الفحص في المختبر النواة الدقيقة هو وسيلة راسخة لتقييم السمية الجينية والسمية الخلوية ولكن تسجيل الفحص باستخدام الفحص المجهري اليدوي هو شاقة ويعاني من الذاتية وتقلب الهدافين. تصف هذه الورقة البروتوكول الذي تم تطويره لتنفيذ نسخة مؤتمتة بالكامل من الفحص باستخدام قياس تدفق التصوير متعدد الأطياف.
غالباً ما يستخدم الفحص في المختبر للنواة الدقيقة (MN) لتقييم السمية الخلوية والسمية الجينية ولكن تسجيل الفحص عن طريق الفحص المجهري اليدوي هو أمر شاق ويدخل عدم اليقين في النتائج بسبب التباين بين الهدافين. ولمعالجة ذلك، تم إدخال الفحص المجهري الآلي لمسح الشرائح وكذلك أساليب قياس التدفق التقليدي في محاولة لإزالة تحيز الهداف وتحسين الإنتاجية. ومع ذلك، هذه الأساليب لها قيودها المتأصلة الخاصة مثل عدم القدرة على تصور السيتوبلازم من الخلية وعدم التحقق من MN البصرية أو تخزين البيانات الصورة مع قياس التدفق الخلوي. وللتصوير المتعدد الأطياف (MIFC) القدرة على التغلب على هذه القيود. تجمع MIFC بين الصور الفلورية عالية الدقة للتنظير المجهري والمتانة الإحصائية وسرعة قياس التدفق التقليدي. وبالإضافة إلى ذلك، يمكن تخزين جميع الصور التي تم جمعها في ملفات خاصة بالجرعة. تصف هذه الورقة البروتوكول الذي تم تطويره لتنفيذ إصدار مؤتمت بالكامل من اختبار MN على MIFC. تم توسيع خلايا TK6 اللمفاوية البشرية باستخدام محلول نقص التوتر (75 مل ككل)، ثابتة مع 4٪ فورمالين والمحتوى النووي كان ملطخا Hoechst 33342. تم تشغيل جميع العينات في تعليق على MIFC، مما يسمح بالحصول على صور عالية الدقة لجميع الأحداث الرئيسية المطلوبة للفحص (على سبيل المثال الخلايا binucleated مع وبدون MN وكذلك الخلايا mononucleated وpolynucleated). وقد تم تلقائياً تحديد الصور وتصنيفها وتعدادها في برنامج تحليل البيانات التابع لـ MIFC، مما يسمح بتسجيل السمية الخلوية والسمية الجينية آلياً. وتبين النتائج أن استخدام MIFC لإجراء اختبار MN في المختبر يسمح بالكشف عن زيادات كبيرة إحصائيا في تردد MN في عدة مستويات مختلفة من السمية الخلوية بالمقارنة مع ضوابط المذيبات بعد التعرض لخلايا TK6 إلى ميتوميسين C وكولشيسين، وأنه لا تلاحظ زيادات كبيرة في تردد MN بعد التعرض لمانيتول.
وقد تم تطوير البروتوكولات التي تستخدم كل من الفحص المجهري وقياس التدفق والنسخ الضوئي ويتم التحقق منها وتستخدم بشكل روتيني لأداء اختبار MN في المختبر6و7و8و9و10، 11،12،13،14. يستفيد الفحص المجهري من القدرة على التأكيد بصرياً أن MN مشروعة ولكنها تستغرق وقتاً طويلاً وعرضة للتباين بين الهدافين15. لمعالجة هذا، تم تطوير أساليب الفحص المجهري الآلي لمسح الشرائح والتقاط الصور من النوى وMN16،17،18،19،ولكن لا يمكن تصور السيتوبلازم، مما يجعلها من الصعب تحديد ما إذا كانت MN مرتبطة بالفعل بخلية معينة. وعلاوة على ذلك، تواجه هذه الأساليب صعوبات في تحديد الخلايا المتعددة النوى (POLY) (بما في ذلك الخلايا الثلاثية والرباعية) اللازمة لحساب السمية الخلوية عند استخدام Cyt-B9. طرق قياس التدفق الخلوي التي تم تطويرها لأداء التنظير MN توظيف الفلورة، فضلا عن كثافة التشتت إلى الأمام والجانب لتحديد السكان من كل من النوى وMN التي تم تحريرها من الخلية بعد lysis20،21 ،22. وهذا يسمح بالحصول على البيانات من عدة آلاف من الخلايا في بضع دقائق ويسمح بالتحليل الآلي23؛ ومع ذلك، فإن عدم القدرة على تصور الخلايا يجعل من المستحيل التأكد من أن الأحداث المسجلة حقيقية. بالإضافة إلى ذلك، فإن التسين في غشاء الخلية يمنع استخدام Cyt-B وكذلك خلق تعليق يحتوي على حطام آخر مثل المجاميع الكروموسومية أو الأجسام المبرمجة وليس هناك طريقة للتمييز بين هذه من MN24.
وفي ضوء هذه القيود، يعتبر قياس تدفق التصوير المتعدد الأطياف (MIFC) نظاماً مثالياً لإجراء الفحص MN لأنه يجمع بين الصور الفلورية عالية الدقة للتنظير المجهري والمتانة الإحصائية وسرعة قياس التدفق الدقيق التقليدي. في MIFC، يتم إدخال جميع الخلايا في نظام fluidics ومن ثم تركز هيدروديناميا في وسط cuvette خلية تدفق. يتم إنجاز الإضاءة المتعامدة لجميع الخلايا من خلال استخدام الصمام الثنائي الباعث للضوء (LED) من الحقل الساطع، وهو ليزر مبعثر جانبي وليزر فلورسنت واحد (على الأقل). يتم التقاط الفوتونات الفلورية من قبل واحد من ثلاثة (20x أو 40x أو 60x) العدسات الموضوعية ذات الفتحة الرقمية العالية ثم تمر من خلال عنصر التحلل الطيفي. ثم يتم تركيز الفوتونات على كاميرا جهاز المقترنة بالشحن (CCD) للحصول على صور عالية الدقة لجميع الخلايا التي تمر عبر خلية التدفق. لتجنب عدم الوضوح أو الشرائط، تعمل اتفاقية مكافحة التصحر في وضع تكامل تأخير الوقت (TDI) الذي يتتبع الكائنات عن طريق نقل محتوى بكسل من صف إلى صف أسفل اتفاقية مكافحة التصحر في تزامن مع سرعة الخلية في التدفق. ثم يتم جمع معلومات البكسل من الصف الأخير من وحدات البكسل. يسمح التصوير TDI جنبا إلى جنب مع التحلل الطيفي ما يصل إلى 12 صورة (2 BF، 10 الفلورسنت) ليتم التقاطها في وقت واحد من جميع الخلايا التي تمر عبر خلية التدفق. يتم تخزين جميع الصور التي تم التقاطها في ملفات بيانات خاصة بالعين، مما يسمح بإجراء التحليل في أي وقت باستخدام برنامج تحليل البيانات MIFC. وأخيرا، تحتفظ ملفات البيانات بالصلة بين الصور الخلوية والنقاط على جميع المؤامرات ثنائية المتغيرات. وهذا يعني أنه يمكن تسليط الضوء على أي نقطة على مؤامرة ثنائية المتغيرات التقليدية وسيتم عرض الصور BF والفلورسنت المقابلةلها 25.
في الآونة الأخيرة، تم تطوير الأساليب القائمة على MIFC لإجراء اختبار MN لكل من قياس الدوسيد الإشعاعي الفرز26،27،28،29،30،31 والوراثية السموم32،33 اختبار. وقد أثبت هذا العمل أن الصور الخلوية للنوى الرئيسية، MN والسيتوبلازم يمكن تصويرها مع الإنتاجية أعلى من غيرها من الطرق26. يمكن تحديد جميع أنواع الخلايا المطلوبة للتحليل، بما في ذلك خلايا MONO، وBNCs (مع وبلا MN)، وخلايا POLY، تلقائيًا في برنامج تحليل البيانات MIFC، ويتم تنفيذ معايير التهديف التي وضعتها Fenech وآخرون من خلال استخدام خوارزميات رياضية مختلفة6،34. وأظهرت نتائج قياس الجرعات الأحيائية أن منحنيات معايرة استجابة الجرعة كانت مماثلة من حيث الحجم لتلك التي تم الحصول عليها من الأساليب الآلية الأخرى في المؤلفات عند التحديد الكمي لمعدل MN لكل BNC29. بالإضافة إلى ذلك، أظهرت الأعمال الأخيرة في علم السموم أن الصور من خلايا MONO، BNCs (مع وبدون MN) وخلايا POLY يمكن التقاطها تلقائيا، وتحديدها، وتصنيفها وتعدادها باستخدام MIFC. ومكّن تحليل البروتوكول والبيانات من حساب السمية الخلوية والسمية الجينية بعد تعريض خلاياTK6 لعدة خلايا من الكلاستوجين اتّباب 32 .
يصف البروتوكول المعروض في هذه الورقة طريقة لإجراء الاختبار MN في المختبر باستخدام MIFC. تتطلب تقنية معالجة العينة المستخدمة في هذا العمل أقل من 2 ساعة لمعالجة عينة واحدة وسهلة الأداء نسبياً بالمقارنة مع أساليب أخرى. تحليل البيانات في برنامج تحليل MIFC معقد، ولكن يمكن إجراء إنشاء قالب التحليل في غضون ساعات قليلة بعد الخطوات المبينة في هذه الورقة. وعلاوة على ذلك، بمجرد إنشاء القالب، يمكن تطبيقه تلقائيا على جميع البيانات التي تم جمعها دون أي عمل آخر. ويحدد البروتوكول جميع الخطوات اللازمة لتعريض خلايا TK6 للكلاستوجينات والأنوجينات، ويصف كيفية زراعة الخلايا ومعالجتها ووصمها، ويوضح كيفية الحصول على صور عالية الدقة باستخدام MIFC. وعلاوة على ذلك، توضح هذه الورقة أفضل الممارسات الحالية لتحليل البيانات في برامج MIFC لتحديد وتسجيل خلايا MONO وBNCs وخلايا POLY تلقائياً لأغراض حساب السمية الخلوية والسمية الجينية.
وفي منشور صدر مؤخرا، أكد فيرما وآخرون على أهمية تطوير نظام يجمع بين ميزة الإنتاجية العالية لقياس التدفق والفوائد التخزينية للبيانات والصور لتحليل الصور35. وMIFC في المختبر MN الفحص الموصوفة في هذه الورقة يلبي هذا الاقتباس ولديه القدرة على التغلب على العديد من التحديات المذكورة أعلاه في المجهرية وتدفق أساليب قياس السيتومترية. ويبين البروتوكول الموصوف هنا أنه يمكن تقييم كل من السمية الخلوية والسمية الجينية باستخدام MIFC. إعداد العينات، تلطيخ الخلوية وجمع البيانات هي مباشرة ولكن هناك بعض الخطوات الحاسمة في البروتوكول التي ينبغي أن تنفذ دائما. إضافة كلوريد البوتاسيوم (KCl) إلى الخلايا أمر بالغ الأهمية لتضخم الخلايا، وتوليد الفصل بين النوى الرئيسية. وهذا يضمن أن خوارزمية الإخفاء يمكن تحديد كافة النوى الفردية في BNCs وخلايا POLY (خلايا POLY) وهو ضروري للتعداد الخاصة بهم. بالإضافة إلى ذلك، يوفر KCL الفصل بين النوى وMN، وهو أمر ضروري لاخفاء MN دقيقة وتكميم. وعلاوة على ذلك، فإن استخدام فورالين بعد إضافة KCl يمنع الخلايا من التسل أثناء الطرد المركزي. إضافة Cytochalasin B يسبب خلايا TK6 التي خضعت لأكثر من تقسيم نووي واحد لتكون كبيرة جدا. ونتيجة لذلك، يصبح السيتوبلازم هشًا ويمكن أن يُنفّذ إذا تم تنفيذ الطرد المركزي مباشرة بعد إضافة KCl. وعلاوة على ذلك، من المهم جدا إدخال Hoechst إلى العينة وفقا لعدد من الخلايا في العينة وليس وفقا لتركيز نهائي. على سبيل المثال، التركيز النهائي من 10 ميكروغرام / مل من Hoechst وصمة عار بشكل موحد عينة من 1 × 106 الخلايا ولكن قد لا وصمة عار كافية عينة تحتوي على 5 × 106 الخلايا ويمكن أن يؤدي إلى العديد من الخلايا مع نوى ملطخة بشكل خافت، مما يجعل التحليل من الصعب. من المهم أيضا أن نلاحظ أن Hoechst يمكن استبدالها بصبغة الحمض النووي الأخرى مثل DAPI إذا تم تجهيز MIFC مع الليزر الإثارة 405 نانومتر أو DRAQ5 إذا تم تجهيز MIFC مع 488 نانومتر و / أو 642nm ليزر الإثارة…. إذا تعديل وصمة عار النووية، فمن الأهمية بمكان لtitrate وصمة عار من أجل العثور على التركيز المناسب لقوة الليزر المطلوبة / المطلوبة.
عند جمع البيانات على MIFC من المهم تحديد حدود المنطقة المثلى لميزات RMS التدرج. وقد تتطلب الحدود المعروضة في هذا البروتوكول تعديلاً بسبب بعض الاختلافات الطفيفة بين صكوك اللجنة. إن تطبيق هذه الميزة أثناء جمع البيانات ضروري لضمان التقاط صور عالية التركيز. إذا كانت ملفات البيانات تحتوي على العديد من الصور غير الواضحة أو غير المركزة، فمن المحتمل أن خوارزميات الإخفاء في برنامج التحليل سوف تسلط الضوء بشكل غير صحيح على تلطيخ القطع الأثرية في المناطق غير الواضحة، مما يؤدي إلى عدد كبير من القطع الأثرية الإيجابية الزائفة التي يتم تسجيلها كـ MN. على الرغم من أن تقنيات معالجة الصور الموضحة هنا يمكن أن تكون صعبة، بمجرد تطوير قالب تحليل في برنامج MIFC، تسمح معالجة الدفعات بتحليل ملفات البيانات تلقائيًا، مما يلغي تدخل المستخدم وبالتالي، هداف التحيز. أيضا، إذا تم استخدام خط خلية غير خلايا TK6 لإجراء التصاق، سيكون من الضروري تعديل الأقنعة وحدود المنطقة حيث أن الخصائص المورفولوجية (مثل الحجم) للخلايا سوف تختلف عن خصائص خلايا TK6.
تظهر النتائج المعروضة هنا (الشكل5)زيادات كبيرة إحصائياً في الحث MN عند تعريض خلايا TK6 لجرعات مختلفة من ميتوميسين C وكولشيسين. ولوحظت زيادات كبيرة إحصائياً في تواتر النـزم النووي مقارنة بضوابط المذيبات لعدة جرعات في كلتا الجماتين الكيميائيتين. وبالإضافة إلى ذلك، لم تسبب أي جرعة من مانيتول سمية خلايا أكثر من 30٪، ولا زيادة كبيرة إحصائيا في تواتر MN بالمقارنة مع ضوابط المذيبات، كما هو متوقع. البروتوكول الموصوف في هذه الورقة باستخدام MIFC لإجراء اختبار MN في المختبر يعطي النتائج المتوقعة من كل من المواد الكيميائية الرقابة الإيجابية والسلبية. من المهم جداً إجراء عدد من التجارب باستخدام كل من ضوابط المذيبات والمواد الكيميائية للرقابة السلبية لتطوير قيم خط الأساس لكل من تواتر MN وكذلك مؤشر انتشار كتلة السيتوكينيسيس (CBPI). وفيما يتعلق بالسمية الجينية، تتحدد الزيادات الهامة إحصائياً في تردد الـ MN من خلال المقارنة مع ترددات الـ MN الأساسية التي يجب أن تكون معروفة بنوع الخلية المستخدمة. وبالإضافة إلى ذلك، تستند جميع حسابات السمية الخلوية إلى CBPI لعينات التحكم، وبالتالي، يجب أن تكون معدلات خط الأساس لخلايا MONO وBNCs وPOLY محددة كمياً في الضوابط.
وقد تم وصف العديد من القيود والمزايا لاستخدام MIFC في سياق الاستفادة من MN في العمل السابق29،32. وتتعلق القيود الرئيسية بانخفاض ترددات الـ MN عند مقارنتها بالفحص المجهري، وهو ما قد ينتج عن انعدام المرونة عند تنفيذ معايير التهديف في برنامج التحليل وكذلك عن العمق المحدود لمجال الـ MIFC. يمكن إنشاء أقنعة محيطة بشكل جيد لتحديد الدقيق للنوى الرئيسية ولكن MN التي يتم لمس (أو قريبة جدا من) النوى الرئيسية قد يتم التقاطها داخل قناع BNC. بالإضافة إلى ذلك، MN صغيرة جداً التي يمكن تسجيلها بسهولة بدلاً من ذلك باستخدام الفحص المجهري ربما غاب بشكل غير صحيح عند استخدام MIFC بسبب الحد الأدنى على معلمة المنطقة من قناع MN لتجنب تسجيل القطع الأثرية الصغيرة. بالإضافة إلى الصعوبات الموجودة في تحليل البيانات المستندة إلى الصور، بسبب تصميمها، تحصل MIFC على صور إسقاط ثنائية الأبعاد للأجسام الخلوية ثلاثية الأبعاد. وهذا يؤدي على الأرجح إلى التقاط بعض MN في عمق مختلف من التركيز أن MN الرئيسيتين اثنين، مما يجعلها تبدو قاتمة جدا وغير قابلة للتآكل باستخدام اخفاء. وعلاوة على ذلك، يمكن أن يقيم جزء صغير من الحركة الوطنية وراء إحدى النوى الرئيسيتين، مما يجعل من المستحيل تصورها وتسجيلها. ولذلك، وبالنظر إلى هذه الصعوبات، ينبغي توخي الحذر عند تفسير الزيادات الكبيرة في تواتر النيوم بالجرعات المنخفضة.
على الرغم من أوجه القصور هذه، فإن طريقة MIFC الموصوفة هنا تقدم العديد من المزايا على تقنيات أخرى. واقترح Fenech وآخرون المعايير والمبادئ التوجيهية التي ينبغي مراعاتها عند وضع نظم ومنهجيات آلية للاختبارات MN36. وتشمل هذه، على سبيل المثال لا الحصر، التصور المباشر للنوى الرئيسية والسيتوبلازم، وتحديد تواتر MN من جرعات مختلفة من المادة الكيميائية أو العوامل التي يجري اختبارها والقدرة على تكميم المورفولوجيا وتحديد موقف جميع النوى وMN للتأكد من أنها داخل السيتوبلازم. وتبين هذه الورقة أن طريقة MIFC التي تم تطويرها لإجراء الاختبار MN في المختبر يرضي (أو يملك القدرة على الوفاء) هذه المعايير. على وجه التحديد، يمكن التقاط صور للنوى وMN بواسطة الليزر الفلورسنت في حين يمكن الحصول على الصور السيتوبلازمية باستخدام الصمام BF. يمكن تمييز صور الخلايا ذات المورفولوجيا النووية العادية تلقائيًا عن تلك الخلايا ذات المورفولوجيا غير النظامية باستخدام مزيج من الأقنعة والميزات المتقدمة. تظهر النتائج المقدمة للكولشيسين وميتوميسين C (الشكل 5) أنه يمكن تقييم كل من السمية الجينية والسمية الخلوية بجرعات مختلفة بالمقارنة مع ضوابط المذيبات، وأن ترددات MN الهامة إحصائياً تُلاحظ حيث يتم ملاحظة ترددات MN الهامة إحصائياً حيث المتوقع. وعلاوة على ذلك، يوصي المبدأ التوجيهي للاختبار 487 لمنظمة التعاون والتنمية في الميدان الاقتصادي بتسجيل 000 2 من هذه الـ 000 2 من الـ BNCs لكل تركيز اختباري لتقييم وجود السمية الجينية لتحديد السمية الجينية إلى جانب ما لا يقل عن 500 خلية لكل تركيز اختباري لتحديد السمية الخلوية9؛ هذا يمكن أن يستغرق أكثر من 1 ساعة باستخدام المجهرية اليدوية. يظهر البروتوكول والنتائج في هذه الورقة أنه تم التقاط ما متوسطه حوالي 6000 BNCs و 16000 خلية MONO و800 خلية بولي وسجل كل تركيز اختبار في حوالي 20 دقيقة. ويبرز المعدل السريع لاقتناء البيانات والأعداد العالية من الخلايا المرشحة التي سجلت في مثل هذا الوقت القصير ميزة هامة أخرى هي استخدام MIFC لإجراء اختبار MN في المختبر.
وفي حين أن النتائج المعروضة في هذه الورقة مشجعة، فإنها تمثل طريقة مبكرة لإثبات المفهوم. وينبغي أن يعقب هذا العمل تحقيق أكثر شمولاً لمجموعة كيميائية أكبر وأكثر تنوعاً تغطي فئات وآليات متعددة للسمية الجينية والسمية الخلوية مثل تلك التي اقترحها كيركلاند وآخرون37 تستغرق وقتا طويلا وكثيفة العمالة، وتقع خارج نطاق هذه الورقة ومع ذلك، فإن هذه الدراسات على نطاق أوسع توفر نظرة ثاقبة قيمة في قدرة الطريقة لتحديد موثوق بها العوامل السامة للجينوية ضعيفة. ولم تُصغر المنهجية المعروضة هنا بعد في شكل ميكروويل، مما سيتيح فحصاً أسرع وأكثر كفاءة عبر نطاق جرعة أكبر. وعلى هذا النحو، قد يكون الفحص الذي يستند إلى MIFC في المختبر والموجود هنا مناسباً لدراسات المتابعة المكثفة أو البحث في الممارسات المختبرية الجيدة. ومع ذلك، فإن الطريقة سوف تستمر في الأمثل والتحقق من صحتها، وتمتلك القدرة على السماح لمزيد من المرونة في الكشف عن الأحداث الكيميائية المحددة المتعلقة مورفولوجيا، مثل التعرض aneugen الذي يزيد من نسبة الخلايا مع النوى غير الدائرية التي لا تزال قابلة للتآكل38. وأخيراً، تتيح طريقة MIFC فرصة لإدخال علامات بيولوجية إضافية في اختبار MN (مثل تلطيخ kinetochore) لتوفير رؤية أكثر شمولاً لآلية الحث MN.
The authors have nothing to disclose.
وتشكر المؤلفة كريستين بروبست (شركة لومينيكس) على جهودها في تطوير الأشكال السابقة من قالب تحليل البيانات، وكذلك الدكتورة هالي بوغسلي (شركة لومينيكس) والدكتور موريسي (شركة لومينيكس) على استعراض وتحرير المخطوطه.
15 mL centrifuge tube | Falcon | 352096 | |
Cleanser – Coulter Clenz | Beckman Coulter | 8546931 | Fill container with 200 mL of Cleanser. https://www.beckmancoulter.com/wsrportal/page/itemDetails?itemNumber=8546931#2/10//0/25/1/0/asc/2/8546931///0/1//0/ |
Colchicine | MilliporeSigma | 64-86-8 | |
Corning bottle-top vacuum filter | MilliporeSigma | CLS430769 | 0.22 um filter, 500 mL bottle |
Cytochalasin B | MilliporeSigma | 14930-96-2 | 5 mg bottle |
Debubbler – 70% Isopropanol | EMD Millipore | 1.3704 | Fill container with 200 mL of Debubbler. http://www.emdmillipore.com/US/en/product/2-Propanol-70%25-%28V%2FV%29-0.1-%C2%B5m-filtred,MDA_CHEM-137040?ReferrerURL=https%3A%2F%2Fwww.google.com%2F |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | MilliporeSigma | 67-68-5 | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline 1X | EMD Millipore | BSS-1006-B | PBS Ca++MG++ Free |
Fetal Bovine Serum | HyClone | SH30071.03 | |
Formaldehyde, 10%, methanol free, Ultra Pure | Polysciences, Inc. | 04018 | This is what is used for the 4% and 1% Formalin. CAUTION: Formalin/Formaldehyde toxic by inhalation and if swallowed. Irritating to the eyes, respiratory systems and skin. May cause sensitization by inhalation or skin contact. Risk of serious damage to eyes. Potential cancer hazard. http://www.polysciences.com/default/catalog-products/life-sciences/histology-microscopy/fixatives/formaldehydes/formaldehyde-10-methanol-free-pure/ |
Hoechst 33342 | Thermo Fisher | H3570 | 10 mg/mL solution |
Mannitol | MilliporeSigma | 69-65-8 | |
MEM Non-Essential Amino Acids 100X | HyClone | SH30238.01 | |
MIFC – ImageStreamX Mark II | EMD Millipore | 100220 | A 2 camera ImageStreamX Mark II eqiped with the 405nm, 488nm, and 642nm lasers was used. http://www.emdmillipore.com/US/en/life-science-research/cell-analysis/amnis-imaging-flow-cytometers/imagestreamx-Mark-ii-imaging-flow-cytometer/VaSb.qB.QokAAAFLzRop.zHe,nav?cid=BI-XX-BDS-P-GOOG-FLOW-B325-0006 |
MIFC analysis software – IDEAS | EMD Millipore | 100220 | The companion software to the MIFC (ImageStreamX MKII) |
MIFC software – INSPIRE | EMD Millipore | 100220 | This is the software that runs the MIFC (ImageStreamX MKII) |
Mitomycin C | MilliporeSigma | 50-07-7 | |
NEAA Mixture 100X | Lonza BioWhittaker | 13-114E | |
Penicllin/Streptomycin/Glutamine solution 100X | Gibco | 15070063 | |
Potassium Chloride (KCl) | MilliporeSigma | P9541 | |
Rinse – Ultrapure water or deionized water | NA | NA | You can use any ultrapure water or deionized water. Fill container with 900 mL of Rinse. |
RNase | MilliporeSigma | 9001-99-4 | |
RPMI-1640 Medium 1X | HyClone | SH30027.01 | |
Sheath – PBS | EMD Millipore | BSS-1006-B | This is the same as Dulbecco's Phosphate Buffered Saline 1X Ca++MG++ free. Fill container with 900mL of Sheath. |
Sterile water | HyClone | SH30529.01 | |
Sterilizer – 0.4-0.7% Hypochlorite | VWR | JT9416-1 | This is assentually 10% Clorox bleach that can be made by deluting Clorox bleach with water. Fill container with 200 mL of Sterilzer. |
System Calibration Reagent – SpeedBead | EMD Millipore | 400041 | Each tube holds ~10 mL. https://www.emdmillipore.com/US/en/life-science-research/cell-analysis/amnis-imaging-flow-cytometers/support-training/XDqb.qB.wQMAAAFLBDUp.zHu,nav |
T25 flask | Falcon | 353109 | |
T75 flask | Falcon | 353136 | |
TK6 cells | MilliporeSigma | 95111735 |