ב פרוטוקול זה, אנו מתארים את זרימת העבודה מלאה עבור בידוד מהיר של שלפוחית חוץ-תאי של דם אנושי ואפיון של סמני ספציפיים על-ידי ניתוח מעקב nanoparticle מבוסס על-ידי קרינה פלואורסצנטית. התוצאות שהוצגו להציג רמה גבוהה של הפארמצבטית, ניתן לכוונן תא תרבות supernatants.
שלפוחית חוץ-תאית (EVs), כולל exosomes, הם מיוחדים עלי הלוואי קרומיים בגודל ננו שלפוחית נמצאו נוזלי גוף צורונים משתחררים מכל סוגי תאים רבים, לשחק תפקיד מרכזי בוויסות תקשורת, מגוון רחב של תהליכים ביולוגיים. שיטות שונות רבות אפיון EVs תוארו. עם זאת, רוב השיטות האלה יש החיסרון כי הכנה ואפיון של הדגימות הן זמן רב, או קשה מאוד לנתח סמנים ספציפי של ריבית בשל גודלם הקטן, בשל היעדר דיסקרטית אוכלוסיות. בעוד שיטות לניתוח של EVs שופרו במידה ניכרת בעשור האחרון, יש עדיין אין שיטה סטנדרטית פלואורסנציה EV יחידס כאן, נדגים שיטה אוטומטי למחצה של אפיון של EVs יחיד על-ידי ניתוח מעקב nanoparticle מבוסס על-ידי קרינה פלואורסצנטית. פרוטוקול המוצג מטפל בבעיה נפוצה של חוקרים רבים בתחום זה ומספק את זרימת עבודה עבור בידוד מהיר של EVs ואפיון עם PKH67, מקשר קרום התא הכללית, כמו גם עם מסוים סמנים משטח כזה כמו CD63, CD9, vimentin, חלבון ממברנלי lysosomal-הקשורים 1 (המנורה-1). התוצאות שהוצגו להציג רמה גבוהה של הפארמצבטית, כפי שאושר על-ידי שיטות אחרות, כגון סופג המערבי. בניסויים מתנהל, השתמשנו באופן בלעדי EVs מבודד מן הדוגמאות סרום אנושי, אך שיטה זו מתאימה גם עבור פלזמה או נוזלי גוף אחרים, ניתן לכוונן את האפיון של EVs מן התא תרבות supernatants. ללא קשר ההתקדמות העתידית של מחקר על ביולוגיה EV, פרוטוקול זה מוצג כאן מספק שיטה מהירה ואמינה אפיון מהירה של EVs יחיד עם סמנים ספציפיים.
שלפוחית חוץ-תאית (EVs), כולל exosomes, הם מיוחדים עלי הלוואי קרומיים בגודל ננו שלפוחית (20-150 ננומטר) המכיל בשילובים מסוימים של ליפידים, אדהזיה מולקולות איתות המערכת, כמו גם רכיבים פונקציונליים אחרים cytosolic כמו microRNA (miRNA) ה-mRNA, ואתה משחק תפקיד מרכזי בוויסות תא-תא-תקשורת-1,–2. EVs משתחררים לסביבה שלהם רבים לסוגי תאים שונים, למשל, תאי אנדותל, תאים חיסוניים, תאים סרטניים, ניתן להבחין בנוזלי גוף כגון סרום זרע, שתן, חלב אם, רוק או נוזל מוחי שדרתי3, 4. Increasing מספרים של מחקרים לסמן את תרומתו מגוונות של EVs סמנים ביולוגיים פוטנציאלי לאבחון מוקדם של מחלות מספר ו/או חיזוי של המחלה התקדמות5,6. Exosomes מתוארים לעתים קרובות על ידי הנוכחות של מולקולות שהן משוייכות באופן ספציפי, ללא תלות בסוג התא שהם שואבים7. לדוגמה, exosomes מכילים tetraspanins שונים (CD9, CD63, CD81), רס ן histocompatibility מורכב מחלקה אני (MHC אני) מולקולות, חלבונים transmembrane שונים, חלבונים cytosolic טיפוסי (טובולין, אקטין), מולקולות מעורב (גוף multivesicular להן MVB) (TSG101 ונתנאל כהן), מחממים חלבונים הלם (HSP 70 ו- HSP 90), חלבונים להשתתף האות התמרה חושית (חלבונים kinases)8.
בשיטות רבות ומגוונות תוארו על האפיון של EVs9. השיטות הנפוצות ביותר בשימוש לניתוח EV הם לזרום cytometry10, סריקה מיקרוסקופ אלקטרונים (SEM) והילוכים מיקרוסקופ אלקטרונים (TEM)11. שיטת best-established ונמצאים בשימוש נפוץ איפיון ביוכימי של תוכן EV הוא מערבי סופג12,13. בעוד SEM, TEM לאפשר הגילוי של EVs הקשת גודל כולו, הזיהוי מוגבלת מאוד של חלבונים פני שטח מסוים הוא חיסרון מסוים בשיטות אלה. לעומת זאת, cytometry זרימה הוא כלי רב עוצמה עבור זיהוי ספציפי EV סמני פני השטח, אבל הסף של שיטה זו מגבילה את ניתוח EVs עם גודל גדול מ 500 ננומטר. ומכאן, ניתוח של EVs מבודד עם זיהוי של סמני פני שטח מסוים הוא כרגע לא נגיש באמצעות כל אחת מהשיטות ומבוססת שלושה אלה. תיארנו קודם לכן עוד שיטה רגישה מאוד עבור הדמיה וניתוח של EVs, ננו-חלקיק-מעקב ניתוח (נ)14. בקצרה, שיטה זו משלבת שני עקרונות פיזיים שונים. ראשית, חלקיקים פיזור אור כאשר הם נמצאים מוקרן עם קרן לייזר, העיקרון השני, המכונה תנועה בראונית, מרמז כי דיפוזיה של חלקיקים שונים בהשעיה נוזלי הוא ביחס הפוך לגודל שלהם. כלי ניתוח אוטומטי למחצה nanoparticle בשולחן העבודה עבור דגימות נוזלים מורכב החלקיק מעקב מנתח עם ניתוח המבוסס על תוכנה, שבו יירשמו תמונות דיגיטליות של אור מפוזר של חלקיקים בודדים. החלקיקים, את תנועת החלקיקים מזוהים על ידי מיקרוסקופ פיזור לייזר עם מצלמת וידאו. קרן הלייזר מכוון אנכית לציר האופטי הוא אופקי וממוקד לתוך התעלה התא מלא המדגם. הנתונים שסופקו על-ידי חלקות מפוזרות נקודות האור ומהירות שלהם התנועה מאפשרים הקביעה של התפלגות ספירת וגודל החלקיקים הכולל. לאחר הקרנה על ידי הלייזר, החלקיקים פיזור האור, אשר נרשם על ידי מצלמת וידאו דיגיטלית באמצעות מיקרוסקופ14. קידום לשיטה לשעבר שלנו היא החדרת 500 ננומטר ארוך גל (LWP) ניתוק מסנן לעבור בין הלייזר (אורך גל של 488 ננומטר) וערוץ התא, המאפשר ניתוח ישירה של חלקיקים התווית על-ידי קרינה פלואורסצנטית (איור 1). פרוטוקול שלנו כתובות משותף הביקוש של חוקרים רבים בתחום זה אפיון מהיר של EVs יחיד, למשל, על-פי מוצאם הורים. ב פרוטוקול זה, אנו מתארים את זרימת העבודה מלאה עבור בידוד מהיר של EVs של דם אנושי ואפיון מהיר של סמני ספציפיים על-ידי ניתוח מעקב אחר חלקיקים המבוססת על ידי קרינה פלואורסצנטית. ניתן להבחין EVs מכתים עם PKH67, מקשר קרום התא הכללית, כמו גם עם סמנים exosomal ספציפי, למשל, CD63, CD9 ו- vimentin. פרוטוקול שלנו מתאים גם EDTA, פלזמה citrated, כמו גם אחרים נוזלי הגוף, תא תרבות supernatants.
נדגים פרוטוקול מפורט עבור בידוד של EVs של דם מלא ואפיון מהיר של סמני פני שטח מסוים עם חלקיקים המבוססת על ידי קרינה פלואורסצנטית מעקב ניתוח. בניסויים מתנהל, השתמשנו באופן בלעדי EVs מבודד מן הדוגמאות סרום, אך שיטה זו מתאימה ethylenediaminetetraacetic חומצה (EDTA) ו פלזמה citrated ניתן גם להרחיב את נוזלי גוף אחרים כגון שתן, חלב אם, רוק, נוזל מוחי שדרתי, וזרע. יתר על כן, פרוטוקול זה ניתן לכוונן את האפיון של EVs מן התא תרבות supernatants. ב פרוטוקול זה, ההשעיה EV הופק מ- 100 μL של נסיוב באמצעות ריאגנט משקעים של exosome, אשר מכיל פולימר קניינית זה בעדינות ארגונייט שוקע exosomes ו- EVs בהתאם מידה corpuscular הנע בין 30 ננומטר ל-200 nm, לפיה 10-20 μL של EVs מונו פלואורסנציה כל סמן משטח. למרבה הצער, השלב בידוד הוא בלתי נמנע, כי כמות גבוהה של חלבון הדוגמאות סרום (למשל, אלבומין, גלובולין) משבש את הנוגדן מכתים הליך ותוצאות רמה גבוהה של רקע וממצאים מתוחכמים. יתר על כן, על סמך את הזמינות הביולוגית של exosomes הדגימות, הכמות של המתלה EV מועסקים, כמו גם הדילול לפני עיבוד שתישמר לחומרים אחרים מקור. כדי להשוות בין מספר דוגמאות, הכרחי בגישה סטנדרטית עבור הדילול של דוגמאות, כמו גם רכישת עקבי פרמטרים (רגישות, תריס, וכו ‘). נקודה חשובה נוספת היא כי המדידות לא הופעלו עד והרשע הוא נמוך (בידיים שלנו, < 5 μm/s). אם והרשע היה גבוה מדי, מדידות חוזרות של המדגם הניב סטיית תקן גבוהה בינם לבין עצמם, אך עם סחיפה נמוך, הנתונים המתקבלים הם מאוד עקביים ואישר רמה גבוהה של הפארמצבטית. חשוב שיש נוגדנים הנבחר של fluorochrome המתאים. חייב להיות מצומדת נוגדנים עם אלקסה עבור חיל הים 488, בגלל FITC יש שיעור גבוה של הלבנת-צילום. ואולי יותר יציב fluophores בהחלט יוביל ליציבות מוגברת assay בעתיד. בדרך כלל, חוקרים רבים להשתמש PBS כמו diluent עבור EVס עבור פרוטוקול זה, זה הכרחי להשתמש מים מזוקקים diluent המתלים EV. מתי EVs מסומנות עם צבעי ואזוריט osmolality גבוהה, ריכוז יון של מדלל אחרים, כגון PBS, יכול להתערב עם המדידה ושינינו להוביל לתוצאות.
בעוד שיטות לניתוח של EVs שופרו במידה ניכרת בעשור האחרון, יש עדיין אין שיטה סטנדרטית עבור בידוד ואפיון של EVס החיסרון העיקרי של cytometry זרימה, איפה EVs לעיתים קרובות מאוגדים חרוזים לספק משטח גדול יותר, הוא EVs רבים המזח על גבי המשטח לספק אות לזיהוי וחזק10. החיסרון כי הכנת דוגמאות גוזלת זמן, EVs רק ניתן להבחין ב שלהם ובגודל מורפולוגיה11SEM ויש TEM. למעלה נכון להיום, שיטת best-established ונמצאים בשימוש נפוץ עבור איכותי (קרי, הביוכימי) אפיון EV הוא מערבי סופג, היכן ניתן לנתח חלבונים עם נוגדנים ספציפיים12,13. עם זאת, החסרונות של כל השיטות האלה נובע חוסר היכולת לנתח EVs יחיד עבור סמני פני שטח מסוים. יתר על כן, זמן עיבוד טיימס ונהלים כביסה ארוך/בידוד המשמש רבים הפרוטוקולים הנוכחי לערב צעדים שדורשת, שהופך אותם למתאימים לא עבור תפוקה גבוהה מדגם ואפיון של EV יחידס פרוטוקול שלנו ומספק זרימת עבודה מלאה מהירה בידוד ואפיון של EVs יחיד עם סמני פני ספציפי כגון CD63, CD9, vimentin, CD107a, ואל ניתן להרחיב על קשת רחבה של סמנים אחרים משטח כדי לקבוע את מקור EV שפורסמוס בגלל קידמה טכנולוגית הקבועה של המכשיר נ, אנחנו אישר את הממצאים שלנו בשיתוף עם היצרן במנתח החדש. ללא קשר ההתקדמות העתידית של מחקר על ביולוגיה EV, במיוחד בנוגע exosomes, פרוטוקול זה מוצג כאן יספק שיטה מהירה ואמינה אפיון של EVs יחיד עם סמנים ספציפיים. מכיוון צבירה של EVs בתקופת הבידוד, מוכתמים הליך כה בלתי נמנע, למחקר עתידי צריך להתמקד בפיתוח שיטות כדי למנוע צבירת EV, לאפשר קביעת גודל מדויק של התווית על-ידי פלורסנט EVס
The authors have nothing to disclose.
המחברים מודים GmbH מה החלקיקים על חלקית המכסה את עלויות הפרסום של עבודה זו.
Serum-separation tube | BD | 366882 | BD Vacutainer |
Ampuwa water | Fresenius Kabi | 10060 | |
Dulbecco's phosphate-buffered saline | Sigma | 56064C | |
Falcon tube, 15 mL | Greiner Bio One | 188271 | |
Falcon tube, 50 mL | Greiner Bio One | 227270 | |
Microcentrifuge tube, 1.5 mL | Eppendorf | 30120086 | Speciality tubes for ultra centrifugation |
Tube with Snap-On Cap 1.5 mL | Beckman Coulter | 357448 | |
Polybeads Microspheres 0.2 µm | Polysciences, Inc. | 7304 | Alignment Solution |
Fluoresbrite YG Carboxylate Microspheres beads 0.2 µm | Polysciences, Inc. | 09834-10 | Alignment Solution |
Syringe, 2 mL | Braun | 4606027V | |
Syringe, 10 mL | Braun | 4606728V | |
Exoquick | SBI | EXOQ20A-1 | EV precipitation solution |
Laemmli Sample Buffer (2x) | BioRad | 1610737 | |
DC Protein Assay Kit II | BioRad | 5000112 | Lowry prtein assay |
PKH67 Green Fluorescent Cell Linker Kit | Sigma | PKH67GL-1KT | For general membrane labelling |
Alexa Fluor 488 anti-human CD107a Antibody | BioLegend | 328609 | Lysosomal-associated membrane protein-1 (LAMP-1) |
Human CD9-Alexa Fluor 488 | R&D Systems | FAB1880G | |
Anti-CD9 Antibody | SBI | EXOAB-CD9A-1 | |
CD63-Alexa Fluor 488 | ThermoFisher | MA5-18149 | |
FITC anti-human CD63 Antibody | BioLegend | 353005 | |
CD63. Antibody, polyclonal | SantaCruz | Sc-15363 | |
Alexa Fluor 488 anti-vimentin Antibody | BioLegend | 677809 | |
Anti-Vimentin Antibody | SBI | EXOAB-VMTN-1 | |
Goat anti mouse IgG + IgM | Jackson Immuno | 315-035-048 | |
Goat anti rabbit IgG | Dianova | 111-035-003 | |
SuperSignal West Femto Maximum Sensitivity Substrate | ThermoFisher | 34094 | |
ZetaView | Particle Metrix | PMX 100, Type | |
Centrifuge | Eppendorf | 5804R | |
Ultracentrifuge | Beckman Coulter | Optima MAX-XP | |
Chemiluminescence Imager | GE Healthcare | Amersham Imager 600 |