Medição dos padrões de emergência de insetos requer precisão. Os sistemas existentes são apenas semi-automático e amostra tamanho é limitado. Abordámos a estas questões, criando um sistema usando microcontroladores para medir precisamente o tempo de aparecimento de um grande número de insetos emergentes.
Sistemas existentes para medir os padrões de emergência de insetos têm limitações; Eles são apenas parcialmente automatizados e são limitados no número máximo de insetos emergentes podem detectar. Para obter uma medição precisa do surgimento de insetos, é necessário para sistemas ser capaz de medir um grande número de insetos emergentes e semi-automático. Abordámos estas questões por projetar e construir um sistema que é automatizado e pode medir o surgimento de até 1200 insetos. Nós modificamos o sistema de “bola cair” existente usando Arduino Microcontroladores para automatizar a coleta de dados e expandir o tamanho da amostra através de múltiplos canais de dados. Múltiplos canais de dados permitem que o usuário não só aumentar o seu tamanho de amostra, mas também permite vários tratamentos a ser executados simultaneamente em uma única experiência. Além disso, criamos um script R para visualizar automaticamente os dados como uma trama de bolha, enquanto também calcular a mediano dia e hora da emergência. O sistema atual foi concebido utilizando a impressão 3D, assim o usuário pode modificar o sistema de ser ajustados para diferentes espécies de insetos. O objetivo do presente protocolo é investigar questões importantes na fisiologia cronobiologia e stress, usando este sistema automatizado e preciso para medir os padrões de aparecimento de insetos.
Medir precisamente o momento da emersão de insetos terrestre em configurações experimentais é notoriamente difícil e requer algum grau de automação. Vários mecanismos foram concebidos no passado, incorporando também um princípio de “bola cair”, usando bolas caindo e sensores ou uma “estrondo-caixa” usando um funil-tipo sistema1,2,3. Há duas limitações com projetos existentes: coleta de dados 1) é apenas parcialmente automatizada e 2) tamanho da amostra ou o número de insetos emergentes que pode ser detectado é limitado. Esses problemas diminuem a precisão da coleta de dados, o que é importante estudar o momento da eclosão e/ou surgimento de padrões. Resolvemos estes problemas através da concepção de um sistema automatizado e não limitado pelo tamanho da amostra, permitindo ao usuário Visualizar melhor ritmos de emergência em resposta aos sinais ambientais.
Nosso sistema é uma melhoria para o princípio de bola caindo, a versão mais recente dos quais usados sensores infravermelhos para detectar o surgimento de insetos em incrementos de seis minutos2. Nosso sistema ainda usa sensores de infravermelhos, mas também incorpora um microcontrolador Arduino para gravar a data e hora de cada evento de emergência para o segundo mais próximo. Dados são armazenados automaticamente para um cartão digital seguro (SD), que pode ser exportado como um arquivo delimitado por vírgulas para análise. A análise é automatizada usando um script personalizado de R, que graficamente os dados como uma trama de bolha e identificar o tempo médio e dia de emergência.
Múltiplos canais permitem ao usuário maior flexibilidade na aquisição de dados. Por exemplo, o nosso projeto de canal múltiplo não só minimiza o impacto de um sensor “entupido”, mas também pode ser usado para aumentar o tamanho da amostra. Além disso, vários canais permitem que o usuário designar os tratamentos de canais específicos para que eles podem executar simultaneamente em um experimento. Usando todos os seis canais permite aproximadamente 1200 abelhas emergentes ser gravado em uma única experiência. A nosso conhecimento, este é o maior tamanho de amostra de qualquer sistema atual medindo o surgimento de insetos e nos permitiu observar padrões de emergência numa escala em resposta aos sinais ambientais. Finalmente, nosso sistema beneficia do facto de que a maioria das peças são 3D imprimido. Isso cria precisamente tamanhos componentes, que reduz a probabilidade de erros que ocorrem (tais como detector entupimento) durante as operações. Ele também permite a personalização para outros sistemas de pesquisa.
O objetivo do presente protocolo é um sistema automatizado e preciso para medir o surgimento de insetos, para investigar questões em cronobiologia e estresse fisiologia de compilação personalizada. Este sistema tem sido e continuará a ser, a crítica na investigação de questões relacionadas aos padrões de emergência de insetos em resposta aos sinais ambientais. Aqui descrevemos a montagem e utilização para a deteção de surgimento da abelha cortadeiras alfafa, Chalicodoma rotundata nas configurações experimentais em laboratório. O sistema é automatizado usando um microcontrolador programável e personalizável usando 3D peças impressas. Racks impressos segura no lugar de tubos contendo células de ninho de abelha seguindo um BB de metal. Após o surgimento, o BB metal é liberado do rack, passando através de um sensor infravermelho, gravar a data e a hora do surgimento de um cartão SD. O projeto atual é otimizado para M. rotundata, mas com pequenos ajustes pode ser adaptado para outras espécies de insetos.
Apresentamos um protocolo para a montagem e utilização de um sistema que permite a medição precisa do tempo de aparecimento de insetos. Este sistema resolve dois problemas, o que limitou a projetos anteriores: automação parcial e tamanho de amostra limitada. Nós resolvemos estes problemas ao automatizar a coleta de dados utilizando microcontroladores, que também nos permitiram aumentar o tamanho da amostra por meio de múltiplos canais. O projeto atual tem seis canais que podem conter um total de 1200 abelhas. Canais adicionais podem ser adicionados ou subtraídos se necessário, permitindo que não só para o tamanho de amostra maior, mas também para simultaneamente a investigar os efeitos de vários tratamentos. Passos críticos, modificações, limitações e aplicações futuras são discutidas abaixo.
A única parte do sistema que não é automatizado é carregar os cestos com células ninhadas e metais BBs airsoft pelotas no início do experimento. Embora os racks são projetados para que eles se apoiam volta ligeiramente para impedir BBs metais quando as prateleiras são cuidados na posição vertical, em pé deve ser tomada quando da colocação das prateleiras para impedir a libertação acidental de BBs metais. Além disso, certifique-se que os racks estão alinhados com a borda da plataforma, então a trajetória de queda do metal BB alinha com a pista. Finalmente, os restos de folha devem ser limpo limpo da pista, e o trem de pouso segurando o BBs metal de experiências anteriores deve ser limpo para evitar o bloqueio do sensor. Dados é automaticamente registrados para um cartão SD como um arquivo CSV, e o roteiro é escrito para que o Arduino não funcionará a menos que um cartão SD está presente. O arquivo de dados é manualmente importado para RStudio e visualizada usando o script R mencionado anteriormente. Este script automaticamente os dados como uma trama de bolha do gráfico e identificar o tempo médio e dia de emergência. O script do Arduino é escrito para acrescentar dados de evento para o final do arquivo, o que evita perda de dados em caso de falha de energia. No entanto, isso também significa que, uma vez que os dados são extraídos a partir do cartão SD, todos os arquivos devem ser cancelados antes do próximo experimento.
Modificações para os arquivos do SketchUp podem ser feitas para ajustar o tamanho das prateleiras para insetos de diferentes tamanhos, com tubos de tamanhos diferentes, sendo usados nas prateleiras modificadas. Além disso, o tamanho da pelota airsoft é importante porque impede que o inseto saindo do tubo, e pelotas de tamanhos diferentes podem ser necessários também. Uma grande variedade de alterações pode ser feita para o script de R para alterar a aparência das parcelas de bolha e outros parâmetros do gráficos.
Reduzimos o risco de falsos positivos em escrever um código de estabilização que desativa qualquer determinado canal por um segundo, depois de um metal que BB é detectado evitando assim um único metal BB sejam contados como vários pontos de dados. Embora, isso cria a possibilidade de um ponto de dados sendo perdido, se muitas abelhas emergem de uma só vez, mas o fato de que os canais são independentes reduz este risco. Outra limitação do sistema atual é que pontos de dados individuais não são perceptíveis, ou seja, um metal quedo BB não pode ser rastreada até um indivíduo específico. Além disso, o atual sistema medidas de emergência mas não eclosão ritmos em M. rotundata, mas iria medir ritmos de eclosão em espécie onde o surgimento e a eclosão são sinônimos. Finalmente, o projeto atual não é à prova de intempéries, limitando seu uso a ambientes controlados.
Futuras aplicações incluem examinar os efeitos de outras pistas ambientais bióticos e abióticos para surgimento de temporização de M. rotundata. Além disso, porque os insetos ocupam diversos ambientes, Dicas ambientais relevantes variam entre as espécies. Assim, a incorporação de mais espécies de insetos é importante investigar sistemas como circadianos evoluídos através de táxons. Pouco é conhecido sobre as condições de desenvolvimento como afetam o momento de emergência de adultos; Portanto, nosso sistema pode ser usado para decifrar os efeitos dos tratamentos na emergência. Além disso, combinações de pistas ambientais podem afetar insetos respostas, assim, futuros experimentos devem incorporar múltiplas pistas ambientais para entender seus efeitos relativos sobre emergência. Por último, a implantação no campo para observar como configurações naturais mediam ritmos de emergência é de interesse. A facilidade de uso deste sistema, e sua combinação exclusiva de fabricação aditiva, programação de código-fonte aberto e traços biológicos observáveis, seja um candidato para uso em ambiente educacional.
The authors have nothing to disclose.
Nós gostaríamos de reconhecer o inseto Criobiologia e Ecofisiologia grupo de trabalho em Fargo, ND para seus comentários úteis sobre experimentos utilizando o sistema.
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