כתב יד זה מתאר את השימוש בטכניקות קליטה באף ובסימפונות, ובמיוחד באמצעות מטריצות ספיגת ידע סינתטי (SAM) לדגימת הנוזל שורות mucosal (MLF) של דרכי הנשימה העליונים והתחתונים. שיטות אלה מספקים יותר סטנדרטיזציה והסבילות מאשר קיימות טכניקות הנשימה הדגימה.
השיטות של קליטה באף (NA) וספיגה הסימפונות (BA) להשתמש מטריצות ספיגת ידע סינתטי (SAM) כדי לספוג את הנוזלים שורות mucosal (MLF) במערכת הנשימה האנושית. נה היא שיטה לא פולשנית אשר סופג נוזלים turbinate נחותים, גורמת אי נוחות מינימלית. נה הניב תוצאות לשחזור עם היכולת לחזור לעתים קרובות על דגימה של דרכי הנשימה העליונות.
לשם השוואה, שיטות אלטרנטיביות של דגימת רירית מערכת הנשימה, כגון שאיפה האף והלוע (NPA) מקימה קונבנציונאלי, פולשניים יותר, עלולה לגרום השתנות הנתונים גדול. שיטות אחרות יש מגבלות למשל, ביופסיות ונהלים הסמפונות הינם פולשניים, sputum מכיל הרבה מתו ולא למות תאים, דורש ניזול, והבל הפה מעובה (EBC) מכיל מים ורוק, שטיפה הדגימות שתדללו ו משתנה.
BA יכולה להתבצע דרך ערוץ עבודה של ברונכוסקופ. במרפאה. הדגימה היא נסבלת היטב, יכול להתבצע באתרים מרובים ב- דרכי הנשימה. BA תוצאות דגימות MLF להיות שתדללו פחות מאשר bronchoalveolar שטיפה (BAL) דגימות.
מאמר זה מדגים את הטכניקות של נה ו BA, כמו גם העיבוד מעבדה של הדגימות וכתוצאה מכך, אשר ניתן להתאים את סמן במורד הזרם הרצוי הנמדדים. טכניקות אלה הקליטה אלטרנטיבות שימושי של טכניקות דגימה קונבנציונאלי השתמשו במחקר קליני בדרכי הנשימה.
רוב מחלות נשימה לגרום לתגובה דלקתית, ויש צורך דחוף דגימה מן השטח הרירית בדרכי הנשימה, קדחת השחת, זיהומים נגיפיים ופטריות, שחפת, אסתמה, מחלת ריאות חסימתית כרונית, ריאות פיברוזיס של הריאות סרטן 1. האף והלוע וביופסיה (NPA), שטיפה של חלל האף bronchoalveolar שטיפה (BAL) הן טכניקות נפוצות עבור הדגימה את דרכי הנשימה העליונים והתחתונים. עם זאת, שיטות אלה להציג בעיות ניכר כולל סבילות המסכן, דילול של מתווכים דלקתיים, וחוסר היכולת לחזור לעתים קרובות דגימה2. חלופה אחת במתכונתם הדגימה הוא השימוש של דגימות, או התקבצו ניילון, כותנה, או משי מלאכותי3,4, אבל אלה גם יש מגבלות, בגלל שהיא גורמת אי נוחות ונזק האפיתל האף, ועל כמה מקרים איגוד בלתי הפיך של מתווכים דלקתיים5. שיטות אלה לא יכולה בדרך כלל להיות חוזרות ונשנות באופן סדרתי יותר משעה, טכניקות חלופיות עשויה להיות יעילה יותר לגילוי של שפע נמוך ציטוקינים ו נוגדנים5,6. בנוסף, מידת ההשתנות המשתמש המשויך טכניקות אלה עשויה ליצור חוסר עקביות בנתונים, וכתוצאה מכך הדרישה של גדודים המטופל גדול יותר.
לחלופין, באמצעות ספוגים טבעיים וסינתטיים טכניקות קליטה שימשו כדי לאסוף MLF משטחים הרירית. ספוגים אופטלמולוגיות המורכב תאית טבעיים (למשל, שיודע-cel) שימשו דגימת רוק, צוואר הרחם, והפרשות הנרתיק7. בנוסף, ספוגים סינתטי זני אלכוהול (PVA), דבק פלסטי hydroxylated (HPVA) היה מנוצל8. שבעה חומרים ספיגת ידע שונים מושווים עבור דגימה נוזלים דרך הפה לפני מדידת נוגדנים9, בעוד מיני פוליאוריתן-ספוגים שימשו כדי לאסוף דמעות אדם10.
נייר סינון המורכב תאית טבעיים מצמח הכותנה כבר בשימוש נרחב כדי לספוג את הפרשות האף מאז הנייר חלוצית עלאם ועמיתיו בשנת 199211,12,13,14, 15,16,17. נייר סינון דיסקים הופקו מ מסנן קלפים (למשל Shandon), היה להיות מנוצל כדי למדוד histamines ו ציטוקינים לאחר מבוקר. האתגרים אלרגן האף, עם אלרגן טבעי חשיפה18,19 20, ,21. עם זאת, קבוצות שונות של נייר סינון להשתנות ב מידת חלבון מחייב ולהיכשל קצת לשחרר ציטוקינים. שיטות שימוש במטריצה ספיגת ידע סינתטי (SAM) ולכן היה מפותח2,22,23. סאמס עכשיו משמשים בדרך כלל כדי לקבל MLF האף על ידי הערך לא ישים סופג חומרים אלה הינם נוחים כדי להשתמש, יכול לקבל MLF אפילו מן האף דלקתי במרווחים תכופים במשך פרקי זמן ארוכים.
קליטה באף היא צורה של דיוק הרירית דגימה באמצעות סאם הדוגמאות של MLF, דרכי הנשימה העליונות. נה מכשירים מיוצרים כמו המסומן CE מכשירים רפואיים מחומרים סיווג רפואי באמצעות חדרים נקיים וחופשיים של אבק, אלרגנים. הדוגם נה מורכבת של ידית וסאם cryotube סטרילי. סאם מורכב פולימרים, בדרך כלל סיבים, אבל זה זמין גם כמו קצף, אלה נבחרו כדי להיות רך ספיגת ידע, עם הפתילה מהירה לאיסוף הדגימה. סאמס יש חלבון מינימלי מחייב לאפשר את • תנאי יעיל של הפרשות נספג. נה היא טכניקה מאוד עדין, לא פולשנית, שניתן לבצע לתורמים בכל הגילאים. בנוסף, דגימה טורי, אפילו כל כמה דקות, אפשרי. נה אומתה נגד קיימות דרכי הנשימה העליונות דגימה טכניקות5 , דגימה חוזרות אפשרה הדור של נתונים קינטי. האתגר של דרכי הנשימה עם אלרגן23,24,25, אנדוטוקסין חיידקי26 ונגיפית מסוג TLR אגוניסטים (Jha, א. et al., כתב היד בהכנה). נה שימש גם אצל תינוקות כדי לחקור את ההיסטוריה הטבעית של אטופיה27,28,29 , נגיפי דלקת סימפונונות30.
Bronchoscopic microsampling (BMS) היא הליך עבור אוסף של MLF בנתיב האוויר התחתון אשר פותחה על ידי אולימפוס31,32,33. למרבה הצער, מערכת זו BMS מוענק רק ביפן. אולימפוס לספק שתי מערכות BMS: בדיקה אחת סיבי פוליאסטר hydroxylated (FHPE)34,35,36,37ולאחר בדיקה אחת עם כותנה33,38, 39 , 40 , 41 , 42 , 43. להיות אבן נגף הגדולות כבר כי החללית BMS להשתמש בחולים עם אסטמה גרמה קשר הרירית מדמם, עם חצי של כל הדגימות מזוהם עם דם. המחברים הסיקו כי לא היה ריאלי מדגם MLF באמצעות מערכת זו עב מ מ איירווייז היקפיים חולי אסטמה43.
כחלופה, פיתחנו BA באמצעות סאם רך יכול להתבצע במהלך חקירת bronchoscopic של דרכי הנשימה התחתונה, לרבות בעקבות זיהום ניסיוני של אסתמה נושאים עם ריינו-וירוס6. המכשיר הבא מורכב: קטטר חלול חיצוני של היד-עבודה על ההפעלה extrudes של סאם, חוט מרכזי מדריך פלסטיק שיש לו את סם על סופו. באשר NA, BA ערכות מיוצרים מחומרים סיווג רפואי באמצעות חדרים נקיים וחופשיים של אבק, אלרגנים. בנוסף, המכשירים הם CE המסומנים ומסופקים מוקרן-גמא. רצועת סאם היא רכה, ספיגת ידע, ויש הפתילה מהירה לאיסוף הדגימה. יש גם חלבון מינימלי מחייב לאפשר את • תנאי יעיל של הפרשות נספג. המכשיר יכול להתאים דרך ערוץ עבודה של ברונכוסקופ יכול לשמש כדי במהירות, במדויק לטעום MLF באתרים ספציפיים של עניין בתוך האוויר. בניגוד BAL או BMS, BA לא לגרום דימום במגע או אי נוחות החולה נוספים post-procedure.
יש לתת שיקול דעת זהיר העיבוד של דגימות נה ו- BA. דוגמאות ניתן ישירות קפוא, לעבד בקבוצות, או יכול להיות מעובד באופן מיידי. הסוג של עיבוד התפורות לכיוון יישומים מסוימים במורד הזרם, כולל immunoassays של ציטוקינים, נוגדנים, immunoglobulins או elutions של ויראלי, חיידקי, ומקושרת התא המארח RNA. אנו מציגים אוסף קליניים ומעבדתיים טכניקות עיבוד המשויך נה ו BA כמדריך עבור חוקרים קליניים.
תוצאות קיימות שיטות הדגימה דרכי הנשימה נחשבים משתנה מאוד; שיטות דגימה חלופית יש צורך לתקנן מחקר בתוך השדה הזה5. נה ו BA היתר דגימה של MLF בצורה לא פולשנית, ויש פוטנציאל מרגש למדוד את תגובות מערכת החיסון דרכי הנשימה בריאים וחולים. טכניקות אלה מציעים יתרונות פוטנציאליים רבים טכניקות הקיימים, כולל וסבילות רבה יותר, מהירות הדיגום, היכולת לחזור לעתים קרובות על הדגימה, להוריד את הבין-המשתמש השתנות, וירידה דילול של מתווכים חיסוניים5 . משך הספיגה ואת טכניקת עיבוד בשימוש צריך להיות אופטימיזציה עבור כל מחקר ומתוחזק בקפדנות בין אירועים הדגימה. בנוסף, במקרה של BA, האתר של הדגימה בתוך האוויר בקפידה תשוכפל בין אנשים.
נה, במיוחד BA, הם עדיין יחסית הרומן טכניקות למחקר קליני. עם זאת, היתרונות של טכניקות אלה גרמו בשימוש במחקרים רבים, כולל אימות זהיר נגד טכניקות חלופיות5. התקנים אלה זמינים כעת כפי המסומן CE התקנים מוכנים לשימוש נרחב במחקר בדרכי הנשימה. בעוד נה ו BA לגרום הרבה כרכים מדגם קטן יותר מאשר שיטות דגימה חלופית, ריכוז שהושג גבוה יכול לגרום רגישות עבור מתווכים חיסוניים שפע נמוכה.
בהתאם היישומים הרצויים במורד הזרם, דגימות נה ו BA שיכול להיות ישירות קפוא לצורך עיבוד מאוחר יותר, שיפור מחקר היתכנות בסביבת מחקר קליני. הפרוטוקול עבור הדגימה טיפול ניתן גם להתאים בהתאם מסוים יישומים במורד הזרם. טכניקות עיבוד המוצע יכול לשמש עבור אוסף של חלבון או חומצות גרעין או מתווכים חיסוניים השומנים, אך צריך להיות אופטימיזציה עבור כל המחקר. בפרט, MLF יכול להיות eluted עם מאגרים שונים. ראשית, מאגר חומרים ניתן למדוד ציטוקינים הרירית, נוגדנים, נוגדנים6,45. מאגרי עם רמות גבוהות יותר דטרגנט יכול לשמש גם כדי להבטיח פירוק התא מתרחשת, ומאפשר ההכללה של ציטוקינים התוך תאית. חילוץ Chaotropic RNA מאגרי ישמשו לצורך הקביעה של זיהום ויראלי, נגיפי לטעון, לארח mRNA, את microbiome. לחלופין, ניתן להשתמש בממסים אורגניים עבור lipidomics וספקטרומטר מסה.
לסיכום, קליטה ישירה של MLF של משטחים הרירית היא טכניקה מרגש עם פוטנציאל שימוש בדרכי הנשימה, העיכול, השתן, ושאר מחלות הרירית. לעומת זאת, שיטות אלה הקליטה מבטיח ידרוש אימות מדויק של דגימה ועיבוד הטכניקה של מבחני בודדים (סמנים ביולוגיים) בהגדרת כל מחלה. בנוסף, שיטות הדגימה הרירית דיוק הרומן אלה תדרוש אימות מול דגימות קונבנציונליים, כגון דם, נשימה, ברוק. עם שיטות אלה, MLF יכול לשמש כדי למדוד את החיידקים, ציטוקינים, נוגדנים, prostanoids ונוגדנים.
The authors have nothing to disclose.
מימון: עבודה זו נתמכה על ידי מימון מן המכון הלאומי הקיסרי עבור לחקר הבריאות (NIHR) ביו מחקר מרכז (BRC), את NIHR בריאות הגנה מחקר יחידה (HPRU), זיהומים בדרכי הנשימה-אימפריאל קולג ‘-לונדון בשותפות עם אנגליה בריאות הציבור (PHE) ואל מרכז המחקר Translational בטיחות המטופל הקיסרית NIHR. הדעות הביע בבלוג הם אלה של המחברים ואלה לא בהכרח של בקופת חולים, את NIHR, מחלקת הבריאות או בריאות הציבור אנגליה.
Nasosorption (adult, 7mm width) | Hunt Developments | NSFL-FXI-11 | Different sizes are available for different patient groups/ages. |
Bronchosorption | Hunt Developments | BSFL-FXI-11 | Minimum bronchoscope channel size 2mm; Max working length 815mm |
Corning Costar Spin-X centrifuge tube filters (without membrane) | Sigma Aldrich | CLS9301-1000EA | |
Corning Costar Spin-X centrifuge tube filters (0.22um membrane) | Sigma Aldrich | CLS8160-24EA | For sterilisation of samples with infection risk. |
Assay (elution) buffer | Millipore | AB-33k | Not listed on the Millipore website but available through enquiry or general lab supply companies, such as Cedarlane. Contains 0.05% Tween-20 and 1% BSA. |
NP-40 Cell lysis buffer | Life Technologies | FNN0021 | Add bovine serum albumin to 1% (w/v). Can recover higher absolute mediator levels. |
Buffer RLT (RNA extraction) | Qiagen | 79216 | Allows recovery of RNA from nasosorption and bronchosorption samples. |
Trifluoroacetic acid | Sigma Aldrich | 302031-100ML-M | For elution of samples to be used in HPLC applications |
2.0ml micro-centrifuge tubes | Costar | 3213 | 2ml tubes are required for the Spin-X tube filters, traditional 1.5ml tubes will not fit these. |