Descriviamo un sistema quantitativo di analisi della citolisi in vitro in tempo reale per valutare la potenza delle cellule T del recettore dell’antigene chimerico che prendono di mira le cellule tumorali liquide e solide. Questo protocollo può essere esteso per valutare altre cellule echeggiatrici immunitarie, così come i trattamenti combinati.
La terapia a cellule T del recettore dell’antigene chimerico (CAR) per il cancro ha ottenuto un significativo beneficio clinico per le neoplasie ematologiche resistenti e refrattarie come la leucemia linfocitica acuta infantile. Sono attualmente in corso sforzi per estendere questa promettente terapia ai tumori solidi oltre ad altri tumori ematologici. Qui, descriviamo lo sviluppo e la produzione di potenti cellule T CAR miranti antigeni con espressione unica o preferenziale sulle cellule tumorali solide e liquide. La potenza in vitro di queste cellule T CAR viene quindi valutata in tempo reale utilizzando l’analisi xCELLigence basata sull’impedimento altamente sensibile. In particolare, viene esaminato l’impatto di diversi domini di segnalazione costimulatorici, come la proteina correlata al fattore di necrosi tumorale indotta da glucocorticoide (TNFR) (GITR), sulla potenza in vitro delle cellule T CAR. Questo rapporto include protocolli per: generare cellule T CAR per studi preclinici utilizzando la trasduzione genica lentivirale, espandere le cellule T CAR, convalidare l’espressione CAR e eseguire e analizzare i saggi di potenza xCELLigence.
Negli ultimi anni, la terapia CAR T-cell è stata una delle più importanti scoperte nell’immunoterapia del cancro per neoplasie ematopoietiche refrattarie. Con la recente approvazione della Food and Drug Administration (FDA) degli Stati Uniti di cellule CAR T dirette da CD19 per la leucemia linfoblastica acuta, linfoma non-Hodgkin, e diffuso linfoma a grandi cellule B, e la designazione di una terapia rivoluzionaria per l’antigene CAR t di maturazione delle cellule B (BCMA) diretto CAR T cellule per mieloma multiplo, questa tecnologia ha generato grande entusiasmo nella comunità scientifica e ha alimentato numerosi studi di base, applicati e clinici1,2,3. 4,5. Nel gennaio del 2019, più di 700 studi clinici sono stati registrati nel database delle sperimentazioni cliniche (clinicaltrials.gov); circa 450 di questi studi stavano per iniziare o stavano reclutando attivamente pazienti. La maggior parte degli studi clinici si concentrano sulle neoplasie ematologiche, e gli studi clinici che utilizzano cellule CAR T rivolte CD20, CD22 e BCMA, oltre a CD19, sono in corso anche6,7. Mentre la maggior parte degli studi utilizza la terapia autologa CAR T-cell, un numero significativo di loro stanno anche esplorando l’utilità delle cellule T CAR allogeniche8,9,910. Nonostante i promettenti risultati con le neoplasie ematologiche, l’uso di cellule T CAR per colpire i tumori solidi si è dimostrato molto più difficile in clinica per una serie di motivi, tra cui ma non solo la mancanza di buoni bersagli che si esprimono esclusivamente nel tumore, l’eterogeneità dei tumori solidi e la “fuga” tumorale, e la difficoltà che le cellule CAR T hanno nell’accedere al microambiente tumorale11,12, 14, 14 15.C’è una necessità critica per lo sviluppo di cellule CAR T solide specifiche per il tumore che possono superare queste barriere all’efficacia e il problema della tossicità “sul tumore bersaglio”. Mentre una moltitudine di approcci in vitro e in vivo sono garantiti nella progettazione e test delle cellule CAR T, un saggio di potenza in vitro robusto e predittivo è di primaria importanza16,17.
Al fine di valutare la potenza delle cellule CAR T, sono stati sviluppati vari metodi in vitro. In generale, questi saggi di potenza possono essere suddivisi in due ampie categorie a seconda che (i) misurino direttamente l’attività citolitica delle cellule T CAR rispetto alle cellule tumorali bersaglio, o (ii) misurare marcatori surrogati come le citochine che vengono rilasciate dalle cellule T CAR mentre uccidono le cellule bersaglio. Le tecniche che misurano direttamente l’attività citolitica includono il cromo-51 release assay (CRA)18, i saggi basati sull’imaging che misurano l’apoptosi delle cellule bersaglio utilizzando sonde fluorescenti19,20e i saggi di citometria a flusso che rilevano le cellule bersaglio apoptotiche21. In questi saggi, le cellule T CAR sono tipicamente co-coltivate con cellule bersaglio che sono state pre-etichettate con sonde radioattive o fluorescenti, seguite da una misurazione appropriata. Anche se è stato a lungo considerato il gold standard nel campo a causa della sua sensibilità, la CRA ha alcuni inconvenienti. In primo luogo, è un’espressione finale e non fornisce informazioni cinetiche. In secondo luogo, le cellule bersaglio devono essere etichettate con cromo-51 che tende a lisciviare dalle cellule e può aumentare significativamente il rumore di fondo22. Infine, richiede le dovute precauzioni e lo smaltimento delle scorie radioattive. I saggi alternativi, che misurano i sottoprodotti dell’interazione tra cellule T CAR con le cellule bersaglio come indicazione della potenza, includono la quantificazione di varie citochine rilasciate dalle cellule T della RCA utilizzando metodi basati sulla citometria di flusso o analisi immunosorbena enzimatica-collegate. Ancora una volta, questi sono saggi endpoint che misurano il rilascio cumulativo delle citochine in un dato momento e, quindi, potrebbero non riflettere necessariamente l’effettiva attività citolitica delle cellule CAR T.
Quando si sviluppa un asino di potenza, in particolare uno che definisce i criteri di rilascio per una terapia a base di cellule come una cellula T CAR, è fondamentale che l’analisi comporti manipolazioni minime e tempo pratico perché ogni interazione è un’altra variabile che deve essere contabilizzata e può diminuire la robustezza complessiva e la coerenza del saggio. Inoltre, l’interazione delle cellule T CAR con le cellule tumorali è un processo dinamico, e fornire informazioni su queste interazioni dinamiche, come il tasso di citolisi, è di primaria importanza per la valutazione della potenza. Tenendo conto di questi criteri, abbiamo sviluppato un saggio di potenza cinetica senza etichette per le cellule CAR T che utilizza la piattaforma di analisi delle celle in tempo reale (RTCA) xCELLigence. xCELLigence utilizza piastre di microtitolazione specializzate (E-Plates) che contengono biosensori d’oro incorporati nella parte inferiore di ogni pozzo. Lavorando con cellule tumorali solide aderenti, o cellule tumorali liquide che sono state legate utilizzando anticorpi specifici, questi biosensori monitorano in tempo reale i cambiamenti indotti dalle cellule CAR T nel numero di cellule bersaglio, nella dimensione delle cellule, nella forza dell’attacco al substrato cellulare e nelle interazioni tra cellule e cellule (cioè funzione barriera)17,23,24,25,26,27,28. Il flusso di lavoro è semplice e prevede semplicemente il seeding delle celle di destinazione nei pozzi di E-Plates, seguito dall’aggiunta delle cellule T CAR a diversi rapporti effettore-bersaglio (Figura 1). Successivamente, poiché i biosensori monitorano continuamente la fattibilità delle cellule bersaglio, i dati vengono visualizzati automaticamente in tempo reale.
Negli ultimi 15 anni il saggio xCELLigence è stato convalidato per valutare la potenza delle cellule killer naturali (NK), cellule T, cellule T CAR, inibitori del checkpoint, anticorpi bispecifici, virus oncolitici, e alcune terapie di combinazione17,29,30,31,32,33,34. Recentemente, il saggio di potenza xCELLigence è stato valutato per la produzione di cellule T-cell (TCR)-ingegnerizzateT-cell 35. Qui riportiamo l’impiego del sistema RTCA per valutare la potenza in vitro delle cellule CAR T progettate per colpire tumori solidi e tumori liquidi nelle terapie cliniche.
I recettori degli antigeni chimerierici sono proteine multidominio composte da un frammento extracellulare di variabili a catena singola (regione scFv), una regione cerniera, una regione transmembrana e un dominio citoplasmico composto da domini di segnalazione TCR e domini cosstimulatori aggiuntivi da recettori come CD28 e OX4011,40. Per progettare CAR sicuri, selettivi ed efficaci, è imperativo che le varie permutazioni nella progettazione dei CAT siano accuratamente testate utilizzando analisi in vitro e, infine, modelli animali. In questo studio, abbiamo fornito un protocollo e un flusso di lavoro per il modo in cui un analisi della potenza in vitro in tempo reale può informare la progettazione di CAT efficaci.
Nella progettazione di qualsiasi tipo di analisi di potenza, in particolare per scopi di produzione, è imperativo che il saggio sia sensibile, robusto, coerente e il più vicino possibile al meccanismo d’azione16,17,41. L’esempio di potenza in tempo reale descritto qui è progettato per misurare direttamente l’attività citolytica della cellula CAR T piuttosto che utilizzare un marcatore surrogato come il rilascio di citochine. È importante sottolineare che il saggio non richiede componenti aggiuntivi come coloranti o reagenti diversi dalla piastra di qualità (E-Plate) e dal supporto consigliato per la manutenzione delle cellule. Inoltre, il saggio è squisitamente sensibile e fornisce dati altamente riproducibili rispetto ad altri saggi basati su etichette42,43,44. Inoltre, il saggio xCELLigence è suscettibile di utilizzare rapporti effetto-bersaglio molto bassi, che è ideale per la valutazione di una citolisi specifica.
Al fine di dimostrare la flessibilità e l’utilità del sistema xCELLigence, ci siamo concentrati su due tipi di tumore, vale a dire tumori di origine ematologica e tumori solidi. Per valutare la potenza delle cellule CAR T, le cellule CAR T, dirette da CD22, le cellule Raji (cioè una linea di cellule del linfoma a cellule B) sono state legate alle piastre E utilizzando un anticorpo anti-CD40. Il tethering delle cellule Raji sul fondo delle piastre E si traduce in un segnale di impedimento che riflette la vitalità e il numero di cellule Raji nel pozzo. Dopo l’aggiunta di cellule T CD22-CAR, le cellule Raji vengono uccise in modo selettivo in modo dipendente dal tempo e dall’effettore, culminando in una diminuzione dipendente dal tempo nel segnale di impedimento. Il calo dell’impegliato significa citolisi o perdita di vitalità delle cellule Raji17. Questo approccio di tethering selettivo utilizzando anticorpi può essere esteso ad altre linee cellulari tumorali liquidi. Una strategia alternativa all’utilizzo di linee di cellule tumorali di origine ematologica consiste nell’utilizzare cellule tumorali aderenti che sono progettate per esprimere stabilmente gli antigeni tumorali, come CD19 espresso nelle cellule HeLa. Il vantaggio di questo approccio è che le cellule HeLa parentali sono prontamente disponibili e possono essere utilizzate come controllo negativo per la specificità. Tale approccio è già stato convalidato con cellule CHO-CD22 rispetto a CHO e CHO-BCMAs e cellule CHO29. Utilizzando approcci così diversi, la progettazione e l’efficacia delle cellule T CAR possono essere facilmente testate. Il saggio xCELLigence è intrinsecamente flessibile e le condizioni di analisi possono essere regolate al fine di approssimare al massimo le condizioni fisiologiche.
Uno dei principali vantaggi dell’analisi della potenza che abbiamo descritto qui è che si tratta di un semplice saggio funzionale e può essere utilizzato in combinazione con tecniche di ingegneria genetica per progettare CAR ottimali ed efficaci in modo ad alta produttività. Come è stato dimostrato qui per le cellule CAR T progettate per colpire le cellule tumorali positive EGFR, il test può essere utilizzato per valutare l’attività relativa di diversi costrutti/mutanti CAR. Ad esempio, abbiamo dimostrato che quando il dominio GITR si trova a monte del dominio CD3 mostra un’attività citolytica molto più robusta rispetto a quando si trova a valle del dominio CD3.
Anche se non è perfettamente correlato con l’attività cellulare CAR T in vivo, il rilascio di citochine in vitro è stato storicamente utilizzato come misura della potenza delle cellule CAR T. Anche se l’analisi di potenza basata su xCELLigence qui descritta può essere utilizzata per valutare terapie basate sulle cellule durante la produzione o prima di essere rilasciate per l’applicazione clinica, quanto bene questi risultati correlano con l’efficacia in vivo non è ancora stato Stabilito. L’efficacia in vivo dipende da una serie di fattori e variabili che non possono essere riassunti all’interno di un saggio in vitro. Tali variabili includono: homing delle cellule T CAR al sito del tumore, la stimolazione e l’attivazione della cellula T CAR e la sua capacità di persistere all’interno del paziente e il microambiente tumorale. Con un ulteriore perfezionamento il saggio xCELLigence può essere in grado di modellare alcuni di questi processi complessi in vitro.
Il protocollo qui fornito si applica alla maggior parte delle linee cellulari tumorali aderenti e ad alcune delle linee cellulari del tumore liquido. I campioni clinici come le cellule tumorali primarie, tuttavia, devono essere ulteriormente testati e ottimizzati a causa della complessità dei tipi e delle fasi tumorali. Vale certamente la pena notare che il sistema di analisi della potenza in vitro qui descritto utilizza linee cellulari tumorali solo per riflettere la potenziale attività delle cellule T CAR. La vera situazione tumorale all’interno del corpo umano è molto più complessa, soprattutto quando un tumore solido è mirato, a causa dell’ambiente tumorale dinamico e dello sviluppo. Pertanto, il risultato della valutazione della potenza potrebbe non tradursi molto bene nell’efficacia clinica delle cellule T CAR testate.
In sintesi, la piattaforma xCELLigence basata su impedimento presentata consente il monitoraggio senza etichette dell’uccisione cellulare per un lungo periodo di tempo, vale a dire fino a 10 giorni. Questa capacità per una scala temporale così lunga per la raccolta dei dati differenzia la tecnologia da altri saggi che sono attualmente in uso e che richiedono la creazione di più repliche sperimentali per la raccolta di punti temporali e la laboriosa manipolazione dei campioni. Inoltre, il contributo minimo del segnale delle cellule immunitarie dell’effettore semplifica l’analisi dei dati. Il software è in grado di elaborare i dati automaticamente e generare parametri utili come la percentuale di citolisi, KT50, ecc. La tecnologia ha già dimostrato un’elevata sensibilità (con rapporti E:T a partire da 1:20) e una vasta gamma dinamica (con rapporti E:T da 20:1 a 1:20), che non è facilmente raggiungibile con altri saggi. Nel complesso, l’implementazione di questa tecnologia dovrebbe consentire un’analisi dei dati più accurata su una scala di velocità effettiva più elevata che migliorerà lo sviluppo di reagenti a cellule T CAR, facendo avanzare il campo a un ritmo molto più elevato.
The authors have nothing to disclose.
Gli autori ringraziano ProMab Biotechnologies e ACEA Biosciences per aver fornito i reagenti e gli strumenti utilizzati in questo studio.
7-AAD | Biolegend | 420404 | |
Anti-CD40, liquid tumor killing assay kit | ACEA Biosciences | 8100005 | |
anti-human F(ab')2 | Jackson Immunoresearch laboratories. | 109-116-088 | |
APC anti-CD3 | Biolegend | 317318 | |
Assay medium RPMI1640 | life technologies.Corp | 11875-093 | |
CAR-T cell frozen solution CryostorCS10 | Stemcell technologies | #07930 | |
CAR-T cell medium from ProMab | AIM-V+300IFU/ml IL-2 | 12055-091 | |
CD3/CD28 coated microbeads, Dynabeads | Thermofisher | 11131D | |
DMEM | GElifesciences.com | SH30243.02 | |
FACS buffer | Promab made | ||
FBS | Lonza.com | 14-503F | |
HEK293FT | Thermo Fisher | R70007 | |
INFg ELISA kit | Thermo Fisher | ||
Lentiviral Packaging Mix | System Biosciences | VP100 | |
Lenti-X quantitative RT-PCR titration kit (Clontech) | Takara | 631235 | |
Promab medium for target cells | Varied with cell lines | ||
Real time Cellular Analyer | ACEA Biosciences | ||
Thermal cycler | Thermo Fisher | ||
Transduction enhance agent, Virus Transduction Enhancer (Alstem) | Transplus, Alstem | V020 | |
Transfection dilution solution, Opti-MEM | Thermo Fisher | ||
Transfection reagent, NanoFect reagent | Alstem | NF100 |