QA-1 (HLA-E в человека) принадлежит к группе неклассических гистосовместимости 1b сложных молекул. Иммунизации с КК-1-привязки epitopes было показано для укрепления тканей специфические иммунные регулирования и улучшения несколько аутоиммунных заболеваний. Здесь мы описываем перекрывающихся пептид библиотека стратегии для идентификации Qa-1 epitopes в протеине.
QA-1 (HLA-E в человека) принадлежит к группе комплекс 1В неклассических гистосовместимости (MHC-Ib) молекул. Последние данные показывают, что КК-1 молекулы играют важную роль в съемки клетки для структурной и функциональной целостности, вызывая иммунную регулирование и ограничение иммунного ответа к вирусным инфекциям. Кроме того функциональные увеличения Qa-1-ограничено CD8+ T-клеток через epitope иммунизации показал терапевтические эффекты в несколько аутоиммунных заболеваний животных моделей, например экспериментально аллергический энцефаломиелит, Коллаген индуцированной артрит и не страдающих ожирением диабетом. Таким образом существует настоятельная необходимость для метода, который можно быстро и эффективно выявлять функциональных эпитопов Qa-1 в протеине. Здесь мы описываем протокол, который использует Qa-1-ограничено CD8+ Т-клеток линии конкретных перекрывающихся библиотеки пептида (OLP) для определения Qa-1 epitopes в протеине. Это OLP библиотека содержит 15-mer перекрывающихся пептиды, которые охватывают всю длину белка, и перекрывать прилегающие пептиды по 11 аминокислоты. Используя этот протокол, мы недавно выявленных epitope Qa-1 9-mer в миелина Олигодендроциты гликопротеина (мог). Это вновь сопоставленного epitope MOG Qa-1 был показан побудить эпитопа специфики, Qa-1-ограничено CD8 клетки+ T что расширенной миелина специфические иммунные регулирование. Таким образом, этот протокол является полезным для будущего расследования новых целей и функций Qa-1-ограничено CD8+ T клетки.
QA-1 принадлежит к группе неклассических гистосовместимости комплекс 1В (MHC-Ib) молекул в мышах. Его человеческие гомолога является HLA-E. Предыдущие доказательства свидетельствуют, что КК-1 молекулы имеют важные биологические функции. Во-первых Qa-1 молекулы играют важную роль в обследовании клетки для структурной и функциональной целостности. В этой связи Qa-1 молекулы развивались несколько стратегий для наблюдения за нормальное функционирование клетки. Одна такая стратегия позволяет Qa-1 молекул образует комплексы с обработанной лидер пептид (epitope), т.е. КК-1 определяющим модификатор (Qdm), который обрабатывается от классической молекул MHC-Ia в эндоплазматический ретикулум1. Эти комплексы Qa-1/Qdm позднее отображения на поверхности клетки и привязку к тормозной NKG2A рецепторов на клетки подавляют НК убийство деятельности2. Если выражение молекул MHC-Ia теряется, ячейки (например злокачественных клеток) становится чувствительным к НК убийство2. Эта стратегия позволяет Qa-1 молекулы для формирования новых комплексов Qa-1/epitope на поверхности клеток, что является несовершенным в TAP (транспортер, связанные с обработкой антигена)3 и/или ERAAP (aminopeptidase эндоплазматического ретикулума, связанные с антиген обработка)4 (оба недостатки часто происходят в злокачественных клеток). Ячейка, которая выражает эти новые комплексы Qa-1/epitope можно затем признал и устраняется epitope специфичные Qa-1-ограничено CD8+ T клетки. Во-вторых Qa-1 молекулы побудить иммунной правила5. В этой связи Qa-1/epitope комплексов было показано, чтобы стимулировать CD8+ регулирования T (Treg) клетки, которые имеют важное значение для предотвращения иммунной опосредованного ущерба self ткани6,,78 ,9,10. В-третьих Qa-1-ограничено CD8 Treg клеток было показано ограничение иммунного ответа против вирусной инфекции11+ .
Таким образом конкретные увеличения CD8 эпитопа специфики Qa-1-restrictred+ T клетки является потенциально перспективной стратегией для ликвидации аномальных клеток, для повышения иммунной регуляции и контроля за масштабами вирус индуцированной иммунных реакций. Хотя он не был определен ли увеличение epitope конкретных Qa-1-ограничено CD8+ T клетки могут повысить иммунной наблюдения и ограничить вирус индуцированной иммунных реакций, наши лаборатории и другие четко показали, что иммунизации с epitopes Qa-1 можно дополнить функции Qa-1-ограничено CD8+ Treg для патогенных аутоиммунные CD4 клеток конкретных+ T клеток, приводит к эффективного контроля над CD4+ Т клеток опосредованной аутоиммунных заболеваний в разнообразие животных моделей таких экспериментальных аллергический энцефаломиелит (животной модели человеческого рассеянный склероз)6,10,7-индуцированной коллагена артрит (животной модели человеческого ревматоидный артрит), и 8-ожирением диабетом (животной модели человеческого типа 1 диабетом). Кроме того, мы обнаружили, что иммунизации с epitope Qa-1 ткани конкретных приводит к конкретным контроля иммунной опосредованного воспаления в этой ткани путем увеличения CD8 клетки+ Treg12. Выше успехи доклинические исследования указывают на необходимость всесторонней оценки Qa-1 epitope иммунизации для лечения иммунной системы заболеваний тканей конкретным и потенциально для лечения других заболеваний, связанных с недостатками в водопроводной и ERAAP.
Соответственно существует спрос на технологию, которая может быстро и надежно анализировать Qa-1 epitopes в протеине. В этой связи был описан ограниченное количество биологически важных epitopes Qa-1. Большинство этих epitopes Qa-1 были определены интуитивно во время изучения CD8+ T мобильных ответы на бактерии13, дефицит крана3клетки, клетки в ERAAP4и клетки, которые вызывают ЕАЕ6, 9. Таким образом высокая пропускная способность технику желательно для идентификации биологически важных epitopes Qa-1 в определенных белков. Ниже мы описываем перекрывающихся пептида (OLP) библиотека стратегию, которая сопоставляет функциональных эпитопов Qa-1 в протеине с помощью Qa-1-ограниченной CD8+ Т-клеток линии для OLP бассейн (OLP_pool) белка.
Здесь мы описали протокол для анализа Qa-1 epitopes в протеине. В отношении настоящего протокола ряд других стратегий также сообщалось ранее. Во-первых, аллогенной CD8+ Т-клеточных линий и клоны были использованы для идентификации Qdm1. Во-вторых предполагаемый мотив Qa-1-привяз…
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Пенелопа Гарсия за ее технической помощи и подготовки этой рукописи. Эта работа была поддержана исследований инноваций Грант (Рог) от Департамента медицины в университете Loma Linda (681205-2967) и экспериментального грант от Национальное общество рассеянного склероза (PP1685) до XT.
The protein to be analyzed | N/A | N/A | Sequence of the protein can be obtained from NCBI |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | Cat#: D2650 SIGMA | DMSO should be sterile and cell culture tested. |
Kb-/-Db-/- mice | The Lackson Laboratory | Stock#: 019995 | We used Taconic H2-KbH2-Db doube knockout mice (Cat#: 4215-F and 4215-M) which however are not available anymore. |
AIM V Serum Free Medium | ThermoFisher Scientific | Cat#: 12055091 | |
2-mercaptoethanol | ThermoFisher Scientific | Cat#: 21985023 | |
Sodium pyruvate | ThermoFisher Scientific | Cat#: 11360070 | |
Nonessential Amino Acids | ThermoFisher Scientific | Cat#: 11140076 | |
Dynabeads CD8 Positive Isolation Kit | ThermoFisher Scientific | Cat#: 11333D | |
Bio-Gel P-100 | Bio-Rad | Cat#: 150-4171 | |
Phoshate Balanced Solution (PBS) | ThermoFisher Scientific | Cat#: 20012027 | |
Trasfer pipette | Globe Scientific | Mfg#: 137238 | |
Murine M-CSF | PeproTech | Cat#: 315-02 | |
48-well tissue culture plates | USA Scientific | Cat#: CC7682-7548 | |
Corning Costar TC-treated Multiple well Plates, 96-well, V-shaped bottom | Sigma-Aldrich | Cat#: Z372129 Sigma | |
1ml deep 06-well PP plate, sterile | USA Scientific | Item#: 1896-1110 | |
Recombinant murine IL-2 | PeproTech | Cat#: 212-12 | |
Recombinant murine IL-7 | PeproTech | Cat#L: 217-17 | |
Capture anti-IFN-γ antibody | BD Biosciences | Cat#: 551881 | |
ELISPOT plate | Sigma-Aldrich | Cat#: S2EM004M99 | |
C1R | ATCC | Cat#: ATCC CRL-1993 | |
C1R.Qa-1b | Custom made (GenBank access#: NM_010398.3) | ||
Qa-1 lentiviral vector | GeneCopoeia | Product#: Mm02955 | |
Detection anti-IFN-γ antibody | BD Biosciences | Cat#: 551881 | |
Tween20 | Sigma-Aldrich | Cat#: P9416 | |
Streptavidin-HRP | BD Biosciences | Cat#: BD557630 | |
AEC substrate | BD Biosciences | Cat#: 551951 | |
ImmunoSpot Analyzer | ImmunoSpot | Any immunoSpot analyer should work for this purpose. |