Nós relatamos um método simples e versátil para executar ao vivo-imagem fluorescente de Arabidopsis thaliana folhas durante um período prolongado de tempo. Nós usamos uma Arabidopsis de plantas transgênicas expressando um gene repórter fluorescente sob o controle de um promotor de imunidade-relacionados como um exemplo para ganhar spatiotemporal compreensão das respostas imunes de planta.
A resposta imune de planta associada com uma reprogramação transcriptional todo o genoma é iniciada no local da infecção. Assim, a resposta imune é regulada espacial e temporalmente. A utilização de um gene fluorescente sob o controle de um promotor de imunidade-relacionados em combinação com uma microscopia de fluorescência automatizada é uma maneira simples de entender spatiotemporal regulação da imunidade da planta. Em contraste com os tecidos de raiz que foram usados para um número de várias experiências de geração de imagens fluorescentes intravital, existem alguns exemplos de imagens ao vivo fluorescentes para os tecidos de folha que encontro uma matriz de infecções microbianas no ar. Portanto, nós desenvolvemos um método simples para montar as folhas das plantas de Arabidopsis thaliana para imagem latente da viver-pilha durante um período prolongado de tempo. Usamos plantas transgênicas de Arabidopsis expressando a proteína fluorescente amarela (YFP) genefused para o sinal de localização nuclear (NLS) sob o controle do promotor de um gene marcador relacionados com defesa, ( Pathogenesis-Related-1 PR1). Nós infiltrados uma folha transgénica com Pseudomonas syringae pv. tomate DC3000 (avrRpt2) Coe (Pst_a2) e realizado em vivo imagens lapso de tempo do sinal YFP para um total de 40 h, usando um microscópio de fluorescência automatizada. Esse método pode ser utilizado não só para estudos de respostas imunes de planta, mas também para as análises de vários eventos no desenvolvimento e respostas ambientais ocorrem nos tecidos da folha.
Resposta imune de planta envolve uma dinâmica transcriptional reprogramação regulada pela transcrição múltiplos fatores bem como fitohormônios1. O acúmulo de dados transcriptome fornece oportunidades para recolher informações sobre o sistema imunológico de planta: por exemplo, a estrutura da rede de sinalização cascatas2. No entanto, nosso conhecimento do dinamismo espacial e temporal da imunidade da planta continua limitado3,4,5.
Em estudos anteriores, spatiotemporal regulação da expressão genética relacionados com defesa tem sido principalmente analisada utilizando hibridização in situ e um repórter do β-glucuronidase (GUS) ensaio6,7,8. Estes métodos permitem-nos Visualizar a ativação transcricional de vários genes de interesse no local. No entanto, estes procedimentos requerem fixação química de espécimes e, portanto, resultam na perda de toda a informação temporal. Eventos biológicos, tais como imunidade, progresso ao longo do tempo. O uso de luciferase como repórter permitiu a captura da dinâmica temporal do promotor de interesse3. No entanto, ensaio baseado em luciferase requer um substrato caro e altamente sensíveis detectores. Para aumentar a nossa compreensão dos aspectos spatiotemporal da resposta imune de planta usando um procedimento simples, geramos transgénicos Arabidopsis thaliana plantas expressando a proteína fluorescente amarela (YFP) gene fundidos para a sinal de localização nuclear (NLS-YFP) sob o controle do promotor do gene marcador de defesa-relacionadas, Pathogenesis-Related 1 (PR1)9. Usamos a clorofila autofluorescência, um marcador de células vivas, para capturar o processo de morte celular programada (PCD), que muitas vezes ocorre durante a imunidade acionadas effector (ETI), uma forma de imunidade planta induzida por determinado patógeno infecção9 , 10. monitoramento a dinâmica temporal da intensidade do sinal de fluorescência em movimentando-se livremente objetos, tais como folhas de Arabidopsis a viver, requer uma complexa software processamento de imagem construído internamente ou disponível comercialmente. Alternativamente, impedindo que espécimes vá é um método simples para resolver a questão. Aqui, nós desenvolvemos um método simples e versátil para montagem vivendo folhas de uma planta de Arabidopsis transgênica para observação de longo prazo sob um microscópio de fluorescência automatizada. O método nos permite capturar o promotor deixa de dinâmica no solo cultivado planta intacta durante alguns dias.
Aqui, nós relatamos um método simples para montar uma vida Arabidopsis folha expressa um gene repórter fluorescente sob o controle de um promotor de interesse para a observação a longo prazo usando um microscópio fluorescente automatizado. Imagem de lapso de tempo de um repórter fluorescente foi frequentemente realizada em tecidos de raiz; no entanto, poucos estudos semelhantes foram realizados em tecidos da folha. Isto é mais provável porque as folhas são capazes de mover-se livremente no espaço, Considerando que as raízes são muitas vezes enterradas e fixadas em meio de ágar sólido.
Neste relatório, enfocamos a spatiotemporal dinâmica da atividade pPR1 durante ETI induzida por Pst_a2. Além da fixação suave da folha detalhada acima, é importante Visualizar claramente a spatiotemporal dinâmica de eventos celulares, como ativação de promotor e PCD. Se a distinção entre células mostrando atividade pPR1 e PCD não é afiada, certifique-se de que todos os espaços intercelulares na área infiltrada são completamente preenchidos com a suspensão do patógeno (consulte a etapa 2.4). Isto é crítico quando usando duas oculares de campo amplo da fluorescência, desde que estes microscópios capturar todos os sinais detectáveis ao longo da mesma posição vertical da amostra. Autofluorescência de clorofila de células sobreviventes acima ou abaixo das células no domínio do PCD máscaras facilmente as células mortas, exibindo sem autofluorescência. Isto também é verdadeiro para sinal YFP.
Condições para a imagem latente de lapso de tempo precisam ser estabelecida cuidadosamente por meio de vários experimentos preliminares sob diferentes condições experimentais. Parâmetros para a imagem latente de lapso de tempo dependem de vários fatores tais como o sistema microscópico, plantas transgênicas e patógenos. Para obter esses parâmetros, primeiro foram analisados vários tempos de exposição para a intensidade de sinal YFP na folha infiltrada no hpi 7, que quase coincide com a ativação inicial da pPR1. Determinou-se uma exposição s 5 conforme apropriado para a captura de sinal YFP com o microscópio utilizado neste estudo. Realizou-se um teste semelhante para clorofila autofluorescência de imagem. Exposição da amostra à luz entre intervalos de 3 min foi programada para o programa da imagem latente de lapso de tempo como imagem de campo brilhante normal com tempo máximo de exposição. Nosso sistema (Tabela de materiais) nos permitiu ter 2,5 min além YFP, TXR e imagem latente de campo brilhante. Essa restrição foi a principal razão para escolher um intervalo de 3 min. Em seguida, nós confirmamos que essa condição de lapso de tempo não causado nenhum dano aparente para as amostras de plantas e não induz a gravidez ectópica acionamento do refletor forç-relacionados da pPR1 (Figura 3B, C). Isto levou ao desenvolvimento do programa utilizado neste estudo. Assim, intervalos de 3 min da imagem latente de fluorescência foram considerados suficientes para capturar pPR1 dinâmica durante Pst_a2-mediada ETI9.
Construções de promotor-repórter, especialmente com o repórter fluorescente fundido para o NLS, têm sido utilizadas por muitos grupos e estão facilmente disponível a partir da comunidade de investigação; usamos a construção publicada pelo Kubo et al . 13. assim, o protocolo descrito aqui pode ser usado em qualquer estudo de biologia de planta examinando tecidos da folha, se plantas transgênicas apropriadas estão disponíveis. Nosso protocolo simples e fácil proporciona uma grande oportunidade para os pesquisadores que pretendem analisar a dinâmica spatiotemporal de qualquer evento biológico, ocorrendo em folhas, como a resposta imune. É plausível que o nosso método usando pedaços de fita induz um ligeiro stress físico sobre as amostras. No entanto, esta questão pode ser controlada, incluindo adequados controlos positivos e negativos, tais como tratamentos simulados, nos experimentos (Figura 3C). As condições experimentais podem ser modificadas e otimizadas, analisando esses controles sob diferentes condições ainda mais.
Nos últimos anos, o rápido desenvolvimento de instrumentos e técnicas de imagem estimulou o interesse dos pesquisadores nos aspectos spatiotemporal complexos de eventos biológicos. Em qualquer análise de imagem, adequada montagem e fixação dos espécimes estão entre as questões mais importantes. O método simples e versátil de montagem viver que deixa de Arabidopsis desenvolvido neste estudo pode ser aplicado e otimizado para várias experiências de imagens.
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi financiado pela Agência de tecnologia e ciência de Japão [PRESTO117665 para S.B., ERATOJPMJER1502 de N.N.] e pela sociedade para a promoção da ciência (Grants-in-Aid para start-up de atividade de pesquisa [22880008 para S.B.] e para jovens cientistas (B) [Japão 23780040 para S.B.]). Agradecemos a r. Senzaki, Y. Suzuki, Y. Sugisawa e E. Betsuyaku pela excelente assistência técnica, J. Parker para fornecer a tensão de Pst_a2 e T. Demura para fornecer o vetor de pBGYN.
Bacto Agar | BD biosciences | 214010 | |
Bacto Protease Peptone No. 3 | BD biosciences | 211693 | |
Bacto Yeast Extract | BD biosciences | 212750 | |
BM2 soil | Berger | ||
Glycerol | nacalai tesque | 17017-35 | |
Kanamycin sulfate | Wako | 113-00343 | |
Leica M205FA with DFC365FX, LED_MCI and Leica EL6000 (Las X software-regulated) | Leica Microsystems | Yellow fluorescent protein (YFP) and Texas Red (TXR) filters installed | |
Magnesium Chloride Hexahydrate | Wako | 135-00165 | |
Micro Slide Glass (Size: 76 mm × 26 mm, Thickness: 1.0–1.2 mm) | MATSUNAMI | S1112 | |
Micropore Surgical Tape (1.25 cm × 9 m) | 3M | 1530-0 | |
Needleless 1 ml plastic syringe | Terumo | SS-01T | |
Plastic cell plug tray (cell size: 44 mm × 44mm × 44 mm) | Tanaka sangyo, Japan | htray-bk72 | Any tray with similar sized cells can be used |
Rifampicin | nacalai tesque | 30259-81 | |
Plastic Tape (0.2 mm thick × 19 mm wide × 10 m long) | Yamato | No0200-19-1 | Any plastic/vinyl tape with similar thickness can be used |