在这里, 我们提出了两个超快的协议, 以重组膜蛋白到融合 proteoliposomes, 并融合这样的 proteoliposomes 与靶脂双层, 以无洗涤剂提供这些膜蛋白到 postfusion 双层。这些方法的结合使复杂的多组分膜系统能够快速、容易地控制装配。
洗涤剂是必不可少的, 以交付膜蛋白成 30-100 nm 小 unilamellar 囊, 而更复杂, 更大的模型脂双层是不相容的洗涤剂。
在这里, 我们描述了一个策略, 绕过这一基本限制使用融合相反带电脂质体轴承膜蛋白的利益。这种囊泡之间的融合发生在低离子强度缓冲器的5分钟以内。正电荷融合脂质体可以作为简单的穿梭载体, 以无洗涤剂的膜蛋白传递到仿生靶脂双层, 这是负电荷。我们还展示了如何用快速的30分钟协议将膜蛋白重组成融合 proteoliposomes。
结合这两种方法, 我们演示了一个电子传输链的快速组装, 由来自大肠杆菌的两个膜蛋白组成, 一个主要的质子泵 bo3氧化酶和 F1Fo ATP 合成酶, 在膜各种大小的水泡, 范围从0.1 到 > 10 微米, 以及 ATP 生产由这个链。
膜蛋白双层人工脂质体的功能化是膜模型系统组装的关键步骤。最简单的模型, proteoliposomes (PL), 包括小 (30-200 毫微米直径) unilamellar 囊 (SUV, 也称为脂质体), 与蛋白质集成到他们的细胞膜。PL 通常在两个步骤1中形成。首先, 预制 SUV 混合了一个膜蛋白的兴趣和洗涤剂的浓度高于其临界胶束浓度 (CMC)。其次, 用各种透析、”生物珠” 或凝胶过滤技术去除洗涤剂, 将蛋白质留在膜中。后者的方法要快得多 (~ 30 分钟1), 因此最好是重构脆弱和敏感的膜蛋白, 而前两种方法受洗涤剂去除速度的限制, 这需要很多小时, 并可能导致大量的活动损失和蛋白质结构完整性的丧失。这种方法更大的囊泡 (大的 unilamellar 泡, 爱, 高达1µm 直径), 这是更具挑战性的, 因为囊泡大小得到减少后洗涤剂去除, 这是不可能的巨大的 unilamellar 泡 (老大, > 1 µm), 因为他们是不稳定的洗涤剂 (但见约翰逊et 等。2用于大双层中膜蛋白的慢2维结晶。可供选择的方法为老爹膜功能化3,4,5存在, 但是费力的, 耗时, 仍然需要一些洗涤剂在浓度低于 CMC。更复杂或脆弱的脂质模型 (例如, 液滴水凝胶双层6和3D 可打印的液滴界面双层人工组织7) 不能容忍洗涤剂。快速新兴的合成生物学应用8,9,10关键取决于这种复杂的膜结构的功能化。因此, 在这一领域中, 有一种简便、稳健的方法, 允许快速、温和地将膜蛋白输送到目标脆弱的双层中。
一种替代的无洗涤剂蛋白传递方法是囊泡融合, 其中相互作用的泡膜结合成完整的 postfusion 双层, 而它们的 intravesicular 水含量得到混合, 而不被释放到外部环境。囊泡融合是启用和驱动的构象重排在互补融合剂 (某些蛋白质11,12和肽13或特别修改的 DNA14) 位于接触双层, 或库仑的脂双层之间的相互作用形成的互补性带电阳离子和阴离子脂15,16, 或阳离子双层和负电荷蛋白17。
前一种方法要求在融合之前, 在相互作用的膜中存在融合剂, 相对较慢 (30 分钟到达核聚变的一半最大值12,18), 但可以应用于自然和人工膜。
使用融合脂 (图 1) 的方法的优点是它能够更快地实现膜融合 (~ 1 分钟达到半最大, 5-10 分钟完成反应)。另外, 融合的程度可以由 i 控制) 容易地公式化融合双层和 ii) 的带电油脂的相对含量, 并且, 一般, 反应媒介的渗透强度 (盐在50毫米以上, 并且, 例如, 蔗糖15显示为停止融合), 或两者的组合。为启动融合, 相反带电的融合泡混合在一个低 (典型的10-20 毫米盐) 离子强度培养基为5-10 分钟。该方法的相对缺点是阳离子脂在融合前对阳离子 proteoliposomes 中膜蛋白的功能产生负面影响, 特别是在低离子强度下, 但这种效应是可逆的, 通过自然后融合膜的脂质组成及其对正常离子强度介质的回归。
以下几个问题需要考虑到这一实验方法的成功:
proteoliposomes 和目标双层的脂质电荷的选择:阳离子脂在自然界中是找不到的, 而在生物膜中, 阴离子的脂质丰富, 例如, 25、35和20% 在大肠杆菌的内膜中, 酵母的细胞膜为酵母菌和内线粒体膜许多种, 分别为27、28、29。预计在 PL+中膜蛋白的功能可能受到双层的正电荷强度的影响, 这反过来又取决于双层和外离子中阳离子脂的相对含量。强度。因此, 重要的是要解决的问题, 在何种程度上的功能, 膜蛋白的兴趣将取决于对阳离子脂环境的电荷。在这里, 我们表明, f1fo ATP 合酶和 bo3氧化酶对阳离子脂质环境敏感, 但我们通过先将蛋白放入 PL+并将其传递到阴离子接受双层, 然后在聚变完成后增加反应介质的离子强度。
特定阳离子脂的选择:大多数商业可用的阳离子脂是非 triacylglyceride 性质;因此, 必须对潜在的候选脂质进行测试, 以便与感兴趣的膜蛋白相容。我们以前发现, 在本研究中使用的 ATP 合成酶在15型乙基 PC 形成的 PL+中表现出最佳性能, 而在 DOTAP (非 triacylglyceride脂质)+这种蛋白活性较低。
囊泡融合化验:真正的囊泡融合 (当 intravesicular 液含量混合) 需要区分从中间半融合状态, 当水泡互相坚持不混合他们的水含量, 但容易地混合他们的外在或两个油脂的内容传单30。如果在不理想的脂质混合物或某些条件下, 囊泡也表现出明显的液体含量泄漏在融合31。融合混合物中带电脂的最小浓度使得真正的融合需要在实验中找到每个脂类, 但总的来说, 发现小于10% 的带电脂的膜呈现非融合32。
当形成融合 SUV 在存在多价离子的情况下, 重要的是不要混合相反的带电成分, 因为这可能会导致立即结块和聚集的脂由这些离子。例如, 在准备 SUV 的钴 calcein edta 方法, 重要的是要避免混合阳离子脂混合物与 edta, 以防止堵塞的聚碳酸酯过滤器的集群成分。
同样重要的是, calcein-EDTA 法, 虽然是非常敏感和方便的实时融合监测, 可能仍然低估了融合的程度, 由于 1) 自由 calcein 荧光自淬火内postfusion 泡, 预计达到1毫米, 而自我淬火阈值报告约20µM33和 2) 表面绑定钴 calcein, 这仍然绑定到 SUV+ , 即使经过凝胶过滤树脂和颜色泡到明亮的橙色, 而 SUV0有一个淡橙色的颜色。还要注意的是, 释放的束缚钴 calcein 后添加洗涤剂海卫 X-100 的存在, EDTA 产生更强的信号, suv+ (图 3C, 红色跟踪) 比 suv0 (灰色跟踪)。
透视: 我们期望这里描述的快速方法可以极大地促进和加快复杂膜的组装, 以满足新兴合成生物学应用的需要。我们的膜蛋白重组协议只需要半小时的时间来重组脆弱的大膜蛋白, 因为这些蛋白质对长透析基础的重建技术敏感, 而这种融合方法只需要 5-10 分钟的时间来提供这种蛋白质变成大的脂质双层。在这里, 我们通过对大肠杆菌f1fo ATP 合成酶的操作来演示这些方法的优点, 这是一种脆弱蛋白质的例子。它是由23个亚基组成的, 如果暴露于次优条件 (例如, 热) 在增溶过程中, 但在这些过程中使用, 这种蛋白质表明重现性在质子泵浦中的高活性, 它就容易失去其完整性。
The authors have nothing to disclose.
作者感谢伊利诺伊大学的罗伯特 Gennis 和伯尔尼大学的克里斯托弗冯 Ballmoos 提供质粒和应变来表达 bo3氧化酶。该项目由 BBSRC 赠款 BB/L01985X/1 支持罗德岛和右岸导流洞
DOPC neutral lipid | Avanti Lipids | 850375 | |
POPA anionic lipid | Avanti Lipids | 840857 | |
E-PC cationic lipid | Avanti Lipids | 890704 | |
Cholesteryl-Bodipy-FL12 | Thermofisher | C3927MP | |
Sephadex G-50, Super Fine | Sigma | G5050 | |
Ficoll 400, Type 400-DL | Sigma | F8016 | |
ACMA | Sigma | A5806 | |
Nigericin | Sigma | N7143 | |
ATP | Sigma | A26209 | |
Q1 | Sigma | C7956 | |
DTT | Sigma | D0632 | |
PEP | Sigma | 860077 | |
NADH | Sigma | N8129 | |
PK | Sigma | P9136-1KU | |
LDH | Sigma | L1254-1KU | |
Luciferin | Sigma | L6882 | |
Luciferase | Sigma/Roche | 10411523001 | |
Calcein | Insight Biotechnology | sc-202090 | |
CoCl2 | Sigma | C8661 | |
EDTA | Sigma | E6758 | |
Sulforhodamine 101 | Sigma | S7635 | |
Extrusion system | Avanti Extruder | ||
Single tube luminometer, model Sirius L | Titertek Berthold | ||
Polycarbonate filter, D19 mm | Sigma, Whatman NucleporeTrack-Etched Membranes | WHA800309, WHA800284 | 100 or 200 nm to form SUV, and 400 or 800 nm for LUV |
Buffers used in the paper | Composition | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Buffer A | 100 mM KCl, 50 mM MOPS pH 7.4, 1 mM MgCl2 | ||
Buffer B | 20 mM KCl, 10 mM MOPS pH 7.4, 0.1 mM MgCl2 | ||
Buffer C | 100 mM KCl, 10 mM MOPS pH 7.4 | ||
Buffer D | 1 mM MOPS pH 7.4 Various concentrations of KCl |