Summary

小さい gtp アーゼ プレニル化および分子量 GTP 結合を使用して膜分画と gtp アーゼ抗体法の検出

Published: November 11, 2018
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Summary

ここでプレニル化とグアノシン 5′-三リン酸 (GTP) を調査するためのプロトコルを説明-GTPase の読み込み。このプロトコルは、2 つの詳細なメソッドで構成されています、すなわち膜分画と gtp アーゼ抗体アッセイします。プレニル化と GTP を測定するプロトコルを使用することができます別の他の低分子量 g タンパク質の読み込み。

Abstract

Rho である家族は、Ras スーパーファミリーに属するし、人間でおよそ 20 人のメンバーが含まれています。低分子量 g 蛋白質 Rho、細胞骨格、細胞運動、細胞極性、軸索ガイダンス、小胞輸送、細胞周期制御を含む、多様な細胞機能の調節に重要です。Rho GTPase シグナリングの変化は、がん、中枢神経系疾患、免疫システム依存性疾患など、多くの病的状態における重要な規制役割を果たします。における Rho gtp アーゼ (すなわち、メバロン酸経路の中間体によるプレニル化) と GTP 結合の翻訳後修飾は、このタンパク質の活性化に影響を与える重要な要因です。本稿 Rho GTPase の広範な範囲のプレニル化と GTP 結合活性を検出する 2 つの重要なメソッドが提供されます。使用されている技術的な手順の詳細を説明したこの原稿で一歩一歩。

Introduction

低分子量 g 蛋白質 Rho Gtpase の Ras スーパーファミリーになりユニークな亜科、進化、よく保存されて小さい蛋白質 (21-25 kDa) のグループであります。このスーパーファミリー内各亜科、GTPase 活性とヌクレオチド交換1関与している共有 G ドメイン コアがあります。Rho ファミリーと他の Ras サブファミリーとの違いは、5番目の β ストランドと小さい gtp アーゼ ドメイン2の 4th α ヘリックス内「Rho 挿入ドメイン」の存在です。

最近の分類に基づいて、Rho Gtpase シグナリング分子 gtp アーゼ Ras スーパーファミリー3に収まるの家族と見なされます。哺乳類における Rho gtp アーゼは、一般的性質4 ρ、Rac1 と Cdc42 がこのグループのほとんどを学んだメンバーの間では、特定の機能に基づく 22 のメンバーを持ちます。Rho Gtpase は厳しく規制されたメカニズム蛋白質翻訳後修飾を介して分子スイッチ5に依存する細胞内シグナル伝達経路を介してにリンクされます。

GTP の読み込みと加水分解の Rho Gtpase 活性化/不活性化サイクルに不可欠な機構が、規制を介してGTPase 活性化蛋白質 (ギャップ)。ギャップは GTP 加水分解を担当し、GTP の読み込み反応に責任があるグアニン ヌクレオチド交換要因 (一種) と連携して動作します。Rho GDP 解離阻害剤 (GDIs) はさらに GDP 結合 Rho gtp アーゼに結合を介して小さな Rho Gtpase の調節を提供します。これは GDP の解離を抑制する、アクティブな細胞内膜サイトから Rho Gtpase の隔離が容易になります。さらにでは、ヌクレオチド加水分解と交換とコントロール GDP/GTP1,6,78をサイクリングの両方を調節する GDIs のプレニル化を含む GTPase 蛋白質の規則はまた。

これら蛋白質1,9の脂溶性の性質を変更することによって GTPase の細胞質と細胞膜との間の動きは、GTP の読み込みと Rho GTPase プレニル化を関与しています。上記の規制当局は、細胞膜のリン脂質と GDP/GTP 交流活動10の他の変調の蛋白質と対話します。また、GDIs、解離の阻害剤は GTP 加水分解して GDP/GTP exchange をブロックします。GDIs は、GDP から非アクティブな Rho 蛋白質の解離と、したがって、下流のエフェクターとの相互作用を阻害します。GDIs は、低分子量 g 蛋白質の細胞質と細胞膜の間のサイクリングも規制します。Rho Gtpase の活動は細胞膜; する動きに大幅に依存します。したがって、GDIs はその疎水性領域/ドメイン11,12を非表示を通って細胞質に低分子量 g 蛋白質を隔離することができます重要な調節因子として見なされます。

その活性化サイクルのすべての段階で最適なシグナル伝達と機能を持っている GTPase の GTP-読み込み/GTP 加水分解の動的なサイクルは重要です。その後細胞極性、増殖、形態形成、細胞質分裂、移行、接着、および生存13,14など Rho GTPase によって調整される細胞機能の変化のこのプロセスの変更についてのあらゆる種類があります。

現在のプロトコルは、プレニル化・ GDP/GTP ロード調査小さい ρ GTPase 活性化を介して監視する詳細な方法で読者を提供します。このメソッドは、プレニル化と低分子量 g タンパク質の広い範囲の GTP 結合検出にも使用できます。Gtp アーゼ アッセーを使用して、他の種類、Rac1、Rac2、Rac3、H、K、または N Ras、Arf、および Rho15など低分子量 g 蛋白質の活性化のレベルを測定できます。薬理学的エージェント シンバスタチンは、最近小さな GTPase プレニル化と活動8,9,14,16の調節に関与すると報告されたなどとして使用します。

Protocol

1. 膜/細胞質分画を用いた ρ 定位法の定量 細胞培養とシンバスタチン治療 U251 100 mm のセル皿し、ダルベッコの文化のそれらの種 50,000 イーグル培地 (DMEM) (高グルコース, 10% 牛胎児血清 [FB]) に変更。 メディアを取り外して、シンバスタチン含有培地を追加すること (ジメチルスルホキシド [DMSO] に溶解シンバスタチンの 10 μ M)、細胞を治療に 30% 合流と 37 ° …

Representative Results

膜分画: 超遠心法は、膜と細胞質成分の分別に使われました。図 1に示すように、上清に含まれて細胞質画分とペレットが入っている膜画分。U251 細胞から得られた細胞内導入が期待されて分数の ρ の豊かさはシンバスタチン免疫ブロットを使用で治療後調べた。純度と膜と細胞質画分の…

Discussion

ここで我々 は小さな GTPase プレニル化と GTP 結合小さい gtp アーゼ内局 (膜細胞質) および Rho GTP の読み込みを測定する正確な方法をについて説明します。低分子量 g タンパク質は真核細胞で表現し、構造、運動、細胞増殖に必須の役割を果たします。プレニル化と GTP 結合; GTPase 活性の調節に関与しています。したがって、プレニル化とこれらの蛋白質の GTP 結合を評価する試金、細?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

島田ガバミは、健康科学センター運営助成金、CHRIM 営業許可と研究マニトバ州新しい探偵の営業補助によって支えられました。バエディ アリザデは研究マニトバ学生の身分によって支えられました。Shahla Shojaei は、健康科学財団営業許可と MITACS 加速員によって支持されました。アデル Rezaei モガダムは、ジョセフ ・ w ・ ゴードンで開催された助成金を営業、レベルによって支えられました。アミール a. ぜひともは NIH/NHLBI K08 賞 (1K08HL114882 01A1) によって支えられました。マレク ・ j ・ ロス親切 NCN 付与 #2016/21/B/NZ1/02812、スマート ロワール バレー一般プログラムを通じて総合研究 (地域センター ヴァル ・ ド ・ ロワール、フランス) ル球場研究所でサポートされており、共同出資者、マリーからサポートが認めています。マリアスクウォドフスカ キュリー アクション #665790 を付与します。シモーネ ・ ダ ・ シルバ ・ ローザは、UMGF 学生の身分によって支えられました。

Materials

DMEM high Glucose VWR (Canada) VWRL0101-0500
Fetal Bovine Serum VWR (Canada) CA45001-106
Penicillin/Streptomycin VWR (Canada) 97062-806
EDTA (Ethylenediamine tetraacetic acid) VWR (Canada) CA71007-118
EGTA (Ethylene glycol bis(2-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid) VWR (Canada) CAAAJ60767-AE
DTT (DL-Dithiothreitol) VWR (Canada) CA97061-340
Ammonium Persulfate VWR (Canada) CABDH9214-500G
Tris-Hydroxymethylaminomethane VWR (Canada) CA71009-186
30% Acrylamide/Bis Solution Biorad (Canada) 1610158
TEMED Biorad (Canada) 1610801
Protease Inhibitor cocktail Sigma/Aldrich (Canada) P8340-5ML 1:75 dilution
Rho-GTPase Antibody Sampler Kit Cell Signaling (Canada) 9968 1:1000 dilution
Pan-Cadherin antibody Cell Signaling (Canada) 4068 1:1000 dilution
GAPDH antibody Santa Cruz Biotechnology (USA) sc-69778 1:3000 dilution
RhoA G-LISA Activation Assay (Luminescence format) Cytoskeleton Inc. (USA) BK121 Cytoskeleton I. G-LISA Activation Assays Technical Guide. 2016.
RhoA Antibody Cell Signaling 2117
ECL Amersham-Pharmacia Biotech RPN2209
Anti-Rabbit IgG (whole molecule) Peroxidase antibody Sigma A6154-1ML
SpectraMax iD5 Multi-Mode Microplate Reader Molecular Devices  1612071A Spectrophotometer
Nonidet P-40 Sigma 11332473001 non-denaturing detergent, octylphenoxypolyethoxyethanol
DMSO Sigma D8418-50ML
PBS Sigma P5493-1L
Phophatase Inhibitor cocktail Sigma P5726-5ML 1:75 Dilution

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Alizadeh, J., Shojaei, S., da Silva Rosa, S., Rezaei Moghadam, A., Zeki, A. A., Hashemi, M., Los, M. J., Gordon, J. W., Ghavami, S. Detection of Small GTPase Prenylation and GTP Binding Using Membrane Fractionation and GTPase-linked Immunosorbent Assay. J. Vis. Exp. (141), e57646, doi:10.3791/57646 (2018).

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