Bu iletişim kuralı diseksiyon ve yetişkin Drosophila melanogaster immunostaining açıklar beyin dokuları. Özellikle, bu iletişim kuralı doğru nöronal gelişim birçok yönlerini temel genel prensipler ortaya çıkarmak için kullanılabilecek örnek nöronal alt kümeleri olarak Drosophila mantar beden ve photoreceptor nöronlar kullanımı vurgulamaktadır.
Sinir sistemi gelişimi çeşitli sinyal yolları ve düzenleyici ağları tarafından koordine olayları sıralı bir dizi içerir. Birçok bu yollar dahil proteinlerin örümceklerle memeliler ve meyve sineği Drosophila melanogasterbenzer organizasyon ilkeleri bunlar geliştirilmesi sırasında bulunduğunu düşündüren, gibi diğer Ökaryotlar arasında korunmuş organizmalar. Önemlisi, Drosophila neurogenesis, farklılaşma, aksonlar rehberlik ve synaptogenesis de dahil olmak üzere memelilerde gereken işlemlerini düzenleyen hücresel ve moleküler mekanizmaları tanımlamak için yaygın olarak kullanılmıştır. Sinekler de başarılı bir şekilde insan nörogelişimsel hastalıkları çeşitli modellemek için kullanılmaktadır. Burada adım adım mikrodiseksiyon, fiksasyon ve yetişkin Drosophila beyin içinde proteinlerin immünfloresan yerelleştirme için bir protokolü açıklar. Bu protokol iki örnek nöron popülasyonları, mantar vücut nöronlar ve retina photoreceptors odaklanır ve bireysel mantar vücut nöronlar Repressible hücre işaretçisi (MARCM) tekniği ile mozaik analizi kullanarak izlemek için isteğe bağlı adımları içerir. Hem vahşi tipi ve mutant beyin örnek verilerden bir puanlama ölçütünü aksonal rehberlik kusurları için kısa bir açıklama ile birlikte gösterilir. Bu iletişim kuralı mantar vücut morfolojisi soruşturma için iki köklü antikorlar vurgular ve photoreceptor nöronlar, diğer Drosophila beyin bölgeleri ve diğer beyin bölgeleri içinde proteinlerin yerelleştirme da olabilir Bu iletişim kuralını kullanan araştırıldı.
Drosophila sinir sistemi insanlar ve kemirgenler, karmaşıklığı daha iyi anlamak, omurgalı karşıtları için güçlü ve ulaşılabilir bir modelini sağlayan daha küçük olmasına rağmen. Birçok durumda, omurgalı ve sinekler genleri sinir sistemi gelişimi mekanizmaları dikte çok benzer protein kodlamak. Aslında, birçok gen omurgalılarda nöronal gelişim için de dahil olmak üzere, sinekler orthologs sinyal yollar bu denetim desenlendirme, neurogenesis ve aksonal rehberlik1,2,3 bu işe gerekli ,4,5. Örneğin, netrin bir ligand memeliler ve D. melanogaster6,7,8‘ aksonal rehberlik için gerekli olur. Netrin ilk olarak embriyonik piliç beyin doku6izole iken, sonraki çalışmalar bu netrin korunmuş bir rol oynar embriyonik merkezi sinir sistemi (MSS) geliştirilmesi sırasında Drosophila8‘ ortaya çıkardı. Diğer çalışmalar genetik ekranlar embriyonik Drosophila içinde CNS korunmuş ligandlar ve reseptörleri Drosophila ve omurgalıların9bunun için gerekli belirlemek için kullandık.
Embriyonik anında CNS kapsamlı bir şekilde geçmişte ligandlar, reseptörleri ve hücre içi sinyal proteinleri aksonal rehberlik8,9için gerekli belirlemek için kullanılmıştır iken, son iş hangi birçok şekillerde araştırmış Bu proteinler de geliştirme daha sonraki aşamalarında bunun kararları denetler. Özellikle, soruşturma mantar vücut (MB) ve retina photoreceptor nöron geliştirme (şekil 1) mekanizmaları içgörü bu denetimi kılavuz, sinaps oluşumu, akson budama ve çeşitli diğer yönleri nöronal sağlamıştır geliştirme10,11,12,13,14,15,16,17. Photoreceptor nöronlar sinek retina lamina denilen yetişkin beyin bölgelerine bağlanmak ve medulla ve mantar vücut nöronlar ise beyin, (18,19tarafından gözden) görsel bilgi geçişi için kritik vardır Merkezi olarak sinek beyinde bulunan ve öğrenme ve hafıza20,21için gereklidir. Photoreceptor nöronlar ve içsel nöronlar Kenyon hücreleri denilen mantar organlarının Post sinaptik hedefleri bulmak için evrimsel korunmuş diffusible ve ilgili kişi-bağımlı aksonal rehberlik mekanizmaları kullanmaktadır. Yetişkin sinekli görünür olmasının yanı sıra, photoreceptor ve MB nöronlar da doğrudan larva ve pupa antikorlar veya muhabir gen22,23,24,25ile görüntülenmeyecektir. Yetenek kolayca farklı gelişim zaman noktalarda nöronlar bu iki kümesi görselleştirmek için nöronal gelişim birçok yönleri için süper model olarak bunların kullanımı teşvik etmiştir.
Bir model olarak normal sinir sistemi gelişimi mekanizmaları anlamak için kullanılan ek olarak, son yıllarda yapılan çalışmalarda sinekler de insan hastalıkları, kırılgan X Sendromu (FXS)26 da dahil olmak üzere çok çeşitli doğru modelleri hizmet verebilir göstermiştir , Fikri Engellilik (ID)27,28,29,30,31ve diğerleri32. Örneğin, ZC3H14 moleküler işlevinin çalışması için son zamanlarda insan Fikri Engellilik için bağlantılı bir gen biz sinek manken Nab230denilen anında ZC3H14 ortholog, bir null alleli kullanarak kimliği oluşturdu. Nab2 eksik sinekler ciddi hafıza bozuklukları ve Poli(a) kuyruğu genişletilmiş, ne recapitulating insan hastalarda gözlenen veya hasta hücre hatları33,34türetilmiş. Önemlisi, sinekler Nab2 de eksik onların yetişkin mantar organları34, FXS Sendromu gen FMR135eksik sinekli gözlenen için benzer şiddetli beyin Morfoloji hataları görüntüler. Böylece, sinekler normal beyin gelişimi ve bunu bozmaya hastalıkları eğitim için önemli model organizma hizmet verebilir.
Son olarak, davranışı, genetik araçlar, geniş dizi ile birlikte izlemek için yüksek aktarım yöntemleri erişilebilirlik olun Drosophila bir model organizma gibi karmaşık davranışlar, kontrol beyin bölgeleri tanımlamak için tercih öğrenme ve bellek, uyku, Kur yapma, susuzluk ve diğerleri36,37,38,39. Bir sinek genetikçi’nın “araç kutusu” merkezinde bir özellikle yararlı bir araç (Şekil 2) GAL4/UAS sistemidir. Bu sistem40,41 Gal4 transkripsiyon harekete geçirmek doku belirli ifade genleri veya transgenes aşağı, bir yukarı etkinleştirme sıra (UAS) ifade artırmak için kullanılır. Bu sistemin değişiklikler, örneğin, tam olarak kontrol uyarılabilirlik belirli nöronlar42,43, overexpress veya knock-down belirli genler faiz44, , araştırmacılar izin 45, gerçek zamanlı kalsiyum dynamics in vivo46çözümlemek ve hızlı reporter genler nöronal soy41işaretlemek için. Mitotik rekombinasyon de mozaik analizi ile bir Repressible hücre işaretçisi (MARCM) sistem12,47yaratılması için izin GAL4/UAS sistemiyle birleşimi. MARCM kapsamlı tek nöron izleme aksonal rehberlik12,47için gereken hücresel sinyal bileşenlerini tanımlamak için kullanılmıştır. Bunlar ve diğer teknikleri değerli bakış açısı çok sayıda sinir sistemi işlevi için gerekli hücresel mekanizmaları üzerinde sağlanan rağmen çoğu Drosophila beyin ilk disseke gerekir; dikkatli kaldırma beyin beyin bölgeleri arasında doğru beyin morfoloji ve bağlantı desenleri korumak için gereklidir. Aşağıdaki iletişim kuralı olarak mantar beden ve photoreceptor nöronlar kullanırörnek olarak nöron popülasyonları diseksiyon ile yol gösterir ve immünfloresan yetişkin boyama Drosophila beyin.
Yukarıda açıklanan diseksiyon ve görselleştirme yöntemi immunostaining çok çeşitli olarak kullanılabilir ve düşsel kullanma yaşamak. Biz bir genel immunostaining protokol belirttiğimiz ve MARCM içinde bireysel mantar vücut nöronların aksonal Morfoloji görselleştirmek için kullanılabilir bir yol çizer. Ayrıca, bu genel yordamları da diğer beyin bölgeleri sabit içinde görüntüleme için kullanılabilir veya taze disseke yetişkin48,65beyin. Canlı görüntüleme ifade desenleri artırıcı tuzakları, muhabir gen veya mimik çizgileri66, örneğin analiz ederken daha verimli bir yaklaşım sağlar. Önlemek için hücre ölümü GFP sabitlenmemiş dokusunda canlı görüntüleme sırasında yapılardan yakalama, beyin gereken 1 fosfat tamponlu tuz (PBS) veya HL3 medya48x disseke, köprü slaytlar 1 x PBS (veya HL3) üzerine monte ve daha az 15-20 dk. bakım görüntüsü Ayrıca GFP Floresans görselleştirme ile etkileyebilir beri–dan disseke beyin görüntüleme önce mümkün olduğu kadar Trakea kaldırmak için alınmalıdır.
Mantar beden ve photoreceptor nöronlar morfolojisi değerlendirmek için boyama koşulları nispeten iyi kurulmuş24,61,67, bu hücredeki ilgi belirli bir protein lokalizasyonu iken türleri kapsamlı sorun giderme ve en iyi duruma getirme gerektirebilir. Özellikle, antikor seyreltme, engelleme arabelleği bileşeni konsantrasyon ve fiksasyon, dahil olmak üzere birkaç önemli adımlar en tekrarlanabilir ve güvenilir sonuçlar üretmek için optimize edilmelidir. İlk olarak, birincil antikor en yüksek konsantrasyonu tespit edilmelidir. Piyasada bulunan antikorlar genellikle önerilen bir seyreltme (ve genellikle başlangıçta bu konsantrasyon kullanarak başlatın rağmen), bu değerler nadiren Drosophila dokular üzerinde ampirik olarak belirlenir. Bu nedenle, aralığın üstündeki ve altındaki üreticinin başlangıç öneri kez daha özel boyama sonuçları birincil antikor dilutions bir dizi test. Birincil antikor seyreltme doğruluk boyama üzerinde önemli bir etkiye sahip olabilir ve tam olarak belirlenir, birincil antikor içeren zaman beyin inkübe çözümler genel sonuç küçük etkisi ile önemli ölçüde değişebilir. Kuluçka beyin Fas2 antikor birincil antikor ile iki, üç, hatta dört gün 4 ° C’de disseke zaman örneğin, benzer sonuçlar gözlemledim Her ne kadar en az iki gece tavsiye, ayrıca tek bir geceliğine birincil antikor çözüm beyinlerinde inkübe ve tekrarlanabilir boyama elde. Önemlisi, beyin içinde oda sıcaklığında (ya da bir gece 4 ° C’de) 3 h ikincil antikor inkübe saat miktarını sınırlayarak sınırı non-spesifik bağlama ikincil antikorların beyin dokusu ile yardımcı olur.
İkinci olarak, istenmeyen arka plan sinyal ortadan kaldırmak için ek “engelleme” reaktifler kullanmak gerekli olabilir. NGS konsantrasyon ~ %10 1-%10 sığır Serum Albumin (BSA) engelleme ve birincil/ikincil antikor çözümleri veya gecede 4 ° C’de Drosophila embriyo (bkz: ile birincil antikorların öncesi adsorpsiyon ekleme, artan seçenekler şunlardır: referans68, Bölüm 2.9, adım 3).
Biz PTN önerilen tampon olarak tüm fiksasyon için yukarıdaki iletişim kuralı’nı yazılı iken, yıkama ve antikor kuluçka adımları, doku fiksasyon (PIP ve Malzemeler tabloPEM gibi) diğer arabelleklerindeki derin farklılıklar neden olabilir sinyal gücü. Örneğin, önceki çalışmalarda siklin E dokuları da PBS içinde seyreltilmiş geleneksel %4 paraformaldehyde sabit olan zaman içinde larva Imaginal yuvarlak yüzey mümkün değildir ama doku PLP arabellekte (Ken Moberg, kişisel tamir ederken açıkça görülmeye başlıyor göstermiştir iletişim ve başvuru69). Arabellekteki değişikliklere ek bileşenleri, doku fiksasyon de önemli ölçüde immünfloresan etkileyebilir için zaman ve sıcaklık değiştirme boyama ve gerekirse ampirik olarak belirlenebilir. Genel olarak, fiksasyon zaman hücresel bileşenleri yeterli polietilenin için izin vermek yeterince uzun olmalıdır ve uzun vadeli olurken genel olarak hücresel Morfoloji bakımından yeterli bitti-çapraz ve “protein epitopları gömme” önlemek için sınırlı. Bu nedenle, başlangıçta yeni alınan bir birincil antikor boyama koşullarını iyileştirirken, genellikle yaklaşık 20 dk fiksasyon zaman sınırı ve genelde doku soğuk sıcaklıklarda ortadan kaldırır.
Birden çok denetimi birincil ve ikincil antikorları özgüllük yanı sıra transgenes/genetik arka plan gözlenen fenotip üzerindeki etkisini araştırmak için herhangi bir ayirt denemede dahil edilmelidir. Özellikle kullanılan birincil antikor protein ilgi tanır olup olmadığını tespit etmek için bu protein ve/veya protein overexpressing doku eksik sinekler dokudan denetimleri dahil edilmelidir. Aşırı saf antijen protein ek birincil antikor sinek beyindeki diğer epitopları tanır olup olmadığını belirlemek için de kullanılabilir. Son olarak, herhangi bir floresan sinyal zaman birincil antikorlar atlanırsa mevcut seçili ikincil antikorlar tarafından non-spesifik bağlama düzeyini temsil eder.
Birkaç önemli denetimleri de genetik arka plan katkısını veya transgenes boyama yoğunluğu veya nöronal Morfoloji varlığı değerlendirmek için dahil edilmelidir. Örneğin, birden çok transgenes şekil 5 MARCM deneyde kullanılan sinekler içerir (hsFLP, UAS-CD8-GFP, FRT82B, küvet > GAL80 ve OK107-GAL4), her biri ayrı ayrı mantar vücut Morfoloji üzerindeki etkileri için analiz edilmelidir. Sinekler bir çok az, mantar vücut Morfoloji OK107-GAL4 ve UAS-CD8-GFP içeren analiz edilmelidir. Ayrıca ısı şok etkisini değerlendirmek için gerekli olabilir ve hsFLP ve FRT82B içeren Flp recombinase üretim mantar vücut geliştirme analiz tarafından üzerinde uçar. MARCM olup olmadığını denetler verilen bir protein özerk aksonal rehberlik hakkında önemli fikir sağlamasına karşın, bu sonuç doğru bir şekilde yapmak için gerekli denetimlerin sayısını bu tekniğin küçük bir sınırlama olabilir. Daha az karmaşık deneylerde benzer denetimler de geçerlidir. Örneğin, nerede GAL4/UAS sistemi bütün nöronlar ilgi bir protein devirme ifade için bir RNAi transgene ile birlikte kullanılan bir deneyi ele alalım. Bu deneyde, en az iki transgenes mevcut olacaktır: Elav-GAL4 ve UAS RNAi transgene gibi bir pan-nöronal GAL4 sürücüsü. Her biri bu transgenes yalnız içeren sinekler nöronlarda mantar vücut morfolojisi ek olarak her iki transgenes aynı sinek içinde sinekler nerede liman deneysel durumu araştırılmalıdır.
Son olarak, protein ilgi mantar vücut nöronlarda ifade olup olmadığını belirlemek için bu ortak leke beyin için genellikle Fas2 antikorlar ile gereklidir. Alternatif olarak, floresan proteinler gibi GFP, RFP veya membran CD8-GFP bağlı aynı zamanda GAL4/UAS sistemi kullanılarak ve faiz protein tanıma antikorlar ile birlikte kullanılan ifade edilebilir. Fas2 sadece mantar vücut α ve β loblar formu fasciculated akson tanır, GAL4 dayalı, membran bağlı CD8-GFP kullanımı mantar vücut nöronlar işaretlemek için özellikle yararlı beri.
Kusurları aksonal rehberlikte genellikle % 100 penetrant değildir ve hatta aynı genotip beyinlerinin bazı değişkenlik gösterebilir. Ne zaman yeni analiz mutant gen kusurları için mantar vücut veya photoreceptor bunun içinde oluşturulan, bu nedenle, farklı gen ve yaklaşımların bir arada kullanılan. Literatürde en çalışmaları bir protein aksonal rehberlik kontrol hücre özerk bir rol oynar olup olmadığını araştırmak için birkaç farklı yaklaşım kullanın: Ben) bunun analizini kusurları (tercihen farklı nu kullanarak homozigoz null sineklill allelleri), II) bunun analizini kusurları nöronlar (genellikle üzerinden RNAi), sadece ilgi protein eksik sinek içinde III) kılavuz kusurları ve IV MARCM analizi) kurtarma gene nerede homozigoz null nöronlarda yeniden ifade deneyler uçar. İdeal olarak, genotip başına birkaç düzine beyin nöronal Morfoloji kusurları için analiz edilebilir.
İletişim kuralı öncelikle odaklanır sabit doku içinde proteinlerin immünfloresan yerelleştirme burada açıklanan rağmen bu tekniğin bazı gelecekteki uygulamalar görüntü canlı beyin dokusu ile geliştirilmektedir. Bir kez beyin (genellikle hücre kültür medyada) disseke, onlar sonra birkaç gün 25 ° C’de kültürlü olabilir Bu ex vivo kodlamayla yöntemleri çok çeşitli yaralanma70,71, hücre içi takip axon rejenerasyon teşvik protein aktivite gibi biyolojik süreçleri araştırmak amacıyla geliştirilmekte olan sinyal dynamics72ve nöronal gelişim73.
The authors have nothing to disclose.
Changhui Pak ve Alysia Vrailas Mortimer başlangıçta beyin diseksiyonu tekniği SMK verdiğiniz için teşekkür etmek istiyorum. Biz de Ken Moberg’ın laboratuar grubunun üyeleri, özellikle Chris mermi, eleştirel yazının okumak için teşekkür ederiz. Fas2 tanıma antikorlar (1 d 4) ve chaoptin (24B10) gelişim çalışmaları Hibridoma bankadan elde. Antikor 24B10 Seymour Benzer ve Nansi Colley24tarafından,60,61DSHB için yatırılır, antikor 1 d 4 için DSHB Corey Goodman 22,23,56tarafından yatırılır. Sinek stokları Bloomington hisse senedi merkezden elde edilmiştir. Ayrıca Ohio tarımsal araştırma ve Geliştirme Merkezi (OARDC) MCIC görüntüleme Merkezi confocal mikroskop kullanımı için şekil 4A beyinlerinde görüntü için teşekkür etmek istiyorum ve B. SMK NICHD hibe tarafından desteklenmektedir (1 R15 HD084241-01A1).
Microdissection forceps/tweezers | Ted Pella | 505-NM | |
Sylgard dishes | Living Systems Instrumentation | DD-50-S-BLK | Available from amazon.com |
Fas2 Antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 1D4 | |
Chaoptin Antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | 24B10 | |
GFP Antibody | Aves Lab | GFP-1010 | |
Alexa488 goat anti-mouse secondary antibody | ThermoFisher | A-11001 | |
Alexa488 goat anti-chicken secondary antibody | ThermoFisher | A-11039 | |
Alexa647 goat anti-mouse secondary antibody | ThermoFisher | A-21236 | |
20% paraformaldehyde | Electron Microscope Services | RT15713 | |
VectaShield | Vector Labs | H-1000 | |
SuperFrost Plus Slides | ThermoFisher | 99-910-01 | |
Coverslips | ThermoFisher | 12-553-454 | |
Na Phosphate Buffer monobasic | Sigma | S3139 | |
Na phosphate Buffer dibasic | Sigma | S3264 | |
Triton X 100 | Sigma | X100-100ml | |
fingernail polish | Electron Microscope Services (EMS) | 72180 | |
stereomicroscope | Leica S6D with KL300 LED light source | ||
9-well dish (spot plate) | VWR | 89090-482 | |
nutator/rocker | Fisher | 22-363-152 or 88-861-041 | |
35mm dish | Genesee Scientific | 32-103 | |
Sylgard | Fisher | 50-366-794 | |
Kimwipe | Fisher | 06-666 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Potential Fixation Buffers | |||
PTN Buffer | 0.1M NaPhosphate, pH 7.2, 0.1% Triton-X-100, Typically make up 0.5 L of 0.1M NaPhosphate buffer and aliquote 50ml at a time as needed | ||
PLP buffer | 2% paraformaldehyde, 0.01M NaI04, 0.075M Lysine, 0.037M NaPO4, pH 7.2, Dissolve 0.36 g lysine in 10 ml H2O + 7.5 ml 0.1 M NaH2PO4 pH 7.2 + 2.5 ml 0.1 M Na2HPO4 on ice. Immediately before use, mix 15 ml of this buffered lysine solution with 50 mg NaIO4 (sodium periodate) + 2ml of the 20% high grade paraformaldehyde (EMS) + 3ml H2O | ||
PEM buffer | 0.1M PIPES pH 7.0, 2mM MgS04, 1mM EGTA, This buffer can be conveniently made as a 2x stock and diluted with 8% paraformaldehyde (PFA) to give a final concentration of 4% PFA | ||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Fly Stocks available from Bloomington | |||
elav (c155)-GAL4 | BL458 | Pan-neuronal GAL4 driver | |
w*;;;OK107-GAL4 | BL 854 | GAL4 driver for all mushroom body neurons (OK107-GAL4 insertion is on the 4th chromosome) | |
y(1), w(67c23); c739-GAL4 | BL 7362 | GAL4 driver for alpha and beta lobes (on 2nd chromosome) | |
y(1), w(67c23); c739-GAL4, UAS-CD8-GFP | BL 64305 | GAL4 driver for alpha and beta lobes, also contains UAS-CD8-GFP | |
w*; 201Y-GAL4 | BL 4440 | GAL4 driver for primarily the gamma lobes of mushroom body (on 2nd chromosome) | |
y(1), w(67c23); 201Y-GAL4, UAS-CD8-GFP | BL 64296 | GAL4 driver for mushroom body gamma lobes, also contains UAS-CD8-GFP | |
w*, elav (c155)-GAL4, hsFLP; FRTG13, Tub>Gal80/CyO | BL 5145 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 2nd chromosome | |
w*, elav (c155)-GAL4, hsFLP, UAS-CD8-GFP | BL5146 | MARCM stock, contains hsFLP, pan-neuronal GAL4, and CD8-GFP on X chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP;;FRT82B, Tub>GAL80/TM3, Sb(1);OK107-GAL4 | BL 44408 | MARCM stock for flipping 3rd chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP;FRT40A, Tub>GAL80;OK107-GAL4 | BL44406 | MARCM stock for flipping 2nd chromosome | |
w*, hsFLP, tub>GAL80, FRT19A; UAS-CD8-GFP/CyO;;OK107-GAL4 | BL 44407 | MARCM stock for flipping X chromosome | |
y(1), w*; UAS-CD8-GFP/CyO | BL 5137 | GFP labels cell surface (CD8 is a transmembrane protein) | |
y(1), w*; FRTG13, UAS-CD8-GFP | BL 5139 | MARCM stock, contains FRT site and CD8-GFP on 2nd chromosome | |
y(1), w*, hsFLP, UAS-CD8-GFP; Pin(1)/CyO | BL 28832 | MARCM stock, contains hsFLP and CD8-GFP on X chromosome | |
w*; FRTG13, Tub>GAL80 | BL 5140 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 2nd chromosome | |
y(1), w*;; FRT82B, Tub>GAL80 | BL 5135 | MARCM stock, contains FRT site and GAL80 on 3rd chromosome |