Summary

Préparation et Modification de gène de Primate non-humaine souches hématopoïétiques et des cellules progénitrices

Published: February 15, 2019
doi:

Summary

Le but du présent protocole est d’isoler les primates non-humains CD34+ des cellules de moelle apprêtée, gène-modification de ces cellules avec des vecteurs lentiviraux et de préparer un produit infusion dans l’hôte autologue. La longueur totale de protocole est d’environ 48 h.

Abstract

La transplantation de cellules (CSPH) souches et progénitrices hématopoïétique a été une thérapie de pierre angulaire pour la leucémie et autres cancers pendant près d’un demi-siècle, est le seul remède connu d’infection par le virus d’immunodéficience humaine (VIH-1) à la base et prometteuse immense dans le traitement des maladies génétiques comme la bêta-thalassémie. Notre groupe a élaboré un protocole de thérapie génique HSPC modèle de primates non-humains (PNH), permettant aux scientifiques d’optimiser les mêmes réactifs et techniques qui sont appliqués à la clinique. Nous décrivons ici les méthodes pour purifier le CD34+ HSPCs et des sous-ensembles de cellules souches hématopoïétiques (CSH) persistant à long terme d’apprêté la moelle osseuse (BM). Techniques identiques peuvent être utilisés pour la purification des autres sources HSPC (p. ex., mobilisé de sang périphérique des cellules souches [CSSP]). Décrit est un protocole de 2 jours dans lequel cellules sont purifiés, cultivées, modifiés avec lentivirus (LV) et préparés pour perfusion vers l’hôte autologue. Des lectures clés de succès comprennent la pureté de la CD34+ HSPC population, la capacité de HSPCs purifiés pour former des colonies morphologiquement distinctes dans les milieux semi-solides et, surtout, efficacité de modification génétique. Le principal avantage de la thérapie génique HSPC est la capacité à fournir une source de cellules longue durée de vie qui donnent lieu à tous les types de cellules hématopoïétiques. Comme tel, ces méthodes ont été utilisées aux thérapies de modèle pour le cancer, les maladies génétiques et maladies infectieuses. Dans chaque cas, l’efficacité thérapeutique est établie en améliorant la fonction de la progéniture HSPC distincte, y compris les globules rouges, lymphocytes T, lymphocytes B ou sous-ensembles myéloïdes. Les méthodes pour isoler, modifier et préparer HSPC produits sont directement applicables et traduisible à plusieurs maladies chez des patients humains.

Introduction

Thérapie génique cellules souches est un moyen puissant pour traiter un large éventail de pathologies humaines. Thérapie génique HSPC est une approche particulièrement attractive, en raison de i) la facilité relative de recueillir ces cellules provenant de patients, ii) la richesse de la connaissance qui n’est disponible concernant les surface phénotypes cellulaires et ex vivo paramètres de culture et, comme le domaine s’agrandit, car iii) il présente des scientifiques avec une boîte à outils croissant de stratégies de modification génique adaptés à diverses maladies d’intérêt. Nous étudions activement HSPC gene therapy approches sous plusieurs angles, y compris les connaissances scientifiques fondamentales de biologie HSPC, la greffe de HSPCs modifiées dans les modèles précliniques in vivo et l’application à des populations de patients concernées. Nous et autres avons caractérisé le phénotype de surface cellulaire de fonctionnellement distinctes HSPC sous-ensembles1,2,3, la mobilisation et les régimes de conditionnement qui maximisent le rendement HSPC et greffe tout en minimisant la toxicité4,5et le gène modification et édition de gène des stratégies qui ont été adaptés à un large éventail de tumeurs malignes, génétique et maladies infectieuses6,7,8, 9,10. La fonction et la prise de greffe de HSPCs modifiées peuvent être évalués dans un certain nombre de modèles de petits et grands-animaux, dont des souris, des chiens et PSN. En particulier, les modèles de PSN sont avantageux car nombreux réactifs, par exemple, les anticorps spécifiques aux protéines de surface de cellules HSPC comme CD34 et CD90, peuvent être utilisés indifféremment dans les cellules humaines et PSN. En outre, contrairement aux souris, grands animaux tels les PSN permettent une approximation plus étroite de l’ampleur de la modification des gènes nécessaires à l’efficacité clinique. Enfin, PSN est l’étalon-or pour la modélisation de pathologies humaines telles que HIV-1 infection11 et un nouveau système modèle pour candidat anticancéreux et anti-VIH immunothérapies12,13.

Le but du présent protocole est de définir des méthodes pour purifier, modifier génétiquement et préparation de produits de perfusion NHP HSPC. Bien que hors de la portée du présent protocole, nous avons déjà montré que ces produits greffer chez les hôtes de PSN autologues, donnent lieu à toutes les lignées hématopoïétiques et offrent une efficacité thérapeutique dans un large éventail de modèles de la maladie1. Nous avons également caractérisé la clonalité d’après HSPCs et construit une plate-forme pour suivre la cinétique, le trafic et le phénotype des HSPCs individuelles et de leur progéniture, suivant la transplantation autologue1,14. Les méthodes présentées ici ont été mis au point avec les objectifs suivants : i) d’isoler HSPCs extrêmement purs et à long terme après sous-ensembles HSC, ii) de maintenir autorenouveler primitif au cours ex vivo la culture et iii) d’efficacement gène-modifier soit en vrac HSPCs ou à long terme faire une exception des sous-ensembles HSC. Nous employons magnétique assistée par cellule tri (MACS), ainsi que de la cellule activée par fluorescence triant (FACS), afin d’isoler phénotypiquement/fonctionnellement HSPC populations distinctes, compatibles avec les méthodes de nombreux groupes2,15, 16. L’entretien des CSH primitive culture (c’est-à-dire, minimisant la différenciation de ces cellules en progéniteurs engagés qui donnent lieu à pleinement différenciées des sous-ensembles lymphoïdes et myéloïdes) est un aspect essentiel du protocole décrit ici. Bien que précédemment, nous avons caractérisé les approches pour développer HSPCs tout en conservant un phénotype primitif17,18, ici, les auteurs décrivent un protocole qui met l’accent sur le maintien des CSH via un minime (48 h) et défini ex vivo culture.

La modification efficace des HSPCs et HSC sous-ensembles est des principaux objectifs du présent protocole. Parmi plusieurs approches, nous l’avons signalé, deux sont de loin les plus étudiés dans les essais cliniques : modification de gènes LV et gènes nucléase édition1,6,19. Stratégies de modification génétique parmi un certain nombre de plates-formes de nucléase utilisent spécifiquement modifier un gène ciblé d’intérêt, par exemple, le récepteur de chimiokine C-C type 5 (CCR5) pour le traitement de HIV infection7,19 ou Bcl11A pour le traitement des hémoglobinopathies6. Ici, nous nous concentrons sur la modification des gènes LV, dont des cargaisons transgéniques intègrent semirandomly dans le génome de8,1,20. Un avantage majeur des approches LV est la capacité à livrer de grandes quantités de matériel génétique (jusqu’à 8 ou 9 kilobases). Bien que les stratégies de modification de gènes sont élaborés pour cibler un transgène d’intérêt d’intégrer seulement à un locus spécifié par recombinaison homologue donneur (HDR), ces méthodes doivent être développement in vitro et sur des modèles animaux petits. En revanche, vecteurs de LV ont été utilisés intensivement dans les PSN et les patients21,22. Ce qui est important, le protocole décrit ici, qui utilise amorcée BM comme source HSPC départ, peut être facilement et largement adapté, par exemple, pour isoler le CSSP. Comme décrit ci-dessus, nous profitons du degré élevé de similarité génétique entre les PSN et les humains d’utiliser des réactifs qui sont applicables à ces deux espèces. Enfin, cette approche a été adaptée pour modifier d’autres sous-ensembles hématopoïétiques, à savoir T cellules12,23,24; l’avènement d’efficaces approches d’immunothérapie de lymphocytes T s’est appuyé fortement sur la même plateforme de LV utilisée dans le présent protocole. Ces méthodes conviennent à tout chercheur intéressé en biologie HSPC ou modification de gènes LV. Par exemple, le protocole de purification HSPC présenté ici pourrait servir à caractériser les nouveaux sous-ensembles HSC enrichi, comme décrit plus haut1,15,25. De même, la transduction LV méthodes présentées ici pourraient de même être appliquée et développée pour de nombreux autres types de cellules et les questions expérimentales, aussi bien dans des modèles in vitro et in vivo.

En résumé, nous présentons des méthodes pour isoler et modifier génétiquement le PSN HSPCs. Ces méthodes peuvent être facilement adaptées pour les autres espèces et d’autres sources de HSPCs. Ce protocole soigneusement contrôlé est très prometteur dans la modélisation des thérapies efficaces pour nombreuses maladies humaines.

Protocol

Autologue transplantations de PSN, d’amorçage (mobilisation), la collection de cellules et la modification des gènes sont menées conformes aux protocoles publiés précédemment26. Toutes les procédures expérimentales sont examinées et approuvées par le Comité de l’utilisation de la Fred Hutchinson Cancer Research Center et l’Université de Washington et d’institutionnels animalier (protocole #3235 – 01). Toutes les études sont réalisées en stricte conformité avec les recommand…

Representative Results

Le protocole décrit ci-dessus est conçu pour isoler et gène-modifier CD34 PSN+ HSPCs, qui peut ensuite être perfusé dans l’hôte autologue (Figure 1 et Figure 2). En suivant ce protocole, nous avons généralement obtenir jusqu’à 8 x 109 totales globules blancs de BM apprêtée de macaques de queue de cochon et, parfois, double de ce montant de macaques rhésus. Chez les deux espèces, le nombre de C…

Discussion

Vecteur de LV ingénierie est la méthode la mieux caractérisée de gène-modifier les types de cellules comme CD34+ HSPCs, destinés à la transplantation ultérieure in vivo. Le protocole décrit ici est conçu pour maximiser le nombre de HSPCs modifiées qui persistent à long terme in vivo et fournir des avantages cliniques aux patients atteints de diverses maladies malignes, infectieuses et génétiques. Bien que les stratégies de modification génique ont vu le jour ces dix dernières années, les cell…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Les auteurs remercient Helen Crawford pour la préparation de ce manuscrit et Jim Woolace pour la conception graphique et Veronica Nelson Devikha Chandrasekaran pour avoir participé à l’élaboration du protocole. L’élaboration du présent protocole a été pris en charge par des subventions de la NIH National Institute of Allergy et maladies infectieuses (R01 AI135953 et AI138329 à H.P.K.) et le National Heart, Lung, and Blood Institute (R01 HL136135, HL116217, P01 HL122173 et U19 HL129902 à H.P.K.), ainsi que les NIH P51 OD010425 et, en partie par le NIH/NCI Cancer Center, Support Grant P30 CA015704. H.P.K. est un chercheur de médecine moléculaire Markey et reçu le soutien comme premier récipiendaire de la chaire José Carreras/E. Donnall Thomas doué pour la recherche sur le Cancer et la chaire de Fred huche pour cellulaire et Gene Therapy.

Materials

Stemspam SFEM II ("HSPC") Media StemCell 09655
Hank's Balanced Salt Solution Gibco 14175095
Phosphate-Buffered Saline Gibco 14190-144
Penicillin/Streptomycin Gibco 15140-122
Dimethyl Sulfoxide Sigma Aldrich D2650-100
100% Ethanol Decon labs M18027161M
Cyclosporine Sigma 30024-25MG
500 mM EDTA Invitrogen 15575-038
Heat-Inactivated Fetal Bovine Serum Sigma Aldrich PS-0500-A
CH-296/ RetroNectin (2.5 mL, 1 µg/µL) TaKaRA T100B
Bovine Serum Albumin Sigma A7906-100g
HEPES Sigma H9897
Rat anti-mouse IgM magnetic beads Miltenyi Biotec 130-047-301
Recombinant HumanStem Cell Factor (SCF) Peprotech 300-07
Recombinant Human Thrombopoietin (TPO) Peprotech 300-18
Recombinant Human FMS-like tyrosine kinase 3 (FLT-3) Peprotech 300-19
Protamine sulfate Sigma P-4505
14 mL Polypropylene Round-Bottom Tube Corning 352059
Colony Gel 1402 ReachBio 1402
QuadroMACS Separators Miltenyi Biotec 130-090-976
MACS L25 Columns Miltenyi biotec 130-042-401
10 mM PGE2 Cayman Chemical 14753-5mg
TC-treated T-75 flasks Bioexpress T-3001-2
Non-TC-treated T-75 flasks Thermo-Fisher 13680-57
20 ml syringes BD Biosciences 302830
16.5 G needles BD Precision 305198
Syringe Tip Cap BD Biosciences 305819
QuickExtract DNA Solution Epicentre QE09050
8-tube strip cap PCR Tubes USA scientific 1402-2708
96-well Thermocycler Thermo-Fisher 4375786
Pre-Separation filters Miltenyi Biotec 130-041-407
Strainer, Cell; BD Falcon; Sterile; Nylon mesh; Mesh size: 70um; Color: white; 50/CS fisher scientific 352350
Ultracomp ebeads eBioscience 01-2222-42
MACSmix Tube Rotator Miltenyi 130-090-753
3 mL Luer-Lock Syringes Thermo-Fisher 14823435
35 mm x 10 mm cell culture dish Corning 430165
60 mm x 15 mm cell culture dish Corning 430196
150 mm x 25 mm cell culture dish Corning 430599
Non TC treated flasks Falcon 353133
Qiagen DNA extraction Qiagen 51104
PE Anti-Human CD90 (Thy1) Clone:5E10 Biolegend 328110
PE-CF594 Mouse Anti-Human CD34 Clone:563 BD horizon 562449
APC-H7 Mouse Anti-Human CD45RA Clone: 5H9 BD Pharmingen 561212
V450 Mouse Anti-NHP CD45 Clone:d058-1283 BD Biosciences 561291
Autologous Serum Collected from autologous host and cryopreserved prior to mobilization and collection of CD34+ HSPCs N/A Beard, B. C. et al. Efficient and stable MGMT-mediated selection of long-term repopulating stem cells in nonhuman primates. Journal of Clinical Investigation. 120 (7), 2345-2354, (2010).
Virus-Conditioned Media (VCM) Kiem Lab, FHCRC Co-operative Center for Excellence in Hematology (CCEH) N/A Beard, B. C. et al. Efficient and stable MGMT-mediated selection of long-term repopulating stem cells in nonhuman primates. Journal of Clinical Investigation. 120 (7), 2345-2354, (2010).
Anti-CD34 antibody, Clone 12.8 Kiem Lab N/A Beard, B. C. et al. Efficient and stable MGMT-mediated selection of long-term repopulating stem cells in nonhuman primates. Journal of Clinical Investigation. 120 (7), 2345-2354, (2010).
Lenti F primer: AGAGATGGGTGCGAGAGCGTCA Integrated DNA Technologies N/A Peterson, C. W. et al. Multilineage polyclonal engraftment of Cal-1 gene-modified cells and in vivo selection after SHIV infection in a nonhuman primate model of AIDS. Mol Ther Methods Clin Dev. 3 16007, (2016).
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Actin F primer: TCCTGTGGCACTCACGAAACT Integrated DNA Technologies N/A Peterson, C. W. et al. Multilineage polyclonal engraftment of Cal-1 gene-modified cells and in vivo selection after SHIV infection in a nonhuman primate model of AIDS. Mol Ther Methods Clin Dev. 3 16007, (2016).
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Radtke, S., Perez, A. M., Venkataraman, R., Reddy, S., Haworth, K. G., Humbert, O., Kiem, H., Peterson, C. W. Preparation and Gene Modification of Nonhuman Primate Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. J. Vis. Exp. (144), e58933, doi:10.3791/58933 (2019).

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