כאן נתאר וזמינותו contractility באמצעות דרוזופילה S2R + תאי. היישום של ליגנד אקסוגני, gastrulation מקופל (ערפל), מוביל ההפעלה של הערפל איתות contractility מסלול וסלולר. Assay זה יכול לשמש כדי לחקור ברגולציה של חלבונים contractility הסלולר בערפל איתות.
פיתחנו מבוססת-תא assay באמצעות תאים דרוזופילה זה recapitulates הפסגה לתעוקה שיזם מקופל gastrulation (ערפל), מורפוגן אפיתל המופרש. במהלך זה assay, ערפל משמש אגוניסט כדי להפעיל את רו דרך מפל איתות הכולל קולטן G-חלבון בשילוב (ערפל), חלבון12 – 13 Gα (מפוחית יד/Cta) ו- PDZ-מחשבים-המכילה גואנין נוקלאוטיד exchange פקטור (RhoGEF2). ערפל איתות תוצאות מהירה ודרמטית לארגונו מחדש של שלד התא אקטין כדי ליצור מחרוזת כויץ את הארנק. ערפל מסיס הוא שנאסף קו יציב תא ומוחלים ectopically S2R + תאים, המוביל שינויים מורפולוגיים כמו הכיווץ הפסגה, תהליך ציין במהלך תהליכים התפתחותיים כגון gastrulation. זה וזמינותו נוטה ההקרנה תפוקה גבוהה, באמצעות RNAi, יכול להקל על הזיהוי של גנים נוספים המעורבים במסלול זה.
מחקרים של מופרה שנערך עם מודל גנטי אורגניזמים הוכיחו שלא יסולא בפז להבנתנו כיצד התאים מתלכדות רקמות. מחקרים של דרוזופילה melanogaster, בפרט, הובילו את הזיהוי של גנים מרכזיים ועקרונות ביולוגי אשר יכוונו את מורפוגנזה ופיתוח של אורגניזמים מן ההפריה לבגרות1,2 , 3. במקביל למחקר גנטי שנערך עם דרוזופילה, שורות תאים בתרבית נגזר זבוב הפירות רקמות הופיעו גם כמערכת רב עוצמה כדי לטפל בקשת רחבה של מולקולרית של התא הביולוגי שאלות4, 5 , 6. דרוזופילה תרביות רקמה תאים יש דרישות מינימליות עבור תחזוקה, כפי שהם בתרבית בטמפרטורת החדר, ללא CO2. ככאלה, הן נתונות דימות ברזולוציה גבוהה, ויש להם רמה גבוהה של רגישות גן עיכוב על ידי RNAi6,7. קבוצות רבות השתמשו דרוזופילה תרביות רקמה תאים ככלי לגלות גנים המעורבים, הגדרת צורת התא, cytoskeletal dynamics, הכדאיות, phagocytosis והאות התמרה חושית מסלולים4,8, 9,10,11. כאשר מועסק כמודל לצד כל החיות, שורות בתרבית של תאים דרוזופילה מציעים קבוצת גישות משלימות מאוד להאיץ את הזיהוי של מולקולות חשוב לפיתוח ומספקים מסגרת שבה לקבוע את תפקידי מכניסטית12. כאן, אנו מתארים וזמינותו מבוססת תא ללמוד את איתות המסלולים המפעילות לתעוקה הפסגה דרך 13,14מסלול (ערפל) מקופל-gastrulation. Assay contractility מבוססת-תא הזה מאפשר לחוקרים לחקור שניהם הערפל איתות לשביל, את המנגנונים המולקולריים המסדירים שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II contractility.
Gastrulation של העובר דרוזופילה מוקדם נחקרה במשך שנים רבות כמודל גנטית את מורפוגנזה אפיתל, הסלולר המעבר אפיתל תא mesenchymal זהות. אחד האירועים מפתח של gastrulation הוא מורפוגנזה של קבוצת משנה של תאים אפיתל לאורך הקו האמצעי הגחון עובריים של טורי כדי כפירמידה צורה15,16,17,18. צורת תא פשוט לשנות תוצאות ההפנמה של התאים mesodermal הרב, שעורר ואת מונעת על ידי פעילות מוטורית של שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II הג’נס19,2016,רשת אקטין. עשורים של מחקר גנטי זיהה את ההרכב המולקולרי של מסלול זה, ברצף מיקמה אותם לפי הסדר הבא: 1) ערפל מופרש מהתחום הפסגה של תאי אפיתל בקו האמצע הגחון; 2) ערפל נקשר לקולטנים G-חלבון בשילוב שיתוף, ערפל, ערפיח, ואת אותות באמצעות heterotrimeric G-חלבון כמתחם יחידת משנה של12 – 13 Gα מפוחית יד (Cta), אשר היא ליוותה אותך על-ידי גף קאנונית ריק-8; 3) Cta ומפעילה פקטור המרת נוקלאוטיד גואנין, RhoGEF2, אשר בתורו מפעיל את Rho1 G-חלבון קטן; 4) Rho1 מפעיל קינאז רו (Rok); 5) Rok מפעיל שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן contractility II התחום הפסגה דרך זירחון של שרשרת אור רגולטוריות (RLC), ובכך לייצר לתעוקה הפסגה (איור 1)15,21,22 ,23,24,25,26,27,28,29. מוטציות בכמה מרכיבים אלה להפריע את gastrulation נורמלי ותנועות morphogenetic אחרים, כולל היווצרות של דיסק כנף, בלוטות הרוק, המציין כי מסלול זה משמש מספר שלבי דרוזופילה מופרה30,31,32. מסלול ערפל הוא אחד הדגמים הכי למד לעיצוב אפיתל, סיפקה תובנות חשובות איך רקמות ברמת מורפוגנזה מוסדר של שעתוק גנים מונחה שלד התא תא תנועות14,15 ,21.
פיתחנו וזמינותו contractility מבוססת-תא זה recapitulates רבים של הסלולר התגובות במורד הזרם של ערפל נצפו בפיתוח עוברי לטוס17. אנחנו מתוכנן של S2 יציב שורת התאים המבטאת ערפל מתויג ב שלה קרבוקסילי עם myc תחת השליטה של יזם inducible metallothionine ניתן לקצור על התוספת של נחושת גופרתית (CuSO4) למדיום. כאשר ממוזגים ערפל מדיה מוחל ectopically לתאים קולטנים S2 + (S2R +), אשר subline של תאים S2 מאופיינת שלהם ביטוי דיפרנציאלי של קולטנים כגון Frizzled ואינטגרין subunits, התאים עוברים ארגון מחדש של שלד התא מאוד מזכיר את הכיווץ הפסגה12,17,27,33. שינויים אלה יכול להיות שנצפו מיקרוסקופ שלב-ניגודיות בערפל איזה טיפול מוביל המראה של שלב-כהה קפלים מעידה על עלייה רדיאלי ב contractility II שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן, או על ידי קרינה פלואורסצנטית מיקרוסקופ לאן הערפל טיפול מוביל צורה של שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן טבעות II בתאים המבטאים RLC מתויג EGFP34. טבעות אלו מכילים phosphorylated צולבות הקישור חוטים שרירן רגולטוריות שרשרת אור (pRLC) גלוי ויה immunostaining23,34,35. תגובה זו ערפל-induced נדרש Cta, RhoGEF2, רו ו Rok; לפיכך, שימוש רקומביננטי ערפל-Myc S2R + תאים, הקמנו אמצעי לחקור ערפל-induced כיווץ24,25,של מערכת מבוססת על רקמות-תרבות34.
כאן, אנו מציגים את פרוטוקול מפורט עבור וזמינותו contractility מבוססת תא באמצעות דרוזופילה תרביות רקמה קו תא (S2R + תאים), אשר עובר שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן לתעוקה II בתגובה ערפל איתות. Assay זו שימושית עבור חוקרים את מסלול ערפל, וכן מנגנונים המסדירים שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II contractility.
תא culturing שיקולים:
התנאים תחת אילו S2R + תאים נשמרים חיוני להשגת נתונים אמין זה וזמינותו. בעת תכנון לבצע את הבדיקה contractility, זה הכי טוב לשמור על S2R + תאים במדיום חרקים מגן ו- M3 שרו. בעוד S2R + תאים יכולים לשגשג בתקשורת תרבות אחרים תא חרקים (למשלSF900 או של שניידר חרקים בינוני), הם לעיתים קרובות מאבדים את ההיענות שלהם כדי ערפל. S2R + תאים המכילים מספר מעבר גבוה, בדרך כלל יותר מ 20-25 קטעים, מתחילים להפסיד רגישות RNAi. עדיף להשתמש במעבר מוקדם תאים עבור כל הניסויים. היבט חשוב נוסף ולניסויים דלדול RNAi היא בחירת הפקדים המתאימים. פקדים שלילי נפוצים כוללים dsRNA מיקוד EGFP או pBlueScript, וגם את אשר יש לי הומולוגיה כדי הגנום לעוף. פילוח חלבונים במסלול ערפל (רו, רוק, וכו ‘), אשר, כאשר דלה, למנוע את ההפעלה של שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן contractility, הם גם פקדים שימושיים. S2:Fog-Myc תאים יכול להישמר במדיום תרבות התא אלטרנטיביות כגון SF900 בתוספת 100 יחידות/mL הפניצילין, סטרפטומיצין µg/mL 100, ו 0.25 שהוא גוסס ב’ הערה FBS הזה נדרש לא כאשר culturing בתאים SF900. תא צפיפות היא גם מרכיב קריטי לכל ההיבטים של תאים תרביות רקמה דרוזופילה . בניגוד תרביות רקמה בתרבית של תאים, דרוזופילה-תרביות רקמה נגזר תאים לשגשג הטוב תחת צפיפויות תא גבוה יותר (צפיפות לא נמוך מ 5 x 105 תאים/מ ל…). עם זאת, בעת ביצוע וזמינותו הזה, זה קריטי כי תאים לא מצופה ב- con A-מצופים מנות עם תחתית זכוכית מעל 80% הנהרות, כפי כימות של חוזה לעומת תאים שאינו מתכווץ מאוד מייגע
היבטים קריטיים, גישות אלטרנטיביות של וזמינותו Contractility הסלולר:
הייצור של ערפל, ליגנד שמפעיל שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II contractility, היא מרכיב מרכזי של זה וזמינותו. הגן ערפל מקודד חלבון של חומצות אמינו 730 עם משקל מולקולרי החזוי של ~ 78 kDa26. ניתוח hydropathy גילה רצועה של שאריות הידרופובי 12-הערפל אמינו-terminus יכול לתפקד כרצף הפרשת אות. בנוסף, רצף קידוד מכיל גם באתרים מרובים עבור פוטנציאל גליקוזילציה N-O-מקושרים, נוסף רומז שערפל הוא חלבון המופרש26. כדי לתמוך בזה, ערפל מקומי שלפוחית הפרשה הרב, שעורר תאים באפידרמיס בתהליך הכיווץ הפסגה16. ערפל-Myc ביטוי הושרה על תוספת של נחושת גופרתית למדיום, נוגדנים נגד ערפל או Myc מוכר חלבון 150-kD מאמצעי התרבות שנקטפו מתרבויות המושרה אבל לא מ המושרה מדיה מתאי S2 חסר הבונה ערפל-Myc. משקל מולקולרי הזה היה גבוה יותר מאשר המשקל המולקולרי של 80-kD החזוי של ערפל, מרמז כי המנגנונים הפרשה של תאים S2 עשוי glycosylate החלבון לפני אקסוציטוזה. לאור ההשתנות פוטנציאליים טיהור ערפל, רצוי להשתמש מאותה אצווה של ערפל ממוזגים מדיה עבור כל הניסויים. ממציא גדול אצוות של מדיה ערפל-Myc מרוכז תסייע בשמירה על עקביות לאורך כל הסיבובים של ניסויים.
ההצלחה של assay זו תלויה גם בביטחון זיהוי תאים שעברו הכיווץ. בעוד תאים מכווץ יכול להיות שנצפו על ידי קרינה פלואורסצנטית מיקרוסקופ, על ידי צביעת אקטין או שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II, הדרך האמינה ביותר כדי לזהות ולכמת תאים מכווץ הוא דרך שלב-ניגודיות או מיקרוסקופ DIC. ספירות מדויק יכולה להיות מושגת באמצעות 20 X – 40 X הגדלה על מיקרוסקופ אור רגיל ביותר. למרות בפרוטוקול נכתב משתמשת כאן מנות תת, וזמינותו ניתן גם לבצע באמצעות תקן 1.5 coverslips זכוכית דקה מצופה con א התוספת של ערפל יכולה להיעשות 35 מ מ של תרביות רקמה על coverslip מניחים על מצלמות-מיקרוסקופים, כדי להגביל את כמות ערפל המשמש עבור כל וזמינותו. האיכות של קיבעון הוא מרכיב קריטי וזמינותו, כפי תאים גרוע קבוע יכול להוביל תוצאות חיוביות שגויות. באמצעות פתרון קיבוע טריים ולוודא התאים לא יבש מתקבעת יוביל תוצאות אמינות יותר. לבסוף, חשוב לספור את מספר גדול של תאים. בדרך כלל, רק 30% – 50% של מטופל או תאים שטופלו RNAi שליטה מתכווצים בעקבות זלוף של ערפל. עם זאת, יש רמה הבזליים של הכיווץ המתרחשת ב- S2R + תאים, כך מספר גדול של תאים יש צורך להבטיח כל שינוי השבר תאים מכווץ עקב טיפולים. יתר על כן, דלדול של כמה חלבונים מעורב ברגולציה של שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן II contractility עלול להוביל hyper-contractility, גם בהיעדר של ערפל. הנתונים המובאים כאן הם מעל התאים 3,600 נמנו שלושה טיפולים רצופים RNAi באמצעות מאותה אצווה של מדיה ממוזגים ערפל.
יישומים של וזמינותו Contractility הסלולר:
זה וזמינותו contractility, בשילוב עם RNAi הקרנת שיטות, מציע מערכת חזקה ללמוד איתות התא, מורפוגנזה ו contractility הסלולר. בעבר, זה שימש כדי לזהות אחד של ערפל שני רצפטורים שיתוף21. מסך יישוב של 138 G-חלבון בשילוב קולטנים (GPCRs) תיגמר ידי RNAi S2R + בתאים, יכולתו להגיב הערפל היה לבדיקה כמפורט בפרוטוקול המוצג כאן. של GPCRs 138, יחיד, ג’ין uncharacterized בעבר, כיום ידוע ערפל, נחשפה. חקירה נוספת הפונקציה של ערפל הוכיח כי לא רק היה זה נדרש עבור ערפל-induced contractility התאית בתאים S2R +, אבל זה גם היה חיוני gastrulation בפיתוח דרוזופילה21. יתר על כן, וזמינותו הזה שימש כדי להדגים כי ריק-8, של גף קאנונית, היא גם מרכיב בערפל איתות לשביל27. סדרה של ניסויים RNAi אפיסטזה בשילוב עם וזמינותו contractility הפגינו ריק-8 אינטראקציה עם יחידת משנה12/13 Gα Cta, פונקציות כדי לאתר אותו בתוך התא, אשר הינה קריטית ערפל-induced contractility הסלולר31 .
תרביות רקמה דרוזופילה הוא מתאים במיוחד טירונים, התאים נשמרים בקלות בטמפרטורת החדר, אינם דורשים CO2 או buffered תא תרבות בינוני, מוצקים כל עוד התא הנכון תרבות צפיפויות נשמרים. וזמינותו contractility הסלולר בוצעה בהצלחה באמצעות המקטע מעבדה של קורס ביולוגיה לתואר ראשון תא, שבו התלמידים היו ללא ניסיון עם תאים culturing או מיקרוסקופ. וזמינותו contractility הסלולר המובאת כאן מייצג כלי רב עוצמה, המבוססים על התא יכול להיות מועסק גילוי הגן, או לחקור את הערפל איתות, עוזר לנו טוב יותר להבין תהליכים התפתחותיים, כגון לתעוקה הפסגה ו שרירים שאינם צולבות הקישור חוטים שרירן contractility II, באופן כללי.
The authors have nothing to disclose.
המחברים רוצה להודות חברי המעבדה רוג’רס, המעבדה אפלוויט גרטה גלובר, הסטודנטים של המכללה ריד האביב 2018 קורס ביולוגיה תאית, שתרמו להתפתחות של פרוטוקול זה. יתר על כן, המחברים רוצה להודות חברי המעבדה ריץ בקפידה קריאה ועריכה של כתב היד הזה. מחקר דיווח בפרסום זה נתמך על ידי הקרן הלאומית למדע תחת מספר פרס 716964 D.A.A., ע. ר, המחלקה לביולוגיה של המכללה ריד.
S2R+ cells | Drosophila Genomics Resorce Center | 150 | cell culture line, undergoes apical constriciton |
S2:Fog-myc cells | Drosophila Genomics Resorce Center | 218 | cell culture line, produces Fog-myc under pMT promoter |
S2R+ :Sqh-EGFP cells | Drosophila Genomics Resorce Center | 196 | cell culture line, stably expresses Sqh(RLC of non-muscle myosin II) tagged with EGFP |
Shield and Sang M3 | Sigma-Aldrich | S3652 | cell culture medium |
SF900 insect medium | Thermofisher Scientific | 12658019 | alternative cell cutlure medium |
Schneider’s insect medium | Thermofisher Scientific | 21720024 | alternative cell cutlure medium |
Fetal Bovine Serum | Thermofisher Scientific | 16000044 | media supplement |
Antibiotic-Antimycotic (100X) | Thermofisher Scientific | 15240112 | antimicrobial/antifugal media supplement |
Concanavalin A | MP Biomedicals | 150710 | used to coat dishes and coverslip for cellular adhesion |
Glass bottom plates | Maktek | P35G-1.5-10 | used for assay and for fixing and staining cells |
Glass cover slips | Corning | 2940-225 | alternative to glass bottom dishes |
Protein concentrators | Millipore | UFC903008 | 30,000 molecular weight cutoff, used to concentrate media |
25 cm2, 75 cm2, 150 cm2 tissue culture flasks | Genessee | 25-204,25-206,25-208,25-210 | used to culture cells |
6-well and 12-well tissue culture dishes | Genessee | 25-105, 25-106 | used to culture cells |
Flourescent mounting medium | Dako | S3023 | to preserve fixed cells |
32% Paraformaldehyde | EMS | 15714-S | used to fix cells |
Pipes | EMS | 19240 | used in PEM buffer for cell fixation |
Anti-Myc Antibody | Drosophila Hybirdoma Bank | cat# 9E10 | used to dectect Fog-Myc |
PhosphoSerine-19 antibody | Cell Signaling | 3671 | antibody against phosphorylated regulatory light chain (RLC) serine 19 |
488-Phalloidin, 568-Phalloidin | Thermofisher Scientific | A12379, A12380 | to stain for f-actin |
Hawk-VT multi-point array scanning confocal system | VisiTech International | Used for live cell imaging of S2R+:Sqh cells | |
Eclipse TE300 Inverted microscope | Nikon | Used for live cell imaging of S2R+:Sqh cells |