Summary

Analyse du Cycle cellulaire dans la lignée germinale de c. elegans avec la Thymidine Analog EdU

Published: October 22, 2018
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Summary

On décrit une méthode axée sur l’imagerie qui peut être utilisé pour identifier la phase S et analyser la dynamique du cycle cellulaire dans le c. elegans de germline hermaphrodite à l’aide de la thymidine EdU analogique. Cette méthode ne nécessite aucun transgènes et est compatible avec la coloration par immunofluorescence.

Abstract

Analyse du cycle cellulaire chez les eucaryotes utilise fréquemment la morphologie des chromosomes, expression et/ou la localisation des produits des gènes requis pour les différentes phases du cycle cellulaire, ou l’incorporation d’analogues nucléosidiques. Au cours de la phase S, ADN polymérases incorporent analogues de la thymidine par exemple EdU ou BrdU dans l’ADN chromosomique, marquage des cellules pour l’analyse. Pour c. elegans, le nucléoside EdU analogique est alimenté à la worms durant la culture ordinaire et est compatible avec les techniques d’immunofluorescence. La lignée germinale de c. elegans est un système puissant modèle pour les études de la signalisation des voies, cellules souches, la méiose et cycle cellulaire parce qu’il est transparent, génétiquement facile, et la prophase méiotique et différenciation cellulaire/gamétogenèse se produisent dans un Assemblée-comme la mode linéaire. Ces caractéristiques font de EdU un excellent outil pour étudier les aspects dynamiques des cellules mitotiquement cyclisme et développement de la lignée germinale. Ce protocole décrit comment correctement préparer EdU bactéries, nourrissez-les à sauvage c. elegans hermaphrodites, disséquer la gonade hermaphrodite, détachant pour EdU incorporation dans l’ADN, détachant avec les anticorps pour détecter différents cycle cellulaire et les marqueurs du développement, l’image de la gonade et analyser les résultats. Le protocole décrit les variations dans la méthode et l’analyse pour la mesure de phase S index, phase M index, G2 durée, durée du cycle cellulaire, taux d’entrée méiotique et taux de progression de la prophase méiotique. Cette méthode peut être adaptée à l’étude du cycle cellulaire ou l’histoire de la cellule dans d’autres tissus, stades, antécédents génétiques et des conditions physiologiques.

Introduction

En développement animal, centaines, milliers, millions, milliards ou même des trillions de divisions cellulaires sont nécessaires pour former l’organisme adulte. Le cycle cellulaire, composé de l’ensemble des événements cellulaires de G1 (gap), S (synthèse), G2 (gap), et M (mitose) définissent la série d’événements qui sont exécutées à chaque division cellulaire. Le cycle cellulaire est dynamique et mieux appréciée en temps réel, qui peut être techniquement difficile. Les techniques présentées dans le présent protocole permettent d’effectuer les mesures des phases et le calendrier du cycle cellulaire des images fixes.

Marquage avec des analogues de nucléosides comme 5-éthynyl-2′-déoxyuridine (EdU) ou 5-bromo-2′-deoxyuridine (BrdU) est l’étalon-or pour identifier la phase S dans les études de la dynamique du cycle cellulaire chez l’adulte Caenorhabditis elegans (c. elegans) lignée germinale hermaphrodite1,2,3,4,5. EdU et BrdU peuvent être utilisé dans presque n’importe quel fond génétique, car ils ne reposent pas sur n’importe quelle construction génétique. Visualisation BrdU nécessite un traitement chimique sévère pour exposer l’antigène anticorps anti-BrdU, coloration, qui est souvent incompatible avec l’évaluation d’autres marqueurs cellulaires visualisées par la souillure conjointement avec d’autres anticorps. En revanche, la visualisation EdU s’effectue par chimie de clic dans des conditions douces et est donc compatible avec anticorps co coloration6,7.

La spécificité de l’étiquette est évidente, puisque les noyaux incorporent seulement les analogues (5-éthynyl-2′-déoxyuridine) de thymidine dans l’ADN au cours de la phase S. Visualisation se déroule dans le tissu fixe. L’étiquette EdU est invisible par lui-même jusqu’à un colorant contenant de l’azide ou fluorophore réagit par liaison covalente avec l’alcyne en EdU par clic catalysé par le cuivre chimie8. EdU étiquetage peut fournir des informations immédiates sur lequel les noyaux sont en phase S, à l’aide d’une brève impulsion d’étiquetage. EdU peut également fournir des informations dynamiques, à l’aide de pulse-chase ou marquage continu ; par exemple, dans une expérience de chasse, l’étiquette est dilué à chaque division cellulaire soit propagée aussi ne se divisant pas cellules progrès par le développement.

La lignée germinale hermaphrodite de c. elegans est un système puissant de modèle pour les études de la signalisation des voies, des cellules souches, la méiose et cycle cellulaire. La lignée germinale adulte est une chaîne de montage polarisée avec des cellules souches à l’extrémité distale, suivie de l’entrée et la progression à travers la prophase méiotique, coordonnée avec les stades de la gamétogenèse plus proximale (Figure 1). À l’extrémité proximale, ovocytes matures, sont ovulés et fertilisé et commencent l’embryogenèse dans l’utérus9,10,11. La région de long ~ 20 cellules de diamètre près du capteur de l’extrémité distale, qui comprend la tige de la lignée germinale mitotiquement cyclisme, cellules progénitrices et cellules en phase S méiotiques mais pas les cellules en prophase méiotique, s’appelle l’ancêtre zone2,4 , 9 , 12. les membranes des cellules fournissent une séparation incomplète entre les noyaux dans la lignée germinale distale, mais les cellules progénitrices de la zone subissent une mitose cellule cyclisme en grande partie indépendamment. La durée médiane cycle cellulaire mitotique des cellules de la zone germinale progénitrices en jeunes adultes hermaphrodites est ~6.5 h ; La phase G1 est brève ou absent, et le repos n’est pas observé de1,2,13. Différenciation des cellules souches germinales se fait par différenciation essentiellement directe et donc n’a pas de titres de transport en commun-amplification4. Au cours de la différenciation dans le stade pachytène, environ 4 des 5 noyaux ne feront pas d’ovocytes mais plutôt apoptose, agissant comme cellules nourricières en faisant don de leur contenu cytoplasmique à l’ovocyte en développement12,14 , 15.

En plus de l’étiquetage des cellules en phase S avec les analogues nucléosidiques, on peut identifier les cellules en mitose et méiose utilisant des anticorps. Lors de la mitose, les noyaux sont immunoréactives à anti-phospho-histone H3 (Ser10) anticorps (appelé pH3)7,16. Lors de la méiose, les noyaux sont immunoréactives à anticorps anti-lui-3 (une protéine d’axe méiotique)17. Noyaux dans la zone de souches peuvent être identifiées par l’absence de HIM-3, la présence de nucléoplasmique REC-818ou la présence de WAPL-119. WAPL-1 intensité est plus élevée dans la gonade somatique, élevée dans la zone de l’ancêtre et faible pendant début prophases méiotiques19. Plusieurs mesures de cycle cellulaire sont possibles avec quelques variations dans le protocole : J’ai) identifier les noyaux en phase S et mesurer l’indice de la phase S ; II) identifier les noyaux en phase M et mesurer l’indice de la phase M ; III) déterminer si les noyaux étaient en phase S mitotique ou méiotique ; IV) mesure la durée du G2 ; V) mesure la duartion des phases G2 + M + G1 ; VI) mesure le taux d’entrée méiotique ; VII) estimer le taux de progression de la méiose.

On peut faire plusieurs mesures cycle cellulaire de seulement quelques types d’expériences de wet-lab. Le protocole ci-dessous décrit un étiquetage d’impulsion de 30 min en se nourrissant de c. elegans adultes hermaphrodites avec EdU étiqueté les bactéries et les cellules de phase M co marquage par coloration avec progénitrices et anticorps anti-pH3 cellules de la zone de coloration avec l’anticorps anti-WAPL-1. Seuls les changements dans la durée de l’Education se nourrissent (étape 2.5), type d’anticorps utilisé (étape 5), et analyses (étape 8.3) sont nécessaires pour les mesures supplémentaires.

Protocol

1. préparation de bactéries marquées EdU Développer une culture de départ de MG1693. Escherichia coli MG1693 (e. coli) porte une mutation en thyA. Strie à MG1693 d’e. coli provenant d’un stock de glycérol congelé sur une gélose de bouillon (LB) de lysogénie 120 mm boîte de Pétri. Culture à 37 ° C pendant la nuit. Ensemencer de deux individuels e. coli MG1693 colonies en deux en double 4 tubes mL de liquide lb Culture à…

Representative Results

Puisque la synthèse de l’ADN est nécessaire pour incorporer EdU, on peut conclure que noyaux marqués EdU a subi une phase S pendant la fenêtre de temps EdU-étiquetage. On peut interpréter les noyaux cette étiquette dans une alimentation de 30 min avec EdU étiqueté bactéries comme noyaux en phase S au moment de la dissection. Noyaux qui label en un plus EdU continu alimentation expérience peuvent ont marqué dès le début dans la fenêtre de temps et depuis la gauche phase S,…

Discussion

Préparation de bactéries marquées EdU (étape 1) est essentielle à ce protocole et le premier point pour le dépannage. Étiquette de type sauvage jeunes adultes hermaphrodites très fiable dans un 4 h EdU-impulsion, ce qui en fait un contrôle utile pour chaque nouveau lot de bactéries marquées EdU. En outre, des bactéries intactes EdU marquées qui pénètrent dans l’intestin (chez les animaux âgés ou certains mutants défectueux du pharynx/rectifieuse) seront étiqueter avec la chimie de clic et apparaissen…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Nous sommes reconnaissants envers le centre de stock d’e. coli pour MG1693 ; Wormbase ; le centre de génétique de Caenorhabditis qui est financé par le National instituts de santé Bureau de recherche programmes d’Infrastructure (P40OD010440) pour les souches ; Zach Pincus pour conseils statistiques ; Aiping Feng pour réactifs ; Luke Schneider, Andrea Scharf, Sandeep Kumar et John Brenner pour formation, conseils, soutien et discussion utile ; et les labos Kornfeld et Schedl pour vos commentaires sur ce manuscrit. Ce travail a été soutenu en partie par le National Institutes of Health [R01 AG02656106A1 à KK, R01 GM100756 à TS] et une bourse prédoctorale National Science Foundation [DGE-1143954 et DGE-1745038 à ZK]. Le National Institutes of Health, ni la National Science Foundation a eu aucun rôle dans la conception de l’étude, la collecte, l’analyse et l’interprétation des données, ni par écrit le manuscrit.

Materials

E. coli MG1693 Coli Genetic Stock Center 6411 grows fine in standard unsupplemented LB
E. coli OP50 Caenorhabditis Genetics Center OP50
Click-iT EdU Alexa Fluor 488 Imaging Kit Thermo Fisher Scientific C10337
5-Ethynyl-2′-deoxyuridine Sigma 900584-50MG or use EdU provided in kit
Glucose Sigma D9434-500G D-(+)-Dextrose
Thiamine (Vitamin B1) Sigma T4625-5G Reagent Grade
Thymidine Sigma T1895-1G BioReagent
Magnesium sulfate heptahydrate Sigma M1880-1KG MgSO4, Reagent Grade
Sodium Phosphate, dibasic, anhydrous Fisher BP332-500G Na2HPO4
Potassium Phosphate, monobasic Sigma P5379-500G KH2PO4
Ammonium Chloride Sigma A4514-500G NH4Cl, Reagent Plus
Bacteriological Agar US Biological C13071058
Calcium Chloride dihydrate Sigma C3881-500G CaCl
LB Broth (Miller) Sigma L3522-1KG Used at 25g/L
Levamisole Sigma L9756-5G 0.241g/10ml
Phosphate buffered saline Calbiochem Omnipur 6506 homemade PBS works just as well
Tween-20 Sigma P1379-500ML
16% Paraformaldehyde, EM-grade ampules Electron Microscopy Sciences 15710 10ml ampules
100% methanol Thermo Fisher Scientific A454-1L Gold-label methanol is critical for proper morphology with certain antibodies
Goat Serum Gibco 16210-072 Lot 1671330
rabbit-anti-WAPL-1 Novus biologicals 49300002 Lot G3048-179A02, used at 1:2000
mouse-anti-pH3 clone 3H10 Millipore 05-806 Lot#2680533, used at 1:500
goat-anti-rabbit IgG-conjugated Alexa Fluor 594 Invitrogen A11012 Lot 1256147, used at 1:400
goat-anti-mouse IgG-conjugated Alexa Fluor 647 Invitrogen A21236 Lot 1511347, used at 1:400
Vectashield antifade mounting medium containing 4',6-Diamidino-2-Phenylindole Dihydrochloride (DAPI) Vector Laboratories H-1200 mounting medium without DAPI can be used instead, following a separate DAPI incubation
nail polish Wet n Wild DTC450B any clear nail polish should work
S-medium various see wormbook.org for protocol
M9 buffer various see wormbook.org for protocol
M9 agar various same recipe as M9 buffer, but add 1.7% agar
Nematode Growth Medium various see wormbook.org for protocol
dissecting watch glass Carolina Biological 42300
Parafilm laboratory film Pechiney Plastic Packaging PM-996 4 inch wide laboratory film
petri dishes 60 mm diameter
Long glass Pasteur pipettes
1ml centrifuge tubes MidSci Avant 2926
Tips
Serological pipettes
500 mL Erlenmyer flask
Aluminum foil
25G 5/8” needles BD PrecisionGlide  305122
5ml glass centrifuge tube Pyrex 
Borosilicate glass tubes 1ml
glass slides
no 1 coverslips 22 x 40 mm no 1.5 may work, also
37 °C Shaker incubator
Tabletop Centrifuge
Clinical Centrifuge IEC 428 with 6 swinging bucket rotor
Mini Centrifuge
20 °C incubator
4 °C refrigerator
-20 °C freezer
Observer Z1 microscope Zeiss
Plan Apo 63X 1.4 oil-immersion objective lens Zeiss
Ultraview Vox spinning disc confocal system PerkinElmer  Nikon spinning disc confocal system works very well, also, as described here: http://wucci.wustl.edu/Facilities/Light-Microscopy 

References

  1. Fox, P. M., Vought, V. E., Hanazawa, M., Lee, M. -. H., Maine, E. M., Schedl, T. Cyclin E and CDK-2 regulate proliferative cell fate and cell cycle progression in the C. elegans germline. Development. 138 (11), 2223-2234 (2011).
  2. Crittenden, S. L., Leonhard, K. A., Byrd, D. T., Kimble, J. Cellular analyses of the mitotic region in the Caenorhabditis elegans adult germ line. Molecular biology of the cell. 17 (7), 3051-3061 (2006).
  3. Seidel, H. S., Kimble, J. Cell-cycle quiescence maintains Caenorhabditis elegans germline stem cells independent of GLP-1/Notch. eLife. 4, (2015).
  4. Fox, P. M., Schedl, T. Analysis of Germline Stem Cell Differentiation Following Loss of GLP-1 Notch Activity in Caenorhabditis elegans. Genetics. 201 (9), 167-184 (2015).
  5. Kocsisova, Z., Kornfeld, K., Schedl, T. Cell cycle accumulation of the proliferating cell nuclear antigen PCN-1 transitions from continuous in the adult germline to intermittent in the early embryo of C. elegans. BMC Developmental Biology. 18 (1), (2018).
  6. Salic, A., Mitchison, T. J. A chemical method for fast and sensitive detection of DNA synthesis in vivo. Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (7), 2415-2420 (2008).
  7. vanden Heuvel, S., Kipreos, E. T. C. elegans Cell Cycle Analysis. Methods in Cell Biology. , 265-294 (2012).
  8. ThermoFisher. . Click-iT EdU Imaging Kits. , (2011).
  9. Pazdernik, N., Schedl, T. . Germ Cell Development in C. elegans. , 1-16 (2013).
  10. Hirsh, D., Oppenheim, D., Klass, M. Development of the reproductive system of Caenorhabditis elegans. Developmental Biology. 49 (1), 200-219 (1976).
  11. Brenner, S. The genetics of Caenorhabditis elegans. Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).
  12. Hansen, D., Schedl, T. Stem cell proliferation versus meiotic fate decision in Caenorhabditis elegans. Advances in Experimental Medicine and Biology. 757, 71-99 (2013).
  13. Jaramillo-Lambert, A., Ellefson, M., Villeneuve, A. M., Engebrecht, J. Differential timing of S phases, X chromosome replication, and meiotic prophase in the C. elegans germ line. Developmental Biology. 308 (1), 206-221 (2007).
  14. Agarwal, I., Farnow, C., et al. HOP-1 presenilin deficiency causes a late-onset notch signaling phenotype that affects adult germline function in Caenorhabditis elegans. Genetics. 208 (2), 745-762 (2018).
  15. Gumienny, T. L., Lambie, E., Hartwieg, E., Horvitz, H. R., Hengartner, M. O. Genetic control of programmed cell death in the Caenorhabditis elegans hermaphrodite germline. Development. 126 (5), 1011-1022 (1999).
  16. Hendzel, M. J., Wei, Y., et al. Mitosis-specific phosphorylation of histone H3 initiates primarily within pericentromeric heterochromatin during G2 and spreads in an ordered fashion coincident with mitotic chromosome condensation. Chromosoma. 106 (6), 348-360 (1997).
  17. Zetka, M. C., Kawasaki, I., Strome, S., Mü Ller, F. Synapsis and chiasma formation in Caenorhabditis elegans require HIM-3, a meiotic chromosome core component that functions in chromosome segregation. Genes & development. 13 (17), 2258-2270 (1999).
  18. Hansen, D., Hubbard, E. J. A., Schedl, T. Multi-pathway control of the proliferation versus meiotic development decision in the Caenorhabditis elegans germline. Developmental Biology. 268 (2), 342-357 (2004).
  19. Crawley, O., Barroso, C., et al. Cohesin-interacting protein WAPL-1 regulates meiotic chromosome structure and cohesion by antagonizing specific cohesin complexes. eLife. 5 (2), 1-26 (2016).
  20. Zhao, H., Halicka, H. D., et al. DNA damage signaling, impairment of cell cycle progression, and apoptosis triggered by 5-ethynyl-2′-deoxyuridine incorporated into DNA. Cytometry Part A. 83 (11), 979-988 (2013).
  21. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans. WormBook. , 1-11 (2006).
  22. Gervaise, A. L., Arur, S. Spatial and Temporal Analysis of Active ERK. in the C. elegans Germline. Journal of Visualized Experiments. 117 (117), e54901-e54901 (2016).
  23. Vos, K. . De Cell Counter Plugin. , (2015).
  24. Schindelin, J., Arganda-Carreras, I., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  25. Rasband, W. . ImageJ. , (2016).
  26. Michaelson, D., Korta, D. Z., Capua, Y., Hubbard, E. J. A. Insulin signaling promotes germline proliferation in C. elegans. Development. 137 (4), 671-680 (2010).
  27. Qin, Z., Jane, E., Hubbard, A., Hubbard, E. J. A. Non-autonomous DAF-16/FOXO activity antagonizes age-related loss of C. elegans germline stem/progenitor cells. Nature communications. 6 (5), 7107 (2015).
  28. Luo, S., Kleemann, G. A., Ashraf, J. M., Shaw, W. M., Murphy, C. T. TGFB and Insulin Signaling Regulate Reproductive Aging via Oocyte and Germline Quality Maintenance. Cell. 143 (2), 299-312 (2010).
  29. Narbonne, P., Maddox, P. S., Labbe, J. -. C. daf-18/PTEN locally antagonizes insulin signalling to couple germline stem cell proliferation to oocyte needs in C. elegans. Development. , 4230-4241 (2015).
  30. Cinquin, A., Chiang, M., et al. Intermittent Stem Cell Cycling Balances Self-Renewal and. Senescence of the C. elegans Germ Line. PLoS Genetics. 12 (4), 1005985 (2016).
  31. . . Invitrogen EdU (5-ethynyl-2’-deoxyuridine). , 1-7 (2010).
  32. Tuttle, A. H., Rankin, M. M., et al. Immunofluorescent Detection of Two Thymidine Analogues (CldU and IdU) in Primary Tissue. Journal of Visualized Experiments. 46 (46), e2166-e2166 (2010).

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Cite This Article
Kocsisova, Z., Mohammad, A., Kornfeld, K., Schedl, T. Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU. J. Vis. Exp. (140), e58339, doi:10.3791/58339 (2018).

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