En este protocolo, se describe el flujo de trabajo completo para el aislamiento rápido de vesículas extracelulares de sangre humana y caracterización de marcadores específicos por análisis de seguimiento de nanopartículas basada en fluorescencia. Los resultados presentados muestran un alto nivel de reproducibilidad y pueden regularse en sobrenadantes de cultivo celular.
Las vesículas extracelulares (EVs), incluyendo exosomas, son especializadas membranosas vesículas de tamaño nanométrico encontradas fluidos corporales que son constitutivamente liberados de muchos tipos de células y desempeñan un papel fundamental en la regulación de la comunicación de la célula y una amplia gama de procesos biológicos. Se han descrito muchos métodos diferentes para la caracterización de los vehículos eléctricos. Sin embargo, la mayoría de estos métodos tienen la desventaja que la preparación y caracterización de las muestras son muy desperdiciador de tiempo, o es muy difícil analizar los marcadores específicos de interés debido a su tamaño pequeño y debido a la falta de discreta poblaciones. Mientras que los métodos para el análisis de los vehículos eléctricos se han mejorado considerablemente durante la última década, todavía no hay ningún método estandarizado para la caracterización de EV solos. Aquí, demostramos un método semiautomático para la caracterización de los vehículos eléctricos solo por el análisis de seguimiento de nanopartículas basada en fluorescencia. El protocolo que se presenta aborda el problema común de muchos investigadores en este campo y proporciona el flujo de trabajo completo para el aislamiento rápido de EVs y caracterización con PKH67, un enlazador de membrana celular general, así como con marcadores superficiales específicos tales como CD63, CD9, vimentina y proteína de la membrana lisosomal asociada 1 (lámpara-1). Los resultados presentados muestran un alto nivel de reproducibilidad, confirmado por otros métodos, como el Western blot. En los experimentos realizados, utilizamos exclusivamente EVs aisladas de muestras de suero humano, pero este método también es conveniente para plasma u otros fluidos corporales y puede ajustarse para la caracterización de los vehículos eléctricos de sobrenadantes de cultivo celular. Independientemente de los progresos futuros de la investigación en biología EV, el protocolo que aquí se presenta ofrece un método rápido y confiable para la caracterización rápida de vehículos eléctricos solo con marcadores específicos.
Las vesículas extracelulares (EVs), incluyendo exosomas, son especializadas membranosas nano-clasificadas vesículas (20-150 nm) que contenga ciertas combinaciones de lípidos, adhesión y moléculas de señalización intercelulares, así como otros componentes citosólicas funcionales como microRNA (miRNA) y mRNA y juegan un papel fundamental en la regulación de la célula comunicación1,2. EVs se liberan en su entorno de muchos diferentes tipos de células, por ejemplo, las células endoteliales, células inmunitarias y las células del tumor y puede detectarse en los fluidos corporales como semen de suero, orina, leche materna, saliva o líquido cefalorraquídeo3, 4. creciente número de estudios destaca la contribución diversa de vehículos eléctricos como posibles biomarcadores para el diagnóstico precoz de varias enfermedades o predicción de progresión de la enfermedad5,6. Exosomas son descritos a menudo por la presencia de moléculas que se asocian específicamente, independientemente del tipo de células que derivan de7. Por ejemplo, exosomas contienen diferentes tetraspaninas (CD9, CD63, CD81), importante clase complejo de histocompatibilidad I (MHC I) moléculas, diversas proteínas transmembranales, típico proteínas citosólicas (tubulina y actina), moléculas implicadas en cuerpo multivesicular ( Biogénesis MVB) TSG101 y alix, calentar las proteínas de choque (HSP 70 y HSP 90), y proteínas que participan en la señal de transducción de señales (proteínas quinasas)8.
Se han descrito muchos métodos diferentes para la caracterización de EVs9. Los métodos más comunes y frecuentes para el análisis de EV son flujo cytometry10, análisis de microscopia electrónica (SEM) y transmisión de microscopía electrónica (TEM)11. El método mejor y comúnmente utilizado para la caracterización bioquímica de los contenidos de EV es Western Blot12,13. Mientras que SEM y TEM permiten la detección de los vehículos eléctricos en todo el espectro de todo tamaño, la escasa identificación de proteínas específicas de la superficie es una desventaja particular de estos métodos. En cambio, citometría de flujo es una herramienta poderosa para la identificación de marcadores de superficie específicos EV, pero el umbral de este método limita el análisis a EVs con un tamaño mayor a 500 nm. Por lo tanto, análisis de los vehículos eléctricos aislados con la detección de marcadores de superficie específicos actualmente no es accesible a través de cualquiera de estos tres métodos bien establecidos. Describimos previamente otro método muy sensible para la visualización y análisis de los vehículos eléctricos, análisis de seguimiento de nanopartículas (NTA)14. Brevemente, este método combina dos principios físicos diferentes. En primer lugar, las partículas dispersan la luz cuando son irradiadas con un rayo láser, y el segundo principio, conocido como movimiento browniano, implica que la difusión de diversas partículas en una suspensión líquida es inversamente proporcional a su tamaño. El instrumento de análisis semiautomático nanopartículas escritorio para muestras líquidas consiste en el rastreo analizador con un análisis basado en el software, donde se registran imágenes digitales de luz dispersada de las partículas individuales de partículas. Las partículas y el movimiento de las partículas se detectan por un microscopio de dispersión láser con una cámara de vídeo. El rayo láser está orientado verticalmente, mientras que el eje óptico es horizontal y centrada en el canal de célula llenado con la muestra. Los datos proporcionados por parcelas de dispersos puntos de luz y su velocidad de movimiento permiten la determinación de la distribución de tamaño y conteo de partículas total. Después de la irradiación con el láser, las partículas dispersan la luz, que es grabada por una cámara de vídeo digital mediante el microscopio14. El avance a nuestro método anterior es la inserción de un filtro de corte de paso de onda larga (LWP) 500 nm entre el láser (longitud de onda de 488 nm) y el canal de la célula, que permite el análisis directo de las partículas marcados con fluorescencia (figura 1). Nuestro protocolo dirige la demanda común de muchos investigadores en este campo para una caracterización rápida de vehículos eléctricos individuales, por ejemplo, según su origen parental. En este protocolo, se describe el flujo de trabajo completo para el aislamiento rápido de los vehículos eléctricos de la sangre entera humana y rápida caracterización de marcadores específicos por análisis de seguimiento de nanopartículas basadas en fluorescencia. EVs puede detectarse mediante tinción con PKH67, un enlazador de membrana celular general, así como con marcadores exosomal específicos, por ejemplo, CD63, CD9 y vimentin. Nuestro protocolo es también conveniente para EDTA y plasma citratado, así como otros fluidos corporales y sobrenadantes de cultivo celular.
Demostramos un protocolo detallado para el aislamiento de EVs de sangre total y rápida caracterización de marcadores de superficie específicos con nanopartículas basadas en fluorescencia análisis de seguimiento. En los experimentos realizados, utilizamos exclusivamente EVs aisladas de muestras de suero, pero este método también es conveniente para el ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) y plasma citratado y también puede ser ampliado a otros líquidos corporales como orina, leche materna, saliva, líquido cerebroespinal y el semen. Por otra parte, este protocolo puede ajustarse para la caracterización de los vehículos eléctricos de sobrenadantes de cultivo celular. En este protocolo, se generó la suspensión de la EV de 100 μL de suero utilizando un reactivo de precipitación de exosomas, que contiene un polímero patentado que precipita suavemente exosomas y EVs según un tamaño corpuscular desde 30 nm a 200 nm, por el que 10-20 μL de los vehículos eléctricos fueron designados para la caracterización de cada marcador superficial. Por desgracia, el paso de aislamiento es inevitable, porque la alta cantidad de proteína en muestras de suero (p. ej., albúmina y globulina) interfiere con el anticuerpo procedimiento de tinción y resultados de alto nivel del fondo y los resultados sofisticados. Además, basado en la disponibilidad biológica de los exosomas en las muestras, la cantidad de la suspensión de EV empleada así como la dilución antes de la transformación se debe ajustar para otros materiales. Para comparar las muestras múltiples, es necesario un enfoque estandarizado para la dilución de las muestras así como parámetros de adquisición consistente (sensibilidad, obturación, etc.). Otro punto importante es que las mediciones no se inician hasta que la deriva es baja (en nuestras manos, < 5 μm/s). Si la deriva era demasiado alta, medidas repetidas de la muestra rindieron alta desviación estándar entre sí, pero con una dispersión baja, los datos resultantes fueron muy constantes y confirmaron un alto nivel de reproducibilidad. Es importante que los anticuerpos seleccionados tengan un fluorocromo adecuado. Anticuerpos deben ser conjugados con Alexa Fluor 488, porque FITC tiene una alta tasa de foto-blanqueo. Posiblemente fluophores más estable sin duda conducirá a ensayo mayor estabilidad en el futuro. Normalmente, muchos investigadores utilizan PBS como un diluyente para EVs. De este protocolo, es esencial usar agua destilada como diluyente para las suspensiones de EV. Cuando EVs están marcado con colorantes fluorescentes, la alta osmolaridad y concentración de iones de otros diluyentes, como PBS, puede interferir con la medición y plomo para altera resultados.
Mientras que los métodos para el análisis de los vehículos eléctricos se han mejorado considerablemente durante la última década, todavía no hay ningún método estandarizado para aislamiento y caracterización de EVs. La desventaja principal de citometría de flujo, donde EVs están limitado a menudo a granos para proporcionar una superficie más grande, es que muchos EVs muelle sobre la superficie para proporcionar una señal fuerte y perceptible10. SEM y TEM tienen la desventaja que la preparación de muestras es desperdiciador de tiempo y EVs puede distinguirse solamente por su tamaño y morfología11. Hasta fecha, el método mejor y comúnmente usado para cualitativa (es decir, bioquímicos) caracterización de EV es Western Blot, donde pueden analizarse las proteínas con anticuerpos específicos12,13. Sin embargo, las desventajas de estos métodos radica en la imposibilidad de analizar solo EVs para marcadores de superficie específicos. Además, los largos tiempos de procesamiento y procedimientos de lavado largo, aislamiento utilizados por muchos de los protocolos actuales implican medidas intensivas, lo que no es adecuado para alto rendimiento y caracterización de EV solos. Nuestro protocolo proporciona un flujo de trabajo completo para rápido aislamiento y caracterización de EVs solo con marcadores de superficie específicos tales como CD63, CD9, vimentin y CD107a y puede ser expandida para un amplio espectro de otros marcadores de superficie para determinar el origen de lanzado EVs. Debido a un adelanto técnico permanente del dispositivo NTA, confirmamos nuestros resultados en cooperación con el fabricante con el analizador más reciente. Independientemente de los progresos futuros de la investigación en biología EV, particularmente acerca de exosomas, el protocolo que se presenta aquí proporcionará un método rápido y confiable para la caracterización de los vehículos eléctricos solo marcadores específicos. Porque hasta ahora es inevitable la agregación de los vehículos eléctricos durante el aislamiento y el procedimiento de tinción, la investigación futura debe centrarse en el desarrollo de métodos para prevenir la agregación de EV y permiten una determinación del tamaño exacto de marcado fluorescente EVs.
The authors have nothing to disclose.
Los autores agradecen la partícula Metrix GmbH para cubrir parcialmente los costos de publicación de este trabajo.
Serum-separation tube | BD | 366882 | BD Vacutainer |
Ampuwa water | Fresenius Kabi | 10060 | |
Dulbecco's phosphate-buffered saline | Sigma | 56064C | |
Falcon tube, 15 mL | Greiner Bio One | 188271 | |
Falcon tube, 50 mL | Greiner Bio One | 227270 | |
Microcentrifuge tube, 1.5 mL | Eppendorf | 30120086 | Speciality tubes for ultra centrifugation |
Tube with Snap-On Cap 1.5 mL | Beckman Coulter | 357448 | |
Polybeads Microspheres 0.2 µm | Polysciences, Inc. | 7304 | Alignment Solution |
Fluoresbrite YG Carboxylate Microspheres beads 0.2 µm | Polysciences, Inc. | 09834-10 | Alignment Solution |
Syringe, 2 mL | Braun | 4606027V | |
Syringe, 10 mL | Braun | 4606728V | |
Exoquick | SBI | EXOQ20A-1 | EV precipitation solution |
Laemmli Sample Buffer (2x) | BioRad | 1610737 | |
DC Protein Assay Kit II | BioRad | 5000112 | Lowry prtein assay |
PKH67 Green Fluorescent Cell Linker Kit | Sigma | PKH67GL-1KT | For general membrane labelling |
Alexa Fluor 488 anti-human CD107a Antibody | BioLegend | 328609 | Lysosomal-associated membrane protein-1 (LAMP-1) |
Human CD9-Alexa Fluor 488 | R&D Systems | FAB1880G | |
Anti-CD9 Antibody | SBI | EXOAB-CD9A-1 | |
CD63-Alexa Fluor 488 | ThermoFisher | MA5-18149 | |
FITC anti-human CD63 Antibody | BioLegend | 353005 | |
CD63. Antibody, polyclonal | SantaCruz | Sc-15363 | |
Alexa Fluor 488 anti-vimentin Antibody | BioLegend | 677809 | |
Anti-Vimentin Antibody | SBI | EXOAB-VMTN-1 | |
Goat anti mouse IgG + IgM | Jackson Immuno | 315-035-048 | |
Goat anti rabbit IgG | Dianova | 111-035-003 | |
SuperSignal West Femto Maximum Sensitivity Substrate | ThermoFisher | 34094 | |
ZetaView | Particle Metrix | PMX 100, Type | |
Centrifuge | Eppendorf | 5804R | |
Ultracentrifuge | Beckman Coulter | Optima MAX-XP | |
Chemiluminescence Imager | GE Healthcare | Amersham Imager 600 |