Este protocolo describe métodos para exponer oralmente e infectar a la mosca de la fruta Drosophila melanogaster con bacterias patógenas y para medir el número de bacterias infecciosas caseta después de la infección intestinal. Además, describimos el efecto de mutantes inmunes mosca supervivencia después de la infección bacteriana oral.
La mosca de la fruta Drosophila melanogaster es uno de los mejores sistemas de modelo desarrollado de infección e inmunidad innata. Mientras que la mayor parte del trabajo se ha centrado en las infecciones sistémicas, ha habido un reciente aumento de interés en los mecanismos de la inmunocompetencia del intestino a los patógenos, que requieren métodos para infectar por vía oral a moscas. Aquí presentamos un protocolo para exponer oralmente moscas individuales a un oportunista patógeno bacteriano (Pseudomonas aeruginosa) y un patógeno bacteriano natural de D. melanogaster (entomophila Pseudomonas). El objetivo de este protocolo es proporcionar un método robusto para exponer las moscas machos y hembras a estos patógenos. Proporcionamos resultados representativos que muestran fenotipos de supervivencia, cargas de microbio y bacterias del vertimiento, que es relevante para el estudio de la heterogeneidad en la transmisión de patógeno. Por último, confirmamos que Dcy mutantes (falta de la matriz de protección peritrophic en el epitelio intestinal) y salsa de mutantes (falta de una vía funcional de la deficiencia inmune (IMD)), muestran mayor susceptibilidad a infección bacteriana oral. Este protocolo, por lo tanto, describe un método robusto para infectar moscas utilizando la vía de infección, que puede ser extendida al estudio de una variedad genética y medio ambiente las fuentes de variación en los resultados de infección intestinal y transmisión bacteriana oral.
La mosca de la fruta (también conocido como la mosca del vinagre), D. melanogaster, se ha utilizado extensivamente como un organismo modelo para la infección y la inmunidad contra una variedad de patógenos1,2. Este trabajo ha ofrecido ideas fundamentales sobre las consecuencias fisiológicas de la infección y también fue pionera en desentrañar las vías moleculares que subyacen la inmunorespuesta del anfitrión contra las infecciones bacterianas, micóticas y virales de parasitoide. Este conocimiento no sólo es útil para entender la respuesta inmune innata de insectos y otros invertebrados, pero porque muchos de los mecanismos inmunes están conservadas evolutivamente entre insectos y mamíferos, Drosophila ha estimulado también el descubrimiento principales mecanismos inmunes en los mamíferos, incluyendo seres humanos3.
Mayor parte del trabajo en Drosophila la infección y la inmunidad se ha centrado en las infecciones sistémicas, utilizando métodos de inoculación que patógenos directamente en el cuerpo del insecto por pinchazo o inyección4,5,6. La ventaja de estos métodos para permitir la entrega de una dosis infecciosa controlada es claro y apoyado por un gran cuerpo de trabajo sobre infecciones sistémicas. Sin embargo, muchos patógenos bacterianos naturales de D. melanogaster se adquieren a través de la alimentación en la descomposición de materia orgánica donde inmunocompetencia intestinal juega un papel importante en el host defensa7,8, 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15. experimentos que emplean infecciones sistémicas omitir estas defensas y, por lo tanto, proporcionan una imagen completamente diferente de cómo insectos montar defensas contra patógenos naturales. Esto es especialmente relevante si el objetivo del trabajo es poner a prueba predicciones acerca de la ecología y evolución de la infección, donde el uso de patógenos naturales y rutas de infección importante16,17. Trabajo reciente ha puesto de relieve cómo la ruta tomada por patógenos significativamente afecta enfermedad resultado18,19, provoca distintas vías inmune20,21, puede determinar el efecto protector de heredado de endosimbiontes16y puede incluso jugar un papel importante en la evolución de host defensas17.
Otra razón para emplear rutas orales de la infección es que permite la investigación de la variación en la transmisión de patógenos mediante la medición del vertimiento bacteriana durante la excreción fecal después de la infección oral22,23, 24. comprensión de las fuentes de heterogeneidad de host en la transmisión de la enfermedad es difícil en las poblaciones naturales25,26, pero componentes de transmisión, tales como patógeno del vertimiento, en laboratorio de control de medición condiciones ofrece una alternativa útil27. Bacterias alimentación de moscas y bacterias medición del vertimiento bajo una variedad de contextos genéticos y ambientales en condiciones experimentales controladas, es posible identificar fuentes de variación en la transmisión entre hosts.
Aquí, describimos un protocolo para la infección por vía oral de D. melanogaster con bacterias patógenas, y para cuantificar el crecimiento bacteriano y vertimiento sigue (figura 1). Describimos este protocolo en dos bacterias Pseudomonas : una cepa virulenta de lo patógeno oportunista p. aeruginosa (PA14) y una tensión menos virulenta de lo natural volar patógeno p. entomophila. Pseudomonas son bacterias Gram negativas comunes con un rango de hospederos amplio, infectar insectos, nematodos, plantas y vertebrados y se encuentran en entornos más4,6. Infección entérica de Drosophila por p. aeruginosa y p. entomophila resultados en patología a epitelio intestinal12,13,14,15, 28. Mientras nos centramos en estos dos patógenos bacterianos, los métodos descritos aquí pueden en principio aplicarse a cualquier patógeno bacteriano de interés con modificaciones menores. Después de la exposición oral, medimos supervivencia post-infección y medir la carga de microbios dentro de los moscas y microbios viables arrojan sobre el medio ambiente, expresado en colonias formando unidades (UFC). Por último, porque gut inmunocompetencia resulta de una combinación de la barrera epitelial y las respuestas humorales, medimos también la supervivencia de líneas de mosca donde se interrumpen estas defensas. En concreto, Drosocrystallin (Dcy) mutantes han demostrado anteriormente ser más susceptibles a la infección bacteriana oral debido a una matriz peritrophic empobrecido en la tripa29. También medimos la supervivencia en un mutante de Relish (Rel) que se ve impedida de producir péptidos antimicrobianos contra bacterias Gram-negativas por el IMD camino30.
Presentamos un protocolo para infectar confiablemente oral D. melanogaster con bacterias patógenas. Nos centramos en p. aeruginosa y p. entomophila, pero este protocolo puede ser fácilmente adaptado para permitir la infección de otras especies bacterianas, por ejemplo, Serratia marcescens7. Aspectos claves del presente Protocolo varían entre especies bacterianas. En consecuencia, la más eficiente dosis infectiva, virulencia correspondiente y host genotipo deben todos ser considerados e idealmente a prueba en estudios piloto. Exponiendo moscas a cultivos bacterianos de una gama de densidades ópticas y medir sus dosis infecciosa y la supervivencia es un punto de partida apropiado cuando se trabaja con nuevas especies bacterianas o líneas de mosca.
Pasos de protocolo tales como volar hambre antes de la alimentación y vuelva a suspensión bacteriana en solución de sacarosa al 5% son comunes en la infección oral y aumentar la confiabilidad de una infección bacteriana durante la exposición7,8, 9 , 10. sin embargo, es importante señalar que durante la exposición, moscas esencialmente viven en una superficie de cultivo bacteriano. En el proceso de caminar en esta cultura, bacterias que se metieran en la superficie de la mosca, sobre todo en la cutícula o alrededor de las cerdas24. Estas bacterias epicuticular, no reflejan una infección entérica éxito pero todavía se detectaría por la mosca de la homogeneización y el. Para reducir el riesgo de falsos positivos, es esencial a la superficie esterilizar moscas mediante inmersión en etanol al 70% para hasta 1 minuto.
Al considerar tasas de vertimiento bacterianas, la infección oral es esencial. El número de patógenos de que un host libera en el medio ambiente es a menudo difícil de medir y la carga interna se toma a menudo como un indicador de la severidad de la infección y por lo tanto transmisión26,27. Medición carga bacteriana junto con desprendimiento bacteriano permite un examen de la relación entre estos dos importantes componentes de gravedad y la propagación de la enfermedad38. Una limitación del método presentado es que ensayando la carga bacteriana interna de moscas requiere muestreo destructivo. Esto hace difícil investigar las tendencias longitudinales de crecimiento patógeno y la separación en el mismo individuo. Sin embargo, es posible superar esta limitación por cohortes de muestreo destructivo de los individuos en diferentes etapas de la infección, bajo el supuesto de que la carga microbio promedio en cada cohorte refleja la dinámica longitudinal del patógeno dentro de cualquier dado individuales. Bacteriana del vertimiento no padecen las mismas limitaciones, y ofrecemos ejemplos de cómo vertimiento se puede cuantificar en una muestra transversal y longitudinalmente para investigar cómo arrojar cambios dentro de un individuo en el tiempo.
Muchos rasgos del anfitrión y el patógeno conjuntamente determinan la propensión de un individuo para transmitir enfermedad25,26,39. Mientras que la significación de estos rasgos probablemente varía entre sistemas huésped-patógeno, vertimiento es probablemente un determinante de transmisión feco-oral. La capacidad para medir el desprendimiento bacteriano abre la oportunidad de probar esta hipótesis. Haber caracterizado dinámica huésped-patógeno en un panel deseado de líneas de mosca, experimentadores podrían oral infectar a individuos y colocarlos junto a los anfitriones no infectados, susceptibles durante sus períodos infecciosos. Estas moscas ‘destinatarios’ podrían ensayarse entonces para carga bacteriana interna en varios puntos del tiempo como una forma de medir directamente la transmisión.
Este trabajo fue apoyado por una concesión estratégica de la confianza de Wellcome para el centro para inmunidad, infección y evolución (http://ciie.bio.ed.ac.uk; grant referencia no. 095831). PFV fue apoyado por una beca de Branco Weiss (https://brancoweissfellowship.org/) y beca de un rectorado (Facultad de ciencias biológicas, Universidad de Edimburgo); JASJ fue apoyado por una beca de doctorado de NERC E3 DTP.
Vials | Sarstedt Ltd. | 58.490 | Polystyrene flat base tube 75mm x 23.5mm, 23ml |
Agar | Sigma-Aldrich | A7002 | Agar, ash 2.0-4.5% |
Brown sugar | Bidvest | 66032 | Light brown soft sugar |
Maize | Dove's Farm | Organic maize flour | |
Fermipan yeast | Bidvest | 96360 | Dry, instant yeast |
Methyl-4-hydroxybenzoate | Sigma-Aldrich | H5501 | >=99.0%, crystalline |
Sucrose | Sigma-Aldrich | 84097 | Sucrose BioUltra, for molecular biology, >=99.5% (HPLC) |
Petri dishes | Fisher Scientific UK Ltd. | 15788517 | X600 Petri Dish 90 X 16.2MM Sterile Triple Vent |
Falcon tubes (50ml) | Greiner Bio-one Inc | 210261 | Centrifuge tube, 50ml, skirted, bagged, sterile |
Eppendorf tube (0.5ml) | Sarstedt Ltd. | 72.699 | Sarstedt Micro Tube Conical Base Push Cap 0.5ml Standard Neutral |
Eppendorf tube (1.5ml) | Sarstedt Ltd. | 72.690.001 | Sarstedt Micro Tube Conical Base Push Cap 1.5ml Standard Neutral |
Ethanol | VWR International Ltd. | 20821.33 | ETHANOL ABSOLUTE ANALAR NP ACS/R.PE – Analytical Grade |
2 L Conical Flask | VWR International Ltd. | 214-0038 | Narrow neck, 2 L Erlenmeyer flask |
Sterile filter paper | Fisher Scientific UK Ltd. | 1001-020 | Plain circle and sheets; Particle Retention: greater than11um; Filtration speed: 150 herzberg; Air flow: 10.5s/100mL/in2; Medium porosity; Smooth surface; Grade 1; Type: circle; Dia: 20mm |
Bijou sample container | Fisher Scientific UK Ltd. | 129A | 7ml polystyrene sample container |
Pseudomonas isolation agar | Sigma-Aldrich | 17208 | Contains agar 13.6 g/L, magnesium chloride 1.4 g/L, peptic digest of animal tissue 20g/L, potassium sulfate 10g/L, triclosan 0.025g/L |
LB broth, Miller | Fisher Scientific UK Ltd. | BP1426 | Contains 10g tryptone, 5g yeast extract, 10g sodium chloride per litre |
Large Embryo Collection Cages | Scientific Laboratory Supplies Ltd. | 59-101 | Flystuff- fits 100mm petri dish |
TRI reagent solution | Life Technologies | AM9738 | |
96-well microplate | Scientific Laboratory Supplies Ltd. | 353072 | Falcon 96 Well Clear Flat Bottom TC-Treated Polystyrene Cell Culture Microplate with Lid Sterile |
Pestle | Fisher Scientific UK Ltd | 12649595 | Pestle, Presterilized; Axygen; Tissue grinder; Blue; Inert polypropylene construction; Fits 1.5 and 2.0mL centrifuge tubes; Individually wrapped; 100/Pk |
Glycerol | Scientific Laboratory Supplies Ltd. | CHE2068 | Glycerol A.R. 99.5% 2.5 L |
Cotton wool- non absorbent | Cowens Ltd | ABL | Non Absorbent Large quantity 20 bags x 500 |
Cotton wool- absorbent | Cowens Ltd | ABS | BP small quantity 20 bags x 500 |
Vortex | Fisherbrand | Whirlimixer 75W 50-6-Hz 220-240V | |
Orbital incubator | Gallenkamp | INR-200-010V | 220 V, 50 Hz, 5 A. Nominal temperature: 70ºC. Shaking frequency: 0…400 rpm. |
Absorbance Microplate Reader | Biotek Instruments Ltd | ELx808™ Absorbance Microplate Reader | |
Gen 5 Microplate Reader and Imager Software | Biotek Instruments Ltd | For Absorbance Microplate Reader | |
Centrifuge | Beckman Coulter | 392304 | Allegra X-12R Benchtop Centrifuge, refridgerated 50Hz 230V |
Step One Plus Real Time qPCR System | Thermofisher Scientific | 4376600 | Applied biosystems Step One Plus real time qPCR system |
Step One Software 2.3 | Thermofisher Scientific | For Stepone and SteponePlus real time qPCR systems | |
R Statistical Software | https://cran.r-project.org/ | ||
10 µL pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 741015 | Easlyload gilson-style. Graduated, clear, refill, 960 pcs |
200 µL pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 741065 | Easlyload gilson-style. Graduated, clear, refill, 960 pcs |
1000 µL pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 741045 | Easlyload gilson-style. Graduated, clear, refill, 960 pcs |
20 µL filtered pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 774288 | Filter tip gilson-style. Clear, rack blue, single packed, R/Dnase free, 10 racks of 96pcs |
200 µL filtered pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 739288 | Filter tip gilson-style. Clear, rack blue, single packed, R/Dnase free, 10 racks of 96pcs |
1000 µL filtered pipette tips | Greiner Bio-one Inc | 740288 | Filter tip gilson-style. Clear, rack blue, single packed, R/Dnase free, 10 racks of 60pcs |