ここでは、再現可能な方法で植物成長挙動と特に表現を勉強するためのプロトコルを提案する.変数と同じ時間安定した光の条件で提供する方法を示します。適切な分析は、十分なサンプル数と有効な統計的評価によって異なります。
植物の生物学者はしばしば選ばれた種の成長挙動を観察する必要があります。このため、植物は一定の環境と安定の光条件があり、別のセットアップの下で研究を行うことができる、好ましくは質と量の変数は必要があります。これらの要件は、気候室蛍光灯-とは対照的異なる波長に設定することができます-光発光ダイオード (LED) 照明の特徴によって満たされます。Led は、エネルギーの節約と、ほとんど多くの場合他の光源の問題を構成する光の強さにも熱を発する。提案するプロトコルは、気象室成長形質の詳細な分析でのいくつかのアプローチを記述すると同様、変数 LED ライト装備をプログラムする方法のステップ バイ ステップ ガイドを提供します。実験のセットアップに応じて成長する植物の様々 な特性は観察および分析できます。ここで我々 は新鮮重, 葉面積, 光合成活性と気孔密度を決定する方法について説明します。我々 は信頼性の高いデータを取得し、統計的評価に個人の十分な数を使用することは必須の有効な結論を描画するためにことを示します。高統計誤差の解析結果のこの種の数が少なすぎる植物を撮影し、その結果、データの少ない明確な解釈。
シロイヌナズナは、二十年以上のための分子時代の植物研究者のモデル生物をされています。いくつかの特性を作るこの小さな代表アブラナ科の分子遺伝学のための理想的な候補者: 比較的小さいゲノムを有する唯一の 5 つの染色体 (例えばタバコと比較して、24 の染色体を持つ) とそのゲノムは完全に 2000年1で配列されました。シロイヌナズナはアグロバクテリウム感染2で簡単に遺伝子組み換えできるも CRISPR/Ca3など最新の遺伝学的ツールを受けやすい。小さいながらも成長のサイクルが材料の高い金額が必要な生化学実験を可能にする十分な速度です。植物は、寒天や土壌を成長し、液体文化4として栽培されることも。シロイヌナズナは気候制御の戸棚には、例えば、パーシバルから育てることができる気候室や温室。成長挙動を比較して変異体の表現型を分析することができる再現性のある、同じ時間の柔軟な成長条件5を提供するが重要です。演説するべき科学的な問題によって 1 つは同じ温度で異なる光質多様な光強度や光の条件を一定温度の異なる必要があります。光は植物の成長に非常に重要なパラメーターとその影響は多様なアプローチ6でよく勉強しました。再現性と得られたデータの比較可能性を確保するため、安定した出力を確保してを同じ種類の光源を適用することが重要です。
温室および気候室で通常の光源は、ナトリウム蒸気や満足のいく植物の成長を促進するが、いくつかの欠点がある蛍光ランプで構成されます。最初に、彼らは強度だけでなく、品質 (自身の観察) でスペクトルの出力を変更する時間をかけて年齢します。しかし、光の質の変化が見過ごされるが、まだ重大な影響がある、強度だけが継続的に監視通常です。両方のタイプのランプが熱を生成する第二に、高い光強度自体は植物の成長の深遠な生理学的影響があるし、可能性があります任意の光依存効果をマスクします。第三に、これらの光源のスペクトルの出力はかなり自然な日光7とは異なり、不変です。Led の場合、これらのすべての欠点を克服されている)8,9,10,11。彼らは長い寿命を持つ排出量のほとんどを変更、非常に高い輝度でも排熱を生成しない、彼らは非常に柔軟な彼らのスペクトル出力に関する。
ここで赤、青、白色光の別の LED ライトを備えた気象室を設定し、時間をかけて植物の成長のさまざまなパラメーターに従ってくださいする方法を示します。我々 は、新鮮重, 葉面積, 気孔密度および光合成能力を測定します。同時に、統計的評価を正しく設定の重要性を示す.
植物の成長の学習の最初のステップは、希望の条件によると人工気候室を設定です。それぞれのソフトウェア (図 1 a) のプログラム マスクにすべての変数を入力すると、これは簡単です。この手順では、光や温度を変更することで多くの変更を実装できます。温度・湿度・光の条件 (図 2) 実験を台無しから技術的な失敗を防ぐためには常に監視することを確認します。これは、再現性のある結果を得るための重要なポイントです。この設定は多くの変数を提供しています、柔軟に調整することができますが、制限があります。現在使用可能な LED ライトが 100% 日光を模倣できないし、気候室内気候条件は決して完全に何が起こって外15を反映できます。
広く使われていると比較して蛍光灯 LED ライトより多目的なより少ないエネルギーを必要し、事実上ない放熱を表示します。これらの利点は、気候と Led16温室を装備する屋内農業の大規模な産業を主導しています。巨大な成功を考慮した株式会社は、この分野で報告された、LED 技術は確かに多くのより多くのアプリケーションを見つけます。
表現型を観察すると、特に考慮に入れることが重要です葉面積の測定より古い植物の葉 (図 3) の重複です。したがって、全体のロゼットの写実的な評価は、正確に傾向があります。その場合は、すべての葉を切断し、そこから行くよりはるかに正確です。
進展挙動の評価と異なる条件下での生育特に相違点は、十分なサンプル サイズに依存します。本研究では、少なくとも六つの植物は例えば光合成収率 (図 5) 新鮮な重量 (図 7) の定量に使用され、葉面積 (図 8 a) が 30 の個々 の種はように研究の開始時に植えられました。まず、十分な種子が発芽して、第二に、「典型的な」植物の選択を行うことができます。同じ人口、すなわち正確な同じ条件下で同じトレイに 1 つのポットの植物の中でもさまざまな表現型を示した。これは、もちろん反映されます標準偏差で統計分析中に、(図 8 b) 小さい統計エラーが観察されるとき、データの解釈は一般により信頼できます。
いくつかのパラメーター (図 4図 5) PAM による光合成能力の測定を行うことができます。この場合、フォーカスは、PSII 収量例として Y(II) が非光化学消光など、規制および非規制エネルギー散逸又は光の量子収率も決定することが可能。重要なここで葉葉の表面に均等に配分あたり少なくとも 5 AOIs を選択し、別の植物からの少なくとも六つ葉を測定することです。この方法の欠点は、PSI への影響は検出できません。そのため、別の機器が必要です。
The authors have nothing to disclose.
F. s. は、本研究の部分を介して Rhenac グリーン テック AG からサポートを認めています。J. s. と B.B. は、DFG (SFB TR175) からの資金援助を受けた。
Climatic chamber equipped with LED panels | Rhenac Green Tec AG | These chambers are custom made. | |
Spectrometer | OceanOptics | USB-650 | |
Imaging PAM | Walz | IMAGING-PAM M-Series | There are several suitable models depending on the broader use. |
Microscope+ 40x objective | Leica | DM1000 | Other companies also produce suitable microscopes. |
Software ImageJ | Free download from website | ||
Plant RNA extraction kit | Qiagen | 74903 | |
Bioanalyser | Agilent | G2939BA | Needs an additional computer |