Здесь, мы представляем протокол для ex vivo качественного обнаружения антиген специфические CD8+ T клетки. Анализ возможна с одной клеточных суспензий от органов или небольшое количество крови. Широкий спектр исследований требуют анализа ответов цитотоксических Т-клеток (вакцинации и Рак иммунотерапия исследований).
После вирусной инфекции, антиген специфические CD8+ цитотоксических Т-клеток (CTL) возникают и вносить вклад в ликвидацию инфицированных клеток, чтобы предотвратить распространение патогенов. Таким образом частота антиген специфические ЦТЛ свидетельствует о прочности клеток T ответ против специфического антигена. Такой анализ имеет важное значение в основных иммунологии, разработки вакцин, рак иммунобиологии и адаптивной иммунологии. В области вакцин CTL реакции, направленной против компоненты вектора вирусный совместно определяет, насколько эффективна поколения антиген специфические клетки против антигена интереса (то есть, трансген). Антиген специфические ЦТЛ либо могут быть обнаружены путем стимуляции с последующим внутриклеточных цитокинов пятнать или прямого окрашивания клеток T антиген специфические рецепторы (TCRs) и анализ подачей cytometry специфических пептидов. Первый метод является довольно трудоемким, так как он требует принесения в жертву животных, чтобы изолировать клетки от органов. Кроме того он требует изоляции крови от мелких животных, которые трудно выполнить. Последний метод является довольно быстро, можно легко сделать с небольшим количеством крови и не зависит от конкретных эффекторных функций, таких как цитолитических активности. MHC-тетрамера являются идеальным инструментом для выявления TCRs антиген специфические.
Здесь мы описываем Протокол одновременно обнаруживать антиген специфические списки для immunodominant пептидов вирусный вектор VSV-GP (LCMV-GP, VSV-NP) и трансгенов (OVA, Е7 ВПЧ 16, eGFP), MHC я Тетрамер окрашивания и потока цитометрии. Окрашивание можно непосредственно из крови или из одного клеточных суспензий таких органов, как селезенке. Крови или одну ячейку суспензий органов инкубируют с тетрамера. После окрашивания с антителами против CD8 и CD3, антиген специфические ЦТЛ количественно подачей cytometry. При необходимости, антитела против CD43, CD44, CD62L или другие могут быть включены определить состояние активации антиген специфические CD8+T клетки и различать наивными и эффекторных клеток.
Цель этого метода является для оценки частоты ответов цитотоксических Т-лимфоцитов (CTL) (несколько) антигены в мыши гранулярных анализа потоков без необходимости времени пептид стимуляции. Этот метод анализирует фенотипа и антиген специфика подмножеств CTL, в одного окрашивания. Мы оптимизировали комплекс гистосовместимости майор я (MHC I) Тетрамер пятнать протокол для анализа эффективности новых подходов вакцины, например VSV-GP, новый вариант вируса везикулярного стоматита (ВСВ), где была заменена гликопротеина G от VSV гликопротеин GP лимфоцитарный хориоменингит вирус (LCMV)1,2. В дополнение к гуморальный ответ важным считывания эффективность вакцины является индукции CTL ответ против одного или нескольких антигенов. Как последовательность и долговечность клеточного ответа имеют важное значение в этом контексте, это благоприятный для мониторинга кинетики CTL ответов от же животное. Это также приведет к сокращению поголовья, важным аспектом относительно принципов «3Rs»3. Следовательно анализ от всего лишь 20 мкл крови является оптимальным для этой цели.
В конце 90-х годов были разработаны тетрамера4 и стал важным инструментом в области иммунологии Т-клеток. Тетрамера являются дневно меченых комплексы четырех MHC I / пептид молекулы, которые привязку к TCRs, специфических для одного пептид. В настоящее время, они могут быть либо куплены готовые5, обычай приказал бесплатно на объекте Core Тетрамер NIH в Университете Эмори6 или производимых в лаборатории7. MHC, I и II тетрамера, доступных, , т.е. для CD8+ и CD4 клеток+ T, соответственно. Потенция Тетрамер окрашивания заключается в экономии времени, довольно просто и легко стандартизировать8 протоколов и чувствительность9. Кроме того при работе с кровью, животных не нужно приносить в жертву и минимальное количество образца не требуется. Одно измерение не ограничивается одной антигена, но несколько антигены могут быть проанализированы в одной окрашивание, когда объединения тетрамера проспряганное с различными флуорофоров. Недавно обнаруженные антигены, например от экранов пептид, легко могут быть включены в тетрамера и используется для количественного определения подмножества Т-клеток.
Тетрамер окрашивания не даст информацию о функциональности CTL (т.е.., производство цитокинов, эффекторные функции), но только специфичности. Для получения сведений о Т-клеток функциональность, внутриклеточных цитокинов, окрашивание (ICS) или Assay фермента, связанных Immuno пятно (ELISpot) должны быть выполнены8,10. Тетрамер окрашивание и ICS/ELISpot, однако, не являются избыточными, но скорее дополняют друг друга. В пробирке стимуляции заставить цитокиновой продукции для ICS/ELISpot будет изменять оригинальный фенотип Т-клеток. Тетрамер окрашивание, напротив, оставляет Т-клеток нетронутыми; оригинальные фенотип сохраняются и могут быть проанализированы. Кроме того еще одним большим преимуществом тетрамера является, что окрашивание может сочетаться с магнитной сортировки и обогащение антиген специфические клетки11. Это позволяет для анализа редких населения, а также культивирования сортировки клеток с определенный антиген-специфические особенности — это функция, которая является не представляется возможным с другими методами.
Используя протокол, описанные здесь, Тетрамер окрашивания, а также ICS/ELISpot может быть выполнена из одного органа, потому что только очень мало материала (кровь: 20 мкл; селезенка: 1 x 106 клеток) необходим для окрашивания Тетрамер. Однако в зависимости от частоты антиген специфические клетки интереса, сила соответствующих TCR и экспериментальной контекста, количество необходимых клеток может потребоваться масштабировать или магнитного обогащения может потребоваться применить.
Тетрамера широко используются, например оценить эффективность вакцин (противоопухолевое)12,13,,1415 или иммунотерапии16,17, анализ фенотипических и пространственных Локализация антиген специфические Т-клеток подмножеств18,19,20,21,22,23. Метод, описанный здесь подходит для исследований, которые призваны включать количественную оценку и фенотипического анализа мышиных антиген специфические CD8+ T-клеток в их анализе в быстрый и удобный способ.
Тетрамер окрашивание является довольно простой и несложный протокол для анализа фенотипа и пептида специфика Т-лимфоцитов. Использование крови для анализа, как описано здесь, минимально инвазивных и обеспечивает непрерывный мониторинг, например в исследованиях вакцинации. В области вакцинации количественная оценка вектор – и антиген специфические реакции представляет интерес, как вектор конкретных ответов может помешать эффективной иммунный ответ против антигенов вакцины28. Следует отметить, что с протоколом, описанные здесь, обе популяции могут быть количественно одновременно в одном Тетрамер окрашивание, снижая изменчивость окраски и образец сумм. Однако несколько шагов необходимо тщательно сделать для обеспечения надлежащего измерения и надежных данных. При использовании крови из вен хвост для анализа, один следует обязательно предварительно теплой животных, чтобы вызвать вазодилатацию24. Таким образом достаточно крови могут быть собраны в течение короткого времени, снижение стресса на животных и анализ гораздо лучше, по сравнению с, если кровь собирается медленно. Кроме того после проб (крови и органов), прямого окрашивания рекомендуется избегать ложных отрицательных результатов благодаря TCR даунрегуляция. То же самое для всех последующих шагов: процедура не должна быть прервана и все этапы стирки уменьшен до минимального числа (как указано в протоколе). Чтобы обеспечить правильное окрашивание, следует позаботиться вихря все решения и образцов до и после инкубации. Это особенно важно до фиксации образцов во избежание слипания клеток.
С точки зрения изменения протокола, других поверхностных маркеров и тетрамера могут использоваться, в зависимости от цели анализа. Однако все реагенты затем нужно титруют, оптимально в сочетании с весь пятнать панели. Для некоторых из тетрамера, указанный здесь, оптимизации показал, что мы можем увеличить разрежения, рекомендованный производителем (1:10 рекомендуется, оптимизированный 1:25) (Таблица 1). Чтобы компенсировать спектрального наложения, бусины компенсации может использоваться вместо окрашенных клеток. Что касается выбор Тетрамер в сочетании флюрохром, один следует предусмотреть использовать яркие флуорохромов, как это облегчает обнаружение – особенно при низком уровне сигнала. 29Долтоне и коллег, мы предпочитаем использовать PE – или APC-в сочетании тетрамера, которые могут быть вполне объединены в единый окрашивание и CD8+ T клетки с точностью один антиген может быть красиво обнаружено (рис. 2). Что касается температуры и инкубации раз существует целый ряд Тетрамер пятнать условия. В нашей оптимизации процесса мы рассмотрели этот вопрос и Тетрамер пятнать в разных условиях (например, 4 ° C, комнатной температуры или 37 ° C). Из полученных результатов мы рекомендуем пятно для 20 минут при 37 ° C, который в соответствии с литературы30,31. Следует избегать длительного инкубации, как это может привести к интернализации Тетрамер30 и false отрицательные результаты.
Выбор правой антитела для обнаружения CD8+ клетки является еще одним важным вопросом, который должен тщательно рассмотреть (и потенциально адаптированы). Это вытекает из того факта, что некоторые антитела анти CD8 клоны блок связывание тетрамера с TCR, в человека32 , а также мыши33 образцы. Для наших Тетрамер пятнать протокол, мы выбрали клон 53 – 6.7 пятно для мышиных CD8+ клетки — клон, который не блокировать, но скорее укрепляет Тетрамер пятнать.
Тетрамер пятнать довольно несложный, при анализе известных иммунные реакции на пике реакции клеток T, например. Однако возможно, населения, которые являются немного более «проблемных». Такие примеры включают в себя клетки, специфичных для низкого сродства антигены (опухоли, самоуправления), недавно активированных клеток, который впоследствии вниз регулирует их рецепторов или подмножества редких ячейки (например,. наивно прекурсоров или памяти клеточных популяций). В этих случаях классическая Тетрамер пятнать протокол может потребоваться быть улучшены или в сочетании с другими методами. К примеру протеин киназы ингибитора (PKI) dasatinib препятствует TCR интернализации и могут быть включены до Тетрамер пятнать. Тетрамера также могут быть стабилизированы, включая анти флюрохром неконъюгированной первичной Abs после Тетрамер пятнать. Кроме того интенсивность флуоресценции может быть увеличена добавлением второй анти Ab конъюгированных флюрохром Ab29,34,35,36. Мы оптимизированные условия выборочно для тетрамера, указанных в настоящем Протоколе и не включают PKI или дополнительных Abs. Однако для любых других Тетрамер, оптимальные условия должны корректироваться индивидуально. Что касается редких населения Тетрамер пятнать может потребоваться сочетаться с магнитного обогащения11.
Для облегчения и проверить анализ СУИМ Тетрамер окрашивание, негативные и позитивные элементы должны быть включены. Как отрицательный контроль мы всегда пятно клетки мыши наивный же штамма с нашими Тетрамер интерес. Кроме того образцы могут быть окрашены с тетрамера с нерелевантных пептиды, но с же флюрохром как Тетрамер интерес. Такие элементы управления имеют важное значение для исключения ложных положительных сигналов, например., из умирающих клеток. Помимо этого рекомендуется включать жить/мертвые пятна, например пропидий йодидом (PI). Это имеет особое значение, если ячейки не окрашенные непосредственно после изоляции. Еще одна стратегия для удаления фона аутофлюоресценция бы включить несколько маркеров Т клеток в одном канале. Исключая инфицированных клеток в этот канал, могут быть исключены T клеточных популяций. Как позитивный элемент образец из мыши OT-1 может использоваться для Тетрамер OVA, например. Для других тетрамера, это должен быть выбран индивидуально (например., образец от мыши, который было иммунизировано несколько раз). Так другие37, мы также наблюдаем вниз регулирование рецептора CD8 во время активации CTL на 7 день эффекторных клеток T ответ. Таким образом, чтобы избежать потери клеток-эффекторов Т активированного Тетрамер+ , мы рекомендуем включитьнизкой CD8 клетки в анализ (по крайней мере если измерения в фазе эффекторных).
Качество и количество информации, которую один можно получить из этого протокола зависит от знания о антигена изучаться, доступность и специфики Тетрамер и качество машины СУИМ (количество доступных детекторов и лазеры). При работе с животных образцы, изменения в иммунном ответе является естественным и неизбежным. Таким образом чтобы получить значимые результаты от Тетрамер окрашивание, по крайней мере 3-5 животных должны быть проанализированы. Если это сделано, протокол, описанные здесь даст надежных и воспроизводимых результатов (образцовый результат от одного эксперимента можно найти в Дополнительной таблице 1). Как упоминалось ранее, этот метод идеально подходит для количественного определения фенотипа и антиген специфика CD8+ Т-клеток (рис. 3, 4; Дополнительные рис. 1), не только в мышь, но и в организме человека. Однако для анализа CD8+ Т-клеток-эффекторов функции, такие как Гранзим индуцированной клеточной гибели, ICS или ELISpot должны быть выполнены. Однако следует иметь в виду, что функции клеток T, как измеряется в пробирке стимуляции может не представляют фактическое положение в естественных условиях. В естественных условиях, подавляющих окружающей среды могли бы предотвратить функции Т-клеток, которые измеряются в лабораторных условиях.
На свой собственный, Тетрамер окрашивания не предоставляет всю информацию, но она эволюционировала, чтобы стать важным методом для характеристики Т-клеток ответов и количественного определения подмножества Т-клеток in vitro в очень чувствительных образом38. Тетрамера не может использоваться только для количественно определенных подмножеств, но и для изолировать те39, локализовать их путем гибридизации in situ19,20 и изучения антигены низкого сродства, например опухольассоциированных40, 41. с момента открытия Тетрамер технологии4, окрашивание Тетрамер стал важным инструментом анализа Т-клеток и спектр применения.
The authors have nothing to disclose.
Этот проект финансировался Фондом Австрии науки FWF (номер P 25499-B13 проекта) и Европейского союза Horizon 2020 исследований и инновационной программы под предоставить соглашение № 681032. Следующие реагент был получен через низ Тетрамер Core: класс I MHC Тетрамер для Нуклеопротеиды вирус везикулярного стоматита (RGYVYQGL).
Safety cabinet class 2 | VWR | LBCP302411030 | |
Flow cytometer (e.g. FACSCanto II) | BD | 338962 | |
Analysis platform for flow cytometry analysis (e.g. FlowJo) | Fisher Scientific Co. L.L.C. | NC0887833 | |
Binocular microscopes, VisiScope 100 | VWR | 630-1553 | |
Vortex mixer | Phoenix Instrument | RS-VA 10 | |
Centrifuge suitable for FACS tubes (e.g. Rotanta 460R) | Hettich | 5660 | |
Sterile Scalpel Blades Nr. 10 | Braun | BB510 | |
Cell strainer 40 µm | Sigma | CLS431750 | |
Cell strainer 70 µm | Sigma | CLS431751 | |
Neubauer counting chamber | VWR | 630-1506 | |
Pipettes (20 μL, 200 µL and 1000 μL) | Eppendorf | 4924000037, 4924000061, 4924000088 | |
Pipette tips, sterile (20 µL, 200 µL, 1000 µL) | Biozym | 770050, 770200, 770400 | |
Pipet Boy | Integra | 155 000 | |
Sterile pipettes (5 mL, 10 mL, 25 mL) | Sarstedt | 86.1253.001, 86.1254.001, 86.1685.001 | |
Multistep Pipette, HandyStep S | BRAND | 705110 | |
12.5 ml Combitips for Multistep Pipette | BrandTech Scientific | 702378 | |
Microvette CB 300 K2E | Sarstedt | 16.444 | |
Sterile reaction tubes (1.5 mL, 50 mL) | Sarstedt | 72.692.005, 62.547.254 | |
FACS tubes (non-sterile) | Szabo Scandic | BDL352008 | |
PBS | Lonza | LONBE17-516F | |
Heat-inactivated FCS | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Formaldehyde | Roth | 4979.1 | |
Sodium azide | Roth | K305.1 | |
PE-Cy7 Rat Anti-Mouse CD3 Molecular Complex | BD | 560591 | Clone 17A2; Lot # 7235504 |
Pacific Blu Rat Anti-Mouse CD8a | BD | 558106 | Clone 53-6.7; Lot # 5058904 |
V450 Rat anti-Mouse CD8a | BD | 560469 | Clone 53-6.7; Lot # 5205945 |
FITC anti-mouse CD43 | BioLegend | 121206 | Clone 1B11; Lot # B233778 |
PE-Cy5 Rat Anti-Mouse CD44 | BD | 553135 | Clone IM7; Lot # 85660 |
APC-Cy7 Rat Anti-Mouse CD62L | BD | 560514 | Clone MEL-14; Lot # 7215801 |
OVA-tetramer/APC | MBL | TB-5001-2 | SIINFEKL, H-2Kb; Lot # T1702008 |
VSV NP-tetramer/PE | MBL | TS-M529-1 | RGYVYQGL, H-2Kb; Lot # 007 |
EGFP-tetramer/PE | MBL | TS-M525-1 | HYLSTQSAL, H-2Kd; Lot # 004 |
LCMV-GP-tetramer/APC | MBL | TB-5002-2 | KAVYNFATC, H-2Db; Lot # T1412006 |
HPV 16 E7-tetramer/APC | MBL | TB-5008-2 | RAHYNIVTF, H-2Db; Lot # T1804003 |