Описан надежный протокол контролировать нейронных популяций покадровой видео микроскопия, следуют программного обеспечения-пост-обработки. Этот метод представляет собой мощный инструмент для выявления биологических события в выбранной популяции во время живых изображений экспериментов.
Понимание механизмов, которые контролируют критические события биологических нейронных клеточных популяций, например распространения, дифференциации или ячейки решения судьбы, будет иметь решающее значение для разработки терапевтических стратегий для многих заболеваний нервной системы. Нынешние методы для отслеживания клеточных популяций полагаются на их окончательные результаты в неподвижных изображений и они обычно не обеспечивают достаточной временное разрешение для выявления поведенческих особенностей в одиночных клетках. Кроме того изменения в смерти клетки, поведенческие гетерогенность популяции клеток, разбавление, распространение или низкая эффективность маркеров, используемых для анализа клеток являются все важные недостатки, которые приведут к неполной или неверной read-outs результатов. И наоборот живые изображения и одну ячейку, отслеживания соответствующих условиях представляет собой мощный инструмент для отслеживания каждого из этих событий. Здесь покадровой видео микроскопия протокол, следуют постобработки, описан отслеживать нейронных популяций с резолюцией одну ячейку, используя специальное программное обеспечение. Описанные методы позволяют исследователям для решения основных вопросов, касающихся клеток биологии и линии прогрессирования различных нейронных популяций.
Для того, чтобы разрабатывать новые и более эффективные терапевтические стратегии для регенерации нейронных популяций, мы должны сначала понять основные механизмы, которые поддерживают клетки с регенеративной нейронных потенциалом. Достижение этой цели требует всеобъемлющее знание факторов, которые регулируют баланс между покоя, распространения/дифференциация, режим и сроки отдела, длина клеточного цикла, мигрирующих потенциала, жизнеспособность, и т.д. Хотя это технический подход, который был нанят для многих лет1, живут изображений и непосредственного наблюдения по-прежнему остаются наилучшим вариантом для мониторинга событий, перечисленных выше. В отличие от многих других подходов сосредоточены на концевой отсчетов живут изображений и одноклеточного слежения предоставляют информацию по всей длине эксперимент2,3,4,5, 6. Таким образом, добавление временное разрешение позволяет смерть клетки, поведение неоднородной ячейки или ячейки судьба решений, а также многие критические события должны быть определены, которые в противном случае может пройти незамеченным. В идеале, эти функции клеток лучше всего должно контролироваться на одну ячейку уровня в естественных условиях, где обе внутренние (ячейка автономной) и внешние (клетки ниши) сигналы принимаются во внимание.
Однако, хотя в в vitro ситуации события происходят в среде, не воспроизводить естественной обстановке, условия low-density культуре, обычно используется в эти протоколы являются более подходящими выявить внутренние характеристики клетки. Кроме того более упрощенный контроль окружающей среды, просто изменив среднего роста, могут служить ценным инструментом для расследования индивидуальных роль каждого внешние фактор, который определяет нейронных нишу, а также экологические факторы, которые могут быть вызваны в патологических сценарии7,8,9,10,11,12,13. Поэтому когда правильно настроена, как и в протоколе, предлагаемые здесь, живой изображений обеспечивает решение осуществимо в пробирке для решения большинства вопросов, ранее перечисленных.
Короче говоря этот протокол описывает аппаратные средства, программное обеспечение, культуры условия и основные шаги, необходимые для успешного выполнения живых изображений эксперимент, следуют одной ячейки отслеживания. Этот подход обеспечивает ценную информацию, которая помогает выявить фундаментальные аспекты биологии и линии прогрессии, нескольких нейронных популяций.
Одним из наиболее важных ценностей живых изображений является возможность выполнять точные линии трассировки, разъяснение критических аспектов линии прогрессии в нейронных населения. Трассировки линии определяется как идентификация и мониторинг всех потомков одного прародителя, от основателя клон для последующего клонирования сформировал21. Удивительно альтернативные методы, используемые для отслеживания (например, вирусный трансдукция или многоцветной репортер конструкции21) линии имеют критический недостаток, whereby окончательный результат основывается на фотографии и он не обязательно составляют всю последовательность. Это означает, что смерть клетки, неоднородности в поведении популяции клеток, разбавление, распространяя или плохой эффективности маркеров, наряду с другими важными недостатками, привести к неполной или неверной read-outs результаты2. Кроме того живой изображений позволяет исследователю проанализировать важные особенности биологии нейронных популяций, таких как режим и сроков деление клетки, рост клеток, миграция, распространение против дифференциации, длина клеточного цикла, neurite формирование, сложности и длины, ячейка выбор судьбы (дифференциации) или преобразования (перепрограммирование).
Кроме того, живой изображений можно легко дополнить другие анализа, предназначенный для получения данных из одной клетки, такие, как, например, РНК последовательности. Однако достижения комбинированных выгоды от живых изображений и других методов требует, чтобы те клетки, ранее контроль в кино являются позже повторно определены и индивидуально, собранные для вторичного анализа. Это может быть достигнуто с помощью Микроскопы, которые включают позиционные координат, путем применения флуоресцентные репортеров для конкретных ячеек или анализа распределения групп клеток как ссылки. Действительно сочетание транскриптом профиля и поведение отдельных клеток может представлять мощный маршрут для выяснения новых молекулярных сигналов, участвующих в биологии клетки.
Одной из основных проблем, которые могут подорвать живой эксперимент изображений является плотность культуры недостаточно клеток. Как указывалось ранее, при высокой плотности избыток мусора или бедных диссоциации (комок образование) могут повлиять на качество и пространственное разрешение изображений, делая невозможным одноклеточного отслеживания. Таким образом условия различных клеточных популяций под исследования должна быть скорректирована в наименьшее количество клеток возможно без ущерба для жизнеспособности клеточной культуры.
Частоту захвата изображений также имеет решающее значение и должны тщательно скорректированы, особенно когда используется флуоресцентной подсветки. Чрезмерное воздействие передается и особенно флюоресценция света может поставить под угрозу жизнеспособность клеток. Кроме того чрезмерная задержка между захвата изображений может мешать временное разрешение анализа.
Еще один важный шаг в живых изображений эксперимента является периодическая корректировка фокусировки. Неудача в правильный параметр/повторно-setting из Фокусное расстояние может препятствовать отслеживания одну ячейку. Кроме того необходимо тщательно проверить, что инкубации камера сохраняет надлежащей температуры, влажности и CO2 уровнях, изменения нежелательные изменения, которые могут вызвать смерть клетки.
Наконец после того, как была выполнена ПМКД, важно должным образом извлечь xyz нулевой позиции до последнего раунда захвата изображений. Неправильное повторное установление xyz нулевое положение сделает его трудным для соответствия фазово контрастной и иммунофлюоресценции изображения, препятствующие идентификации потомства ячейки.
Хотя этот подход имеет много положительных аспектов, по-прежнему сохраняются некоторые ограничения для живой съемки нейронных популяций. Например плотность низкая клеток, необходимых для выполнения успешной одноклеточного отслеживания aNSCs делает невозможным использовать биохимических анализов, например западной blotting14. Кроме того мониторинг, быстро деления населения как мозжечка астроциты или N2a клетки временно ограничен, как это часто слишком сложно отслеживать клетки как культур недалеко от впадения. Кроме того многие методы культуры, а также присущие биологические ограничения, связанные с изоляции клеток, часто компромисс жизнеспособность клеток более длительных периодов времени, ограничивая продолжительность живой изображений экспериментов. Наконец изоляция клетки из их естественной среды имеет позитивные и негативные последствия. Клетки изолированы от их физиологических ниши может не получать важные сигналы, которые модулировать их поведение, хотя в то же время, он представляет собой мощное средство для проверки эффекта этих сигналов индивидуально в прогрессии линии конкретных нейронных населения.
С учетом ограничений, описанных выше, становится ясно, что идеальный методологических сценарий будет выполнять жить изображений и одной ячейки отслеживания экспериментов в нормальных физиологических условиях в естественных условиях. Однако существующие методы не могут следовать одной клетки для длительных периодов времени в глубоких регионах мозга2. Таким образом будущее живых изображений следует сосредоточиться на преодолеть это ограничение, стремясь полностью проанализировать клеточной биологии из одной клетки в vivo с самых незначительных возможно вмешательство физиологической среды3.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Beatriz гасконец за ее помощь и искусства работы на рисунке 1. Мы также благодарим д-р C. Норрис за его помощь. Работы, представленные здесь была поддержана исследовательских грантов, «красный де Джубая Consolider-Инхенио испанский ионного канала инициатива» (BFU2015-70067REDC), MEC (BFU2014-53654-P), БРАД-CM (S2013/ICE-2958), UCM-Сантандер (PR26/16-18В-3) и Фонд Рамон Программа грантов Аресес (PR2018/16-02). Фелипе Ortega признает Ramon y Cajal программа испанского министерства экономики и конкурентоспособности (MEC: Исправительные-2013-13290).
Poly-D-lysine | Sigma | P0899 | Working solution 0.02 mg mL-1 |
24 wells plate | Falcon | 352047 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM): F12 Nutrient Mixture medium (-L Glutamine) | Invitrogen | 21331-020 | |
DMEM High Glucose medium | Sigma | D6546 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma | A6003 | |
Triton X-100 | Merck | 11869 | non-ionic surfactant |
Mouse anti-β III Tubulin | Sigma | T8660 | |
Rabbit anti-GFAP | DakoCytomation | Z0334 | |
Mouse anti-α Tubulin | Sigma | T5168 | |
Anti-Mouse FITC | Jackson Laboratories | 715-095-150 | |
Anti-Rabbit Cy3 | Jackson Laboratories | 711-165-152 | |
Brightfield/Phase contrast/fluoresence microscope | Nikon | TE-2000-E | |
CFI PLAN FLUOR DLLL 10X objetives | Nikon | Ref 280MRH10101 | |
CFI SUPER PLAN FLUOR ELWD AMD 20X objetives | Nikon | Ref 280MRH48230 | |
pE-300 LED fluorescence | Cool LED | Ref Number 1981 | |
310M-201 Incubation system (temperature) | OKO-Lab | Serial Nº VOF007307 | |
Pro-ScanII Motorized stage system | Prior | Serial Nº 60018 | |
High precision microscope camera version 4.2 | ANDOR Zyla | VSC-03650 | |
Specifc software for live imaging with timelapse module: NIS-Elements AR4.5 | Nikon | NIS-Elements AR4.5 -Hasp ID: 13CE819E | |
OKO touch Incubation system (CO2) | OKO-lab | Serial number 1716 | |
Murine Neuro-2a Neuroblastoma Cell line | ATCC | ATCCCCL131 | |
HEPES buffer solution 1 M | Invitrogen | 15630-056 |