Alkaline Phosphatase Live Stain (500x) Thermo A14353
Blasticidin S Sigma-Aldrich 203350
BsmBI/Esp3I NEB R0580L/R0734L
Carbenicillin Millipore 205805-250MG
Collagenase IV  Worthington Biochemical Corporation LS004189
Competent Cells TakaRa 636763
CutSmart  NEB B7204S
CytoTune-iPS 2.0 Sendai Reprogramming Kit Thermo A16517
DirectPCR Lysis Reagent (cell) VIAGEN BIOTECH 302-C
Dispase (1 U/mL) STEMCELL Technologies 7923
Doxycycline Hydrochloride Fisher BioReagents BP26535
EcoRI-HF NEB R3101L
Fibronectin bovine plasma SIGMA F1141
 
QIAEX II Gel Extraction Kit (500)
QIAGEN 20051
Gelatin from porcine skin, type A SIGMA G1890
HardSet Antifade Mounting Medium with DAPI Vector H-1500
Hygromycin B (50 mg/mL) Invitrogen 10687010
Ketamine HCL Injection HENRY SCHEIN ANIMAL HEALTH 45822
KpnI-HF NEB R3142L
lenti-CRISPRv2-blast Addgene 83480
lenti-Guide-Hygro-iRFP670 Addgene 99377
Lipofectamin 3000 Transfection Kit Invitrogen L3000015
LV-TRE-VP64-mouse MyoD-T2A-dsRedExpress2   Addgene 60625
LV-TRE-VP16 mouse MyoD-T2A-dsRedExpress2 Addgene 60626
Mouse on Mouse (M.O.M.) Basic Kit Vector BMK-2202
NotI-HF NEB R3189L
Opti-MEM I Reduced Serum Media ThermoFisher 31985070
Polyethylene glycol 4,000 Alfa Aesar AAA161510B
Polybrene SIGMA TR1003
Corning BioCoat Poly-D-Lysine/Laminin Culture Slide CORNING CB354688
PowerUp SYBR Green Master Mix ThermoFisher A25742
PrimeSTAR Max Premix TakaRa R045
Proteinase K VIAGEN BIOTECH 507-PKP
Puromycin Dihydrochloride MP Biomedicals ICN19453980
qPCR Lentivirus Titration Kit abm LV900
Quick ligation kit NEB M2200S
QIAprep Spin Miniprep Kit (250) QIAGEN 27106
QIAGEN Plasmid Plus Midi Kit (100) QIAGEN 12945
RevertAid RT Reverse Transcription Kit Thermo scientific K1691
RNAzol RT Molecular Research Center, INC RN 190
T4 DNA Ligase Reaction Buffer NEB B0202S
T4 Polynucleotide Kinase NEB M0201S
Terrific Broth Modified Fisher BioReagents BP9729-600
ViralBoost Reagent (500x) ALSTEM VB100

References

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Cite This Article
Jin, Y., Shen, Y., Su, X., Weintraub, N., Tang, Y. CRISPR/Cas9 Technology in Restoring Dystrophin Expression in iPSC-Derived Muscle Progenitors. J. Vis. Exp. (151), e59432, doi:10.3791/59432 (2019).

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