Riprogrammazione neuronale diretto genera neuroni che mantengono l’età della cellula somatica partenza. Qui, descriviamo un metodo basato su vettori per generare neuroni indotti dai fibroblasti cutanei ottenuti da donatori umani adulti.
Neuroni indotti (iNs), il prodotto delle cellule somatiche direttamente convertito in neuroni, sono un modo per ottenere neuroni paziente-derivato dal tessuto che è facilmente accessibile. Attraverso questo percorso, neuroni maturi possono essere ottenuti nel giro di poche settimane. Qui, descriviamo un protocollo semplice e rapida One-Step per ottenere iNs da fibroblasti cutanei ottenuti attraverso campioni di biopsia da donatori umani adulti. Spieghiamo ogni fase del processo, compreso il mantenimento dei fibroblasti cutanei, le modalità di congelamento per costruire un magazzino della linea cellulare, semina di cellule per la riprogrammazione, nonché le condizioni di cultura durante il processo di conversione. In più, descriviamo la preparazione dei vetrini coprioggetti per registrazioni elettrofisiologiche, condizioni a lungo termine del rivestimento e delle cellule attivate la fluorescenza che ordinano (FACS). Illustriamo anche esempi dei risultati da aspettarselo. Il protocollo descritto qui è facile da eseguire e possono essere applicata all’essere umano fibroblasti derivati dalle biopsie di pelle umana da pazienti con varie diagnosi diverse e di età. Questo protocollo genera una quantità sufficiente di iNs che può essere utilizzato per una vasta gamma di applicazioni biomediche, tra cui malattia di modellazione, lo screening di stupefacenti e convalida di destinazione.
Sviluppo di trattamenti efficaci per i disturbi neurologici sono stati ostacolati dall’accesso limitato alle cellule di cervello umano vivente per eseguire studi meccanicistici e saggi funzionali. Circa un decennio fa, questa situazione è cambiata radicalmente con lo sviluppo di pluripotenti indotte (iPSCs) sulle cellule staminali tecnologia1,2. Questo, combinato con una migliore comprensione dei meccanismi di differenziazione neurale che si verificano durante il normale sviluppo umano, ha permesso per la generazione di definiti e diversi sottotipi neuronali da materiale specifico paziente e malattia. Con tale materiale, è ora possibile studiare meccanismi intracellulari malattie neurologiche e il potenziale di diversi composti per alleviare quelle caratteristiche patologiche3.
Mentre iPSCs sono stati rivoluzionario nel campo delle neuroscienze, uno svantaggio principale di queste cellule è che loro firma di invecchiamento è cancellato durante il processo di riprogrammazione in modo tale che il neurone ringiovanito non mantiene la vulnerabilità associata invecchiamento4,5,6. Questa particolare caratteristica dei neuroni che sono prodotte può finire per essere critico per ricapitolare molti aspetti della cascata patogeno intracellulare, particolarmente nel caso di malattie per le quali la vecchiaia è un importante fattore di rischio.
Diretta riprogrammazione neurale è una tecnologia in cui una cellula somatica viene convertita direttamente in una a senza passare attraverso un pluripotenti intermedio della fase. Questo consente per la generazione rapida di neuroni umani in vitro che può essere sia paziente e malattia specifica. Una caratteristica notevole di riprogrammazione diretta è che l’età d’inizio della cellula donatrice viene mantenuta, e con questo, sua vulnerabilità ai processi di invecchiamento come aumento della produzione di stress ossidativo4,7. Di conseguenza, iNs da pazienti con malattie neurologiche associate con l’invecchiamento, come il morbo di Alzheimer e morbo di Parkinson, sono adatti per un’ampia gamma di applicazioni biomediche, compreso la malattia di modellazione, analisi e studi tossicologici di screening di stupefacenti .
L’avvertenza principale che ha impedito l’iNs di pazienti con patologie neurodegenerative essendo ampiamente usati è che essi non sono facili da riprogrammare, e questo diventa ancora più difficile con l’espansione dei fibroblasti. Di conseguenza, la generazione di cellule in quantità necessaria per questi tipi di applicazioni non è stato raggiunto fino al recente8. Ora abbiamo sviluppato un metodo semplice per riprogrammare i fibroblasti da donatori di tutte le età in un modo molto efficiente. Questo metodo combina l’espressione forzata dei fattori di trascrizione di un neurone Ascl1 e Brn2 con un atterramento del proteina RE1-silenziamento repressore (resto) utilizzando un singolo vettore. Qui, descriviamo le diverse fasi che portano alla generazione di iNs convertito da fibroblasti della pelle biopsiati da donatori anziani.
Questo vettore di one-step/one riprogrammazione metodo fornisce un modo efficace per ottenere iNs da fibroblasti umani adulti. Fibroblasti umani adulti sono normalmente molto più difficili a covert di fibroblasti fetali, con limitati studi precedentemente reporting efficienze di circa 5-10%12,13. Tuttavia, con questo nuovo protocollo è possibile raggiungere una resa di un neurone (misurata come cellule MAP2 +) di circa 50%8. Inoltre, il nostro protocollo può essere utilizzato sui fibroblasti cutanei che sono stato attraversati più volte senza perdere in efficienza di conversione. Finora abbiamo usato le cellule attraversate fino a 14 volte senza rilevare alcuna diminuzione nell’efficienza di conversione. Inoltre, non esiste alcuna differenza nella riprogrammazione efficienza nelle nostre mani con i fibroblasti da donatori di età compresa tra 52 e 87. Per maggiori dettagli sull’età e la malattia di altre linee cellulari testati con questo costrutto Vedi riferimento8. Altri studi non hanno anche riferito alcuna differenza di efficienza di conversione utilizzando un protocollo basato su vettori lentivirali e piccolo molecola-enhanced con donatori tra 0 e 89 anni4. Inoltre, applicabilità coerente con riprogrammazione neuronale basato su miRNA è stata segnalata nei fibroblasti di tutte le età, con donatori tra 0 e7di 86 anni. Attraverso questo percorso, neuroni maturi possono essere ottenuti in circa 12 – 15 settimane in vitro o circa 8 settimane dopo trapianto in vivo8. Questo è vantaggioso perché dà accesso sia la malattia che il paziente in specifici umana dal tessuto che è facilmente accessibile. Anche se questo protocollo è efficiente, non produrrà un rendimento di un neurone di 100%, e come tale è necessaria una fase di purificazione mediante FACS per esempio.
Il punto più critico all’interno di questo protocollo è trasduzione virale (protocollo sezione 4). È fondamentale che il titolo del virus è preciso, oltre ad aver placcato un numero preciso di aHDFs per la conversione. Il titolo consigliato per l’uso con questo protocollo è tra 4 x 108 e 4 x 109. Utilizzando un titolo di nulla di sotto di 1 x 108 non sarebbe consigliabile come l’aggiunta di grandi volumi di virus sarà tossici per le cellule. Inoltre, come i fibroblasti cominciano a covert a iNs diventeranno più fragile e suscettibile di sollevamento. È essenziale essere gentile quando si modificano i media per non disturbare troppo le celle. Questo può essere fatto rimuovendo il liquido lentamente con una pipetta di 1.000 µ l. Infine, quando placcatura per riprogrammazione (protocollo sezione 3) è importante garantire una popolazione sana del fibroblasto prima di iniziare un esperimento; Questo è indicato da una vitalità cellulare di superiore al 90% con la macchiatura blu di trypan. Il aHDFs dovrebbe sempre essere attraversate prima di raggiungere confluency di 95%.
Se c’è la morte delle cellule evidente prima di trasduzione virale, non iniziare la conversione: doppio controllo che l’attuabilità delle cellule è superiore al 90% e che ci sono stati problemi con il rivestimento della piastra. Si prevede di avere una piccola quantità di morte delle cellule dopo la trasduzione virale, tuttavia, questo non dovrebbe essere significativo. In questo caso, confermare la semina precisa di 50.000 aHDFs/pozzetto e controllare il titolo del virus. Se c’è evidente incoerenza tra pozzi durante la conversione, in primo luogo verificare che ogni pozzo contiene una quantità uguale di media e palesi evaporazione non è in corso presso i bordi (se necessari supporti supplementari possono essere aggiunti ai pozzetti bordo). In alternativa, controllare passo 4.4 e garantire la miscelazione appropriato per una sospensione omogenea quando trasducendo. È fondamentale aggiungere il lentivirus al medium in primo luogo, prima di aggiungere questo nei pozzetti. Aggiunta diretta di lentivirus nei pozzetti aumenterà la variabilità di un pozzetto a altro e rischia anche di essere tossico per le cellule. Infine, controllare sempre che il mezzo è riscaldato a 37 ° C prima dell’aggiunta alle cellule.
Questo protocollo comprende le sezioni facoltative per condizioni di rivestimento per lungo termine cultura di iNs e FACS ordinamento per aumentare la purezza di un neurone. Per gli esperimenti che desiderano approfondire la caratterizzazione funzionale di iNs, un protocollo per la preparazione dei vetrini coprioggetti per elettrofisiologia è stato anche incluso. Il protocollo di conversione qui è impostato per l’utilizzo con una piastra a 24 pozzetti; Se lo si desidera può essere modificato a 6, 12, 48-, piastra a 96 pozzetti o boccette. In questo caso, si prega di regolare tutti i volumi per l’area della superficie della piastra o pallone utilizzato.
Questo protocollo utilizza l’espressione forzata di Ascl1 e Brn2 in combinazione con un atterramento di resto tutti confezionati in un singolo vettore8 per generare aggiuntivi di un fenotipo pan-neuronale. La generazione di eventuali sottotipi gliali con questo metodo, tuttavia, non è stata valutata. Questo metodo così avrebbe bisogno di essere modificati per l’utilizzo con altri fattori di riprogrammazione per ottenere sottotipo neuroni specifici. Riprogrammazione diretta precedentemente ha indicato la possibilità di generare motoneuroni, neuroni sensoriali, fotorecettori, neuroni medi spinosi striatali e neuroni dopaminergici10,14. Questo sarà utile quando studia le malattie neurologiche in quale specifico sottotipo di un neurone sono preferenzialmente colpite, per esempio la malattia del Parkinson e neuroni dopaminergici.
Fino a poco tempo fa, tecnologia di riprogrammazione neurale diretta non ha permesso per la produzione di iNs in modo standardizzato ed efficiente — ad un livello che è necessario per tossicologia e saggi su larga scala di screening di stupefacenti. Questo nuovo metodo è molto efficiente e può essere utilizzato sui fibroblasti che sono state attraversate molte volte, tale che ora rimuove tali restrizioni e si apre per una vasta gamma di studi, non solo in un sistema neurale umano, ma anche in un sistema che può essere paziente specifico. La semplicità di questo approccio rende accessibile per eventuali gruppi che vogliono eseguire studi simili in-House iN tecnologia e può essere facilmente utilizzata non solo per applicazioni biomediche su larga scala, come lo screening di stupefacenti e le analisi di tossicologia, ma anche per sostenere dati derivati da modelli animali e campioni di tessuto umano post-mortem .
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo Marie Persson Vejgården per l’assistenza tecnica. La ricerca che porta a questi risultati ha ricevuto finanziamenti dalla Fondazione cellule staminali New York, il Consiglio europeo della ricerca nell’ambito del settimo programma quadro dell’Unione europea: FP/2007-2013 Neuro cellule staminali riparazione (No. 602278) e la convenzione di sovvenzione CER no. 30971, Consiglio di ricerca svedese (di sovvenzione 521-2012-5624, 2016-00873 e 70862601 / Bagadilico), Fondazione Parkinson svedese (Parkinsonfonden) e l’Area di ricerca strategica presso Lund University Multipark (ricerca multidisciplinare in Morbo di Parkinson). Janelle Drouin-Ouellet è supportato da una borsa di studio di istituti canadesi di ricerca di salute (CIHR) (#358492) e Roger Barker è supportata da una sovvenzione di NIHR Biomedical Research Centre per l’Università di Cambridge/Addenbrooke Hospital. Malin Parmar è un investigatore di Robertson Foundation di New York sulle cellule staminali. Shelby Shrigley è finanziato dal programma di Unione europea orizzonte 2020 (H2020-MSCA-ITN-2015) sotto la rete di formazione innovativo di Marie Skłodowska-Curie e Grant contratto n. 676408.
Cell Lines | |||
Adult human dermal fibroblasts | [C2 passage #7] Donor was a 67 year old male. Cells obtained from the Parkinson’s Disease Research and Huntington’s disease clinics at the John van Geest Centre for Brain Repair (Cambridge, UK). | ||
Reagents for Fibroblast Culture, Transduction and Conversion | |||
Dulbecco's phosphate-buffered saline (DPBS) [-CaCl2, -MgCl2] | Gibco | 14190094 | |
Trypsin-EDTA [0.5%] | Gibco | 15400-054 | Dilute to 0.05% in DPBS. |
Virkon (agent used to neutralize virus) | Viroderm | 7511 | Dilute to 1% solution with warm water. |
Milli-Q Water | Millipore | ||
Basal medium – Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) + GlutaMax | Gibco | 61965059 | |
Penicillin/Streptomycin [10,000 U/mL] | Gibco | 15140-122 | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Gibco | 10270-106 | |
CryoMACS® dimethyl sulfoxide (DMSO) 10 | Miltenyi | 170-076-303 | |
Neural differentiation medium – NDiff 227 | Takara-Clontech | Y40002 | |
LM-22A4 | Tocris | 4607 | Dilute 10 mg in 1450 µL DMSO. Stock concentration: 20 mM. |
Glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF) [recombinant human] | R&D systems | 212-GD-010 | Dilute 10 ug in 500 µL 0,1% BSA in DPBS. Stock concentration: 20 µg/mL. |
NT3 [recombinant human] | R&D systems | 267-N3-025 | Dilute 25 µg in 2,5 mL 0,1% BSA in DPBS. Stock concentration: 10 µg/mL. |
db-cAMP | Sigma Aldrich | D0627 | Dilute 1 g in 40,7 mL Milli-Q water. Filter and make 500 µL aliquots or stock tubes of 10 mL. Stock concentration: 50 mM. |
CHIR99021 | Axon | 1386 | Dilute 2 µg in 429,8 µL DMSO. Stock concentration: 10 mM. |
SB-431542 | Axon | 1661 | Dilute 5 mg in 595 µL DMSO. Stock concentration: 20 mM. |
Noggin [recombinant human] | Miltenyi | 130-103-456 | Dilute 100 µg in 100 µL of Milli-Q water + 900 µL 0,1% BSA in DPBS. Stock concentration: 100 µg/mL. |
LDN-193189 | Axon | 1509 | Dilute 2 mg in 360 µL DMSO. Stock concentration: 10 mM. |
Valproic acid sodium salt (VPA) | Merck Millipore | 676380 | Dilute 5 g in Milli-Q water to acheive a stock concentration of 1 M. CAUTION: Avoid ingestion, contact with skin, and breathing dust formation. |
Reagents for Coatings | |||
Gelatin | Sigma Aldrich | G2500 | Dilute to 0.1% in Milli-Q water. |
Poly-L-ornithine | Sigma Aldrich | P3655 | Dissolve in Milli-Q water. Use at 15µg/mL. |
Fibronectin | ThermoFisher Scientific | 33010-018 | 2 mL of Milli-Q water + 70 µL 0,25 M NaOH. Use at 5 µg/mL. |
Laminin | ThermoFisher Scientific | 23017-015 | Store at -80°C. Thaw on ice, keep cool and aliquot 30 µL. Use at 5 µg/mL. |
Reagents for Fluorescence Activated Cell Sorting | |||
Cell dissociation agent – Accutase (Stem Pro) | ThermoFisher Scientific | A1110501 | |
Hanks' Balanced Salt Solution (HBSS) 1X [-calcium, -magnesium, – phenol red] | ThermoFisher Scientific | 14175-046 | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma Aldrich | A2153 | Use at 1% concentration for Anti-Human CD56 (NCAM). |
DNAase | Sigma Aldrich | DN-25 | Use at 0.05% concentration. |
Anti-Human CD56 (NCAM) Antibody [Mouse] | BD Pharmingen | 555518 | Use at 1 : 50. |
Propidium iodide | Sigma Aldrich | P4170 | Dilute to 1mg/mL in PBS and keep sterile. Use at 1:1000 to achieve a concentration of 10µg/mL. |
Reagents for Glass Coverslips | |||
Autoclaved deionized water | |||
Alconox detergent | Sigma Aldrich | Z273228 | |
Ethanol 95% | |||
Nitric Acid | Sigma Aldrich | 438073-M | CAUTION: Concentrated nitric acid is highly corrosive, and its vapours are potentially harmful. |
Concentrated hydrochloric acid (HCI) | CAUTION: Concentrated hydrochloric acid is highly corrosive, and its vapours are potentially harmful. | ||
Reagents for Immunocytochemistry | |||
Paraformaldehyde (PFA) | Merck Millipore | 1040051000 | Use at a concentration of 4%. CAUTION: PFA is a potent fixative. Avoid ingestion and contact with skin |
Triton X-100 | Fisher Scientific | 10254640 | Use at a concentration of 0.1%. |
Serum [Donkey] | Merck Millipore | S30-100ML | |
Anti-MAP2 Antibody [Chicken] | Abcam | ab5392 | Use at a concentration of 1 : 5,000. |
Tau HT7 Monoclonal Antibody [Mouse] | ThermoFisher Scientific | MN1000 | Use at a concentration of 1 : 500. |
Cy3 Anti-Chicken Antibody [Donkey] | Jackson ImmunoResearch | 703-165-155 | Use at a concentration of 1 : 400. |
Alexa Fluor488 Anti-Mouse Antibody [Donkey] | Jackson ImmunoResearch | 715-545-150 | Use at a concentration of 1 : 400. |
4′,6-Diamidine-2′-phenylindole dihydrochloride (DAPI) | Sigma Aldrich | D9542 | Reconstitute the powder in Milli-Q water to 1 mg/mL. Aliquot and store at -20°C, light sensitive. Use at a concentration of 1 : 500. |
Equipment | |||
T75 flask [Nunclon Delta Surface] | ThermoFisher Scientific | 156499 | |
24-well plate [Nunc] | ThermoFisher Scientific | 142485 | |
1.5 mL polypropylene tube | Sigma Aldrich | Z336769 | |
15 mL falcon tube | Sarstedt | 62.554.502 | |
50 mL falcon tube | Sarstedt | 62.547.254 | |
CryoPure tube 1.6 mL | Sarstedt | 72.380 | |
Pippette controller | For pipetting volumes 1-25 mL. | ||
Sterile serological pipettes: 5, 10 and 25 mL | Sarstedt | 86.1253.001, 86.1254.001, 86.1685.001 | |
Adjustable volume pipettors: 5, 20, 200, and 1,000 µL | |||
Sterile pipette tips | For pipetting volumes of 0.5 – 1,000 µL. | ||
Glass coverslips | NeuVitro | GG-12-1.5-oz | #1.5 thickness, 12mm diameter, 0.5oz, CE certified, fit 24 well plates. |
Glass dish | Approximately 150mm diameter. | ||
Glass beaker | Make sure to have an appropriate size beaker for the sonicator bath available. Water from the sonicator bath should not overflow into the glass beaker. | ||
Parafilm M | VWR | ||
ThawSTAR Automated Cell Thawing System | BioCision | BCS-601 | |
Countess II Automated Cell Counter | ThermoFisher Scientific | AMQAX1000 | |
Cell counting chambers [50 slides] and trypan blue [0.4%] | ThermoFisher Scientific | C10228 | For use with Countess II Automated Cell Counter. |
CoolCell Cell LX Controlled-rate Freezing Container | Biocision | BCS-405 | |
Laminar flow hood | |||
Humidified 5% CO2 37 °C incubator | |||
Centrifuge | Suitable for 1,5, 15 and 50 mL tubes. | ||
Orbital shaker | |||
Sonicator – Bransonic Model B200 cleaner | Sigma Aldrich | Z305359 | Frequency = 50-60Hz, Amplitude = 30 Watts |
FACS Aria III cell sorter | BD Pharmingen | ||
Phase contrast microscope | Olympus | CKX31 | |
Inverted fluorescence microscope | Leica | DMI6000 B |