Het doel van dit protocol is bedoeld als een stapsgewijze handleiding om uit te voeren van de experimenten van de 3-D “lever-on-a-chip” infectie met het hepatitis B-virus.
Ondanks de uitzonderlijke infectiviteit van het hepatitis B-virus (HBV) in vivo, waar slechts drie virale genoom in een chroniciteit van experimenteel geïnfecteerde chimpansees resulteren kunnen, vereisen meest in vitro modellen verschillende honderden tot duizenden virale genoom per cel in om te beginnen een voorbijgaande infectie. Bovendien kunnen statische 2D culturen van primaire menselijke hepatocyten (PHH) alleen op korte termijn studies als gevolg van hun snelle dedifferentiation. Hier beschrijven we 3D lever-on-a-chip culturen van PHH, monoculturen of in cocultures met andere cellen van de lever-ingezetene nonparenchymal. Deze bieden een significante verbetering aan het bestuderen van langdurige HBV infecties met fysiologische host cel reacties. Naast het vergemakkelijken van de drug werkzaamheid studies, toxicologische analyse en onderzoek naar pathogenese, inschakelen deze microfluidic cultuur systemen de evaluatie van genezende therapieën voor HBV-infectie ter opheffing van covalent gesloten, circulaire (ccc) DNA. Dit gepresenteerd methode beschrijft de set-up van PHH monoculturen en co celculturen PHH/Kupffer, hun infectie met gezuiverde HBV en de analyse van de antwoorden van de gastheer. Deze methode geldt met name voor de evaluatie van de effecten op lange termijn van HBV-infectie behandeling combinaties en pathogenese.
De studie van HBV is door de slechte gevoeligheid van cultuur systemen, waarvoor honderden tot duizenden HBV genoom kopieën per cel tot de infectie1is ingewikkeld. Bovendien, primaire menselijke hepatocyten zijn over het algemeen bijzonder kwetsbaar en snel dedifferentiate tijdens conventionele culturen2. Dit is voornamelijk te wijten aan het feit dat de vlakke en harde kunststof oppervlakken niet na te de natuurlijke extracellulaire omgevingen binnen de lever en het algemene gebrek aan oxygenatie van de culturen in de afwezigheid van microfluidic circulatie gevonden bootsen doen. Conventionele statische hepatocyte culturen op collageen beklede platen snel dedifferentiate en verliezen hun gevoeligheid voor HBV-infectie3. Hier beschrijven we de set-up en besmetting van PHH gegroeid in 3D lever-on-a-chip culturen, die enorm voordelig voorbij conventionele 2D statische PHH culturen op collageen beklede platen als gevolg van hun uitgebreide metabole en functionele bevoegdheid zijn, te vergemakkelijken op lange termijn culturen van ten minste 40 dagen4. In dit systeem worden PHH overgeënt op collageen beklede steigers, die voortdurend zijn geperfundeerd met groeimedium voor de levering van zuurstof en voedingsstoffen naar de cellen. Hoewel alternatieve cultuur systemen voor PHH gebaseerd op complexe cocultures van lymfkliertest fibroblasten of 3D groei in spheroïden zijn gevalideerd en vatbaar zijn voor HBV-infectie met behulp van multipliciteit van infectie van 500 genoom equivalenten (GE) van HBV per cel, 3D lever-on-a-chip culturen blijven de enige in vitro modelsysteem die vatbaar zijn voor 0.05 GE van HBV per cel4. Dit wordt bovendien ondersteund door de noodzaak van het gebruik van hoge concentraties van dimethylsulfoxide (DMSO) en polyethyleenglycol (PEG) om vast te stellen van de HBV-infectie in deze culturen, die is overbodig voor de infectie van 3D lever-on-a-chip cultuur systemen 4. onder de belangrijke kenmerken van HBV-infectie is het zwembad van cccDNA, die als de transcriptionele sjabloon voor alle de novo–geproduceerd virionen5,6 fungeert. Hoewel cccDNA kan worden opgespoord in conventionele hepatocyte culturen7,8, het blijft onduidelijk of de regulering van cccDNA en eventuele therapeutische benaderingen, gericht op de afschaffing zijn gerecapituleerd gedeeltelijk of volledig dedifferentiated hepatocyten. We hebben aangetoond dat cccDNA functioneel wordt gevormd in 3D lever-on-a-chip culturen, reageert op fysiologische stimuli, en kan worden gericht door te interfereren met de toegankelijkheid van de transcriptionele machine de cccDNA genoom4.
Host-Reacties op HBV-infectie in 3D lever-on-a-chip mimic die bij HBV-geïnfecteerde patiënten waargenomen, zodat de identificatie van biomarkers voor infectie, evenals therapeutisch succes. Onder de unieke kenmerken van de culturen van de lever-on-a-chip is de mogelijkheid om op lange termijn host reacties tussen PHH en andere cellen van de nonparenchymal binnen de lever, met inbegrip van Kupffer cellen4Notti cellen9en lever sinusvormige evalueren endotheliale cellen10,11. Dit biedt de unieke kans om te evalueren van de cel/interacties in een complexe 3D communicatie.
De periode van de uitgebreide cultuur van dit platform vergemakkelijkt bovendien de beoordeling van de sequentiële drug behandelingen en hun impact op HBV persistentie, die niet mogelijk met behulp van conventionele hepatocyte cultuur systemen.
Dit protocol beschrijft hoe 3D-lever-on-a-chip culturen worden gegenereerd, monocultuur van PHH of voor cocultures van PHH met Kupffer cellen. Daarnaast beschrijven we de productie van gezuiverde HBV voor lage-multipliciteit-van-infectie studies, evenals de daaropvolgende analyse van host en virale reacties.
De uitdagingen bij het handhaven van langdurige culturen van PHH verdreven de ontwikkeling van verschillende cultuur modellen met verbeterde functionaliteit en levensduur, elk exposeren differentiële voor- en nadelen. Het wordt nu algemeen erkend dat statische 2D culturen van PHH zijn het nabootsen van bepaalde aspecten van de hepatocyte biologie voor zeer beperkte hoeveelheid tijd. Zo micropatterned12,13, sferoïde culturen14,15, cocultures en 3D lever-on-a-chip culturen16,17 zijn snel ter vervanging van deze meer basissystemen. Vooral bij de studie van besmettelijke ziekten, die coevolved hebben met hun gastheer voor het gebruiken van specifieke microenvironments, wordt de eis voor het verstrekken van fysiologische omgevingen geschraagd door de vaak uitdagend aard van het kweken van de mens-tropic besmettelijke ziekten, zoals hepatitis C-virus, HBV en malaria.
De meest kritische stap in het uitvoeren van 3D lever-on-a-chip culturen is de kwaliteit van het aanvankelijk afkomstige primaire celtypes. Deze cellen dienen te worden getest op hun naleving van capaciteit en alleen vezinkbaar PHH veel moeten worden gebruikt met het oog op succesvolle weefsel vorming en cultuur generatie. Hoewel vers geïsoleerde PHH kan worden gebruikt, hun cryopreservatie is meestal complex en vereist speciale tarief-gecontroleerde diepvriezers.
In tegenstelling tot conventionele statische 2D culturen, de genetische achtergrond van gastheer is te verwaarlozen met betrekking tot de gevoeligheid voor HBV-infectie, en alle hij-tot nu toe geteste hepatocyte donoren kunnen vast te stellen van de HBV-infectie4.
Hoewel de patiënt afkomstige HBV vaststelt infecties van 3D culturen, het is noodzakelijk om gebruik maken van PEG-neergeslagen en sacharose kussen-gezuiverd HBV wanneer met behulp van afleidbare HBV producent cel voor de generatie van virale entmateriaal lijnen. Cel cultuur supernatant direct toegepast op de 3D lever-on-a-chip culturen, of door de aanwezigheid van remmende factoren of als gevolg van een incompatibiliteit van huidige groeifactoren met hepatocyten, niet gemakkelijk leiden tot infectie. Bovendien, bij het selecteren van virale entmateriaal patiënt afkomstige, moet alleen serum worden gebruikt, aangezien plasma onvermijdelijk stolt en verstopping van de microfluidic verspreiding van de cultuur-platform.
Ongeacht de virale entmateriaal gebruikt, is cellulaire levensvatbaarheid en differentiatie, evenals het zorgen voor volledige verwijdering van de eerste HBV entmateriaal, sleutel tot succesvolle langetermijnstudies infectie. De handigste manier om dit te doen is bemonstering culturen volgend op het verwijderen van de virale entmateriaal, evenals het meten van menselijk serum albumine niveaus gedurende de cultuur. Van de nota, ook voor alle andere beschreven platformen, HBV-infectie, als tot stand gebracht, is niet gemakkelijk verspreid naar niet-geïnfecteerde cellen. Het onderliggende mechanisme hiervoor blijft ongrijpbaar aangezien HBV-infectie in vivo gemakkelijk de meerderheid van de hepatocyten binnen de lever infecteert.
Met betrekking tot cocultures PHH en Kupffer cellen is het raadzaam voor het uitvoeren van veel tests van Kupffer cellen te evalueren IL6 en TNFα secretie in reactie op de stimulatie van de LP’s, aangezien niet alle verkrijgbare Kupffer cel donoren een gelijke responsiviteit hebben.
Nog belangrijker is, voor alle drugs behandelingen of eerste infectie van culturen met HBV, moet het totale volume van de put (1,4 mL), evenals vanaf het microfluidic kanaal (0,2 mL), men in aanmerking voor de berekening van de drug of entmateriaal concentraties. Om te verzekeren nauwkeurige dosering, wordt een wassen stap met medium dat HBV of drugs uitgevoerd om het kanaal microfluidic prime.
Het gebruikte platform maakt gebruik van 600.000 PHH per putje, waarbij meerdere lagen hepatocyten binnen de steigers. Hoewel het nummer van de cel kan worden gevarieerd, de concentratie van de gekozen cel zorgt voor optimale resultaten. De indeling van de plaat behaalde een totaal van 12 steigers, die kan worden opgewaardeerd tot 36 steigers. Als gevolg van de eisen van de microfluidic is opschalen naar hoge goed cijfers echter niet mogelijk is tot nu toe.
Met behulp van deze benaderingen, kunnen culturen worden gehandhaafd met optimale mobiele prestaties voor ten minste 40 dagen, die tot dusver ongekende mogelijkheden biedt te evalueren van de roman drugkandidaten, evenals het bestuderen van de complexe wisselwerking tussen verschillende hepatische cel populaties tijdens HBV-infectie.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gefinancierd door een subsidie van de Starter van de European Research Council (637304), een Wellcome Trust Investigator Award (104771/Z/14/Z), en door CN Bio innovaties.
Reagents | |||
William's E Medium, no phenol red | GIBCO | A12176-01 | |
Hepatocyte Thaw Medium | GIBCO | CM7500 | |
Primary Hepatocyte Thawing and Plating Supplements | GIBCO | CM3000 | |
Primary Hepatocyte Maintenance Supplements | GIBCO | CM4000 | |
DMEM/F-12 | GIBCO | 11320-033 | |
Advanced DMEM | GIBCO | 12491023 | |
DPBS, no calcium, no magnesium | GIBCO | 14190-144 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (NEAA) 100X | GIBCO | 11140050 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | GIBCO | 15140-122 | |
Fetal Bovine Serum, USA origin, Heat Inactivated, sterile-filtered, suitable for cell culture | SIGMA | 12106C | |
Hydrocortisone | SIGMA | H0888 | |
Trypan blue | Merck | T8154 | |
Collagen from calf skin | Merck | C9791 | |
G418 | SIGMA | G418-RO | |
Tetracycline | SIGMA | T3258 | |
Polyethylene glycol 8000 | SIGMA | P2139 | |
Sucrose | SIGMA | SO389 | |
Sodium carbonate anhydrous | SIGMA | 451614-25G | |
Sodium bicarbonate | SIGMA | S5761 | |
Sodium azide | SIGMA | S2002-5G | |
Sulfuric acid, 99.999% | SIGMA | 339741 | |
4% Paraformaldehyde | SIGMA | 252549 | |
Triton-X 100 | SIGMA | X100 | |
Tween 20 | SIGMA | P1379 | |
DAPI | SIGMA | D9564 | |
Albumin (human) | SIGMA | A9731 | |
Fisher BioReagent Bovine Serum Albumin, Fraction V, Heat Shock Treated | Fisher Scientific | BP9701-100 | |
ProLong Gold Antifade Mountant | Invitrogen | P36930 | |
TaqMan Universal Master Mix II, no UNG | Applied Biosystems | 4440040 | |
SYBR Select Master Mix | Applied Biosystems | 4472903 | |
Lipopolysaccharide from Escherichia coli K12 | InvivoGen | tlrl-eklps | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Kits/Consumables | |||
Sterile membrane | CN Bio innovations | LC-SC | |
LiverChip Perfusion cell culture plate | CN Bio innovations | LC12 | |
LiverChip culture plate lid | CN Bio innovations | LC-SC | |
Sterile round filter paper | CN Bio innovations | LC-SC | |
Cell attachment scaffold | CN Bio innovations | LC-SC | |
Retaining ring | CN Bio innovations | LC-SC | |
Sterile plunger | CN Bio innovations | LC-ST | |
Dneasy blood & tissue kit | Qiagen | 69506 | |
Rneasy mini kit | Qiagen | 74106 | |
Human Magnetic Luminex assay | R&D Systems | ||
1-Step Ultra TMB-ELISA Substrate Solution | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
High Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | ThermoFisher Scientific | 4368814 | |
QIAamp Viral RNA Mini Accessory Set | Qiagen | 1048147 | Containing RNA carrier |
Millicell HY 5-layer cell culture flask, T-1000, sterile | Millipore (Merck) | PFHYS1008 | |
MicroAmp Optical 384-Well Reaction Plate with Barcode | Life technologies | 4309849 | |
MicroAmp Optical Adhesive Film | Life technologies | 4311971 | |
Clear Flat-Bottom Immuno Nonsterile 96-Well Plates | ThermoFisher Scientific | 442404 | |
Sealing Tape for 96-Well Plates | ThermoFisher Scientific | 15036 | |
Nalgene Rapid-Flow Sterile Disposable Bottle Top Filters with PES Membrane | ThermoFisher Scientific | 295-3345 | |
Fisherbrand Microscopic Slides with Ground Edges, Twin Frost | Fisher Scientific | FB58628 | |
Tube, Thinwall, Ultra-Clear, 38.5 mL, 25 x 89 mm | Beckman Coulter | 344058 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Primary cells / Cell lines | |||
Human Plateable Hepatocytes, Transporter Qualified | Thermo Fisher Scientific | HMCPTS | |
Cryopreserved Human Kupffer Cells | Thermo Fisher Scientific | HUKCCS | |
HepDE19 cell line | Haitao Guo (Indiana University, IN, USA) | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Primers/Probes/Standards | |||
HBV DNA forward primer | Invitrogen | 5'-GTGTCTGCGGCGTTTTATCA-3' | |
HBV DNA reverse primer | Invitrogen | 5'-GACAAACGGGCAACATACCTT-3' | |
HBV DNA probe | Invitrogen | 5'FAM-CCTCTKCATCCTGCTGCTATGCCTCATC-3'TAMRA | |
pgRNA forward primer | Invitrogen | 5'-GAGTGTGGATTCGCACTCC-3' | |
pgRNA reverse primer | Invitrogen | 5'-GAGGCGAGGGAGTTCTTCT-3' | |
RPS11 forward primer | Invitrogen | 5'-GCCGAGACTATCTGCACTAC-3' | |
RPS11 reverse primer | Invitrogen | 5'-ATGTCCAGCCTCAGAACTTC-3' | |
pCMV-HBV | Professor Christoph Seeger (Fox Chase Cancer Centre, PA, USA) | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies | |||
Anti-Hepatitis B virus core antigen IgG fraction (polyclonal) | DAKO | discontinued | Lot 10102505 |
Human Albumin Antibody, A80-129A | Bethyl Laboratories. inc | A80-129A | |
Human Albumin cross-adsorbed Antibody, A80-229P | Bethyl Laboratories. inc | A80-229P | |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 594 | ThermoFisher Scientific | # A-11072 | Lot 1431810 |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Equipment | |||
LiverChip Vacuum pump | CN Bio innovations | LC-PN | |
LiverChip Pneumatic Hookup | CN Bio innovations | LC-PN | |
LiverChip platform | CN Bio innovations | LC-PN | |
LiverChip plate washing dock | CN Bio innovations | ||
Autoclavable metal forceps | VWR | 232-0106 | |
Vortex Genie 2 | Scientific industries | SKU: SI-0236 | |
Optima XPN-80 Ultracentrifuge | Beckman Coulter | A95765 | |
Heraeus Multifuge X3R Centrifuge | Thermo Scientific | 75004500 | |
SAM-12 Medical Suction High Vacuum High Flow | MGE worldwide | SAM12/01010101 | |
NUAIRE 5800 SERIES incubator | NUAIRE | NU-5841 | |
Automated precision torgue | CN Bio innovations | ||
Manual torque | CN Bio innovations | ||
LiverChip compressor | CN Bio innovations | ||
Luminex LX-200 Instrument with xPONENT 3.1 | Luminex | ||
Millipore Hand-Held Magnetic Separator Block | ThermoFisher Scientific | Millipore™ 40-285 | |
FluoStar Optima Plate Reader | BMG Labtech | ||
KOLVER Precision electric screwdrivers | VTECH ltd | FAB10RE/FR | |
KOLVER Power supply | VTECH ltd | EDU1FR | |
BAMBI VTS75D | Air Equipment | Discontinued | |
Integra Vacuboy | INTEGRA | ||
ViiA 7 Real-Time PCR System with 384-Well Block | ThermoFisher Scientific | 4453536 |