This article describes how the ion selectivity of channelrhodopsin is determined with electrophysiological whole-cell patch-clamp recordings using HEK293 cells. Here, the experimental procedure for investigating chloride selectivity of an anion-selective channelrhodopsin is demonstrated. However, the procedure is transferable to other channelrhodopsins of distinct selectivity.
過去10年間で、チャネルロドプシンは神経科学的研究において不可欠となり、標的細胞における電気的プロセスを非侵襲的に操作するツールとして使用されている。これに関連して、チャネルロドプシンのイオン選択性は特に重要である。この記事では、HEK293細胞の電気生理学的パッチクランプ記録を介して、Proteomonas sulcataの最近同定された陰イオン伝導性チャネルロドプシンの塩化物選択性の研究について説明する。光ゲート光電流を測定するための実験手順は、従来のパッチクランプセットアップの顕微鏡に結合された、高速で切り替え可能な、理想的には単色の光源を必要とする。実験前の準備手順は、緩衝液の調製、液絡部電位の検討、細胞の播種およびトランスフェクション、およびパッチピペットの引き上げを含む概略を述べる。電流 – 電圧関係の実際の記録トランスフェクションの24時間後から48時間後に異なる塩化物濃度の逆転電位を測定することができます。最後に、電気生理学的データを塩化物伝導の理論的考察に関して分析する。
チャンネルロドプシン(ChR)は、運動性の緑藻の眼球のスポットに存在する光依存性イオンチャネルであり、光走性および恐怖反応の主要な光センサーとして機能する1 。 2002年2月の最初の記述以来、ChRは新興オプトジェネティクス分野への道を開き、様々な興奮性細胞、例えば骨格筋、心臓、または脳内に適用することができる3,4,5。標的細胞におけるChRの発現は、それぞれの細胞の光制御可能なイオン透過性をもたらす。これは、ニューロンの状況において、活動電位(AP)の発火(伝導イオンに依存する)の活性化6,7,8または阻害9,10を空間的および時間的ChR変異体のイオン選択性がどのようにその光発生適用を決定するかを強調する光の精度。
Chlamydomonas reinhardtiiおよびVolvox carteri由来の最初に発見されたChRは、プロトンに対して透過性であるが、ナトリウム、カリウム、およびカルシウムおよびマグネシウムなどの二価陽イオンにはあまり関わらない一価カチオンにも透過性である11,12,13 。今日では、70種類以上の天然カチオン伝導性チャネルロドプシン(CCR)14,15,16,17およびいくつかの改変された改変体18,19,20が 、 光電流サイズ、分光感度、カイネティックス、およびカチオン選択性が利用可能である。神経科学では、CCRはa細胞を活性化させ、APを誘発するために再使用される場合、光駆動の微生物ポンプは、ニューロンをサイレンシングするために唯一利用可能なアンタゴニストであった。 2014年に2つのグループが同時に、CCRが分子工学を介して推定イオン伝導ポアに沿って極性を変化させることにより、陰イオン伝導チャネルロドプシン(ACR)に変換できることを示した9,21。続いて、いくつかのクリプトフィト藻類において天然ACRが同定された22,23,24。最も重要なことに、ACRの軽い活性化は、成人ニューロンにおける塩化物電流を媒介し、吸収された光子につき単一の電荷のみを輸送する微生物ポンプよりもはるかに低い光強度でニューロン活性の阻害を可能にする。
ChR活性は、HEK293細胞における光誘起電流の電気生理学的パッチクランプ記録によって直接対処することができる。パッチクランプ技術はもともと1970年代後半に開発されたものであり、Hamill et al。高い電流分解能および膜電圧26の直接制御を伴う小さなセル(全細胞モード)からの電流実体の記録を可能にする。細胞培養に適用されるこの技術は、イオンおよび電気記録条件の正確な制御を提供し、イオン選択性を総電流に対するイオンの相対的な寄与と共に研究することを可能にする。ここでは、様々な細胞外クロライド濃度下で電流 – 電圧関係を記録して、高塩化物コンダクタンスを証明することにより、Proteomonas sulcata( Ps ACR1) 22,23の陰イオン伝導性チャネルロドプシンのイオン選択性の試験を例示する。
定義されたイオン状態および電気状態での反転電位の決定は、ChRの光活性化後に輸送されるイオン種に関する情報を提供する。排他的に1つのイオン種が複雑な生理学的媒体中で変化し、得られた逆電位が理論上のネルンスト電位に従ってシフトするならば、このイオン種は唯一の輸送種である。
しかし、ChRの場合、反転電位シフトは通常、異なるイオン種への浸透性お?…
The authors have nothing to disclose.
優れた技術支援をしてくれたMaila Reh、Tharsana Tharmalingam、特にAltina Kleinに感謝します。この研究は、ドイツ研究財団(DFG)(SFB1078 B2、FOR1279 SPP1665〜PH)およびカタリシス、UniCat、BIG-NSE(JV)およびE4(PH)における優良概念クラスタのクラスターによって支持された。
HEK293 cells | Sigma Aldrich | 85120602 | Human embryonic kidney cells |
Retinal | Sigma Aldrich | R2500 | all-trans retinal |
FuGENE HD | Promega | E2312 | Transfection reagent |
DMEM | Biochrome | FG 0445 | Dulbecco's Modified Eagle Medium |
Agarose | Roth | 3810 | Agar bridges |
CaCl2 | Roth | 5239 | CaCl2 2H2O |
CsCl | Biomol | 2452 | |
EGTA | Roth | 3054 | |
FBS | Biochrome | S0615 | Cell culture |
Glucose | Roth | HN06 | D(+)-Glucose |
KCl | Roth | 6781 | |
MgCl2 | Roth | 2189 | MgCl2 6H2O |
NaCl | Roth | 3957 | |
NMG | Sigma Aldrich | M2004 | N-Methyl-D-glucamine |
Na-Aspartate | Sigma Aldrich | A6683 | L-Aspartic acid sodium salt monohydrate |
Citric acid | Roth | 6490 | |
AgeI | ThermoFischerScientific | ER1462 | Restriction enzyme |
XhoI | ThermoFischerScientific | ER0695 | Restriction enzyme |
NheI | ThermoFischerScientific | ER0975 | Restriction enzyme |
XL1Blue E.coli/ | Agilent Technologies | 200249 | Chemocompetent E.coli |
Kanamycin | Roth | T832 | |
Lysogeny broth medium | Roth | X964 | |
Agar-Agar | Roth | 6494 | Agar plates |
Plasmid purification kit | Marchery-Nagel | 740727.25 | |
Penicilin/Streptomycin | Biochrome | A 2213 | Cell culture |
Poly-D-lysine hydrobromide | Sigma Aldrich | P6407-5MG | Cover slip coating |
Microforge | Custom made | Fire polishing | |
Serological pipettes | TPP | Different sizes | |
Clean bench | Kojair | Biowizard SL130 | |
Stirrer | IKA | RCT classic | |
Silver wire | Science Products | AG-T25; AG-T10 | Electrodes, 0.64 mm (bath); 0.25 mm (electrode) |
pH-meter | Knick | 765 Calimetric | |
Osmometer | Vogel | OM 815 | |
Microscope | Carl Zeiss | ID03 | Fire polishing |
CO2 incubator | Binder | CB150 | |
Cell culture dishes | TPP | 93040 | 34 mm internal diameter |
Cover slips | Roth | P232 | 15 mm diameter |
Thermometer | Rössel Messtechnik | MTM12 | |
Beamsplitter | Chroma | 21011 | 90/10 transmission |
Pipette holder | ALA Scientific Instruments | PPH-1P-AXU-0-1.5 | |
Headstage | Molecular Devices | CV203BU | |
Amplifier | Molecular Devices | AxoPatch200B | |
Digitizer | Molecular Devices | DigiData1400 | Digital analog converter |
Lightsource | TILL Photonics | Polychrome V | Set to 540 nm full intensity |
Microscope | Carl Zeiss | Axiovert 100 | |
Shutter | Vincent Associates | VS25 | |
Shutter driver | Vincent Associates | VCM-D1 | |
Glass capilarries | Warner Instruments | G150F-3 | Boresilicate capillaries with fire polished ends OD 1.5 mm ID 0.86 mm |
Micropipette puller | Sutter Instruments | P1000 | |
Bath handler | Lorenz Messgerätebau | MPCU | |
Tripleband filterset | Chroma | 69008 | Fluorescence filter ECFP/EYFP/mCherry |
CCD camera | Watec | Wat-221SCCD | |
Optometer | Gigahertz Optik | P9710 | Measure light intensities |
Objective | Carl Zeiss | 421462-9900-000 | W Plan-Apochromat 40X/1.0 DIC |
Micromanipulator | Scientifica | PatchStar | |
Recording chamber | Custom made | ||
Power supply | Manson | HCS-3202 | Avoids electrical noise from microscope built-in power supply |
Vibration isolated table | Newport | M-VW-3636-OPT-01 | |
Faraday cage | Custom made or any commercial matching table | ||
Hoses | Any comercial; e.g. Roth | Different sizes and materials for bath handling and application of pipette pressure; agar bridges | |
Linear shaker | Sunlab Instruments | SU 1000 | |
Liquid junction potential calculator | Molecular Devices or directly from Peter H. Barry | Program is included in the Clampex aquisition software or can be obtained from p.barry@unsw.edu.au | |
Data acquisition software | Molecular Devices | Clampex 10.X | |
Data evaluation software | Molecular Devices | Clampfit 10.X | |
PsACR1 | GenBank or Addgene | KF992074.1 or Addgene plasmid #85465 | Gene encoding for PsACR1 |
Amplifier guide | Molecular Devices | The Axon Guide |