כאן, אנו מציגים פרוטוקולים לגלות תרכובות פעיל קולטני GABAA , מן הכריכה פיזיולוגיה, פרמקולוגיה.
זה מציג כתב יד פרוטוקול צעד אחר צעד לסינון תרכובות-גמא-aminobutyric חומצה סוג של קולטנים (GABAA) והשימוש בה לקראת הזיהוי של הרומן מולקולות פעילים מבחני פרה מ רקומביננטי במבחנה הקולטן והשפעותיהם תרופתי-קולטנים יליד פרוסות המוח מכרסמים. עבור תרכובות מחייב באתר בנזודיאזפינים של הקולטן, הצעד הראשון הוא להגדיר מסך ראשי המורכב בפיתוח מבחני הכריכה radioligand על קרום התא לבטא את תת-סוגי GABAA מז’ור. לאחר מכן, תוך ניצול של הביטוי heterologous של קולטני GABAA מכרסמים ואנושי oocytes צפרדע רפואית או תאים HEK 293, זה אפשרי לחקור, במבחני אלקטרופיזיולוגיות, המאפיינים הפיזיולוגיים של הקולטן שונים תת והמאפיינים תרופתי של תרכובות שזוהה. מערכת oocyte צפרדע רפואית , יוצגו כאן, החל הבידוד של oocytes את, microinjection שלהם עם mRNAs שונים, עד האפיון תרופתי באמצעות מלחציים שני-אלקטרודה מתח. לבסוף, הקלטות שנערכו פרוסות המוח מכרסמים יתוארו המשמשים פיזיולוגיים כמבחן משני כדי להעריך את הפעילות של מולקולות ב שלהם יליד קולטנים עצביים במעגל מוגדרים היטב. הקלטות חוץ-תאית באמצעות תגובות האוכלוסייה של נוירונים מרובים מודגמות יחד עם הבקשה סמים.
כאן, אנו מציגים פרוטוקולים על הגילוי של חומרים פעילים על קולטני GABAA , מן הכריכה פיזיולוגיה, פרמקולוגיה. חפש את הרומן מולקולות ספציפיות עבור קולטני GABAA , זה חיוני כדי להגדיר במדויק ככל האפשר, סוג המשנה של עניין את ההערכה של יחודיות של תרכובות שזוהה (ראהלמשל, לסקירה, רודולף ו Knoflach1או Sieghart2). נתיב אופייני. גילוי סמים ואת הצעדים שצריכים להיות מושגת מומחשים באיור1.
מבחני הכריכה, משמשים עדיין בעיקר בשלב הראשון של גילוי תרופות. במקרה של קולטני GABAA , והם ממוטבים לזהות תרכובות לאגד אתר איגוד בנזודיאזפינים של הקולטן איפה לאגד רפואית שימושי ובטוח סמים. טכניקות אחרות, באמצעות fluorometric הדמיה צלחת הקורא (FLIPR) ממברנה פוטנציאליים מבחני מבוסס-צבען אדום3, לזהות תרכובות כמו ברביטורטים לאגד לאתרים נוספים שהן לא רצויות בשל הפרופיל שלהם-לוואי בלתי רצויות. בנוסף, שימוש צבעים ניתן ישירות להפעיל קולטני GABAA , וכך לחקור את התועלת של אלה מבחני. גילוי סמים4. איגוד מבחני יכול לספק רק את הראיות זה תרכובת נתון באפשרותך לאגוד בשיעור קולטן ספציפי. במבחנה מבחני עם קרום התא משמשים לזיהוי האדם סלקטיבי GABAA α5β3γ2 קולטן ליגנדים. Transiently transfected תאים HEK293 לבטא את האדם GABAA α5β3γ2, α1β3γ2, α2β3γ2 ו α3β3γ2 רצפטורים משמשות היכונו ממברנות מבחני אלה. השפעת ליגנדים מזוהה על ידי מדידת את נצנוץ של פלומאזניל [3H] מחויב על קולטני ממברנה (עיכוב של איגוד פלומאזניל [3H]). היתרון העיקרי של שיטה זו הוא כי החלטה מהירה ויעילה של אהדה המתחם מחייב על הקולטן עניין מספק את הקולטן של עניין.
מחקרים פונקציונלי חיוניים כדי להעריך את פעילות פונקציונלית של תרכובות, להציע הסבר פיזיולוגי ותרופתי של המנגנונים נגרם על-ידי הכריכה של תרכובות הקולטנים. . היום, זה מוכרת היטב כי פונקציונלית קולטני GABAA הם תוצאה של ההרכבה של חמישה subunits סביב ציר של pseudosymmetry שהוקמה על ידי נקבובית יונית תוצאת מההרכבה חמש subunits זהים. רוב קולטני GABAA מורכבים של שניים או יותר subunits שונים. הקולטן נכשלים GABAA , למשל, מורכבת subunits α1, β2 γ2 ב סטויכיומטריה של 2, 2, ו-1 בהתאמה5,6. שיחזור מערכת המחשב המארח כמו צפרדע רפואית oocytes או תאים HEK293 מציעה את האפשרות במהירות לחקור את מאפייני קולטני תרופתי.
המאפיינים תרופתי של תרכובות נידונות ואז עם הקלטות חוץ-תאי המוח פרוסות7. שיטה זו מאפשר חקירה של ההשפעה של תרכובות על עצבית והוא מספק דרך יעילה כדי לאשר את ההשפעות פונקציונלי של תרכובות נחוש במערכות heterologous ביטוי ברמה של רצפטורים מקורי הכולל סביבת עצביים. GABAergic עצבית יכולה גם להיות מוערך ברמה המולקולרית על ידי מדידת ההשפעות של תרכובות על זרמי postsynaptic מעכבות (IPSCs)8. אבל הפרוטוקול המשמש כאן, המבוסס על הקלטות מלחציים תיקון שלם-תא פרוסות המוח הוא משוכלל יותר ותשואות של תפוקה נמוכה יותר.
לבסוף, היתרונות והחסרונות של ה במבחנה הקרנת אשד המשמש לצורך זיהוי ליגנדים α5β3γ2 סלקטיבית נדונים בפרספקטיבה של הטכניקות השונות והמגבלות מהותי שלהם. עבודה זו צריכה לספק מומחים שאינם מומחים בתחום של קולטני GABAA סקירה מועיל של השילוב בין גישות שונות במבחנה המשמש כדי להתמודד עם גילוי מאפננים החדש של תעלות יונים ממותגת ליגנד אלה.
הפיתוח של תרכובות הרומן פעיל תעלת יונים ממותגת ליגנד כגון קולטני GABAA דורש השימוש של מספר גישות. בדרך כלל, הצעד הראשון בדרך כלל מתבצע באמצעות מבחני הכריכה; עם זאת, מדידות כאלה אינם מספיקים לאפיין את פעילות פיזיולוגית של המתחם או פרמקולוגיה המדויק שלו. בפרט, מתחם זה נקשר לקולטן עשוי לשפר או לעכב את תפקידה או אפילו לייצר אין השפעה תפקודית (להיות שקט) (קרי, לאגד הקולטן מבלי לשנות את תפקידו). לכן, בדיקה פונקציונלית נדרש עבור אפיון מלא המורכב.
מבחני האיגוד:
היתרון העיקרי של איגוד וזמינותו היא כי זה יכול להיות יעיל נערך על מספר רב של דוגמאות הנעות עד כמה אלפים, שהיא מספקת הזיקות מחייב עבור מולקולות פעילים. כמתואר להלן, הצעד הראשון מורכב להקמת שיטה להערכה מסוגי המשנה קולטן הרצוי. כלומר, בעוד איגוד יכול להתבצע על קולטנים יליד שברים או המוח כולו, השיטה תמנע הקביעה של הזיקות-קולטן ספציפי יחוברו. לכן, צורך להשתמש מערכות רקומביננטי מסך מולקולות על המטרה הרצויה. כיום, תרביות תאים ארעי או יציבה של cDNAs יחידת משנה קולטן הרצויים בשורות תאים מציע שיטה יעילה ואמינה לבטא את תת-סוגי קולטן עניין (למשל, GABAA α5β3γ2). שימוש מסורתי מחייב לבצע מבחני radioligands, אבל כיום טכניקות זמינים זה למנוע את אי הנוחות של טיפול רדיואקטיביות (למשל, כמותי מבוסס על-ידי קרינה פלואורסצנטית ליגנד מחייב).
ביטוי תפקודית במערכת מחשב מארח:
כדי לבטא את הגנים במערכת המחשב המארח, רצף קידוד עניין להוסיף לתוך פלסמיד המכיל את באמרגנים נאותה. בדרך כלל, עבור במבחנה סינתזת mRNA, משמשים את באמרגנים חיידקי T7 או T6. עבור ביטוי cDNA, שעתוק של הגן עניין להיות מפוקח על ידי promotor איקריוטים כגון CMV (cytomegalovirus) או שווה ערך. כיום, מספר פלסמידים, כולל את שני באמרגנים (כלומר, pUNIV, pCMV-6AC, psf-CMV/T7, pCI-neo, pcDNA), הם זמינים, המאפשר סינתזה של במבחנה של mRNA או ביטוי cDNA כמוצג באיור15. ביטוי של קולטני GABAA ניתן להשיג בנאמנות שורות תאים או צפרדע רפואית oocytes. היתרונות העיקריים של האחרונים הם העדר ביטוי הקולטן אנדוגני, הפשטות של מניפולציות, והזמינות של מערכת אוטומטית עבור מיקרו-זריקות והקלטות. בהליכים המתוארים תחת פרוטוקול זה להדגים את היעילות של מערכת אוטומטית אשר מאפשר ההזרקה של 96 oocytes כ 7 דקות והוא דורש כישורים המיקרומניפולציה. לזכור כי שחלה יחיד מ צפרדע רפואית מכילה בין 10,000-30,000 oocytes, ברור כי מספר גדול של מדידות התא יכול להתבצע על תכשיר יחיד. יתר על כן, כפי ביטוי יכול להתבצע באמצעות זריקות cDNA, פלסמידים באותו המכיל את הגנים של עניין זה מפותחים עבור הניסויים איגוד יכול לשמש עבור אפיון פונקציונלי ללא צורך נוסף בביולוגיה מולקולרית מניפולציות.
בהינתן גודל גדול וביטוי משטח גבוהה, oocyte יחיד מניבה מספר קולטנים אשר שווה בקירוב ל התאים confluent 35 מ מ פטרי. עם זאת, הזרקת והכנה oocytes מייצג חלק של העלות של קו תא, כמו הניסויים אינן דורשות מדיום תרבות מסוים ומניפולציות סטרילי. ההפעלה של ערוץ GABAA אחד מניב מספר picoamperes (10-12), זרמי הנעות עד עשרות microampere (10-6) נרשמות בקלות oocyte יחיד, אשר מאשר את הפעילות בו-זמני של מספר מיליוני קולטנים במהלך תשובה בודדת.
שלב ראשוני האפיון של תעלות יונים ממותגת ליגנד לעתים קרובות הקביעה של זיקה לכאורה של הקולטנים. הניסויים צריכים להתנהל מורכב החלה סדרה של פולסים מבחן בקצרה אגוניסט של התוויית את משרעת של עורר הנוכחי או, במקרים מסוימים, האזור מתחת העקומה (AUC) כפונקציה של הלוגריתם של ריכוז אגוניסט. כמו שזה ריאלי בקלות כדי microinject שונים פלסמיד ריכוזים, יחס מאותה אצווה של oocytes, מערכת זו של הביטוי מתאים במיוחד אפיון כזה. יתר על כן, השוואה אצווה-כדי-אצווה חשף רמה גבוהה של יציבות עבור s50EC שונים. השפעת ההרכב יחידה משנית על זיקה נראית לעין של הקולטן הוא מדמיין בקלות באמצעות מזימה עכביש, למשל, באיור10.
התוצאות של המלחציים שני-אלקטרודה מתח בשנת oocytes צפרדע רפואית מושווה לעתים קרובות עם הקלטות שבוצעו באמצעות אלקטרודות מלחציים תיקון. בעוד שזה יגיע מעבר להיקף העבודה הזאת להיכנס השוואה מפורטת בין שתי מערכות אלה, אפשר לבחון כמה נקודות. מלחציים תיקון בתאים מציעה יתרונות עבור אפיון biophysical עם יישום מהיר סמים, לדרישות שלו מורכבים יותר מאלה של ההקלטות שני-אלקטרודה צפרדע רפואית oocytes. קושי שעצירת והראשון הוא הביטוי של חלבון נתון בצורך של תרבות תא, הציעה שתושב זמני או תרביות תאים יציב, וזיהוי של התאים הם ביטוי הבונה הרצוי. בנוסף, היא הכרחית כדי לבחון את התרומה אפשרי של הביטוי אנדוגני בתא נחשב. יתר על כן, הקלטה מלחציים תיקון מחייב אדם מיומן לנהל את המיקרומניפולציה תחת מיקרוסקופ הגדלה גבוהה, בעוד אותו אדם גם צריך לבצע ניתוח נאותה במהלך הניסוי כדי להעריך, לדוגמה, האיכות של החותם. ההתנגדות גישה וכו לעומת זאת, מלחציים שני-אלקטרודה מתח הקלטה, במיוחד אחד באמצעות מערכת אוטומטית אלקטרופיזיולוגיות, אינו דורש שום כישורים ספציפיים, יכול להתבצע על ידי טכנאי מעבדה.
בעת רכישת של הגדרת אלקטרופיזיולוגיות, שיקול העלות היא ללא ספק גורם חשוב שצריך להיות מנותח בקפידה. לדוגמה, בעוד העלות של מערכת אוטומטית היא גבוהה יחסית, השוואה קרוב יותר מגלה כי ההתקנה של מעטה אלקטרופיזיולוגיות מלאה כולל קניית ציוד כגון micromanipulators טוב, עדשה דו-עינית, מגבר, זלוף המערכת, טבלת אנטי רטט, תוך רכישת נתונים וביצוע ניתוח גם. עלות השוואה בין שני-אלקטרודה מתח קלאמפ הגדרת נגד הפללה מלחציים תיקון מגלה אי-התאמות עוד יותר. יתר על כן, המערכת האוטומטית מציעה את היתרון של ציוד ממוחשב ופועל ללא התערבות יום ולילה.
המאפיינים תרופתי של תרכובת נקבעים על ידי פעולתה על הקולטן. לדוגמה, מעכבי תחרותי הם מולקולות יכולים להזין את היד לכיס איגוד, או באתר orthosteric, כמו אגוניסט עצמו גורם תחרות. מעכבי שאינו תחרותי הם תרכובות המעכבות את קולטני על ידי אינטראקציה באתר אחר, במקרה של ערוץ יונים ממותגת ליגנד, שניתן להזין או לחסום הנקבובית יוניים, לדוגמה. זה ילך מעבר להיקף עבודה זו לבחון את מנגנוני שונים של אינטראקציה, אך בהמשך ניתן לקבל מידע מתוך ספר לימוד תרופתי ו/או מהעבודה אחרים כגון ברטרנד, ברטראן22.
במקרה של allosteric מאפננים, איגודים תרכובת-אתר שהוא נבדל באתר orthosteric, אבל הנוכחות של המולקולה משנה מחסום האנרגיה בין המדינות פעיל ועוד. חיובי allosteric מאפננים (PAMs) הם תרכובות להפחית את מחסום אנרגיה מן המנוחה למצב הפעיל ולשפר, לכן, ההשפעה של אגוניסט. כדי לאפיין תופעות אפשריות פאם, יש, לכן לקבוע אם חשיפה למתחם משפר את התגובה אגוניסט,, ואם כן, על איזה ריכוז. הניסויים המוצגים באיור 11 ו -14 איור להמחיש פרוטוקולים יכול לשמש בהצלחה עבור אפיון PAMs על קולטני GABAA .
במקרים מסוימים, חשיפה פאם לבד עשויה להספיק להפעיל את הקולטנים. פעילות כזו יכולה להיקבע על ידי שינוי קל של פרוטוקול ניסיוני המוצג כאן. כלומר, במקום באמצעות יישום שיתוף של אפנן במהלך החשיפה גאבא, הפרוטוקול יכול להיות שונה עבור היישום של הראשונה המתחם לבד ולאחר מכן בנוכחות גאבא. אפיון של הפעילות אגוניסט ישיר ייעשה על ידי קביעת משרעת של התגובה עורר על ידי המתחם עצמו, לעומת הנוכחי עורר-GABA.
ניסויים שנערכו פרוסות המוח, כגון מאויר ב איור 7, משמשים כדי לאשר מתחם פעילות מקורית קולטנים במעגל מעכבות מובהק לפני שנמשיך הלאה במודלים של בעלי חיים, לאורך השביל לכיוון בניסויים קליניים. פרוטוקול הקלטה וניתוח נתונים פשוטים יחסית מאפשר הדירוג של תרכובות מרובים על-ידי הערכת השפעתם modulatory דיפרנציאלית על PS משרעת. אפקטים שאינם ספציפיים של תרכובות שאינן קשורות למערכת גאבא עשוי גם להיות שזוהו (למשל, כאשר שינויים בצורת PS מובחנות). ישירה, GABAergic עצבית יכול להידרש במקרים אלה על ידי מדידת ההשפעות של תרכובות על זרמי מעכבות postsynaptic (IPSCs) באמצעות טכניקה קלאמפ8תאים כל תיקון.
The authors have nothing to disclose.
המחברים תודה ג’ודית לינגל, מריה Karg, Grégoire פריץ, רחל Haab, ו מארי קלייר Pflimlin של רוש ו שר סרט דבורה Paolucci מ- HiQScreen לקבלת סיוע טכני מעולה שלהם.
General equipment | |||
96 well cell harvester -(Filtermate 196) | Packard | To filter membranes with bound radioligand | |
Microtiter plate liquid scintillation counter (Top Count NXT) | Packard | Microplate Scintillation and Luminescence counter | |
Vial liquid scintillation counter (Beta-Couter 2500 TR) | Packard | Vial Scintillation and Luminescence counter | |
Liquid handler (Biomek 2000) | Beckman coulter | To prepare compound dilutions | |
Vortex (Vortex Genie 2) | Scientific industries Inc. | To mix compound stock solutions | |
Tissue homogenizer (Polytron PT1200E) | Kinematica AG | To resuspend the membrane preparations | |
XLfit5 software | Microsoft Excel add-on by IDBS |
Curve fitting software | |
Smart Pull | UniPix | – | Electrode Puller |
RoboInject | MultiChannel Systems | – | Automated Injection (Xenopus Oocytes) |
HiClamp | MultiChannel Systems | – | Automated Voltage Clamp (Xenopus Ooocytes) |
DataMining | MultiChannel Systems | – | Data Analysis Software |
DataMerger | MultiChannel Systems | – | Data Processing Software |
Digidata 1550 | Molecular Devices | Low noise data acquisition system | |
CyberAmp 380 or equivalent | Axon Instruments | Programmable Signal Conditioner | |
pClamp program suite | Molecular Devices | Software for data acquisition and analysis software | |
Antivibraton table | TMC | To avoid microelectrode vibrations | |
Patchstar Micromanipulators | Scientifica | To accurately position microelectrodes in brain slices | |
Faraday Cage | Sutter Instruments | To isolate recordings from noise | |
McIlwain Tissue Chopper | Campden Instruments LTD | To prepare brain slices | |
Borosilicate glass micropipette | Warner Instruments | GC150TF-10 | To record extracellular potentials in brain slices |
Twisted pair, platinum iridium wires stimulation electrode | World Precision Instruments | To stimulate the brain slices with current | |
Stimulus generator for current and voltage driven stimulation | MultiChannel Systems | STG4000 | Delivers the current to the stimulation electrode |
Plasticware | |||
Microtiter plate round bottom | Corning | #3365 | Used for the binding assay |
GF/C glassfibre filter-bottom 96-well microplate with 1.2µm poresize, for cell harvesting assays using a vacuum manifoldwell filter | Packard | #6005174 | used for the binding assay |
50 mL Tubes | Falcon | #352070 | used for the binding assay |
Safe-lock tubes 1.5 mL | Eppendorf | #0030 120086 | used for the binding assay |
Safe-lock tubes 2 mL | Eppendorf | #0030 120094 | used for the binding assay |
Shipping tubes 180ml | Semadeni Europe AG | #3722 | used for the binding assay |
Pony vial Polyethylene 6ml | Perkin Elmer | #6013329 | used for the binding assay |
Top Seal | Perkin Elmer | #60051859 | used for the binding assay |
Spinner Flask | Bellco | BELLCO # 1965-00100 | Spinner Flask |
96 Well Plate (Conical) | Thermo Scientific Milian | 56368 | Injection plate for the oocytes |
96 Well Plate (Flat bottom) | Corning (Vitaris Switzerland) | 3364-cor | Compound Plate for the HiClamp |
Glass capillary | Hilgenberg (Germany) | – | borosilicate glass 1.2 O.D. 0.76 I.D. with filament |
RNA preparation | |||
Ambion mMessage mMachine | Thermo Fisher Scientific | for the in vitro synthesis | |
Chemicals | |||
Assay buffer: KCl 5 mM; CaCl2 1.25 mM; MgCl2 1.25 mM; NaCl 120 mM; Tris 15 mM pH adjust with HCl to 7.4; store up to 3 months at 4°C. | Used for binding assay | ||
Washing buffer: Tris 50mM -HCl pH 7.4; store at 4°C. | Used for binding assay | ||
Stock solution of test compounds 10mM in DMSO | Used for binding assay | ||
Flumazenil (RO0151788) 10mM in DMSO | Used for binding assay | ||
Diazepam 4mM in DMSO | Used for binding assay | ||
[3H]-Flumazenil 60-85 Ci/mmol in Ethanol; store at -20°C | Used for binding assay | ||
Microscint 40 | Packard | #6013641 | Used for binding assay |
Ultima Gold | Perkin Elmer | #6013329 | Used for binding assay |
MS-222 | Sigma | Sigma # A5040 | MS-222 |
AB/AM | Sigma | Sigma # A5955 | antibiotics / antimycotics |
Collagenase | Sigma | Sigma # C1030 | Collagenase Type I |
Rnase | Sigma | Sigma # R2020-250 mL | RNaseZAP |
EndoFree Plasmid maxi Kit | Qiagen | Qiagen # 12362 | |
Salts for artificial cerebrospinal fluid (NaCl, KCl, etc.) | Sigma | ||
Membranes | |||
Frozen membrane preparations from transient or stably transfected HEK293 overexpressing different human GABAA receptor subtypes: α1β3γ2, α2β3γ2, α3β3γ2, α5β3γ2. See Ballard et al 2009 for detailed methods. | Used for binding assay |